Plant gene bank collections - sources of variation in health substances

Gene banks and national plant genetic resources programmes have been established to conserve genetic resources of domesticated plants. Variation of the beneficial health substances found in plants is the result of growing conditions (environment) and genes directing the growth (genotype)

Ongoing inventory on landrace potato onions in Finland

vo

Amarellit ja morellit - kirsikat DNA-vertailussa

Näytä koko lehti201

Kirsikoiden geenivarakokoelman valinta fenotyyppisten havaintojen ja DNAmarkkerien avulla

MTT:lle sijoitettu kansallinen kirsikkakokoelma on syntynyt 1980- luvun luumu- jakirsikkakeräysten tuloksena. Hapankirsikat istutettiin alun perin Hämeen tutkimusasemankoekentälle Pälkäneelle ja Ahvenanmaan tutkimusasemalle Jomalaan, jonne sijoitettiin myösmakeita kirsikoita. Kaikki Hämeen kokoelman kirsikkakloonit on kuvattu 1992 kansainvälisestihyväksytyillä UPOV:in määrittelemillä havainnointikriteereillä (deskriptorit), jotka liittyvät kasvinulkomuotoon, kasvutapaan, kestävyyteen ja satoon. Vuonna 2003 osa havainnoista uusittiin niilläpuilla, jotka olivat säilyneet siihen asti.Kesällä 2005 kaikista jäljellä olevista klooneista kerättiin lehtinäytteet mikrosatelliitti-DNA –analyysiin, jossa näytteitä vertailtiin tunnettuihin suomalaisiin hapankirsikkalajikkeisiin japaikalliskantoihin. Lisäksi puista tehtiin satohavaintoja, ja valittiin kasvutavan ja sadon puolestalupaavimmalta vaikuttavat kannat. Hedelmän ja sen mehun värin sekä yleisen kasvutavanperusteella kokoelman puut jaettiin alun perin kolmeen ryhmään: 1) Amarelli –tyyppi, 2) Morelli –tyyppi ja 3) Rymättylä –tyyppi.DNA-markkerianalyysin perusteella Amerellit ja Morellit erottuivat hyvin selkeästi omiksiryhmikseen. Molemmille ryhmille löytyi useita ainoastaan sille ominaisia DNA-merkkejä.Rymättylä –tyyppiä edustavia näytteitä oli jäljellä enää kaksi, ja ne ryhmittyivät molemmat yhteenAmarellien kanssa, joka tulos oli yhdenmukainen v.1993 havaintojen kanssa. DNA –merkkienperusteella 72 tutkittavasta näytteestä löydettiin yhteensä 28 erilaista genotyyppiä eli erillistäkantaa. Sekä Amarellien että Morellien joukossa oli yksi suuri klooniryhmä, johon kuului 19 tai 20täysin identtistä näytettä. Näiden voidaan olettaa kuuluvan samaan lajikkeeseen tai paikalliskantaan,jota hyvin menestyneenä on levitetty kasvullisesti lisäämällä alan harrastajien keskuudessa. Näiden,kuten myös pienempien klooniryhmien, keräyspaikat olivat yleensä melko lähellä toisiaan.Geenivarakokoelmaan valittiin DNA –analyysin tulosten perusteelle mahdollisimman suurtamuuntelua edustavat kirsikkanäytteet. Näiden joukosta tarkistettiin, että mukaan tulivatkenttähavaintojen perusteella kaikkein lupaavimmat näytteet. Valintaperusteissa tärkeimpinätekijöinä olivat sadon laatu ja määrä sekä puun koristearvo. Valitut kannat otettiin MTT Laukaallelisäykseen, ja uudet taimet istutettiin v.2003-2004 osaksi Piikkiön Tuorlan kansallistageenipankkikokoelmaa

DNA fingerprinting demonstrates extremely low levels of genetic variation among blackberry cultivars grown in Finland

Most blackberry plants cultivated in Finland closely resemble the American species Rubus allegheniensis. Thirty nine such blackberry accessions in the University of Helsinki clone collection were studied by hybridization-based DNA fingerprinting and compared with some known cultivars of R. allegheniensis derivation. ‘lmperial’ appears to be identical to the old cultivar ‘Majestät’, but ‘Earliest of All’ differs considerably. In addition, 37 of the accessions analysed also have DNA fingerprints that appear to be completely identical to that of ‘Majestät’! The remaining two accessions, although identical to each other, exhibit one band not found in ‘Majestät’ that is probably caused by a somatic mutation

Rosa -ryhmän säilytysohjeet

vokMyynti MTT Tietopalvelut 31600 Jokioine