Impact of infection on proteome-wide glycosylation revealed by distinct signatures for bacterial and viral pathogens

Mechanisms of infection and pathogenesis have predominantly been studied based on differential gene or protein expression. Less is known about posttranslational modifications, which are essential for protein functional diversity. We applied an innovative glycoproteomics method to study the systemic proteome-wide glycosylation in response to infection. The protein site-specific glycosylation was characterized in plasma derived from well-defined controls and patients. We found 3862 unique features, of which we identified 463 distinct intact glycopeptides, that could be mapped to more than 30 different proteins. Statistical analyses were used to derive a glycopeptide signature that enabled significant differentiation between patients with a bacterial or viral infection. Furthermore, supported by a machine learning algorithm, we demonstrated the ability to identify the causative pathogens based on the distinctive host blood plasma glycopeptide signatures. These results illustrate that glycoproteomics holds enormous potential as an innovative approach to improve the interpretation of relevant biological changes in response to infection

Relationship between molecular pathogen detection and clinical disease in febrile children across Europe: a multicentre, prospective observational study

BackgroundThe PERFORM study aimed to understand causes of febrile childhood illness by comparing molecular pathogen detection with current clinical practice.MethodsFebrile children and controls were recruited on presentation to hospital in 9 European countries 2016-2020. Each child was assigned a standardized diagnostic category based on retrospective review of local clinical and microbiological data. Subsequently, centralised molecular tests (CMTs) for 19 respiratory and 27 blood pathogens were performed.FindingsOf 4611 febrile children, 643 (14%) were classified as definite bacterial infection (DB), 491 (11%) as definite viral infection (DV), and 3477 (75%) had uncertain aetiology. 1061 controls without infection were recruited. CMTs detected blood bacteria more frequently in DB than DV cases for N. meningitidis (OR: 3.37, 95% CI: 1.92-5.99), S. pneumoniae (OR: 3.89, 95% CI: 2.07-7.59), Group A streptococcus (OR 2.73, 95% CI 1.13-6.09) and E. coli (OR 2.7, 95% CI 1.02-6.71). Respiratory viruses were more common in febrile children than controls, but only influenza A (OR 0.24, 95% CI 0.11-0.46), influenza B (OR 0.12, 95% CI 0.02-0.37) and RSV (OR 0.16, 95% CI: 0.06-0.36) were less common in DB than DV cases. Of 16 blood viruses, enterovirus (OR 0.43, 95% CI 0.23-0.72) and EBV (OR 0.71, 95% CI 0.56-0.90) were detected less often in DB than DV cases. Combined local diagnostics and CMTs respectively detected blood viruses and respiratory viruses in 360 (56%) and 161 (25%) of DB cases, and virus detection ruled-out bacterial infection poorly, with predictive values of 0.64 and 0.68 respectively.InterpretationMost febrile children cannot be conclusively defined as having bacterial or viral infection when molecular tests supplement conventional approaches. Viruses are detected in most patients with bacterial infections, and the clinical value of individual pathogen detection in determining treatment is low. New approaches are needed to help determine which febrile children require antibiotics.FundingEU Horizon 2020 grant 668303

Genomic investigations of unexplained acute hepatitis in children

Since its first identification in Scotland, over 1,000 cases of unexplained paediatric hepatitis in children have been reported worldwide, including 278 cases in the UK1. Here we report an investigation of 38 cases, 66 age-matched immunocompetent controls and 21 immunocompromised comparator participants, using a combination of genomic, transcriptomic, proteomic and immunohistochemical methods. We detected high levels of adeno-associated virus 2 (AAV2) DNA in the liver, blood, plasma or stool from 27 of 28 cases. We found low levels of adenovirus (HAdV) and human herpesvirus 6B (HHV-6B) in 23 of 31 and 16 of 23, respectively, of the cases tested. By contrast, AAV2 was infrequently detected and at low titre in the blood or the liver from control children with HAdV, even when profoundly immunosuppressed. AAV2, HAdV and HHV-6 phylogeny excluded the emergence of novel strains in cases. Histological analyses of explanted livers showed enrichment for T cells and B lineage cells. Proteomic comparison of liver tissue from cases and healthy controls identified increased expression of HLA class 2, immunoglobulin variable regions and complement proteins. HAdV and AAV2 proteins were not detected in the livers. Instead, we identified AAV2 DNA complexes reflecting both HAdV-mediated and HHV-6B-mediated replication. We hypothesize that high levels of abnormal AAV2 replication products aided by HAdV and, in severe cases, HHV-6B may have triggered immune-mediated hepatic disease in genetically and immunologically predisposed children

Experiencias situadas: Reflexiones en el marco de un proyecto de extensión en artes en territorios serranos

El presente artículo busca relatar la experiencia del equipo de extensión en Artes “Minga!! Ponele Pastón” durante el período comprendido entre septiembre del 2020 y abril del 2021. El territorio de acción del proyecto se enmarca en la región “centro” del eje punillano, comprendida entre la Comuna de Casa Grande, Molinari y El Balcón de Punilla. Es fundamental destacar que las actividades extensionistas se han realizado durante el contexto del Aislamiento Social, Preventivo y Obligatorio (ASPO) y durante la emergencia ambiental por los incendios serranos de los meses de agosto, septiembre y octubre del 2020. Estos complejos y duros devenires, han modificado de forma radical el contexto de acción del equipo, requiriendo nuevas estrategias de acercamiento y vinculación con el contexto. Sobre todo agudizando las dimensiones de abordaje y observación, desde donde se posiciona y acciona el proyecto, comprendidas desde perspectivas biopolíticas.Fil: Estarellas, Natalia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Centro de Producción e Investigación en Arte; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Martina, Emiliana Belen. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Diseño; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Barral, Marisol. Universidad Nacional de las Artes; ArgentinaFil: Díaz, Julieta María. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes; ArgentinaFil: Moyano Cortéz, Hernán Nehuén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes; Argentin

Caracterización y evaluación de la ejecución de las capas ultrafinas

La caracterización de las mezclas ultrafinas (AUTL) debe realizarse considerando el sistema global constituido por la propia mezcla y su adherencia a la capa soporte. Para poder llevar a cabo su caracterización en este sentido, el Laboratorio de Caminos de la Universitat Politècnica de Catalunya ha desarrollado un nuevo ensayo, de forma que puedan ensayarse probetas formadas por dos capas (ultrafina y soporte), obtenidas a partir de una probeta o un testigo cilíndrico extraído de la obra realizada. Se han propuesto dos configuraciones de ensayo, una dirigida a la evaluación de la resistencia a la fisuración del sistema aplicado y otra dirigida a valorar su adherencia. Estas configuraciones son una variante del ensayo Fénix y, como éste, se basan en someter la mezcla a evaluar a un proceso de carga por tensión para valorar la resistencia a la fisuración de la capa fina o su despegue de la capa soporte, así como las energías asociadas a ambos procesos, a diferentes temperaturas. En este trabajo se recogen los primeros resultados obtenidos para evaluar el comportamiento de diferentes mezclas AUTL, tanto sobre testigos extraídos de un tramo experimental, como sobre probetas fabricadas en el laboratorio con el compactador de rodillo metálico; en este último caso, los ensayos se han realizado en tres laboratorios diferentes: Campezo, Padecasa y el Laboratorio de Caminos de la UPC, coordinados por éste último, con objeto de evaluar la reproducibilidad del ensayo.Postprint (published version

III Cuadernillo de Extensión en Artes : reivindicar el encuentro imaginar el futuro

Una vez más nos encontramos presentando los Cuadernillos de Extensión en Artes, orgulloses y felices de ver en ellos una publicación que se sostiene y consolida en el tiempo. Los Cuadernillos iniciaron en el año 2019 como una propuesta de sistematización y visibilización de proyectos de extensión. Los objetivos eran difundir lo que hacíamos, dotar de legitimidad nuestras prácticas, construir consensos colectivos respecto de la extensión para que sirva como insumo para trabajar y dialogar en las cátedras. Hoy presentamos esta tercera edición y logramos ver el camino recorrido. Un camino colectivo, una cantidad de docentes, estudiantes y egresades que se sumaron a la tarea de sostener esta publicación y con ella la multiplicación de proyectos, contribuyendo a la jerarquización de la extensión. Los cuadernillos de extensión hoy son parte de la bibliografía de algunas cátedras, son recuperados para hablar de extensión en artes con les estudiantes, son citados en diversos proyectos y artículos de análisis de experiencias. Todo ello nos deja un saldo más que positivo de este proceso transitado en estos tres años, un proceso que debe dar su salto cualitativo para seguir creciendo y consolidándose.Fil: Rinero, Lucia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Cine y Televisión; Argentina

IV Cuadernillo de Extensión en Artes : la imaginación frente a la contingencia: andares colectivos

Como casi siempre, al asomarnos a una nueva lectura se nos ofrece la posibilidad de un viaje. Un viaje que nos invita a alimentar nuestros propios andares a partir de lo que nos cuentan de otros mundos, de otros encuentros, de otres. Esta vez no haremos la excepción. Les invitamos a subirse a este colectivo que reúne una diversidad de voces y miradas. Desde una butaca, el pasillo, el fondo o adelante, en soledad o acompañades, pueden pasar, un poquito más acá, acérquense que hay lugar, en ronda o en fila como prefieran, búsquense un lugarcito cómodo desde donde poder escuchar; pero sabiendo también que al sumergirse en las experiencias y reflexiones que aquí compartimos, el convite es también a tomar la palabra. El viaje al que les invitamos con la cuarta edición del Cuadernillo de Extensión en Artes tiene varias particularidades que conocemos y otras que seguramente sobrevendrán en las subjetividades de cada une de ustedes. Entre las particularidades que conocemos, podemos contarles el qué, de qué se trata, cuáles son las articulaciones que le dan forma y sentidos y que hoy se integran dando testimonio, como si se tratase de una fotografía instantánea que sintetiza el trabajo de todo un año. Este cuadernillo reúne un conjunto de narraciones y reflexiones sobre los andares colectivos transcurridos desde y en el tiempo extraordinario de la pandemia. Escritos realizados en un tiempo que seguramente recordaremos con la preponderancia de la incertidumbre y el dolor que trajo consigo, a lo que se suman las desigualdades que sabemos que nos deja aún sin haberse retirado del todo. Sin embargo, casi alardeando la militancia del optimismo que alimenta los encuentros donde transformarnos junto a otres, aquí hacemos foco en la imaginación. La pandemia nos puso en la exigencia ineludible de repensar estructuralmente las prácticas extensionistas. Así como en otros ámbitos debimos redefinir las estrategias pedagógicas, las urgencias vitales, las vinculares, las laborales, las ambientales y demás esferas de la vida social. Rondas, redes y tramas son imágenes que metaforizan asiduamente nuestros modos de encuentro y creación. El compartir cercano, físico, presencial, grupal, con abrazos, mates y criollos, debió ser reinventado para que pudiera seguir siendo próximo pero también seguro. Asimismo, el aislamiento fue un tiempo para revisitar otros viajes anteriores y afianzar los sentidos de los mismos, incluso construir nuevas lecturas sobre estos. Nos enfocamos en recuperar y reivindicar esos esfuerzos. Los esfuerzos de unes por imaginar e inventar estrategias que pudieran desafiar la contingencia; así como los esfuerzos de otres de sobreponerse a la parálisis del aislamiento insuflándole potencia productiva a la intimidad reflexiva. De allí que en esta edición, el cuadernillo reúne un conjunto de escritos que, como planos detalles de una película, nos adentran en las particularidades del desarrollo de algunas experiencias, en la problematización de la curricularización de la extensión, en la politicidad de las prácticas y perspectivas extensionistas, etc. y en conjunto pueden dar cuenta –como en un plano general- de la complejidad que resulta de la trama de relaciones y participaciones diversas.Cáceres, María Alicia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Cine y Televisión; Argentina.Rinero, Lucía. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Cine y Televisión; Argentina.Albretch, Micaela. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Secretaría de Extensión; Argentina.Alessio, Guillermo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Artes Visuales; Argentina.Galleti Baldi, Clara. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Artes Visuales; Argentina.Cavanagh, Inés. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Teatro; Argentina.Del Val, Mariana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Secretaría de Extensión; Argentina.De la Horra, Ana E. Universidad Nacional de Córdoba. Colegio Nacional de Monserrat. Área de Extensión; Argentina.Gazal Chalhub, Octavio. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes; Argentina.Grill, Judith. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Artes Visuales; Argentina.Moyano Cortéz, Nehuén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Artes Visuales; Argentina.Osorio, Griselda. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Artes Visuales; Argentina.Sarmiento, Andrea. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Artes. Departamento Académico de Música; Argentina

Emergency medical services utilisation among febrile children attending emergency departments across Europe: an observational multicentre study

Abstract Children constitute 6–10% of all patients attending the emergency department (ED) by emergency medical services (EMS). However, discordant EMS use in children occurs in 37–61% with fever as an important risk factor. We aimed to describe EMS utilisation among febrile children attending European EDs. This study is part of an observational multicentre study assessing management and outcome in febrile children up to 18 years (MOFICHE) attending twelve EDs in eight European countries. Discordant EMS use was defined as the absence of markers of urgency including intermediate/high triage urgency, advanced diagnostics, treatment, and admission in children transferred by EMS. Multivariable logistic regression analyses were performed for the association between (1) EMS use and markers of urgency, and (2) patient characteristics and discordant EMS use after adjusting all analyses for the covariates age, gender, visiting hours, presenting symptoms, and ED setting. A total of 5464 (15%, range 0.1–42%) children attended the ED by EMS. Markers of urgency were more frequently present in the EMS group compared with the non-EMS group. Discordant EMS use occurred in 1601 children (29%, range 1–59%). Age and gender were not associated with discordant EMS use, whereas neurological symptoms were associated with less discordant EMS use (aOR 0.2, 95%CI 0.1–0.2), and attendance out of office hours was associated with more discordant EMS use (aOR 1.6, 95%CI 1.4–1.9). Settings with higher percentage of self-referrals to the ED had more discordant EMS use (p &lt; 0.05).  Conclusion: There is large practice variation in EMS use in febrile children attending European EDs. Markers of urgency were more frequently present in children in the EMS group. However, discordant EMS use occurred in 29%. Further research is needed on non-medical factors influencing discordant EMS use in febrile children across Europe, so that pre-emptive strategies can be implemented. What is Known: •Children constitute around 6–10% of all patients attending the emergency department by emergency medical services. •Discordant EMS use occurs in 37–61% of all children, with fever as most common presenting symptom for discordant EMS use in children. What is New: •There is large practice variation in EMS use among febrile children across Europe with discordance EMS use occurring in 29% (range 1–59%), which was associated with attendance during out of office hours and with settings with higher percentage of self-referrals to the ED. •Future research is needed focusing on non-medical factors (socioeconomic status, parental preferences and past experience, healthcare systems, referral pathways, out of hours services provision) that influence discordant EMS use in febrile children across Europe. </jats:p