168 research outputs found
Darkâdark and darkâbright soliton interactions in the two-component defocusing nonlinear Schrödinger equation
We use the Inverse Scattering Transform machinery to construct multisoliton solutions to the 2-component defocusing nonlinear Schrodinger equation. Such solutions include darkâdark solitons, which have dark solitonic behaviour in both components, as well as darkâbright soliton solutions, with one dark and one bright component. We then derive the explicit expressions of two soliton solutions for all possible cases: two darkâdark solitons, two darkâbright solitons, and one darkâdark and one darkâbright soliton. Finally, we determine the long-time asymptotic behaviours of these solutions, which allows us to obtain explicit expressions for the shifts in the phases and in the soliton centers due to the interactions
Expression signatures of cisplatin- and trametinib-treated early-stage medaka melanomas
Small aquarium fish models provide useful systems not only for a better understanding of the molecular basis of many human diseases, but also for first-line screening to identify new drug candidates. For testing new chemical substances, current strategies mostly rely on easy to perform and efficient embryonic screens. Cancer, however, is a disease that develops mainly during juvenile and adult stage. Long-term treatment and the challenge to monitor changes in tumor phenotype make testing of large chemical libraries in juvenile and adult animals cost prohibitive. We hypothesized that changes in the gene expression profile should occur early during anti-tumor treatment, and the disease-associated transcriptional change should provide a reliable readout that can be utilized to evaluate drug-induced effects. For the current study, we used a previously established medaka melanoma model. As proof of principle, we showed that exposure of melanoma developing fish to the drugs cisplatin or trametinib, known cancer therapies, for a period of seven days is sufficient to detect treatment-induced changes in gene expression. By examining whole body transcriptome responses we provide a novel route toward gene panels that recapitulate anti-tumor outcomes thus allowing a screening of thousands of drugs using a whole-body vertebrate model. Our results suggest that using disease-associated transcriptional change to screen therapeutic molecules in small fish model is viable and may be applied to pre-clinical research and development stages in new drug discovery
Validierung innerklinischer Sichtungsalgorithmen fĂŒr den Massenanfall von Verletzten
Background
In the event of a mass casualty incident (MCI), the situation-related shortage of medical resources does not end when the patients are transported from the scene of the incident. Consequently, an initial triage is required in the receiving hospitals. In the first step, the aim of this study was to create a reference patient vignette set with defined triage categories. This allowed a computer-aided evaluation of the diagnostic quality of triage algorithms for MCI situations in the second step.
Methods
A total of 250 case vignettes validated in practice were entered into a multistage evaluation process by initially 6 and later 36 triage experts. This algorithmâindependent expert evaluation of all vignettesâserved as the gold standard for analyzing the diagnostic quality of the following triage algorithms: Manchester triage system (MTS module MCI), emergency severity index (ESI), Berlin triage algorithm (BER), the prehospital algorithms PRIOR and mSTaRT, and two project algorithms from a cooperation between the Federal Office of Civil Protection and Disaster Assistance (BBK) and the Hashemite Kingdom of Jordanâintrahospital Jordanian-German project algorithm (JorD) and prehospital triage algorithm (PETRA). Each patient vignette underwent computerized triage through all specified algorithms to obtain comparative test quality outcomes.
Results
Of the original 250 vignettes, a triage reference database of 210 patient vignettes was validated independently of the algorithms. These formed the gold standard for comparison of the triage algorithms analyzed. Sensitivities for intrahospital detection of patients in triage category T1 ranged from 1.0 (BER, JorD, PRIOR) to 0.57 (MCI module MTS). Specificities ranged from 0.99 (MTS and PETRA) to 0.67 (PRIOR). Considering Youdenâs index, BER (0.89) and JorD (0.88) had the best overall performance for detecting patients in triage category T1. Overtriage was most likely with PRIOR, and undertriage with the MCI module of MTS. Up to a decision for category T1, the algorithms require the following numbers of steps given as the median and interquartile range (IQR): ESI 1 (1â2), JorD 1 (1â4), PRIOR 3 (2â4), BER 3 (2â6), mSTaRT 3 (3â5), MTS 4 (4â5) and PETRA 6 (6â8). For the T2 and T3 categories the number of steps until a decision and the test quality of the algorithms are positively interrelated.
Conclusion
In the present study, transferability of preclinical algorithm-based primary triage results to clinical algorithm-based secondary triage results was demonstrated. The highest diagnostic quality for secondary triage was provided by the Berlin triage algorithm, followed by the Jordanian-German project algorithm for hospitals, which, however, also require the most algorithm steps until a decision
Grundlinien der Wirtschaftsentwicklung 2010/2011
Das DIW Berlin rechnet fĂŒr 2010 und 2011 mit einem Wirtschaftswachstum von jeweils rund zwei Prozent. MaĂgebliche TriebkrĂ€fte kommen von der Binnennachfrage, die - mit Ausnahme der Unternehmensinvestitionen - in groĂem Umfang durch staatliche Stabilisierungsprogramme sowie durch die automatischen Stabilisatoren gestĂŒtzt wird. Die wichtigste SĂ€ule bildet der private Verbrauch, der von betrĂ€chtlichen KaufkraftzuwĂ€chsen der privaten Haushalte profitiert. FĂŒr die Exporte ist zunĂ€chst noch mit keiner krĂ€ftigen Erholung zu rechnen. Die deutschen Ausfuhren dĂŒrften aufgrund der Spezialisierung auf InvestitionsgĂŒter und des noch relativ geringen Marktanteils in den Wachstumszentren der Weltwirtschaft nur mit Verzögerung - und damit erst im nĂ€chsten Jahr - deutlicher am weltwirtschaftlichen Aufschwung teilhaben. Die Zahl der Arbeitslosen wird im kommenden Jahr zwar die Vier-Millionen-Marke ĂŒbersteigen, angesichts der vorausgegangenen ProduktionseinbrĂŒche fĂ€llt der BeschĂ€ftigungsrĂŒckgang jedoch vergleichsweise schwach aus. Ermöglicht wird dies durch eine schwache ProduktivitĂ€tsentwicklung und eine nur allmĂ€hliche Normalisierung der geleisteten Arbeitszeit. Gleichzeitig bleiben die Preise mit einer Inflationsrate um ein Prozent weitgehend stabil. Voraussetzung hierfĂŒr ist jedoch eine Beruhigung auf den RohstoffmĂ€rkten, die in der Prognose unterstellt ist. Insgesamt sind die RĂŒckschlĂ€ge durch die schwere Wirtschaftskrise indes noch nicht ĂŒberwunden: Erst gegen Ende 2011 dĂŒrfte die Wirtschaftskraft Deutschlands wieder an den Wert von Mitte 2008 und damit an das Niveau vor den dramatischen ProduktionseinbrĂŒchen heranreichen. Das entspricht rein rechnerisch mehr als drei Jahren mit Nullwachstum. In der Geldpolitik stellt sich die Frage nach dem richtigen Zeitpunkt fĂŒr einen Ausstieg aus dem expansiven Kurs. Angesichts der noch bestehenden Unsicherheiten bezĂŒglich der weiteren konjunkturellen Erholung und der Nachhaltigkeit der Finanzmarktstabilisierung ist eine nur allmĂ€hliche RĂŒckfĂŒhrung der ĂŒbermĂ€Ăigen LiquiditĂ€tsversorgung empfehlenswert - zumal das PreisstabilitĂ€tsziel derzeit nicht gefĂ€hrdet ist. Die Haushalts- und Finanzpolitik der Bundesregierung ist kritisch zu bewerten: Die Vorhaben der Bundesregierung - Abgabensenkung, Steuerreform, Gesundheitsreform und Einhaltung der Schuldenbremse ab 2016 - mögen fĂŒr sich genommen jeweils eine gewisse BegrĂŒndung haben, als Ganzes betrachtet sind diese MaĂnahmen jedoch nicht gleichzeitig realisierbar. Diese WidersprĂŒchlichkeit in der Wirtschaftspolitik kann erheblich zur Verunsicherung der privaten Haushalte und der Unternehmen beitragen. Hier wĂ€ren eine stĂ€rkere PrioritĂ€tensetzung und eine klarere Gesamtkonzeption dringend geboten
Comparative Genomic Analysis of the Class \u3ci\u3eEpsilonproteobacteria\u3c/i\u3e and Proposed Reclassification to Epsilonbacteraeota (phyl. nov.)
The Epsilonproteobacteria is the fifth validly described class of the phylum Proteobacteria, known primarily for clinical relevance and for chemolithotrophy in various terrestrial and marine environments, including deep-sea hydrothermal vents. As 16S rRNA gene repositories have expanded and protein marker analysis become more common, the phylogenetic placement of this class has become less certain. A number of recent analyses of the bacterial tree of life using both 16S rRNA and concatenated marker gene analyses have failed to recover the Epsilonproteobacteria as monophyletic with all other classes of Proteobacteria. In order to address this issue, we investigated the phylogenetic placement of this class in the bacterial domain using 16S and 23S rRNA genes, as well as 120 single-copy marker proteins. Single- and concatenated-marker trees were created using a data set of 4,170 bacterial representatives, including 98 Epsilonproteobacteria. Phylogenies were inferred under a variety of tree building methods, with sequential jackknifing of outgroup phyla to ensure robustness of phylogenetic affiliations under differing combinations of bacterial genomes. Based on the assessment of nearly 300 phylogenetic tree topologies, we conclude that the continued inclusion of Epsilonproteobacteria within the Proteobacteria is not warranted, and that this group should be reassigned to a novel phylum for which we propose the name Epsilonbacteraeota (phyl. nov.). We further recommend the reclassification of the order Desulfurellales (Deltaproteobacteria) to a novel class within this phylum and a number of subordinate changes to ensure consistency with the genome-based phylogeny. Phylogenomic analysis of 658 genomes belonging to the newly proposed Epsilonbacteraeota suggests that the ancestor of this phylum was an autotrophic, motile, thermophilic chemolithotroph that likely assimilated nitrogen from ammonium taken up from the environment or generated from environmental nitrate and nitrite by employing a variety of functional redox modules. The emergence of chemoorganoheterotrophic lifestyles in several Epsilonbacteraeota families is the result of multiple independent losses of various ancestral chemolithoautotrophic pathways. Our proposed reclassification of this group resolves an important anomaly in bacterial systematics and ensures that the taxonomy of Proteobacteria remains robust, specifically as genome-based taxonomies become more common
Grundlinien der Wirtschaftsentwicklung 2010/2011
Das DIW Berlin rechnet fĂŒr 2010 und 2011 mit einem Wirtschaftswachstum von jeweils rund zwei Prozent. MaĂgebliche TriebkrĂ€fte kommen von der Binnennachfrage, die - mit Ausnahme der Unternehmensinvestitionen - in groĂem Umfang durch staatliche Stabilisierungsprogramme sowie durch die automatischen Stabilisatoren gestĂŒtzt wird. Die wichtigste SĂ€ule bildet der private Verbrauch, der von betrĂ€chtlichen KaufkraftzuwĂ€chsen der privaten Haushalte profitiert. FĂŒr die Exporte ist zunĂ€chst noch mit keiner krĂ€ftigen Erholung zu rechnen. Die deutschen Ausfuhren dĂŒrften aufgrund der Spezialisierung auf InvestitionsgĂŒter und des noch relativ geringen Marktanteils in den Wachstumszentren der Weltwirtschaft nur mit Verzögerung - und damit erst im nĂ€chsten Jahr - deutlicher am weltwirtschaftlichen Aufschwung teilhaben. Die Zahl der Arbeitslosen wird im kommenden Jahr zwar die Vier-Millionen-Marke ĂŒbersteigen, angesichts der vorausgegangenen ProduktionseinbrĂŒche fĂ€llt der BeschĂ€ftigungsrĂŒckgang jedoch vergleichsweise schwach aus. Ermöglicht wird dies durch eine schwache ProduktivitĂ€tsentwicklung und eine nur allmĂ€hliche Normalisierung der geleisteten Arbeitszeit. Gleichzeitig bleiben die Preise mit einer Inflationsrate um ein Prozent weitgehend stabil. Voraussetzung hierfĂŒr ist jedoch eine Beruhigung auf den RohstoffmĂ€rkten, die in der Prognose unterstellt ist. Insgesamt sind die RĂŒckschlĂ€ge durch die schwere Wirtschaftskrise indes noch nicht ĂŒberwunden: Erst gegen Ende 2011 dĂŒrfte die Wirtschaftskraft Deutschlands wieder an den Wert von Mitte 2008 und damit an das Niveau vor den dramatischen ProduktionseinbrĂŒchen heranreichen. Das entspricht rein rechnerisch mehr als drei Jahren mit Nullwachstum. In der Geldpolitik stellt sich die Frage nach dem richtigen Zeitpunkt fĂŒr einen Ausstieg aus dem expansiven Kurs. Angesichts der noch bestehenden Unsicherheiten bezĂŒglich der weiteren konjunkturellen Erholung und der Nachhaltigkeit der Finanzmarktstabilisierung ist eine nur allmĂ€hliche RĂŒckfĂŒhrung der ĂŒbermĂ€Ăigen LiquiditĂ€tsversorgung empfehlenswert - zumal das PreisstabilitĂ€tsziel derzeit nicht gefĂ€hrdet ist. Die Haushalts- und Finanzpolitik der Bundesregierung ist kritisch zu bewerten: Die Vorhaben der Bundesregierung - Abgabensenkung, Steuerreform, Gesundheitsreform und Einhaltung der Schuldenbremse ab 2016 - mögen fĂŒr sich genommen jeweils eine gewisse BegrĂŒndung haben, als Ganzes betrachtet sind diese MaĂnahmen jedoch nicht gleichzeitig realisierbar. Diese WidersprĂŒchlichkeit in der Wirtschaftspolitik kann erheblich zur Verunsicherung der privaten Haushalte und der Unternehmen beitragen. Hier wĂ€ren eine stĂ€rkere PrioritĂ€tensetzung und eine klarere Gesamtkonzeption dringend geboten.Economic outlook, Business cycle forecast
Distributing CV entanglement over 4 co-propagating orthogonal modes
We propose a scheme for distributing continuous variable entanglement
originally established among a pair of mode between a set of four orthogonal
co-propagating modes. This is accomplished by exploiting the possibility of
coupling polarization with optical angular momentum provided by the q-plate.
Here we present the principle of the proposed scheme with a short feasibility
study that shows that the four-modes covariance matrix at the scheme output
represent an entangled multi mode system.Comment: 8 pages, 1 figur
Engineering of a complex bone tissue model with endothelialised channels and capillary-like networks
In engineering of tissue analogues, upscaling to clinically-relevant sized constructs remains a significant challenge. The successful integration of a vascular network throughout the engineered tissue is anticipated to overcome the lack of nutrient and oxygen supply to residing cells. This work aimed at developing a multiscale bone-tissue-specific vascularisation strategy.
Engineering pre-vascularised bone leads to biological and fabrication dilemmas. To fabricate channels endowed with an endothelium and suitable for osteogenesis, rather stiff materials are preferable, while capillarisation requires soft matrices. To overcome this challenge, gelatine-methacryloyl hydrogels were tailored by changing the degree of functionalisation to allow for cell spreading within the hydrogel, while still enabling endothelialisation on the hydrogel surface.
An additional challenge was the combination of the multiple required cell-types within one biomaterial, sharing the same culture medium. Consequently, a new medium composition was investigated that simultaneously allowed for endothelialisation, capillarisation and osteogenesis. Integrated multipotent mesenchymal stromal cells, which give rise to pericyte-like and osteogenic cells, and endothelial-colony-forming cells (ECFCs) which form capillaries and endothelium, were used.
Based on the aforementioned optimisation, a construct of 8 à 8 à 3 mm, with a central channel of 600 ”m in diameter, was engineered. In this construct, ECFCs covered the channel with endothelium and osteogenic cells resided in the hydrogel, adjacent to self-assembled capillary-like networks. This study showed the promise of engineering complex tissue constructs by means of human primary cells, paving the way for scaling-up and finally overcoming the challenge of engineering vascularised tissues
Validierung innerklinischer Sichtungsalgorithmen fĂŒr den Massenanfall von Verletzten â eine simulationsbasierte Studie â deutsche Version
Hintergrund
Die situationsbedingte Verknappung medizinischer Ressourcen endet bei einem Massenanfall von Verletzen (MANV) lageabhĂ€ngig nicht mit dem Abtransport der Patienten von der Einsatzstelle. Folglich ist in den aufnehmenden Kliniken eine Eingangssichtung erforderlich. Ziel dieser Studie war es im ersten Schritt einen ReferenzâPatientenvignettensatz mit definierten Sichtungskategorien zu erstellen. Dies erlaubte im zweiten Schritt, die rechnergestĂŒtzte Evaluation der diagnostischen GĂŒte klinischer Sichtungsalgorithmen fĂŒr MANV-Lagen.
Methodik
In einen mehrstufigen Bewertungsprozess durch zunĂ€chst sechs, spĂ€ter 36 Sichtungsexperten gingen 250 in der Ăbungspraxis validierte Fallvignetten ein. Diese Algorithmen â unabhĂ€ngige Expertenbewertung aller Vignetten â dienten als Goldstandard fĂŒr die Analyse der diagnostischen GĂŒte der folgenden innerklinischen Algorithmen: Manchester Triage System (MTS Modul MANV), Emergency severity Index (ESI), Berliner Sichtungsalgorithmus (BER), die prĂ€hospitalen Algorithmen PRIOR und mSTaRT, sowie zwei Projektalgorithmen aus einer Kooperation des Bundesamts fĂŒr Bevölkerungsschutz und Katastrophenhilfe (BBK) mit dem Haschemitischen Königreich Jordanien â innerklinischer jordanisch-deutscher Projektalgorithmus (JorD) und prĂ€hospitaler Sichtungsalgorithmus (PETRA). Jede Patientenvignette durchlief computergestĂŒtzt eine Sichtung durch alle angegeben Algorithmen, um vergleichend die TestgĂŒte fĂŒr alle Verfahren zu erheben.
Ergebnisse
Von den ursprĂŒnglich 250 Vignetten konnte eine Sichtungsreferenzdatenbank mit 210 Patientenvignetten algorithmenunabhĂ€ngig validiert werden. Diese bildeten den Goldstandard fĂŒr den Vergleich der analysierten Sichtungsalgorithmen. Die SensitivitĂ€ten fĂŒr die innerklinische Detektion von Patienten der Sichtungskategorie I lagen zwischen 1,0 (BER, JorD, PRIOR) und 0,57 (MANV-Modul MTS). Die SpezifitĂ€ten lagen zwischen 0,99 (MTS und PETRA) und 0,67 (PRIOR). Gemessen am Youden-Index ergab sich bei BER (0,89) und JorD (0,88) die beste Gesamtperformance fĂŒr die Detektion von Patienten der Sichtungskategorie I. Eine Ăbertriage ist am ehesten bei PRIOR, eine Untertriage beim MANV-Modul von MTS zu erwarten. Bis zum Entscheid SK I benötigen die Algorithmen folgende Schrittanzahlen (Median [IQR]): ESI 1 [1â2]; JorD 1 [1â4]; PRIOR 3 [2â4]; BER 3 [2â6]; mSTaRT 3 [3â5]; MTS 4 [4â5]; PETRA 6 [6â8]. FĂŒr die SK II und III besteht ein positiver Zusammenhang zwischen der Schrittanzahl bis zum Entscheid und der TestgĂŒte.
Schlussfolgerung
In der vorliegenden Studie konnte eine Ăbertragbarkeit prĂ€hospitaler algorithmenbasierter Vorsichtungsergebnisse auf die Ergebnisse klinischer Algorithmen gezeigt werden. Die höchste diagnostische GĂŒte fĂŒr die innerklinischen Sichtung lieferten BER und JorD, die allerdings auch die meisten Algorithmusschritte bis zum Entscheid benötigen
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