Genetic diversity in Mexican Creole pigs with candidate genes associated with productive characters

The aim of this study was to compare the genetic variability and diversity, and genetic distances between Mexican Creole pigs – Pelón Mexicano (CPM) and Cuinos (CC) – with the commercial breed Yorkshire for the candidate genes CAST,DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN andCHX, using the PCR-RFLP technique. One hundred eighty pigs (59 CPM, 65 CC and 56 Yorkshire) were evaluated. Gene and genotypic frequencies, heterozygosity, genetic distances and filogenetic trees between breed groups were analyzed. In the comparison among the three breeds, the allelic and genotypic frequencies were different for CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 and CHX. ForLIPE, CC pigs were similar to Yorkshire; while for MYOG, the CPM were similar to Yorkshire breeds. There were no differences in the genic and genotypic frequencies for HALand RN genes between Creole and Yorkshire populations. The Yorkshire breed had higher favorable allele frequency for CAST, LIPE, MCR4 and MYOG, smaller for DECR1,HFABP4, and for CHX, and moderate for LEP genes. The heterozygosity average for all genes was higher in CPM (0.42±0.05) and similar in both the CC (0.33±0.06) and Yorkshire (0.35±0.05) breeds. In the estimation of genetic distances considering all genes, the CC breed are more distant from the Yorshire pigs.El objetivo de este trabajo fue comparar la variabilidad, diversidad y distancias genéticas entre cerdos criollos, Pelón Mexicano (CPM) y Cuinos (CC), con Yorkshire, cuanto a los genes candidatos CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN y CHX, a través de analysis por PCR-RFLP. Se evaluaron 180 cerdos: 59 CPM, 65 CC y 56 Yorkshire. Se analizaron las frecuencias génicas y genotípicas, heterocigosidad, distancias genéticas y árboles filogenéticos entre grupos raciales. Para CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 y CHX las frecuencias génicas y genotípicas fueron diferentes al comparar las tres razas. En LIPE, los CC fueron iguales a los Yorkshire; en cuanto a MYOG, los CPM fueron iguales a los Yorkshire. No hubo diferencias entre poblaciones criollas y Yorkshire en las frecuencias génicas y genotípicas para HAL y RN. Los cerdos Yorkshire presentaron mayor frecuencia en alelos favorables para CAST, LIPE, MCR4 y MYOG, menor frecuencia de DECR1, HFABP4, CHX, y moderada en LEP. La heterocigosidad promedio para todos los genes fue mayor en CPM (0,42±0,05) y similar en CC (0,33±0,06) y Yorkshire (0,35±0,05). Al calcular distancias genéticas con todos los genes, los CC se encuentran más distantes de los Yorkshire.The aim of this study was to compare the genetic variability and diversity, and genetic distances between Mexican Creole pigs – Pelón Mexicano (CPM) and Cuinos (CC) – with the commercial breed Yorkshire for the candidate genes CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN and CHX, using the PCR-RFLP technique. One hundred eighty pigs (59 CPM, 65 CC and 56 Yorkshire) were evaluated. Gene and genotypic frequencies, heterozygosity, genetic distances and filogenetic trees between breed groups were analyzed. In the comparison among the three breeds, the allelic and genotypic frequencies were different for CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 and CHX. For LIPE, CC pigs were similar to Yorkshire; while for MYOG, the CPM were similar to Yorkshire breeds. There were no differences in the genic and genotypic frequencies for HAL and RN genes between Creole and Yorkshire populations. The Yorkshire breed had higher favorable allele frequency for CAST, LIPE, MCR4 and MYOG, smaller for DECR1, HFABP4, and for CHX, and moderate for LEP genes. The heterozygosity average for all genes was higher in CPM (0.42±0.05) and similar in both the CC (0.33±0.06) and Yorkshire (0.35±0.05) breeds. In the estimation of genetic distances considering all genes, the CC breed are more distant from the Yorshire pigs

Aplicación del protocolo de auditoría Welfare Quality® en bovinos Holstein para engorda bajo condiciones desérticas

The application of the European Welfare Quality® protocol was evaluated in finishing Holstein males in a fattening cattle production company located in the Mexicali Valley, Baja California, Mexico. Twelve pens were randomly selected with 75 steers per pen. In addition, 38 animals per pen were individually evaluated. The evaluation was performed using a format for each of the four principles: feeding, housing, health and behaviour, corresponding to 9 criteria and evaluating 20 measurements, to obtain a global rating. The results for the principles "good health" were 92 points, for housing " 88 points, for "health" 52 points and for " behaviour" 68 points. The overall rating was "good animal welfare". It is concluded that the European protocol WQ® is feasible to be applied in finishing feedlots; however, modifications and adaptations of some measurements are suggested in accordance with the climatic conditions of the area and the temperament of the Holstein cattle.Con el objetivo de evaluar la aplicación del protocolo europeo Welfare Quality® en machos Holstein en finalización, se realizó un estudio en una empresa productora de ganado de engorda ubicada en el valle de Mexicali, Baja California, México. Se seleccionaron aleatoriamente 12 corrales con 75 machos por corral, además de evaluaciones individuales a 38 animales por corral. Se aplicaron formatos considerando los cuatro principios: alimentación, alojamiento, salud y comportamiento, correspondientes a 9 criterios y evaluando 20 mediciones, para obtener una calificación global. La calificación para los principios “buena salud” obtuvo 92 puntos, el de “buen alojamiento” 88 puntos, el de “buena salud” 52 puntos y el de “comportamiento adecuado” 68 puntos. La calificación global fue de “buen bienestar animal”. Se concluye que el protocolo europeo WQ® es factible de ser aplicable en los corrales de engorda en finalización; sin embargo, se sugieren modificaciones y adecuaciones de algunas mediciones acordes con las condiciones climáticas de la zona y el temperamento del ganado Holstein

Comparación de la castración quirúrgica al nacimiento versus inmunocastración sobre el comportamiento conductual y parámetros sanguíneos (testosterona y cortisol) en machos Holstein en engorda

The behavioural response and blood parameters were compared in immunocastrated and surgically castrated bovine males. In total, 720 Holstein males, 7-8 months old and approximately 240 kg body weight were used. One group was immunocastrated by vaccination with Bopriva (commercial anti-GnRH vaccine) on days 1, 21, 101 and 181 days of the fattening and the other group was surgically castrated at birth. Blood samples were taken on vaccination days for testosterone determination and on days 181 and during slaughtering to analyse blood cortisol. Sexual behaviour (mounts and flehmen signs) and aggressive (threats and head butting) and social behaviour (sniffing, grooming, lowered head, and vocalization) were evaluated, finding no significant differences between treatments. Testosterone concentration in both treatments was below 1 ng/ml in all samples. Cortisol levels on day 181 of fattening were lower (p<0.05) with respect to the day of slaughtering in both treatments. Slaughter weight (242 days fattening) was 595.0 kg in immunocastrated males and 620.74 kg in surgically castrated males.Se comparó el comportamiento conductual y parámetros sanguíneos en toros inmunocastrados y quirúrgicamente castrados. Se utilizaron 720 machos Holstein de 7-8 meses de edad y peso aproximado de 240 kg. Un grupo fue inmunocastrado mediante vacunación con Bopriva (vacuna comercial anti-GnRH) los días 1, 21, 101 y 181 días de engorda y el otro grupo fue castrado quirúrgicamente al nacimiento. Se tomaron muestras de sangre los días de las vacunaciones para la determinación de testosterona y los días 181 y durante el desangrado en el sacrificio para analizar cortisol sanguíneo. Se evaluó el comportamiento sexual (montas y signos de flehmen), agresivo (amenazas y topetazos) y social (olfateos, acicalamiento, cabeza baja y vocalizaciones) no encontrándose diferencias significativas entre tratamientos. La concentración de testosterona en ambos tratamientos fue por debajo de 1 ng/ml en todos los muestreos. Los niveles de cortisol en el día 181 de engorda fueron más bajos (p<0.05) con respecto al día de sacrificio en ambos tratamientos. El peso al sacrificio (242 días de engorda) fue de 595.0 kg en machos inmunocastrados y 620.74 kg en castrados quirúrgicamente

APLICACIÓN DE UN MODELO ARIMA PARA PRONOSTICAR LA PRODUCCIÓN DE LECHE DE BOVINO EN BAJA CALIFORNIA, MÉXICO

El objetivo fue aplicar un modelo de series de tiempo univariado tipo ARIMA en la descripción y pronóstico del comportamiento de la producción lechera de bovino en el estado, aplicando para ello la metodología de Box y Jenkins. La serie de producción mensual de litros leche de enero del 2000 a diciembre del 2009 fue utilizada en el estudio. El análisis  del  correlograma  y la aplicación de la prueba de Dickey y Fuller aumentada indicaron que la producción lechera presentaba un comportamiento estacional. Del análisis de diversas combinaciones AR(p) y MA(q), dos modelos fueron propuestos y evaluados: ARMA (1,1) y ARMA (2,2). Los parámetros fueron estimados por mínimos cuadrados. Con base a éstos y aplicando los criterios de Akaike y Schwarz (18.06, 18.13 y 18.20, 18.27, respectivamente) se definió el mejor modelo. Adicionalmente se analizaron los residuales y la capacidad predictiva de cada modelo a través de los estadísticos de calidad de ajuste, resultando como mejor el ARMA (1,1). Se concluye que este tipo de modelos son de utilidad tanto para describir como para predecir el comportamiento de la producción lechera

Diversidad genética en cerdos criollos mexicanos con genes candidatos asociados a características productivas

The aim of this study was to compare the genetic variability and diversity, and genetic distances between Mexican Creole pigs – Pelón Mexicano (CPM) and Cuinos (CC) – with the commercial breed Yorkshire for the candidate genes CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN and CHX, using the PCR-RFLP technique. One hundred eighty pigs (59 CPM, 65 CC and 56 Yorkshire) were evaluated. Gene and genotypic frequencies, heterozygosity, genetic distances and filogenetic trees between breed groups were analyzed. In the comparison among the three breeds, the allelic and genotypic frequencies were different for CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 and CHX. For LIPE, CC pigs were similar to Yorkshire; while for MYOG, the CPM were similar to Yorkshire breeds. There were no differences in the genic and genotypic frequencies for HAL and RN genes between Creole and Yorkshire populations. The Yorkshire breed had higher favorable allele frequency for CAST, LIPE, MCR4 and MYOG, smaller for DECR1, HFABP4, and for CHX, and moderate for LEP genes. The heterozygosity average for all genes was higher in CPM (0.42±0.05) and similar in both the CC (0.33±0.06) and Yorkshire (0.35±0.05) breeds. In the estimation of genetic distances considering all genes, the CC breed are more distant from the Yorshire pigs.El objetivo de este trabajo fue comparar la variabilidad, diversidad y distancias genéticas entre cerdos criollos, Pelón Mexicano (CPM) y Cuinos (CC), con Yorkshire, cuanto a los genes candidatos CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN y CHX, a través de analysis por PCR-RFLP. Se evaluaron 180 cerdos: 59CPM, 65CC y 56Yorkshire. Se analizaron las frecuencias génicas y genotípicas, heterocigosidad, distancias genéticas y árboles filogenéticos entre grupos raciales. Para CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 y CHX las frecuencias génicas y genotípicas fueron diferentes al comparar las tres razas. En LIPE, los CC fueron iguales a los Yorkshire; en cuanto a MYOG, los CPM fueron iguales a los Yorkshire. No hubo diferencias entre poblaciones criollas y Yorkshire en las frecuencias génicas y genotípicas para HAL y RN. Los cerdos Yorkshire presentaron mayor frecuencia en alelos favorables para CAST, LIPE, MCR4 y MYOG, menor frecuencia de DECR1, HFABP4, CHX, y moderada en LEP. La heterocigosidad promedio para todos los genes fue mayor en CPM (0,42±0,05) y similar en CC (0,33±0,06) y Yorkshire (0,35±0,05). Al calcular distancias genéticas con todos los genes, los CC se encuentran más distantes de los Yorkshire