3 research outputs found
Fish biodiversity of Courtown Cays, seaflower biosphere reserve (Colombian Caribbean): new records and an annotated checklist
Phylogeographic pattern of the common octopus Octopus insularis in the Colombian Caribbean
Ilustraciones, tablasOctopus insularis es una especie de pulpo de aguas someras explotada por las pesquerías artesanales y distribuida a lo largo del Atlántico occidental, el Golfo de México, el Caribe y una extensa región del Atlántico sur. Con el fin de evaluar su patrón filogeográfico se analizaron marcadores mitocondriales (16S rRNA y COIII) y marcadores nucleares (SNP’s) a lo largo del genoma de individuos provenientes de la pesca artesanal, en diferentes localidades de la costa Caribe colombiana: Providencia, San Andrés, Cabo de la Vela, Santa Marta, isla Ceycén e isla Fuerte. Los análisis mitocondriales mostraron haplotipos nuevos ((16S = H2, H3 y H4) (COIII = H2 – H7)) y haplotipos compartidos con áreas geográficas distantes ((16S = H1) (COIII = H1)). La prueba de FST por pares no mostró diferenciación genética entre localidades con los genes mitocondriales evaluados. El análisis demográfico de COIII indicó que el tamaño efectivo poblacional de la especie se ha mantenido constante. Se hicieron inferencias a partir de datos genómicos de última generación con ADN asociado a sitios de restricción (ddRAD-seq) y se obtuvieron en total 6769 loci polimórficos, dichos datos mostraron, mediante la prueba de FST por pares, que existen diferencias bajas pero significativas entre localidades (Cabo de la Vela-Santa Marta; Cabo de la Vela-Isla Fuerte/Isla Ceycén; Santa Marta-Isla Fuerte/Isla Ceycén). No obstante, el análisis de varianza molecular (AMOVA) general y el análisis de coordenadas principales mostraron que no existe diferenciación genética entre las poblaciones geográficas analizadas. No se encontró correlación entre la distancia genética y la distancia geográfica mediante la prueba de Mantel y los análisis de estructura indicaron la presencia de un único stock genético distribuido homogéneamente a lo largo de todas las localidades. La información obtenida en este estudio permite evidenciar la falta de estructuración y conectividad genética poblacional de O. insularis debido a la ausencia de barreras biogeográficas putativas que afecten su flujo génico en el Caribe sur; a la alta capacidad de dispersión que posee por sus estrategias de historia de vida larval (paralarva planctónica) y a los factores oceanográficos que operan en el área de estudio.Octopus insularis is a shallow-water octopus species exploited by artisanal fisheries and distributed
throughout the western Atlantic, the Gulf of Mexico, the Caribbean, and an extensive region of the
South Atlantic. In order to evaluate its phylogeographic pattern, mitochondrial markers (16S rRNA
and COIII) and nuclear markers (SNP's) were analyzed along the genome of individuals from
artisanal fishing, in different locations on the Colombian Caribbean coast: Providencia, San Andres,
Cabo de la Vela, Santa Marta, Isla Ceycén and Isla Fuerte. Mitochondrial analyzes showed new
haplotypes ((16S = H2, H3 and H4) (COIII = H2 - H7)) and haplotypes shared with distant geographic
areas ((16S = H1) (COIII = H1)). The pair-wise FST test did not show genetic differentiation between
localities with the evaluated mitochondrial genes. The COIII demographic analysis indicated that the
effective population size of the species has remained constant. Inferences were made from the latest
generation genomic data with DNA associated with restriction sites (ddRAD-seq) and a total of 6769
polymorphic loci were obtained; these data showed, by means of the pair-wise FST test, that there
are low but significant differences between locations (Cabo de la Vela-Santa Marta; Cabo de la VelaIsla Fuerte / Isla Ceycén; Santa Marta-Isla Fuerte / Isla Ceycén). However, the general molecular
analysis of variance (AMOVA) and the principal coordinate analysis showed that there is no genetic
differentiation between the geographic populations analyzed. No correlation was found between
genetic distance and geographic distance using the Mantel test and the structure analyzes indicated
the presence of a single genetic stock homogeneously distributed throughout all localities. The
information obtained in this study shows the lack of structure and population genetic connectivity of
O. insularis due to the absence of putative biogeographic barriers that affect its gene flow in the
southern Caribbean; to the high dispersal capacity of its larval life history (planktonic paralarva) and
to the oceanographic factors that operate in the study area.MaestríaMagíster en Ciencias - BiologíaSe usaron marcadores mitocondriales (COIII y 16S) y nucleares (SNP"s) para analizar el patrón filogeográfico de Octopus insularis en el Caribe colombiano
Genetic and morphologic identities of hydrozoans (Cnidaria, Hydrozoa) from reef patches of Santa Marta, Colombian Caribbean
Torres-Rodríguez, Javier, Ortiz-Oyola, Daniel, Puentes-Sayo, Alejandra, Lecompte, Orlando P., Jauregui, Aminta (2020): Genetic and morphologic identities of hydrozoans (Cnidaria, Hydrozoa) from reef patches of Santa Marta, Colombian Caribbean. Zootaxa 4758 (1): 127-140, DOI: https://doi.org/10.11646/zootaxa.4758.1.