Detection, isolation and characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) in fresh ground beef from butcher shops in Concepción, Tucumán Province

Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC) es un patógeno emergente transmitido por alimentos. Existen numerosos serotipos de STEC asociados a enfermedad en humanos, entre los cuales prevalece el serotipo O157:H7. La carne molida es el principal vehículo de transmisión. En la ciudad de Concepción, provincia de Tucumán, entre setiembre y diciembre de 2004 se diagnosticaron dos casos de síndrome urémico hemolítico (SUH). El objetivo de este trabajo fue detectar, aislar y caracterizar STEC O157 y no-O157 a partir de muestras de carne molida fresca obtenidas en las bocas de expendio. Entre los meses de setiembre y diciembre de 2004 se recolectaron 53 muestras de carne molida fresca en carnicerías de la ciudad de Concepción. Para la detección, el aislamiento y la caracterización de STEC O157:H7 se utilizó la metodología USDA-FSIS 2002. Para la detección de E. coli no-O157 se utilizaron dos técnicas de PCR; para el aislamiento y la caracterización se utilizó una metodología previamente validada en una etapa intralaboratorio. Siete muestras fueron positivas para el gen stx2 , de las cuales 4 también fueron positivas para el gen rfbO157. Sin embargo, solo se aisló una cepa de E. coli O157:H7 biotipo C, portadora de los genes eae, stx2 y ehxA. El presente trabajo refleja la importancia de implementar técnicas que permitan detectar este grupo de patógenos emergentes a partir de productos cárnicos.Shiga toxin-producing Escherichia coli is an emerging foodborne pathogen. There are many STEC serotypes associated with human diseases, being the O157:H7 serotype the most prevalent. Ground beef is the main transmission vehicle. In Concepción city, Tucumán Province, between September and December 2004, two hemolytic uremic syndrome (HUS) cases were diagnosed. The main objective of this work was to detect, isolate and characterize STEC O157 and non-O157 strains in fresh ground beef. Between September and December 2004, 53 fresh ground beef samples were collected from butcher shops in Concepción city. The USDA-FSIS (2002) methodology was used for detection, isolation and characterization of STEC O157:H7. Two PCR techniques for E. coli non-O157 detection and a previous intra-laboratory validated methodology for the isolation and characterization of these strains were used. The stx2 gen was identified in seven samples and the rfbO157 gene also in four of them. However, only one E. coli O157:H7 strain, biotype C, carrying the eae, stx2 and ehxA genes, was isolated. The present study shows the importance of implementing techniques for the detection of this emerging pathogen in meat samples.Instituto de Genética Veterinari

Detección, aislamiento y caracterización de Escherichia coli productor de toxina Shiga a partir de carne molida fresca proveniente de carnicerías de Concepción, provincia de Tucumán Detection, isolation and characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) in fresh ground beef from butcher shops in Concepción, Tucumán Province

Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC) es un patógeno emergente transmitido por alimentos. Existen numerosos serotipos de STEC asociados a enfermedad en humanos, entre los cuales prevalece el serotipo O157:H7. La carne molida es el principal vehículo de transmisión. En la ciudad de Concepción, provincia de Tucumán, entre setiembre y diciembre de 2004 se diagnosticaron dos casos de síndrome urémico hemolítico (SUH). El objetivo de este trabajo fue detectar, aislar y caracterizar STEC O157 y no-O157 a partir de muestras de carne molida fresca obtenidas en las bocas de expendio. Entre los meses de setiembre y diciembre de 2004 se recolectaron 53 muestras de carne molida fresca en carnicerías de la ciudad de Concepción. Para la detección, el aislamiento y la caracterización de STEC O157:H7 se utilizó la metodología USDA-FSIS 2002. Para la detección de E. coli no-O157 se utilizaron dos técnicas de PCR; para el aislamiento y la caracterización se utilizó una metodología previamente validada en una etapa intralaboratorio. Siete muestras fueron positivas para el gen stx2, de las cuales 4 también fueron positivas para el gen rfbO157. Sin embargo, solo se aisló una cepa de E. coli O157:H7 biotipo C, portadora de los genes eae, stx2 y ehxA. El presente trabajo refleja la importancia de implementar técnicas que permitan detectar este grupo de patógenos emergentes a partir de productos cárnicos.Shiga toxin-producing Escherichia coli is an emerging foodborne pathogen. There are many STEC serotypes associated with human diseases, being the O157:H7 serotype the most prevalent. Ground beef is the main transmission vehicle. In Concepción city, Tucumán Province, between September and December 2004, two hemolytic uremic syndrome (HUS) cases were diagnosed. The main objective of this work was to detect, isolate and characterize STEC O157 and non-O157 strains in fresh ground beef. Between September and December 2004, 53 fresh ground beef samples were collected from butcher shops in Concepción city. The USDA-FSIS (2002) methodology was used for detection, isolation and characterization of STEC O157:H7. Two PCR techniques for E. coli non-O157 detection and a previous intra-laboratory validated methodology for the isolation and characterization of these strains were used. The stx2 gen was identified in seven samples and the rfbO157 gene also in four of them. However, only one E. coli O157:H7 strain, biotype C, carrying the eae, stx2 and ehxA genes, was isolated. The present study shows the importance of implementing techniques for the detection of this emerging pathogen in meat samples

Ecology of Vibrio cholerae in relation to phytoplankton and physico chemical variables in rivers of Tucumán (Argentina)

Ecology of Vibrio cholerae in relation to phytoplankton and physico-chemical variables in rivers of Tucumán (Argentina). Vibrio cholerae shows a great serologic diversity in relation to his O somatic antigen and we know at least 200 serogroups. About these, only O1 and O139 are responsible of epidemics and pandemics. The serogroup O1 reemerged in Latin America in 1991 after being absent from the continent for nearly a century. This bacterium survives and grows up associated to plankton, independently of appearance of human infections. From 90 th decade, there were sporadic cases of diarrhea because of Vibrio cholerae O1 in Tucumán. The aims of this paper were to study the possible relation between phytoplankton species, physico-chemical variables and V. cholerae isolations in rivers of Tucumán. There were 18 sampling in the rivers Salí and Lules from 2003 to 2005. Physico- chemical variables of water (pH, temperature, conductivity and dissolved oxygen), phytoplankton (richness and relative frequency) and V. cholerae isolations were studied in this paper. Results showed differences in water quality, with anoxic periods in the River Salí. Diatoms were conspicuous in almost all months and generally there were in percentages upper 85 %. Just Vibrio cholerae non- O1, non-O139 was isolated, specially in months warmer with alkaline pH and also with dissolved oxygen low concentration.Vibrio cholerae muestra gran diversidad serológica en base a su antígeno somático O, conociéndose al menos 200 serogrupos. De éstos, solamente O1 y O139 son causantes de epidemias o pandemias. En Latinoamérica el serogrupo O1 reapareció en 1991, tras cien años de no presentar brotes en el continente. Esta bacteria sobrevive y se multiplica asociada al plancton, independientemente de la aparición de infecciones humanas. Desde la década del noventa, en Tucumán, se detectaron casos esporádicos de diarrea por Vibrio cholerae no-O1. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la posible relación entre la presencia de especímenes de fitoplancton, variables fisicoquímicas y aislamientos de Vibrio cholerae en ríos de Tucumán. Se realizaron 18 campañas en los ríos Lules y Salí entre 2003-2005. Se estudiaron las variables fisicoquímicas del agua (pH, temperatura, conductividad y oxígeno disuelto), el fitoplancton (riqueza y frecuencia relativa) y las cepas aisladas de V. cholerae. Los resultados evidenciaron diferencias en la calidad del agua, observándose períodos de anoxia en el río Salí. Las diatomeas sobresalieron en la mayoría de los meses y generalmente estuvieron en porcentajes superiores al 85 %. Sólo se aisló Vibrio cholerae no-O1, no-O139, detectándose más frecuentemente en los meses cálidos, con pH alcalino, aún con baja concentración de oxígeno.Fil: Gaudioso de Allori, María Cristina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Tracanna, Beatriz Concepcion. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Seeligmann, Claudia Teresa. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo; ArgentinaFil: Cangemi, R.. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Aulet, O.. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Cecilia, M.. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Mirande, V.. Universidad Autónoma de Entre Ríos; ArgentinaFil: Silva, Clara del Valle. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Binsztein, N.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentin

Environment and virulence factors of vibrio cholerae strains isolated in Argentina

Aims: To determine the presence of Vibrio cholerae in different areas of Argentina in three sample types, to determine the composition of planktonic communities in areas at which this pathogen was detected and to characterize the virulence properties and antimicrobial resistance of the recovered environmental isolates. Methods and Results: Water and plankton samples were collected in marine, brackish and freshwater environments. Vibrio cholerae non‐O1, non‐O139 was isolated in 36·1% of the samples analysed. The micro‐organism was detected in freshwater but not in marine or brackish samples. No relationship was found between isolation of V. cholerae and presence of any species of plankton. All the isolates presented very similar virulence profiles by PCR, lacking ctxA and tcpA El Tor and containing hlyA (98·7%), rtxA (99·0%), toxR (98·7%) and stn‐sto (1·9%). Resistance to ampicillin was found in both Tucumán (21%) and Buenos Aires isolates (45%). Conclusions: We identified two geographic areas in Argentina where V. cholerae was present: freshwaters of the rivers from Tucumán and the Río de la Plata. Significance and Impact of the Study: The identification of V. cholerae strains in the environment, carrying both virulence factors and resistance to antimicrobial agents, highlight the need for a continuous and active surveillance of this pathogen.Fil: Gonzalez Fraga, S.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Pichel, M.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Costagliola, M.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Jurquiza, V.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Peresutti, S.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Caffer, M. I.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Aulet, O.. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Hozbor, C.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Tracanna, Beatriz Concepcion. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: de Gamundi, A. V.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Hernández, D.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Ramirez, F. C.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Akselman, R.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Subsede Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero; ArgentinaFil: Binsztein, N.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentin

Environment and virulence factors of Vibrio cholerae strains isolated in Argentina

Aims: To determine the presence of Vibrio cholerae in different areas of Argentina in three sample types, to determine the composition of planktonic communities in areas at which this pathogen was detected and to characterize the virulence properties and antimicrobial resistance of the recovered environmental isolates. Methods and Results: Water and plankton samples were collected in marine, brackish and freshwater environments. Vibrio cholerae non-O1, non-O139 was isolated in 36Æ1% of the samples analysed. The micro-organism was detected in freshwater but not in marine or brackish samples. No relationship was found between isolation of V. cholerae and presence of any species of plankton. All the isolates presented very similar virulence profiles by PCR, lacking ctxA and tcpA El Tor and containing hlyA (98Æ7%), rtxA (99Æ0%), toxR (98Æ7%) and stnsto (1Æ9%). Resistance to ampicillin was found in both Tucuma´n (21%) and Buenos Aires isolates (45%). Conclusions: We identified two geographic areas in Argentina where V. cholerae was present: freshwaters of the rivers from Tucuma´n and the Rı´o de la Plata. Significance and Impact of the Study: The identification of V. cholerae strains in the environment, carrying both virulence factors and resistance to antimicrobial agents, highlight the need for a continuous and active surveillance of this pathogen