55 research outputs found

    Mutational processes molding the genomes of 21 breast cancers

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    All cancers carry somatic mutations. The patterns of mutation in cancer genomes reflect the DNA damage and repair processes to which cancer cells and their precursors have been exposed. To explore these mechanisms further, we generated catalogs of somatic mutation from 21 breast cancers and applied mathematical methods to extract mutational signatures of the underlying processes. Multiple distinct single- and double-nucleotide substitution signatures were discernible. Cancers with BRCA1 or BRCA2 mutations exhibited a characteristic combination of substitution mutation signatures and a distinctive profile of deletions. Complex relationships between somatic mutation prevalence and transcription were detected. A remarkable phenomenon of localized hypermutation, termed "kataegis," was observed. Regions of kataegis differed between cancers but usually colocalized with somatic rearrangements. Base substitutions in these regions were almost exclusively of cytosine at TpC dinucleotides. The mechanisms underlying most of these mutational signatures are unknown. However, a role for the APOBEC family of cytidine deaminases is proposed

    Serum magnesium and calcium levels in relation to ischemic stroke : Mendelian randomization study

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    ObjectiveTo determine whether serum magnesium and calcium concentrations are causally associated with ischemic stroke or any of its subtypes using the mendelian randomization approach.MethodsAnalyses were conducted using summary statistics data for 13 single-nucleotide polymorphisms robustly associated with serum magnesium (n = 6) or serum calcium (n = 7) concentrations. The corresponding data for ischemic stroke were obtained from the MEGASTROKE consortium (34,217 cases and 404,630 noncases).ResultsIn standard mendelian randomization analysis, the odds ratios for each 0.1 mmol/L (about 1 SD) increase in genetically predicted serum magnesium concentrations were 0.78 (95% confidence interval [CI] 0.69-0.89; p = 1.3 7 10-4) for all ischemic stroke, 0.63 (95% CI 0.50-0.80; p = 1.6 7 10-4) for cardioembolic stroke, and 0.60 (95% CI 0.44-0.82; p = 0.001) for large artery stroke; there was no association with small vessel stroke (odds ratio 0.90, 95% CI 0.67-1.20; p = 0.46). Only the association with cardioembolic stroke was robust in sensitivity analyses. There was no association of genetically predicted serum calcium concentrations with all ischemic stroke (per 0.5 mg/dL [about 1 SD] increase in serum calcium: odds ratio 1.03, 95% CI 0.88-1.21) or with any subtype.ConclusionsThis study found that genetically higher serum magnesium concentrations are associated with a reduced risk of cardioembolic stroke but found no significant association of genetically higher serum calcium concentrations with any ischemic stroke subtype

    Movilización pasiva continua en pacientes con artroplastia de rodilla

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    Introduction: Total knee arthroplasty (TKA) is a valid therapeutic option for patients with severe arthritis and physical disability. However, many TKA patients develop pain and functional impairment. In our study, we used a continuous passive motion (CPM) device for exercise starting 10 days after surgery. materials and methods: The study population consisted of 60 patients, who were randomized into 2 groups. Group I (GI: 30 patients, 23 females) underwent the standard treatment and group II (GII, 30 patients, 17 females) underwent the standard treatment plus CPM starting 10 days after surgery. We evaluated pain, range of motion (ROM), extension muscle strength, and function (WOMAC and TUG tests). Results: All compared parameters yielded no statistically significant differences. A greater trend toward improvement was observed in GII regarding some parameters: greater extension muscle strength and a baseline correlation between flexion strength and the TUG test. Conclusions: The use of CPM starting 10 days after of surgery improved the extension muscle strength and produced better TUG test results, although without any statistically significant difference with the standard procedure. No adverse effects were observedIntroducción: La artroplastia total de rodilla es el recurso terapéutico para pacientes con artrosis severa y gran incapacidad física. Sin embargo, muchos evolucionan con dolor y déficit funcional. En este estudio, se utiliza un tratamiento con movilización pasiva continua a partir de los 10 días de la cirugía. materiales y métodos: Se incluyó a 60 pacientes que fueron asignados, en forma aleatoria, a 2 grupos (30 en cada grupo). Al grupo 1 (G1, 23 mujeres) se le aplicó un protocolo de tratamiento convencional y, al grupo 2 (G2, 17 mujeres), el mismo programa y la adicción de un equipo de movimiento pasivo continuo a los 10 días de la inter-vención. Se evaluaron el dolor, la movilidad articular, la fuerza muscular y la función (WOMAC y prueba TUG). Resultados: No se observaron diferencias estadísticamente significativas en los parámetros estudiados, aunque sí una tendencia a la mejoría en el G2. En este grupo, la fuerza de extensión de la rodilla fue mayor y también hubo una correlación basal entre la fuerza y la prueba TUG. Conclusiones: El uso diferido de la movilización pasiva continua mejoró la fuerza de extensión de la rodilla y el rendimiento en la prueba TUG, aunque sin diferencias significativas entre ambos grupos. No se observaron efectos adverso

    Efectos del ejercicio aeróbico interválico, combinado con entrenamiento de fuerza y de la restricción calórica, sobre la composición corporal de ratas obesas

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    Objetivo: Investigar los efectos de un programa de ejercicio aeróbico interválico, combinado con entrenamiento de fuerza, y de la restricción calórica, sobre el peso y la composición corporal de ratas genéticamente obesas. Método: Un total de 32 ratas genéticamente obesas fueron divididas aleatoriamente en dos grupos (n = 16) con o sin ejercicio aeróbico interválico combinado con entrenamiento de fuerza. A su vez, cada grupo, con o sin ejercicio aeróbico interválico combinado con entrenamiento de fuerza, fue dividido en dos grupos, con o sin restricción calórica, resultando cuatro grupos de intervención (n = 8). El programa de ejercicio aeróbico interválico combinado con entrenamiento de fuerza se llevó a cabo en una misma sesión de 60 min, cinco días por semana, durante dos meses. Los grupos con restricción calórica consumieron un 30% menos de alimento que los ad libitum. Se determinó el peso corporal y la masa de la carcasa mediante una balanza de precisión y la masa grasa, muscular y el agua corporal, mediante un analizador de composición corporal, basado en resonancia magnética nuclear, de diseño especial para ratas. Resultados: El peso corporal final fue menor en aquellos animales que realizaron restricción calórica frente a aquellos cuya alimentación fue ad libitum (p < 0.001). La masa grasa fue menor y la masa muscular mayor en aquellos animales que desarrollaron el ejercicio aeróbico interválico combinado con entrenamiento de fuerza, frente a los sedentarios (p < 0.001), sin diferencias atendiendo a la restricción calórica (p > 0.05). Hemos observado interacciones entrenamiento versus restricción calórica, en masa muscular y agua total. Los animales que incrementaron más su masa muscular y agua corporal, fueron los que combinaron el entrenamiento con la restricción calórica (ambos p < 0.01). Conclusiones: Tanto el programa de ejercicio aeróbico interválico, combinado con entrenamiento de fuerza desarrollado, como la restricción calórica, fueron eficaces, mejorando la composición corporal de ratas obesas, pero el ejercicio lo hizo en mayor magnitud
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