Comparaison du typage moléculaire par M.L.V.A. et M.L.S.T. d'une collection de 70 isolats de E. coli au C.H.U. de Nantes

Le M.L.V.A. est une nouvelle technique de typage moléculaire innovante basée sur l analyse de plusieurs loci présentant des séquences répétées. Le but de cette étude était de développer une approche de typage par M.L.V.A. sur une cohorte de souches de E. coli préalablement caractérisées par M.L.S.T. Soixante-neuf souches d'origine humaine ou animale et un témoin ont été analysés. La technique développée par Lindsted et al. a été adaptée. Une typicité de 100 % et un polymorphisme des loci (index de diversité : de 0,03 à 0,91) étaient mis en évidence. Trente-cinq profils M.L.V.A. ont été retrouvés et 54 % des souches présentaient un profil qui ne variait que pour l'allèle 14. Les souches exprimant un mécanisme de résistance chromosomique (ST23, ST155) présentaient une homologie des profils où seul l allèle 14 variait. A l'inverse, les souches sauvages ou possédant un mécanisme de résistance plasmidique (BLSE ou AmpC plasmidique) présentaient des profils plus hétérogènes tant en M.L.V.A. qu'en M.L.S.T. Cette technique simple et rapide semble être plus discriminante que le M.L.S.T., pour des souches de même ST présentant des profils M.L.V.A. différents. Des études complémentaires devraient comparer ces performances à celles de l'E.C.P. lors d'épidémies ou pour analyser la circulation de certaines souches.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocSudocFranceF

La ville sous nos pieds : connaissances et pratiques favorables aux mobilités piétonnes

4ème colloque francophone international du GERI COPIE, MONTREAL, CANADA, 20-/11/2013 - 22/11/2013De part et d'autre de l'Atlantique, on assiste à la revalorisation d'une urbanisation qui laisse une plus grande place au piéton, une démarche qui va de pair avec la promotion des modes de transport « doux », aussi appelé « actifs » (la marche, le Îlo). Celle-ci s'appuie de plus en plus sur des études qui démontrent leurs bénéfices en termes économiques et de santé publique, mais pose en même temps l'enjeu de la sécurité routière de ces « nouveaux » usagers de la route. La prévention des accidents impliquant des piétons reÐt une importance particulière en raison de leur vulnérabilité en tant qu'usager de la route. Les enjeux sociétaux, comme le vieillissement de la population, et l'intérêt pour les modes doux rendent nécessaire la mise à jour des connaissances sur les comportements des piétons en fonction de l'environnement. Le comportement du piéton dans son environnement est l'objet de recherche qui fédère le groupe d'échanges et de recherches de l'IFSTTAR (GERI) COPIE (http://actions-incitatives.ifsttar.fr/geri/copie/). Les objectifs fondateurs de ce groupe d'échange sont de rassembler une communauté de chercheurs issus de disciplines relevant aussi bien des Sciences Pour l'Ingénieur (SPI) que des Sciences de l'Homme et de la Société (SHS), d'offrir un espace de diffusion de leurs travaux de recherche, de confronter les différentes approches utilisées et de discuter autour de problématiques communes. Depuis sa création, le GERI COPIE a su alimenter la réflexion sur la place du piéton dans les travaux en sécurité routière lors de séminaires, mais aussi à travers un colloque francophone international biannuel depuis 2007, colloque s'étant tenu en France à chaque fois. Pour sa quatrième édition, le colloque COPIE a traversé l'Atlantique et s'est dépaysé à Montréal, sur le thème « La ville sous nos pieds: connaissances et pratiques favorables aux mobilités piétonnes ». Ce colloque a été l'occasion de présenter les travaux de recherches et les opérations de terrain en faveur du piéton dans un contexte nord-américain et de pouvoir comparer, voire de confronter, les connaissances et les pratiques de pays francophones (France, Québec/Canada, Suisse, Belgique). Ces échanges ont été l'occasion d'un enrichissement mutuel pour de nouvelles actions sur chacun des territoires

Humoral response to a third injection of BNT162b2 vaccine in patients on maintenance haemodialysis

International audienceAbstract Background Humoral response against sudden acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) after two doses of BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) has been proven to be less intense in maintenance dialysis patients as compared with healthy subjects, leading the French authorities to recommend a third injection in this population. Here we investigated the response to the third injection in two cohorts of haemodialysis (HD) patients. Methods Data from two prospective observational cohorts were collected. In the first (‘systematic’) cohort, patients from two HD centres (n = 66) received a third injection of BNT162b2, regardless of the response after two injections. In the second (‘conditional’) cohort, the injection was only prescribed to patients (n = 34) with no or low response to the previous two doses. In both cohorts, the third dose was injected 1–2 months after the second dose. Serology was performed after the second and third doses to assess anti-Spike immunoglobulin G (S IgG) antibody titre. Results In the systematic cohort, anti-S IgG was found in 83.3 and 92.4% of patients after the second and third doses of BNT162b2, respectively. In this cohort, 6/11 (54.5%) and 20/21 (95.2%) patients switched from non-responder to low responder and from low responder to high responder, respectively. In low and high responders to two doses, 50/55 (90.9%) at least doubled their anti-S IgG titre. Similar trends were observed in the conditional cohort. Conclusions In maintenance HD patients, humoral response against SARS-CoV-2 was boosted after a third dose of BNT162b2, allowing seroconversion in more than half of non-responders. These data may support an intensified vaccination protocol with a third dose of BNT162b2 in dialysis patients

Rapid characterization of a Delta-Omicron SARS-CoV-2 recombinant detected in Europe

Abstract Recombination is a crucial process in the evolution of many organisms. Although the evolutionary reasons behind its occurrence in RNA viruses are debated, this phenomenon has been associated with major epidemiological events such as virus host range expansion, antigenic shift or variation in virulence 1,2, and this process occurs frequently in positive strand RNA viruses such as coronaviruses. The SARS-CoV-2 pandemic has been associated with the repeated emergence of variants of concern presenting increased transmissibility, severity or immune escape 3. The recent extensive circulation of Delta worldwide and its subsequent replacement by viruses of the Omicron lineage 4 (BA.1 then BA.2), have created conditions for genetic exchanges between viruses with both genetic diversity and phenotypic specificities 5-7. Here we report the identification and in vitro and in vivo characterization of a Delta-Omicron recombinant in Europe. This recombinant exhibits immune escape properties similar to Omicron, while its behavior in mice expressing the human ACE2 receptor is more similar to Delta. This recombinant provides a unique and natural opportunity to better understand the genotype to phenotype links in SARS-CoV-2