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CartoCell, a high-content pipeline for 3D image analysis, unveils cell morphology patterns in epithelia
Decades of research have not yet fully explained the mechanisms of epithelial self-organization and 3D packing. Single-cell analysis of large 3D epithelial libraries is crucial for understanding the assembly and function of whole tissues. Combining 3D epithelial imaging with advanced deep-learning segmentation methods is essential for enabling this high-content analysis. We introduce CartoCell, a deep-learning-based pipeline that uses small datasets to generate accurate labels for hundreds of whole 3D epithelial cysts. Our method detects the realistic morphology of epithelial cells and their contacts in the 3D structure of the tissue. CartoCell enables the quantification of geometric and packing features at the cellular level. Our single-cell cartography approach then maps the distribution of these features on 2D plots and 3D surface maps, revealing cell morphology patterns in epithelial cysts. Additionally, we show that CartoCell can be adapted to other types of epithelial tissues.Ministerio de Ciencia e Innovación PID2019-103900GB-I00, PID2020-120367GB-I00, PID2021-126701OB-I00Junta de Andalucía US-1380953, PY18-631Ministerio de Economía y Competitividad BES-2022-07778
Didáctica de la Música Comtemporánea en los Conservatorios de Música
Resumen basado en el de la publicaciónSe incluye archivo con anexosLa formación en arte moderno, muy particularmente en música, resulta muy compleja tanto a nivel primario como secundario. La enseñanza musical se canaliza a través de enseñanzas de régimen general y de régimen especial, formación cultural y formación técnica. Pero en ningún caso la propia legislación apuesta por los valores actuales, sino por la tradición, obviando en buena medida la evolución acaecida en música en los últimos cien años y sus aportaciones. Las principales causas de esta desatención podrían relacionarse con la eficiencia y con la innovación. La actividad docente – en última instancia – viene determinada por el cumplimiento de unas programaciones de amplios contenidos, que requieren una atención muy continuada y que dificultan la ampliación de dichos contenidos con el mismo tiempo de atención. Además, la innovación en contenidos requiere innovación en metodología, así como ampliación de recursos y conocimientos. Aplicar la innovación en términos de eficiencia, requiere del docente un esfuerzo verdaderamente extraordinario de puesta al día en conocimiento de estilos, repertorio, material didáctico (normalmente de difícil acceso, y principalmente editados en el extranjero), grabaciones… y saber adecuarlo a las circunstancias. El proyecto de innovación “Didáctica de la música contemporánea en los conservatorios de música” realizado en el Conservatorio Profesional de Música, C.P.M. “Marcos Redondo" de Ciudad Real, pretende paliar ese déficit de formación en los profesores, que termina por incidir en los alumnos. El hecho de tratarse de un proyecto de innovación supone un incentivo importante para la actividad docente individual, así como para priorizar esta cuestión a nivel de Centro.Consejería de Educación, Cultura y Deportes de Castilla-La ManchaCastilla La ManchaES