COVID-19 associated pulmonary aspergillosis in ICU patients: Report of five cases from Argentina

Invasive pulmonary aspergillosis is a complication in critically ill patients with acute respiratory distress syndrome, especially those with severe coronavirus disease-associated pneumonia. In this study, five cases of presumed invasive pulmonary aspergillosis in one immunocompromised and four immunocompetent patients with COVID-19 in Buenos Aires are described. In all cases, the underlying conditions, clinical presentation, fungal diagnostic tests used and their results, features of the chest scan images, antifungals used and clinical outcomes are detailed.Fil: Benedetti, María Fernanda. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Alava, Katherine Hermida. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Sagardia, Judith. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Cadena, Roberto Corella. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Laplume, Diego. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Capece, Paula. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Posse, Gladys. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Nusblat, Alejandro David. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

Análisis genéticos de las mutaciones presentes en las poblaciones virales minoritarias asociadas con farmacorresistencia a la familia de los nrti en pacientes con vih-1

EL VIH ES RESISTENTE A LOS ANTIRRETROVIRALES ES UNO DE LOS PRINCIPALES PROBLEMAS EN LA LUCHA CONTRA EL VIH/SIDA EN LA ACUTALIDAD.EL OBJETIVO DE ESTA TESIS FUE EL IMPLEMENTAR LA TÉCNICA DE PIROSECUENCIACION 454 (ROCHE), PARA DETECTAR MUTACIONES ASOCIADAS A RESISTENCIA EN POBLACIONES MINORITARIAS (1-20%)GuayaquilBiólog

Esporotricosis felina por Sporothrix globosa en la región metropolitana de Buenos Aires: estudio de un caso

We describe here the first case of feline sporotrichosis caused by Sporothrix globosa, occurring outside the epizootic area of Buenos Aires province, Argentina. Unlike cases reported with Sporothrix brasiliensis, on this occasion there was no clinical or serological evidence of zoonotic transmission through scratches or bites from the sick cat to the attending veterinarian or the person responsible for its care. This report aimed to improve the knowledge about the pathogenic profile of S. globosa.En este trabajo se describe el primer caso de esporotricosis felina causada por Sporothrix globosa fuera del área epizoótica de Buenos Aires. A diferencia de los casos documentados de Sporothrix brasiliensis, en este no hubo evidencia clínica ni serológica de transmisión zoonótica por aranazos ˜ o mordeduras del gato enfermo a su dueno˜ ni al veterinario que lo atendió. Con este reporte se espera contribuir a un mejor conocimiento sobre el perfil patogénico de S. globosa.Fil: Etchecopaz, Alejandro Nazareno. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Hermida Alava, Katherine Stefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Escarpa Miguel, Jesús Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Duchene, Adriana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: García Re, Diego. Veterinaria San Juan; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

Molecular epidemiology of Aspergillus species and other moulds in respiratory samples from Argentinean patients with cystic fibrosis

In cystic fibrosis (CF) patients, fungal colonization of the respiratory tract is frequently found. Aspergillus fumigatus is the most frequently recorded and is associated with loss of pulmonary function and allergic disease (ABPA). The knowledge on prevalence rates of filamentous fungi in CF patients in Latin America is scarce. One hundred and seventy-six fungal isolates recovered from the upper respiratory tract of CF patients from Argentina were identified to species by morphology and DNA sequencing. In total, 90% of CF patients were colonized by Aspergillus sp., followed by Exophiala sp. (14%) and Scedosporium sp. (10%). Among Aspergillus, six species complexes (Fumigati, Flavi, Terrei, Nigri, Usti, and Nidulante) and different cryptospecies were found. Among Scedosporium, three species were observed (Scedosporium apiospermum, Scedosporium aurantiacum and Scedosporium boydii). All Exophiala isolates were identified as Exophiala dermatitidis. Rare filamentous fungi were also found. All cases of ABPA were associated to the presence of A. fumigatus. Mixed colonization with other mould or rare fungi was observed in half of them. To our knowledge, this is the first prospective study of mould species in CF using molecular methods in Latin America. This study shows that Aspergillus sp., E. dermatitidis and Scedosporium sp. have a high frequency in CF patients from Argentina, and by far, A. fumigatus was the most commonly cultured species. Continuous clinical surveillance is required to detect the emergence of new fungal pathogens and to detect resistant or difficult-to-treat species capable of chronic colonizing the airways and of hematogenous dissemination in case of lung transplantation.Fil: Brito Devoto, Tomás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Hermida Alava, Katherine Stefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Pola, Santiago J.. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Pereda, Rosana. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños Pedro Elizalde (ex Casa Cuna); ArgentinaFil: Rubeglio, Etelvina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Finquelievich, Jorge L.. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

Hallazgo de Scedosporium boydii en un paciente inmunocomprometido y revisión de la literatura

Background: Scedosporiasis is an emerging mycosis that has gained importance in recent years due to its worldwide prevalence. It is caused by species of the Scedosporium apiospermum complex. These species can cause opportunistic infections in immunocompromised patients and, occasionally, in immunocompetent patients as well. The high intrinsic antifungal resistance make these infections difficultto manage. Aims: The objective ofthis study was to interpretthe mycological findings in a transplant patient,together with the images obtained in the radiological studies, in order to provide an early and effective antifungal therapy. Methods: The mycological analysis of samples taken from a heart transplant patient with radiological images suggesting a fungal infection was performed. Computed tomography scan of the head and thorax showed space-occupying lesions in both the frontal lobe and cerebellum, and multiple pulmonary nodules. The nodules were punctured and the samples obtained were analyzed according to the procedures for mycological analysis. The identity of the isolates was confirmed by nucleotide sequencing. Eventually, the antifungal susceptibility was studied. Results: The fungal isolates obtained, whose identity was confirmed by sequencing, belonged to the species Scedosporium boydii. Injured tissues were surgically removed and a treatment with amphotericin B and voriconazole-minimum inhibitory concentration (MIC) 0.5 g/mL and ≥0.5 g/mL respectively – was administered. Conclusions: Although the patient died due to complications of a Klebsiella pneumoniae sepsis refractory to treatment, the progression of the fungal disease, although slow, was favourable in the early phases of the treatment due to a correct diagnosis and the antifungal susceptibility test carried out. Clinical cases of this nature highlight the need to increase the epidemiological study of these microorganisms, as well as the proper treatment ofthe diseases caused, in order to achieve early diagnoses that reduce the morbidity and mortality of patients.Antecedentes: La escedosporiasis es una micosis emergente de relevancia en los últimos anos ˜ por su prevalencia mundial. Es causada por especies del complejo Scedosporium apiospermum (S. apiospermum), que pueden provocar infecciones oportunistas de difíciltratamiento en pacientes inmunocomprometidos y, ocasionalmente, en inmunocompetentes. El alto grado de resistencia intrínseca de las especies de este complejo dificulta el manejo de las infecciones. Objetivos: Interpretar los hallazgos micológicos en un paciente trasplantado, en conjunción con los estudios radiológicos, a fin de instaurar una terapia antifúngica precoz y efectiva. Métodos: Se realizó el estudio micológico de muestras de un paciente con trasplante cardiaco, cuyos exámenes radiológicos eran compatibles con una infección fúngica. La tomografía axial computarizada de cabeza y tórax mostró masas ocupantes en el lóbulo frontal y el cerebelo, así como múltiples nódulos pulmonares. Se punzaron las mismas y se procesó de acuerdo con el protocolo de análisis micológico de rutina; la identidad de los aislamientos se confirmó por secuenciación nucleotídica. Finalmente se evaluó la sensibilidad antifúngica. Resultados: La identidad de los aislamientos fúngicos obtenidos fue Scedosporium boydii (S. boydii). Se procedió a la remoción quirúrgica del tejido afectado y se puso un tratamiento con anfotericina B y voriconazol, para los cuales los valores de concentración inhibitoria mínima del aislamiento fueron 0,5 g/mL y ≥ 0,5 g/mL, respectivamente. Conclusiones: Si bien el paciente falleció por complicaciones asociadas a sepsis por Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) refractaria al tratamiento, la evolución del cuadro micológico, aun siendo lenta, progresó favorablemente en las primeras fases del tratamiento. Esto se atribuye a un correcto diagnóstico y evaluación de la sensibilidad antifúngica del hongo aislado. Casos clínicos de este tenor muestran la necesidad de profundizar tanto en el estudio epidemiológico de estos microorganismos como en eltratamiento de las enfermedades que provocan, para lograr así un diagnóstico temprano que disminuya la morbimortalidad de los pacientes.Fil: Ramadán, Silvana Sandra Ana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Dalmaso, Hernan. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Luque, Alicia Graciela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Sortino, Maximiliano Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Química Orgánica. Área Farmacognosia; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Hermida Alava, Katherine Stefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Bértola, Diego Alejandro. Provincia de Santa Fe. Ministerio de Salud y Medio Ambiente - Rosario. Hospital Provincial del Centenario; ArgentinaFil: Bulacio, Lucia Candelaria. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentin

Antifungal susceptibility profile and molecular identification of Cyp51C mutations in clinical and environmental isolates of Aspergillus flavus from Argentina

Background: The emergence of azole resistance in non‐fumigatus Aspergillus strains is on the raise. Objectives: To study the susceptibility profiles and the molecular mechanisms of azole resistance of environmental and clinical strains of Aspergillus flavus from Argentina. Methods: Thirty‐five A flavus isolates (18 from soybean seeds and chickpea seeds and 17 from the clinic) were analysed for amphotericin B and azole resistance using the standard microbroth dilution method according to CLSI M38‐A2 guidelines. Sequencing analysis of the cyp51 genes was conducted in those isolates displaying high MICs values to itraconazole, voriconazole and/or posaconazole. Results: Among the environmental isolates, 33.3% of them showed high MIC values for at least one triazole whereas 23.5% of the clinical isolates displayed high MIC values for amphotericin B. Point mutations in the Cyp51C gene were recorded in most environmental isolates with non‐wild‐type MIC values. Conclusions: Susceptibility differences among environmental A flavus isolates might suggest the possibility of native resistance to certain triazole antifungals used in the clinic. To the best of our knowledge, this is the first report of antifungal screening of environmental strains of A flavus in soybean seeds and chickpea seeds from Argentina that showed increased resistance to voriconazole and itraconazole in comparison to clinical strains.EEA ParanáFil: Hermida‐Alava, Katherine. Universidad de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Brito Devoto, Tomás. Universidad de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Sautua, Francisco José. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Gordó, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Parana; ArgentinaFil: Scandiani, Mercedes M. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Centro de Referencia de Micología (CEREMIC); ArgentinaFil: Formento, Angela Norma. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Paraná; ArgentinaFil: Luque, Alicia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Centro de Referencia de Micología (CEREMIC); ArgentinaFil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Cuestas, María L. Universidad de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin

Highly effective inhalable voriconazole-loaded nanomicelles for fungal infections in cystic fibrosis patients: a promising therapeutic strategy for allergic bronchopulmonary aspergillosis.

In patients with cystic fibrosis (CF), growth of A. fumigatus and other fungal hyphae within the bronchial lumen can trigger an immunoglobulin E-mediated hypersensitivity response known as allergic bronchopulmonary aspergillosis (ABPA) which can potentially advance to fibrosis. The management of ABPA involves the administration of systemic glucocorticoids alongside azole antifungals, such as voriconazole (VRC). This study evaluated the potential of Soluplus® polymeric micelles as an effective nanocarrier for pulmonary delivery of VRC to improve antifungal therapy in CF patients. The micellar nanoformulation prepared in this study could increase up to 51-fold the aqueous solubility of VRC. Their micellar size, evaluated by dynamic light scattering, was 102.2 ± 1.3 nm for loaded freeze-dried nanoformulations with a unimodal size distribution. Nanomicelles showed excellent colloidal stability during the in vitro nebulization process and under dilution in similar interstitial fluids for pulmonary VRC delivery. Nanoformulations demonstrated high in vitro cytocompatibility in A549 and Vero cells. Interestingly, in vitro antifungal activity of VRC-loaded micelles was at least 2-fold higher than the drug aqueous suspension against different fungal species isolated from CF sputum, regardless of the presence of artificial CF mucus layer. Following single intratracheal dose, significantly (p < 0.05) higher VRC concentrations were observed within 2 h in the lung tissue for the micellar formulations compared with the VRC suspension. We concluded that these findings will help to develop a potent and innovative inhalable VRC micellar nanoformulation that may be effective against different lung disorders caused by fungi, such as ABPA.Fil: Briceño, Victor. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Hermida Alava, Katherine Stefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Bernabeu, Ezequiel Adrian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Tecnología Farmacéutica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto de Tecnología Farmacéutica y Biofarmacia (intecfyb); ArgentinaFil: Fuentes, Pedro. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Tecnología Farmacéutica; ArgentinaFil: Brito Devoto, Tomás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Höcht, Christian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Farmacología; Argentina. Instituto de Tecnología Farmacéutica y Biofarmacia (intecfyb); ArgentinaFil: Chiappetta, Diego Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Tecnología Farmacéutica; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Moretton, Marcela Analía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Tecnología Farmacéutica; Argentin

Antifungal susceptibility profile and molecular identification of Cyp51C mutations in clinical and environmental isolates of Aspergillus flavus from Argentina

Background: The emergence of azole resistance in non-fumigatus Aspergillus strains is on the raise. Objectives: To study the susceptibility profiles and the molecular mechanisms of azole resistance of environmental and clinical strains of Aspergillus flavus from Argentina. Methods: Thirty-five A flavus isolates (18 from soybean seeds and chickpea seeds and 17 from the clinic) were analysed for amphotericin B and azole resistance using the standard microbroth dilution method according to CLSI M38-A2 guidelines. Sequencing analysis of the cyp51 genes was conducted in those isolates displaying high MICs values to itraconazole, voriconazole and/or posaconazole. Results: Among the environmental isolates, 33.3% of them showed high MIC values for at least one triazole whereas 23.5% of the clinical isolates displayed high MIC values for amphotericin B. Point mutations in the Cyp51C gene were recorded in most environmental isolates with non-wild-type MIC values. Conclusions: Susceptibility differences among environmental A flavus isolates might suggest the possibility of native resistance to certain triazole antifungals used in the clinic. To the best of our knowledge, this is the first report of antifungal screening of environmental strains of A flavus in soybean seeds and chickpea seeds from Argentina that showed increased resistance to voriconazole and itraconazole in comparison to clinical strains.Fil: Hermida Alava, Katherine Stefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Brito Devoto, Tomás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Sautua, Francisco. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Gordó, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Paraná; ArgentinaFil: Scandiani, María Mercedes. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Formento, Ángela Norma. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Entre Ríos. Estación Experimental Agropecuaria Paraná; ArgentinaFil: Luque, Alicia Graciela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Cuestas, María Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin