Medicina científica y filosofía natural : dos aportes de José Celestino Mutis al desarrollo integral de las ciencias en Colombia

La historia de la ciencia en nuestro país ha sido elaborada a manera de crónica para el gran público o bien a manera de rigurosos trabajos académicos dirigidos a un público restringido. Entre estos dos extremos, y con el propósito de documentar los pilares fundamentales de la ciencia en Colombia, hemos optado por una aproximación intermedia, a la vez atractiva y rigurosa, en torno a 2 manuscritos de José Celestino Mutis en el período colonial en los años que precedieron lo que se ha llamado la “independencia” de nuestro país.74-7

Current studies on phylum Tardigrada and its importance in medicine

La siguiente revisión permite obtener una visión global de los diferentes estudios que se han llevado a cabo en la actualidad respecto a los tardígrados, principalmente a nivel molecular y genético. Los documentos consultados permiten un acercamiento a la anatomía del Tardígrado y al proceso de criptobiosis, así como a la taxonomía tradicional. Posteriormente, se abordan la genética y la biología molecular del Tardígrado, y se recopilan algunos de los resultados obtenidos respecto a su genoma, teniendo en cuenta genes o fragmentos secuenciados reportados en GenBank y estudios cromosómicos, con referencia a los métodos de extracción de ADN, taxonomía molecular, construcción de bibliotecas de ADNc y evolución-filogenia.Revisión380-403The following review allows a general vision of different studies that have been performed on Tardígrados, mainly those related to molecular biology and genetics. In general, this document shows some aspects on Tardigrade's anatomy, cryptobiosis processes and the methodology of traditional taxonomy. Then wc follow with some of the findings reported on the genetics and molecular biology of Tardígrados, taking into account sequenced genes or fragments reported in GcnBank and chromosomal studies, likewise, with reference to DNA extraction methods, molecular taxonomy, cDNA library'construction and phylogenyevolution

A physics approach to the consequences of excess umbilical cord length

Introducción: el cordón umbilical es una estructura incomprendida a pesar de transportar todo lo que un feto necesita para crecer y subsistir. Cada una de sus características es relevante, y la principal es la longitud, la cual, cuando está alterada, se relaciona con pobre pronóstico neurológico y muerte fetal. Materiales y métodos: con base en la revisión de principios físicos, se proponen fórmulas que podrían explicar la importancia de la longitud del cordón por sus repercusiones hemodinámicas. Resultados: se analizó la circulación fetal desde el corazón hasta la red capilar vellositaria en el plato placentario y, por medio de fórmulas físicas, se plantea la importancia de la longitud del cordón en la perfusión fetal. Conclusiones: las complicaciones clínicas conocidas para la excesiva longitud del cordón umbilical fueron analizadas desde el punto de vista de la física, dejando listas las fórmulas para ser alimentadas con datos reales provenientes de doppler fetales y mediciones del cordón umbilical.Q3Artículo original53-60Introduction: Despite its role of transporting all the things that a foetus needs to grow and survive, the umbilical cord is still poorly understood. All of its characteristics are relevant, and paramount among them is its length. When abnormal, length is associated with poor neurological prognosis and foetal demise. Materials and methods: Based on a review of physics principles, formulae were proposed in an attempt to explain the importance of umbilical cord length on the basis of its haemodynamic repercussions. Results: Foetal circulation was analysed from the heart to the placental villous capillaries and physics formulae were used to describe the importance of umbilical cord length in foetal perfusion. Conclusions: Clinical complications known to be associated with excess umbilical cord length were analysed from the physics perspective, and formulae were established for use with real data derived from foetal Doppler scans and umbilical cord measurements

Phylogenetic relationships among genera of the subtribe oncidiinae (epidendroideae : orchidaceae) and a new genus : santanderella

338-406Santanderella, a new genus of orchids from Colombia with the type species, Santanderella amado-rinconiana, related to Macroclinium and Notylia, is analyzed both at the phenotypic and genotypic levels. Phylogenetic trees related to genomic matK-trnK and ITS1-5.8S-ITS2 sequences are presented to support the proposal of a new genus

Giardia intestinalis infection frequency estimate among aboriginal and black communities in Colombia : a cross-sectional study

Introducción: Las infecciones parasitarias intestinales son un importante problema de salud púbica. Las parasitosis como la giardiasis, son de particular relevancia para el estudio de la salud en comunidades aisladas en Colombia. Objetivo: describir la frecuencia de infección por G. intestinalis en 21 comunidades aisladas colombianas (18 comunidades indígenas y 3 comunidades negras). Materiales y Métodos: análisis microscópico en campo de muestras de materia fecal de 671 muestras de voluntarios de 21 comunidades aisladas colombianas. Cálculo de prevalencia por comunidad y descripción de las condiciones nutricionales y de manejo de agua y excretas en las comunidades. Resultados: la prevalencia global de infección por G. intestinalis en las comunidades aisladas estudiadas fue del 11% en comunidades indígenas y del 9% en comunidades negras. Las prevalencias por comunidad varían entre 0% hasta el 63%. El 100% de los individuos evaluados presentó algún tipo de parasitismo intestinal. Discusión: el parasitismo intestinal por G. intestinalis tiene prevalencias similares a otros grupos indígenas de Sur América. La causa del parasitismo intestinal debe ser considerada según comunidad y de acuerdo a factores de riesgo conocidos, como manejo de excretas y acceso a agua potable.Artículo de investigación10-24IndígenasAfrosIntroduction: Intestinal parasitic infections are a major problem of public health. Parasitic disea-ses such as giardiasis, are relevant for the study of health in isolated communities in Colombia.Objective: To describe the frequency of G. intestinalis infection in 21 isolated communities in Colombia (18 indigenous communities and 3 black communities). Materials and Methods: mi-croscopic analysis on 671 stool samples of volunteers from 21 isolated Colombian communities. The analysis included prevalence of giardiasis, nutritional status and management of water and sewage for each of the communities. Results: The overall prevalence of G. intestinalis infection was 11% in indigenous communities and 9% in black communities. The community prevalence ranged from 0% to 63%. 100% of the evaluated individuals were affected by at least one kind of intestinal parasite. Discussion: prevalence of intestinal parasitism by G. intestinalis is similar to other indigenous groups in South America. The cause of intestinal parasites should be considered by each community and according to known risk factors such as residual waters management and access to drinkingwater

Descriptive analysis of homocysteine levels, polymorphisms C699T, C1080T and 844Ins68pb of CBS, C677T from the MTHFR, and other cardiovascular risk factors in a Colombian population with acute coronary syndrome

La enfermedad cardiovascular es la primera causa de muerte en el mundo occidental. Por esta razón, es necesario describir los factores de riesgo conocidos, al igual que los factores genéticos, nutricionales y ambientales emergentes, como la hiperhomocisteinemia y la deficiencia de la vitamina B12 y de ácido fólico en la población colombiana, que permitan proponer estrategias comunitarias de control de la enfermedad. El objetivo de este estudio fue describir los factores de riesgo conocidos y los emergentes, principalmente la hiperhomocisteinemia y los polimorfismos relacionados con ella en pacientes con síndrome coronario agudo. El estudio incluyó 156 pacientes, a qtiienes se les cuantificó perfil üpídico, glucosa, creatinina, urea, homocisteína, vitamina B12 y ácido fólico, y se describieron las frecuencias de las variantes polimórficas c.dllCÍI, de la MTHFR {5,10-methylenetetrahydrofolate reducíase y C.699C/T, c.1080 C/T y c.844ins68pb de CBS (Cystathionine â-Synthase). El 43,6% de los pacientes con síndrome coronario agudo correspondió a las mujeres y el 56,4% a los hombres. Los valores medios de colesterol total, cLDL, cHDL, glucosa, homocisteína, vitaminas B12 y ácido fólico, se encontraron en el rango normal. Sin embargo, se pudo observar que la homocisteína presentaba una tendencia al aumento con la edad, tanto en hombres como en mujeres. Los niveles de cHDL en el grupo de hombres y de mujeres, presentaron diferencia significativa (p=0,0379) e, igualmente, la diferencia fue significativa en los niveles de creatinina (p=0007), de vitamina B12 (p=0,0341 ) y en la diabetes mellitus (p=0,0436). Con este estudio se realizó una aproximación a la descripción de los niveles del perfil lipídico, glucemia, hiperhomocisteinemia y de polimorfismos en genes involucrados en la vía de la homocisteínametionina, en pacientes con enfermedad cardiovascular en la población colombiana.322-334Cardiovascular diseases are the main cause of death in the western world. Therefore, it is necessary to describe the associated genetic, nutritional and environmental risk factors, including hyperhomocysteinemia, vitamin B12 and folie acid deficiencies in the Colombian population. Through this survey we want to propose strategies to the community in order to control cardiovascular diseases. The goal of this study was to describe the known risk factors and also the emerging ones such as hyperhomocysteinemia and some polymorphisms, in a Colombian population. Our study included 156 patients with acute coronary artery syndrome, whose lipid, glucose, creatinine, homocysteine, vitamin B12 and folie acid levels were measured and the identification of polymorphisms 677C/T, from the MTHFR and 699C/T, 1080C/T, 844ins68pb of CBS. Overall, 43.6% of patients with acute coronary artery syndrome corresponded to women, and 56.4% to men who participated in this study. The results of cholesterol CLDL, CHDL, glucose, homocysteine, vitamin B12 and folie acid levels were found in normal ranges. However, we were able to observe that the homocysteine presented a tendency to increase with age in men and women, the CHDL levels within the group of men and women showed a significant difference (p=O.O379) as well as in the levels of creatinine (p=0.0007) of vitamin B12 (p=0.0341) and diabetes mellitus (p=0.0436). tn this study, we propose a rough description of the lipid, glycemia, and hyperhomocysteinemia levels and polymorphisms in genes involved the homocysteine-methionine metabolism in patients with cardiovascular disease in the population of Colombia

Mitochondrial DNA analysis on pre-Columbian bone remains of the Herrera period

Introducción. Los restos óseos arcaicos son fuente privilegiada de información biológica y sucaracterización genética permite confirmar o descartar filiaciones propuestas por otrasaproximaciones científicas. La historia precolombina de los Andes orientales se divide en tresperiodos principales: i) un poblamiento temprano por parte de grupos cazadores-recolectores;ii) un periodo intermedio (Herrera) de pueblos con agricultura incipiente, y iii) un periodo tardíode pueblos chibchas, agrícolas y alfareros (agroalfarero).Objetivo. Analizar el ADN mitocondrial de restos óseos del periodo Herrera.Materiales y métodos. Se analizaron 11 individuos pertenecientes al yacimiento arqueológicoMadrid 2-41, con una edad aproximada de 2.000 años. Un fragmento (192 pb) del segmentohipervariable I fue amplificado y secuenciado, siguiendo criterios estrictos de autenticidad deADN arcaico. Las secuencias se compararon con las existentes en bases de datos deNorteamérica y Europa usando herramientas bioinformáticas.Resultados. Todas las secuencias resultaron idénticas y fueron clasificadas como haplogrupoB. Esto puede relacionarse con el tipo de entierro ritual practicado en Madrid 2-41, es decir,probablemente los individuos analizados hagan parte de una familia jerárquicamente importanteen la antigua sociedad Herrera. La búsqueda de secuencias homólogas en las bases de datosestadounidense y europea no arrojó coincidencias exactas, aunque existe el reporte de unindividuo amazónico de ~4.000 años de antigüedad (Brasil) cuya secuencia coincide con lahallada en Madrid 2-41.Conclusión. Los individuos del yacimiento arqueológico Madrid 2-41 están estrechamenteemparentados entre sí por línea materna y presentan una secuencia aparentemente ausenteen poblaciones actualesIntroduction. Ancient bone remains constitute an important source of biological information,and their genetic characterization allows the confirmation or rebuttal of human affiliationsproposed on the basis of non-molecular approaches. Pre-Columbian history of the EasternAndes in Colombia has been divided into three main periods: (i) an early colonization bygroups of hunter-gatherers, (ii) an intermediate period “Herrera” characterized by primitiveagriculture and (iii) a late stage of Chibcha-speaking groups, with agriculture and ceramics(“agroalfarero”).Objective. The mitochondrial DNA on ancient bone remains of the Herrera period were analyzedfor comparison with modern and other ancient DNAs.Materials and methods. Mitochondrial DNA was extracted from 11 Herrera individuals [~2,000years before present (YBP)] found in the Madrid 2-41 archaeological site near Bogotá, Colombia.A 192 bp segment of the hypervariable segment I was amplified and sequenced, following stringent archaic DNA authenticity criteria. The sequences were compared with those inAmerican and European databases using bioinformatics tools.Results. All individuals had identical sequences and were classified as haplogroup B. Thisidentity may be related to the type of ritual burial performed in the site, probably exclusively formembers of a hierarchically important family of the ancient Herrera society. The search forhomologous sequences in the American and European mtDNA data bases produced noidentical coincidences, although a Brazilian Amazonic individual (~4,000 YBP) was recordedwith a matching sequence.Conclusion. Individuals buried in the Madrid 2-41 site were maternally closely related andshowed a mtDNA sequence that is apparently absent in contemporary population

Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia

Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determinar cuál de los tres protocolos de extracción seleccionados, que habían sido publicados previamente para ADN vegetal, permitía extraer ADN de buena calidad, susceptible de ser amplificado y secuenciado, a partir de exsicados de orquídeas conservadas en herbario hasta por 63 años. De los protocolos evaluados, el más eficaz permitió obtener y secuenciar productos amplificados en 6 de las 7 muestras estudiadas, con las mejores relaciones de pureza ADN / proteína.Q2121-129Plant tissue from herbarium specimens contains DNA that has undergone post-mortem degradation. Only small amounts of possibly degraded genetic material free of chemicals and impurities can be extracted from these samples. The aim of the present work was to compare and determine which one of three previously published plant DNA extraction protocols would extract good quality DNA from orchid herbarium specimens stored up to 63 years, susceptible of PCR amplification and Sanger sequencing. The most effective protocol for this type of samples allowed us to obtain and sequence amplified products in 6 of the 7 samples studied with an optimal DNA / protein purity relationship

Identification of messenger RNA of fetoplacental source in maternal plasma of women with normal pregnancies and pregnancies with intrauterine growth restriction

Q3Q3Artículo original184-188Mujeres en embarazoObjective: to quantify placenta-specific RNA in plasma of women carrying foetuses with intrauterine growth restriction and pregnant women with normal pregnancies. Materials and methods: 8 pregnant women with foetuses with intrauterine growth restriction were studied as well as 18 women with uncomplicated pregnancies in the third pregnancy trimester. Total free RNA was quantified in maternal plasma by spectrophotometry and the gene expression of hPL (Human Placental Lactogen) at the messenger RNA level through technical Real Time-Chain Reaction Polymerase. Results: plasma RNA of fetoplacental origin was successfully detected in 100% of pregnant women. There were no statistically significant differences between the values of total RNA extracted from plasma (p = 0.5975) nor in the messenger RNA expression of hPL gene (p = 0.5785) between cases and controls. Conclusion: messenger RNA of fetoplacental origin can be detected in maternal plasma during pregnancy

The association between homocysteine-methionine and folate metabolism and pregnancy complicated by idiopathic intrauterine growth restriction - Preliminary data

Objetivo: el objetivo general de esta investigación es hacer una aproximación para evaluar la asociación entre alteración del metabolismo de la homocisteí-na-metionina y folato en embarazos complicados con restricción de crecimiento intrauterino (RCIU) idiopático, a través del estudio de los niveles de ho-mocisteína pre y posparto, vitamina B12 y folato, así como las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos genéticos de enzimas que participan en la vía metabólica de la homocisteína-metionina y folato en gestantes con embarazos complicados con RCIU idiopático y en condiciones fisiológicas en embarazo normal.Materiales y métodos: estudio piloto observacio-nal analítico de tipo casos y controles. Se estudia-ron 8 gestantes con embarazos con restricción de crecimiento intrauterino idiopático y 21 gestantes control con embarazos sin complicaciones y recién nacido sano. Se analizaron las concentraciones de folato, vitamina B12 y homocisteína en el tercer trimestre de embarazo, así como los niveles de homocisteína posparto. Se determinaron los ge-notipos de las gestantes para los polimorfismos MTHFR C677T, MTHFR A1298C, MTRR A66G, CBS 844ins68, CBS VNTR31pb, CBS C699T y CBS C1080T por medio de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción (RFLP). Resultados: los polimorfismos MTHFR C677T y el genotipo 18/18 del polimorfismo CBS VNTR-31pb, de manera independiente y en coexistencia, se asociaron a niveles bajos de folato. Igualmente, el genotipo 18/18 del polimorfismo CBS VNTR-31pb, solo y cuando coexistía con el polimorfismo MTHFR C677T, se asoció con RCIU idiopático. Conclusiones: el metabolismo de la homocisteína-metionina y folato es importante para el crecimiento y desarrollo del embrión-feto. El compromiso de estas rutas metabólicas se asocia a complicaciones del embarazo como RCIU idiopático. Los resulta-dos preliminares de este estudio deben incentivar el estudio del metabolismo de la homocisteína-metionina y folato en complicaciones del embarazo como la RCIU, así como en condiciones fisiológicas en el embarazo normal en nuestra población.Q3334-345Objective:This work was aimed at evaluating the association between homocysteine-metionine and folate metabolism alteration and pregnancies complicated by idiopathic intrauterine growth restriction(IUGR). This was done by studying pre- and post-partum homocysteine, vitamin B12and folate levels, as well as allele and genotype frequency for genetic polymorphisms from enzymes participating in the homocysteine-methionine and folate metabolic route in pregnant women having pregnancies complicated by idiopathic IUGR and physiological conditions during normal pregnancy.Materials and methods: This was an analytical observational (cases and controls) pilot study. Eight pregnant women suffering IUGR were studied, as well as 21 pregnant women as control whose pregnancy had no complications and healthy newborn. Folate, vitamin and B12 homocysteine concentrations as well as postpartum homocysteine levels were analyzed during the third trimester of pregnancy. The pregnant women’s genotypes were determined formethylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T, MTHFR A1298C, methionine synthase reductase (MTRR) A66G, cystathionine beta-synthase (CBS) 844ins68, CBS 31pb VNTR, CBS C699T and CBS C1080T polymorphisms by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP).Results:MTHFR C677T polymorphisms and the CBS 31bp VNTR 18/18 genotype (independently and in coexistence) were associated with low folate levels. The CBS 31bp VNTR 18/18 genotype alone and when coexisting with MTHFR C677T was associated with idiopathic IUGR.Conclusions:Homocysteine-methionine and folate metabolism is important for embryo-fetus growth and development. Compromise of these metabolic routes is associated with pregnancy complications such as idiopathic IUGR. This study’s preliminary results should encourage studying homocysteine-methionine and folate metabolism in complications regarding pregnancy such as IUGR and in physiological conditions during normal pregnancy in our population