Diagnostic des infections sexuellement transmissibles à l'Institut Hospitalo-universitaire Méditerranée Infection, une évaluation rétrospective

La fréquence des infections sexuellement transmissibles (IST) est en augmentation en France. Jusqu’à 77 % de ces infections sont asymptomatiques et les localisations extra-génitales des IST (anales ou pharyngées) sont fréquentes. Nous avons mené une analyse rétrospective des données des kits diagnostics d’IST réalisés dans notre centre sur une période de 18 mois, permettant le diagnostic de treize pathogènes fréquents responsables d’IST.Sur la période étudiée, 363 kits ont été réalisés chez 327 patients dont 87 % d’hommes. 106 IST ont été diagnostiquées sur 94 kits. La syphilis a été l’IST la plus fréquemment retrouvée (48 % des IST diagnostiquées). Le kit IST a permis de diagnostiquer une IST dans 19 % des cas si le patient était asymptomatique et dans 40 % des cas si le patient était symptomatique. Les infections à C. trachomatis et à N. gonorrhoeae étaient asymptomatiques dans respectivement 83 % et 45 % des cas. Le diagnostic par biologie moléculaire sur prélèvement rectal a été plus sensible que les urines pour le diagnostic de N. gonorrhoeae (100 % versus 37 %), de C. trachomatis (80 % versus 30 %) et de T. pallidum (83 % versus 16 %). Chez les patients présentant une urétrite clinique, dans 52 % des cas aucun germe typique d’IST n’a été retrouvé. Parmi les kits réalisés, un HPV oncogène a été détecté dans 42 % des cas. En cas d’antécédent d’IST le dépistage d’HPV était plus fréquemment positif qu’en absence d’IST (68 % versus 46 %, p<0,001). Une IST a été retrouvée chez près d’un patient asymptomatique sur cinq, renforçant l’intérêt du dépistage. Nous proposons un kit IST optimisé en précisant la place du dépistage d’HPV

Should we fear gonorrhoea?

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Failure of metagenomics in detecting emerging pathogens, the Clostridium difficile paradigm

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Metagenomics, culturomics, and the human gut microbiota

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Old antimicrobials and Gram-positive cocci through the example of infective endocarditis and bone and joint infections

International audienceThe management of some serious infections such as infective endocarditis (IE) and bone and joint infections (BJIs) caused by Gram-positive cocci (GPC) is complex and requires great responsiveness and effective antimicrobials with high bioavailability in heart valves or bone tissues. Treatment of these infections requires the use of a higher dosage that may result in increased toxicity or the use of new promising antimicrobials to control the infection. However, use of these new antimicrobials could still bring about new toxicity and resistance. Another approach may be the `comeback' of old antimicrobials, which is evaluated in this review in the treatment of IE and BJIs caused by GPC. (C) 2017 Elsevier B.V. and International Society of Chemotherapy. All rights reserved

Clostridium scindens Is Present in the Gut Microbiota during Clostridium difficile Infection: a Metagenomic and Culturomic Analysis

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Koch Postulate: Why Should we Grow Bacteria?

International audienceUnderstanding infectious diseases has long relied on the Koch postulate, which consists of the pure culture of microorganisms. The advent of molecular methods in clinical microbiology has led the phasing out of culture as a diagnostic tool and metagenomics has become the technique most commonly used to assess the impact of commensal microbes on human health. However, culturing microbes has led to substantial advances, even recently, in infectious diseases involving fastidious microorganisms, as evidenced by the Tropheryma whipplei or Bartonella species. This allows their genomes to be sequenced and, consequently, new diagnostic tools to be acquired, experimental model to be created and antibiotic susceptibility testing to be performed. In addition, extensive culture focused on isolation of human commensals, know as the culturomics approach, has increased the number of bacteria isolated from humans by more than 35% over the past five years. As strains belonging to the same species can have different impacts on human health, it would appear necessary to pursue efforts to constitute an exhaustive bank of isolates in order to establish further proof of concepts. This review discusses recent examples, including the influence of Akkermansia muciniphila and Faecalibacterium prausnitzii, as well as the secretion of lugdunin by Staphylococcus lugdunensis which is efficient against the nasal carriage of Staphylococcus aureus. Finally, responses to some anti-cancer therapies and the treatment of Clostridium difficile infections through the use of fecal microbiota transplantation clearly suggest that culturing marks the beginning of bacteriotherapy

Measles from Madagascar

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