The research of the exhaled breath condensate to evaluate the local homeostasis in patients with pulmonary tuberculosis

The research of the exhaled breath condensate (EBC) is important in the study of a number of indicators that characterize the local homeostasis of the respiratory system. The aim of the research was to study the direction and the degree of the changes in the EBC LC-spectra of the patients with tuberculosis according to the clinical nature of the tuberculous process established certain patterns of metabolic changes of a local nature. The noninvasiveness of the laser correlation spectroscopy (LCS) method, the high sensitivity and speed of the native material research opens up the possibility of using it in phthisiology

The influence of genetic factors on clinical course and outcomes of сhronic hepatitis c and B

В огляді вітчизняної та іноземної літератури за останні 5 років представлені результати останніх досліджень процесів міжклітинної взаємодії імунокомпетентних клітин при хронічних гепатитах В та С, опосередкованих цитокінами. Розглянуті дані про функціональний поліморфізм генів цитокінів та їх рецепторів при різних соматичних захворюваннях, можливість звязку алельного поліморфізму генів цитокінів та тяжкості й наслідками вірусних гепатитів.The review of the national and foreign literature over the past 5 years describe the results of researches of processes intercellular interactions of immune cells in chronic hepatitis B and C, mediated by cytokines. There are data on functional polymorphism of cytokine genes and their receptors in various somatic diseases and the possibility of connection allelic polymorphism of cytokine genes and the severity and outcomes of viral hepatitis

Sad epochs of the national genetics

У статті простежується складний шлях вітчизняної генетичної науки протягом XX сторіччя. Детально викладені післявоєнні події у 40-х роках минулого століття, пов’язані з намаганнями зупинити розвиток генетики.The article deals with the difficult path of national genetics in the XX century. The 40-th years last century postwar events connected with genetics progress stop were considered in details

БІОФІЗИЧНА ХАРАКТЕРИСТИКА ВОЛОГИ ПОВІТРЯ, ЩО ВИДИХАЄТЬСЯ, У ХВОРИХ НА ТУБЕРКУЛЬОЗ ЛЕГЕНЬ У ДИНАМІЦІ ЛІКУВАННЯ

Волога повітря, що видихається, привертає увагу як матеріал для вивчення біологічних компонентів. Пов'язано це з тим, що конденсат вологи повітря, що видихається (КВВП), формується в альвеолах легеневої тканини і його складові відображають стан місцевого гомеостазу системи дихання. Крім того, метод отримання КВВП належить до неінвазивних, що також привертає увагудослідників.У попередніх дослідженнях нами була показана діагностична цінність методу лазерної кореляційної спектроскопії (ЛКС) у дослідженнях біофізичних властивостей КВВП при захворюваннях органів дихання

Immune status and gene polymorphism of cytokines IL-10, IL-4, TNF in patients with chronic hepatitis C depending on the degree of fibrosis

Цель – изучить полиморфизм генов IL-10 (G1082A), IL-4 (C589T) и TNFα (G308A) и показателей клеточного иммунитета (CD3+, CD4+, CD8+, CD16+, CD19+) у пациентов с хроническим гепатитом С (ХГС) и здоровых лиц, принадлежащих к этнически однородной группе жителей Одесского региона, а также выявление возможной взаимосвязи определенных генотипов и степени фиброза печени. Материал и методы. Обследовано 100 пациентов с ХГС. В группу контроля вошли 30 человек, не имеющих заболеваний гепатобилиарной системы. Использованы традиционные методы диагностики, предусмотренные действующим протоколом. Полиморфизм изучался при помощи амплификации соответствующих участков генома методом ПЦР. Структура использованных праймеров описана в базе GenBank. Оценка морфологических изменений в печени (степень активности и выраженность фибротических изменений) определяли по шкале METAVIR с использованием неинвазивного метода Fibrotest. Результаты. Установлен определенный уровень статистической значимости определенных генотипов цитокинов, показателей клеточного иммунитета и степени фиброза печени. У пациентов с гомозиготным генотипом СС IL-4 отмечаются меньшие фибротические изменения в печени, чем у носителей гомозиготного генотипа ТТ (р<0,01). У пациентов с гомозиготным генотипом GG TNFα отмечается меньшая степень фиброза печени, чем у носителей гомозиготного генотипа АА (р<0,01). У пациентов с меньшими изменениями показателей клеточного иммунитета (снижение содержания CD3+, CD4+, CD16+, CD19+) отмечается меньшая степень фиброза печени (р<0,01). У пациентов с более высоким содержанием CD8+ отмечается более выраженный фиброз печени (р<0,01). Заключение. Наличие взаимосвязи степени фиброза печени и определенных генотипов IL-4 и TNFα позволяет использовать полученную информацию как один из критериев быстроты прогрессирования фибротических процессов печени. Выраженность изменений показателей клеточного иммунитета является дополнительным критерием степени морфологических нарушений в печеночной ткани.Objectives. To study gene polymorphisms of IL-10 (G1082A), IL-4 (C589T) and TNFα (G308A) and cellular immunity indices (CD3+, CD4+, CD8+, CD16+, CD19+) in patients with chronic hepatitis C (CHC) and healthy persons belonging to the ethnically homogeneous group of the Odessa region residents, as well as to identify possible association of certain genotypes and the degree of liver fibrosis. Material and methods. The study included 100 patients with CHC. The control group consisted of 30 people having no diseases of the hepatobiliary system. Traditional diagnostic methods stipulated by the protocol in effect were used. Polymorphism was studied using amplification of the corresponding regions of the genome by PCR method. The structure of the primers used was described in the data base GenBank. The evaluation of morphological changes in the liver (the degree of activity and the severity of fibrotic changes) was made according to METAVIR scale using a noninvasive method Fibrotest. Results. A certain level of statistical significance of certain genotypes of cytokines, cellular immunity indices and the degree of liver fibrosis was established. Patients with the homozygous CC genotype IL-4 had smaller fibrotic changes in the liver compared to the carriers of the homozygous TT genotype (p<0,01). Patients with the homozygous genotype GG TNFα had a lower degree of liver fibrosis in comparison with the carriers of the homozygous genotype AA (p<0,01). Patients with smaller changes in cellular immunity indices (reduction of CD3+, CD4+, CD16+, CD19+) had a lower degree of liver fibrosis (p<0,01). Patients with higher levels of CD8 + had a higher degree of liver fibrosis (p<0,01). Conclusions. The presence of an interconnection between the degree of liver fibrosis and certain genotypes of IL-4 and TNFα allows to use the received information as a criterion of the progression speed of fibrotic processes in the liver. The expressiveness of the changes in cellular immunity indices is an additional criterion of the degree of morphological disturbances in the liver tissue

Genetic profiles of patients with chronic hepatitis C and B

Цель – провести сравнительный анализ частоты встречаемости полиморфизмов генов IL-4(C589T), IL-10(G1082A), TNFα (G308A) у пациентов с хроническим гепатитом В (ХГВ) и с хроническим гепатитом С (ХГС), проживающих в Одесском регионе, для повышения качества диагностики на основе полученных генетических критериев. Материал и методы. Полиморфизм генов цитокинов изучался при помощи амплификации соответствующих участков генома методом ПЦР. Структура использованных праймеров и параметры температурных циклов использованы из международной геномной базы данных. Результаты. В этнически однородных группах жителей Одесского региона между пациентами с хроническим гепатитом В и с хроническим гепатитом С выявлены различия по частотам аллелей гена TNFα (G308A) (р<0,05). При сравнительном анализе аллельного полиморфизма IL-4(C589T) и IL-10(G1082A) между группами пациентов с ХГС и ХГВ не обнаружено статистически значимого различия. Заключение. Существенные различия в полиморфизме генов TNFα (G308A) у пациентов с ХГС и ХГВ указывают на возможность индивидуализации генетического профиля при различных гепатитах. Отсутствие существенной разницы частоты генотипов IL-4(C589T) и IL-10(G1082A) может служить подтверждением важной роли этих цитокинов в иммунологическом сегменте генетического профиля пациентов.To conduct a comparative analysis of the frequency of polymorphisms of IL-4 (C589T), IL-10 (G1082A), TNFα (G308A) in patients with chronic hepatitis B (CHB) and chronic hepatitis C (CHC), residing in Odessa region for the improvement of the diagnosis quality on the basis of the obtained genetic criteria. Material and methods. Cytokine gene polymorphism was studied using amplification of the corresponding regions of the genome by PCR method. The structure of the primers used and the parameters of temperature cycles were employed from the international genomic data base. Results. The differences in allele frequencies of TNFα gene (G308A) (p<0,05) were revealed in ethnically homogeneous groups of the inhabitants of Odessa region among patients with chronic hepatitis B and chronic hepatitis C. The comparative analysis of allelic polymorphism of IL-4 (C589T) and IL-10 (G1082A) in patients with CHC and CHB didn’t show any statistically significant difference between them. Conclusions. Significant differences in gene polymorphism of TNFα (G308A) in patients with CHC and CHB indicate the possibility of genetic profile individualization in different hepatites. Thus, the absence of significant difference in the frequency of genotypes of IL-4 (C589T) and IL-10 (G1082A) can serve as a confirmation of the important role of these cytokines in the immunological genetic profile segment of patients

Application of whole genome sequencing of m. tuberculosis in practical epidemiology of tuberculosis

Відстеження контактів разом з генотипуванням є важливими засобами з’ясування передачі туберкульозу (ТБ) від людини до людини. Роль і місце повного секвенування геному (ПСГ) M. tuberculosis в епідеміологічних дослідженнях, особливо напопуляційному рівні та у різних груп ризику вивчені недостатньо. Цей систематизований огляд має за мету визначити чутливість і специфічність ПСГ для виявлення недавньої передачі ТБ з використанням звичайної епідеміології як «золотого стандарту» і дослідити, чи ПСГ ідентифікує раніше незафіксовані факти передачі. Систематизований огляд був проведений відповідно до критеріїв бажаних елементів звітності для систематизованих оглядів і метааналітичних досліджень. Змішана стратегія пошуку була розроблена для виявлення всіх відповідних досліджень, опублікованих в період з 01.01.2005 по 30.11.2014 з використанням трьох баз даних у мережі Інтернет. Публікації, що відповідали спеціальним критеріям, були виявлені та їх дані були використані в огляді. Загалом було включено 12 публікацій. Установлено, що ПСГ має більш високу дискримінаційну здатність порівняно зі звичайними методами генотипування та виявляє випадки передачі, які були прогаяні епідеміологічними дослідженнями. Генетична відстань < 6 SNP (однонуклеотидних поліморфізмів) між ізолятами є прогностичним показником нещодавньої передачі збудника ТБ. Жодне з досліджень не проводилося шляхом прямого порівняння між ПСГ і звичайним генотипуванням з використанням невибіркового проспективного збору ізолятів. Були запропоновані мінімальні критерії звітності та параметри контролю якості для вивчення ПСГ.Contact tracing complemented with genotyping is considered an important means of understanding person-to-person transmission of tuberculosis (TB). It still remains unclear whether Whole Genome Sequencing (WGS) of M. tuberculosis can rule in transmission and how it performs in different human populations, risk groups and across TB lineages. This systematic review aimed to determine the sensitivity and specificity of WGS for detection of recent transmission using conventional epidemiology as the gold standard and investigate if WGS identifies previously undetected transmission events. Systematic review was conducted according to the criteria of the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses group. A compound search strategy was developed to identify all relevant studies published between 01/01/2005 and 30/11/2014 using three online databases. Publications satisfying specific criteria have been identified and data extracted. A total of 12 publications were included. We established that WGS has a higher discriminatory power compared to conventional genotyping and detects transmission events missed by epidemiological investigations. A cut-off value of <6 SNPs between isolates may predict recent transmission. None of the studies performed a head-to-head comparison between WGS and conventional genotyping using unselected prospectively collected isolates. Minimum reporting criteria for WGS studies have been proposed and quality control parameters considered

Diagnosing pneumonia by analyzing changes in the subfractional composition of the condensate moisture of exhaled air

Изучение соотношения макромолекулярных фракций конденсата влажности выдыхаемого воздуха (КВВВ) у детей, больных пневмонией, позволяет установить направленность и выраженность адаптационных сдвигов гомеостаза тканей органов дыхания при наличии острого патологического процесса. В спектр КВВВ детей, больных пневмонией, основной вклад (87,0 %) вносят частицы размером 1–100 нм. Кроме того, в спектре КВВВ больных пневмонией детей появляются низкомолекулярные частицы размерами от 26 до 100 нм и среднемолекулярные частицы размерами от 101 до 290 нм, которые полностью отсутствуют у здоровых детей. От общего количества всех частиц они составляют 11,6 и 10,2 % соответственно для низкомолекулярного и среднемолекулярного диапазонов. Указанные изменения в ЛК-спектрах КВВВ у больных детей можно объяснить процессами экссудации и выходом с жидкостью мелких молекулярных частиц, в том числе альбуминов крови. Это подтверждает наличие острого воспалительного процесса и может служить диагностическим признаком при распознавании пневмонии.Earlier it was shown that the biophysical properties of condensed moisture of exhale air (CMEA) depends on the functional stress in respiratory system. In this regard, both scientific and practical interest are to study the characteristics of the macromolecular structure of CMEA in the presence an acute inflammatory process in the airways.There were examined two groups of children — healthy (15 people) and patients with pneumonia (24 people) aged 6 to 10 years. CMEA samples were researched by laser correlation spectroscopy (LCS). In CMEA spectrum of childhood pneumonia, the main contribution — 87.0% — comes from particles of 1–100 nm. Moreover, in CMEA spectrums of children with pneumonia particles with size of 26 to 100 nm and with size of 101 to 290 nm appear. These particles are completely absent in healthy children. Of the total number of all particles, these particles make up 11.6% and 10.2% respectively. These changes in CMEA spectra of sick children can be explained by processes of exudation and liquid yield small molecular species, including albumin. The composition of CMEA according to the LCS data has some differences in healthy and sick children with pneumonia. The appearance of particles with size of 26 to 290 nm in CMEA of children with pneumonia confirms intoxication process according to the semiotic classifier that are observed in diseases of pneumonia and can serve as a diagnostic feature

Распространенность и особенность течения туберкулезной инфекции у некоторых позвоночных (филогенетические параллели)

Приводятся литературные сведения относительно распространенности разновидностей микобактерий у низших позвоночных. Характеризуются разные звенья механизма микобактериоза в зависимости от степени развития нервной, иммунной и эндокринной систем.There presented literature data about prevalence of different types of mycobacteria in lowest vertebrates. Different links of mycobacteriosis mechanism depending of the degree of the nervous, immune and endocrine system are characterized

Особенности сенсибилизации к мажорным и минорным компонентам сорных трав у больных с поллинозами и прогнозирование эффективности назначения аллерген-специфической иммунотерапии

Определяли сенсибилизацию к мажорным и минорным компонентам аллергенов сорных трав (амборзия, полынь) у 302 человек в возрасте от 18 до 54 лет с жалобами на сезонный аллергический ринит (АР) и конъюнктивит (АК) в период с конца июля до конца сентября (период цветения сорных трав в Одесской области, Украина) с помощью технологии ImmunoCAP (Phadia). Cенсибилизацию к мажорному компоненту амброзии (w230 – nAmb a 1) выявили у 281 пациента (87,1%), к мажорному компоненту полыни (w231 – nArt v 1), у 83 (24,7 %) пациентов. Сочетанная сенсибилизация к мажорным компонентам обоих аллергенов отмечалась у 74 (24,5%) обследуемых