Propiedades catalíticas de la lipasa B de Candida antarctica inmovilizada en soportes magnéticos. Actividad sintética en disolventes orgánicos

Este trabajo se centra en la inmovilización de la lipasa B de Candida antarctica en nanopartículas magnéticas y la posterior caracterización cinética de su actividad sintética en medios orgánicos para la pr oducción de biodiesel. La historia del biodiesel comienza en 1893, cuando Rudolph Diesel, el padre del motor diésel, puso en marcha el primer motor de este tipo. Más tarde, en 1900, Diesel ganó el Grand Prix en la Feria Mundial de París con su m otor impulsado por un biodiesel de aceite de cacahuete. En 1903, además, comenzó la producción del Modelo T de Henry Ford, diseñado para utilizar etanol como combustible. Diesel creía que la utilización de biodiesel era el futuro de la automoción: “ el uso de aceites vegetales como combustibles para motor puede parecer insignificante hoy en día, pero estos aceites puede n convertirse, con el transcurso del tiempo, en combustibles tan importantes como el petróleo y el carbón lo son hoy en día ” Sin embargo, a p artir de 1920, los fueles basados en petróleo comenzaron a ganar terreno, debido a su mayor eficiencia, menor precio y mejor disponibilidad. De esta forma, el mercado de los biofueles quedó relegado hasta que las distintas crisis del petróleo (1973, 1979, 19 90) unidas a la creciente preocupación por la polución y la c onservación del medio ambiente, además de al aumento de la población y por tanto de la demanda de combustibles , llevaron a devolve r la mirada a estos fueles . Fue en esta época cuando comenzó, p rincipalmente en EEUU y Brasil, la producción a gran escala de biocombustibles de primera generación, basados en la utilización de excedentes agrícolas como el maíz y la caña de azúcar para la producción de bioetanol y aceites de maíz y grasas animales par a la producción de biodiesel

Hirigune historikoen babesa klima-aldaketaren aurrean: arriskua neurtzeko metodologiak

Artikulu honetan hirigune historikoetarako klima–aldaketarekin erlazionatutako arriskuen ebaluaziorako metodologiei buruzko egungo literaturaren berrikuspen sistematiko eta kritikoa egiten da. Horretarako, gaur egungo literaturaren azterketa sakona egin da Web of Science eta Scopus datu-baseetan, klima-aldaketaren eta ondoriozko muturretako gertaeren eraginpean dagoen kultura-ondarearen kalteberatasun eta arrisku ebaluazio metodologiak identifikatu eta ezaugarritzeko. Etorkizunean zuzendu beharreko metodologien ezaugarriak eta ezagutza-hutsune nagusiak identifikatu dira, hirigune historikoetan bero-boladak izateko arriskua ebaluatzeko metodologia holistikorik eza barne. Berrikuspenaren emaitzak aztertu dira, ondoren arriskuak ebaluatzeko etorkizuneko metodologietarako adierazleak identifikatu eta garatzeko. Metodologia horiek, hirigune historikoetako elementuak sistema bakar gisa landuko dituzte, eta bero-bolada luzeek izan dezaketen inpaktu potentziala landuko dute, muturreko gertaera klimatiko horien probabilitate handiagoa kontsideratuz.; This article presents a systematic and critical review of the existing literature on climate-change risk assessment methodologies for historic urban areas. For this, a systematic search of the existing literature on Web of Science and Scopus was carried out, with the aim of identifying and characterizing the existing methodologies on vulnerability and risk assessment for cultural heritage exposed to the effects of climate change and the resulting extreme events. The main characteristics of the methodologies that need to be addressed in the near future and the key knowledge gaps were identified, including the lack of holistic heat wave risk assessment methodologies for historic urban areas. The results of the review are analyzed to identify and develop key performance indicators for use in future risk assessment methodologies that address both the elements of historic urban areas as a system and the potential impact of prolonged heat waves in light of increasing probability of this extreme weather events

Evolution of CRISPR-associated endonucleases as inferred from resurrected proteins

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated Cas9 is an effector protein that targets invading DNA and plays a major role in the prokaryotic adaptive immune system. Although Streptococcus pyogenes CRISPR–Cas9 has been widely studied and repurposed for applications including genome editing, its origin and evolution are poorly understood. Here, we investigate the evolution of Cas9 from resurrected ancient nucleases (anCas) in extinct firmicutes species that last lived 2.6 billion years before the present. We demonstrate that these ancient forms were much more flexible in their guide RNA and protospacer-adjacent motif requirements compared with modern-day Cas9 enzymes. Furthermore, anCas portrays a gradual palaeoenzymatic adaptation from nickase to double-strand break activity, exhibits high levels of activity with both single-stranded DNA and single-stranded RNA targets and is capable of editing activity in human cells. Prediction and characterization of anCas with a resurrected protein approach uncovers an evolutionary trajectory leading to functionally flexible ancient enzymes.This work has been supported by grant nos. PID2019-109087RB-I00 (to R.P.-J.) and RTI2018-101223-B-I00 and PID2021-127644OB-I00 (to L.M.) from the Spanish Ministry of Science and Innovation. This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement no. 964764 (to R.P.-J.). The content presented in this document represents the views of the authors, and the European Commission has no liability in respect to the content. We acknowledge financial support from the Spanish Foundation for the Promotion of Research of Amyotrophic Lateral Sclerosis. A.F. acknowledges Spanish Center for Biomedical Network Research on Rare Diseases (CIBERE) intramural funds (no. ER19P5AC756/2021). F.J.M.M. acknowledges research support by Conselleria d’Educació, Investigació, Cultura i Esport from Generalitat Valenciana, research project nos. PROMETEO/2017/129 and PROMETEO/2021/057. M.M. acknowledges funding from CIBERER (grant no. ER19P5AC728/2021). The work has received funding from the Regional Government of Madrid (grant no. B2017/BMD3721 to M.A.M.-P.) and from Instituto de Salud Carlos III, cofounded with the European Regional Development Fund ‘A way to make Europe’ within the National Plans for Scientific and Technical Research and Innovation 2017–2020 and 2021–2024 (nos. PI17/1659, PI20/0429 and IMP/00009; to M.A.M.-P. B.P.K. was supported by an MGH ECOR Howard M. Goodman Award and NIH P01 HL142494

Propiedades catalíticas de la lipasa B de Candida antarctica inmovilizada en soportes magnéticos. Actividad sintética en disolventes orgánicos

Este trabajo se centra en la inmovilización de la lipasa B de Candida antarctica en nanopartículas magnéticas y la posterior caracterización cinética de su actividad sintética en medios orgánicos para la pr oducción de biodiesel. La historia del biodiesel comienza en 1893, cuando Rudolph Diesel, el padre del motor diésel, puso en marcha el primer motor de este tipo. Más tarde, en 1900, Diesel ganó el Grand Prix en la Feria Mundial de París con su m otor impulsado por un biodiesel de aceite de cacahuete. En 1903, además, comenzó la producción del Modelo T de Henry Ford, diseñado para utilizar etanol como combustible. Diesel creía que la utilización de biodiesel era el futuro de la automoción: “ el uso de aceites vegetales como combustibles para motor puede parecer insignificante hoy en día, pero estos aceites puede n convertirse, con el transcurso del tiempo, en combustibles tan importantes como el petróleo y el carbón lo son hoy en día ” Sin embargo, a p artir de 1920, los fueles basados en petróleo comenzaron a ganar terreno, debido a su mayor eficiencia, menor precio y mejor disponibilidad. De esta forma, el mercado de los biofueles quedó relegado hasta que las distintas crisis del petróleo (1973, 1979, 19 90) unidas a la creciente preocupación por la polución y la c onservación del medio ambiente, además de al aumento de la población y por tanto de la demanda de combustibles , llevaron a devolve r la mirada a estos fueles . Fue en esta época cuando comenzó, p rincipalmente en EEUU y Brasil, la producción a gran escala de biocombustibles de primera generación, basados en la utilización de excedentes agrícolas como el maíz y la caña de azúcar para la producción de bioetanol y aceites de maíz y grasas animales par a la producción de biodiesel

Ariadne's Thread in the Analytical Labyrinth of Membrane Proteins:Integration of Targeted and Shotgun Proteomics for Global Absolute Quantification of Membrane Proteins

The field of systems biology has been rapidly developing in the past decade. However, the data produced by "omits" approaches is lagging behind the requirements of this field, especially when it comes to absolute abundances of membrane proteins. In the present study, a novel approach for large-scale absolute quantification of this challenging subset of proteins has been established and evaluated using osmotic stress management in the Gram-positive model bacterium Bacillus subtilis as proof-of-principle precedent. Selected membrane proteins were labeled using a SNAP-tag, which allowed us to visually inspect the enrichment of the membrane fraction by immunoassays. Absolute membrane protein concentrations were determined via shotgun proteomics by spiking crude membrane extracts of chromosomally SNAP-tagged and wild-type B. subtilis strains with protein standards of known concentration. Shotgun data was subsequently calibrated by targeted mass Snotgun-his Targeted MY spectrometry using SNAP as an anchor protein, and an enrichment factor was calculated in order to obtain membrane protein copy numbers per square micrometer. The presented approach enabled the accurate determination of physiological changes resulting from imposed hyperosmotic stress, thereby offering a clear visualization of alterations in membrane protein arrangements and shedding light on putative membrane complexes. This straightforward and cost-effective methodology for quantitative proteome studies can be implemented by any research group with mass spectrometry expertise. Importantly, it can be applied to the full spectrum of physiologically relevant conditions, ranging from environmental stresses to the biotechnological production of small molecules and proteins, a field heavily relying on B. subtilis secretion capabilities