Idoneidad de especies vegetales para el desarrollo poblacional de Neophilaenus campestris (Fallén) (Hemiptera: Aphrophoridae)

El conocimiento de la biología y dinámica poblacional de los insectos vectores de la bacteria fitopatógena Xylella fastidiosa Wells et al., 1987, es fundamental para llevar a cabo un adecuado control de las enfermedades que produce en plantas cultivadas, por medio del manejo de dichos vectores. En la Comunidad Valenciana, en la Zona Demarcada por presencia de la bacteria localizada en la provincia de Alicante, Philaenus spumarius (Linnaeus, 1758), Neophilaenus campestris (Fallén, 1805) y Neophilaenus lineatus (Linnaeus, 1758) han evidenciado portar la bacteria, si bien solo las dos primeras especies son vectores reconocidos en Europa

Búsqueda y caracterización de virus bacteriófagos frente a Xylella fastidiosa

Xylella fastidiosa es una bacteria Gram-negativa de la familia Xanthomonadaceae que habita el xilema de la planta hospedadora, donde se multiplica y puede llegar a obstruir el flujo de savia bruta, pudiendo llegar a provocar la muerte de la planta. Tiene un modo de vida dual, ya que también habita en el tracto digestivo anterior de insectos chupadores de xilema que actúan como vectores. Afecta a un elevado número de especies vegetales, muchas de ellas de gran interés agrícola y medioambienta

Bacteriófagos para el control de la bacteria fitopatógena Xylella fastidiosa

Xylella fastidiosa (Xf) es una bacteria patógena que habita en el xilema de la planta hospedadora y el tracto digestivo de insectos que actúan como vectores. Afecta a un elevado número de especies vegetales, siendo una de las principales bacterias de cuarentena en la Unión Europea. Puesto que actualmente no existen medidas terapéuticas eficaces y los antibióticos están prohibidos en Europa, el control de Xf se basa principalmente en la erradicación de las plantas infectadas y el uso de compuestos químicos contra los vectores, pero estas medidas no son suficientes

Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Funder: NCI U24CA211006Abstract: The Cancer Genome Atlas (TCGA) and International Cancer Genome Consortium (ICGC) curated consensus somatic mutation calls using whole exome sequencing (WES) and whole genome sequencing (WGS), respectively. Here, as part of the ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, which aggregated whole genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumour types, we compare WES and WGS side-by-side from 746 TCGA samples, finding that ~80% of mutations overlap in covered exonic regions. We estimate that low variant allele fraction (VAF < 15%) and clonal heterogeneity contribute up to 68% of private WGS mutations and 71% of private WES mutations. We observe that ~30% of private WGS mutations trace to mutations identified by a single variant caller in WES consensus efforts. WGS captures both ~50% more variation in exonic regions and un-observed mutations in loci with variable GC-content. Together, our analysis highlights technological divergences between two reproducible somatic variant detection efforts