Herpesvirus and human Herpesvirus infections

Herpesviruses are widespread throughout the biosphere and infect a wide variety of different animal species. They all belong to the order Herpesvirales and the three families Herpesviridae, Alloherpesviridae, and Malacoherpesviridae. They share numerous properties: an enveloped large DNA structure, an ability to persist indefinitely as a silent infection in the host after primary infection and to reactivate and produce again a lytic infection, an ability to maintain a balance with the host defences, and the development of serious symptoms when these defences weaken. The eight human herpesviruses are herpes simplex viruses type 1 and 2 (HSV-1, HSV-2), varicella-zoster virus (VZV), human cytomegalovirus (CMV), Epstein-Barr virus (EBV), and human herpesviruses (HHV) 6, 7, and 8 (-6, HHV- 7, HHV-8), the last one being also known as Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV). Cell tropism, either during active infection or latency, differs according to each virus species and partly determines the pathogenicity of herpesviruses which behave as opportunistic agents. The diagnosis of acute infections is mainly based on PCR, and particularly real-time to quantify the viral load. Preventive vaccines only exist against VZV. Antiviral chemotherapy, based on viral DNA polymerase inhibitors, is efficient against active infections but has no effect against latent infection or in case of drug resistance due to viral DNA mutations.Les herpèsvirus sont des virus largement répandus dans la biosphère et infectant un très grand nombre d'espèces animales différentes. Ils appartiennent tous à l'ordre des Herpesvirales et aux trois familles Herpesviridae, Alloherpesviridae, et Malacoherpesviridae. Ils partagent de nombreuses propriétés communes: une structure de virus à ADN enveloppé de grande taille, une capacité à persister indéfiniment de façon silencieuse chez leur hôte après la primo-infection et à se réactiver ensuite pour donner à nouveau une infection lytique, l'établissement d'un équilibre vis-à-vis des mécanismes de défense de l'hôte, et la gravité des symptômes quand ces défenses sont amoindries. Les huit herpèsvirus humains sont les virus herpes simplex de type 1 et 2 (HSV-1, HSV-2), le virus de la varicelle et du zona (VZV), le cytomégalovirus (CMV), le virus Epstein-Barr (EBV) et les herpèsvirus humains HHV-6, -7 et - 8, ce dernier étant encore appelé herpèsvirus associé à la maladie de Kaposi (KSHV). Le tropisme cellulaire, qu'il s'agisse de la multiplication active ou de l'état de latence, varie selon l'espèce virale et détermine en partie le pouvoir pathogène de ces virus qui ont un comportement opportuniste. Le diagnostic des infections aiguës repose actuellement essentiellement sur la PCR, en particulier les techniques en temps réel permettant un quantification virale. La prévention des infections humaines par la vaccination se limite au VZV. La chimiothérapie antivirale, fondée sur des inhibiteurs de l'ADN polymérase des herpèsvirus, permet de traiter les infections aiguës mais elle n'est pas efficace sur l'infection latente ou en cas de résistance consécutive à la sélection de mutations du génome viral

Human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) continues to evolve in presence of broadly neutralizing antibodies more than ten years after infection.

BACKGROUND: The evolution of HIV-1 and its immune escape to autologous neutralizing antibodies (Nabs) during the acute/early phases of infection have been analyzed in depth in many studies. In contrast, little is known about neither the long-term evolution of the virus in patients who developed broadly Nabs (bNabs) or the mechanism of escape in presence of these bNabs. RESULTS: We have studied the viral population infecting a long term non progressor HIV-1 infected patient who had developed broadly neutralizing antibodies toward all tier 2/3 viruses (6 clades) tested, 9 years after infection, and was then followed up over 7 years. The autologous neutralization titers of the sequential sera toward env variants representative of the viral population significantly increased during the follow-up period. The most resistant pseudotyped virus was identified at the last visit suggesting that it represented a late emerging escape variant. We identified 5 amino acids substitutions that appeared associated with escape to broadly neutralizing antibodies. They were V319I/S, R/K355T, R/W429G, Q460E and G/T463E, in V3, C3 and V5 regions. CONCLUSION: This study showed that HIV-1 may continue to evolve in presence of both broadly neutralizing antibodies and increasing autologous neutralizing activity more than 10 years post-infection

Continuous evolution of HIV-1 more than ten years after infection in an elite neutralizer

International audienc

Truncated forms of human and simian immunodeficiency virus in infected individuals and rhesus macaques are unique or rare quasispecies

AbstractTruncated proviruses of variable sizes are present in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)-infected persons and simian immunodeficiency virus (SIV)-infected rhesus macaques. Here, we investigated whether the highly deleted HIV and SIV proviruses are present in infected organisms as multiple copies or whether each truncated provirus is unique. Using end-point dilution, multiple long-distance (LD) DNA PCR assays were run in parallel using DNA extracted from PBMC of seropositive, treatment-naive persons and from lymph nodes of a rhesus monkey inoculated with cloned, full-length SIVmac239 DNA. The PCR products were titrated and mapped. Most truncated proviruses were present in the DNA samples tested as single, nonintegrated molecules that differed from one another in size and/or nucleotide sequence. These results indicate that truncated primate lentiviral sequences found in infected tissues are unique or rare quasispecies that do not replicate significantly

Superior control of HIV-1 replication by CD8+T cells is reflected by their avidity, polyfunctionality, and clonal turnover

The key attributes of CD8+ T cell protective immunity in human immunodeficiency virus (HIV) infection remain unclear. We report that CD8+ T cell responses specific for Gag and, in particular, the immunodominant p24 epitope KK10 correlate with control of HIV-1 replication in human histocompatibility leukocyte antigen (HLA)–B27 patients. To understand further the nature of CD8+ T cell–mediated antiviral efficacy, we performed a comprehensive study of CD8+ T cells specific for the HLA-B27–restricted epitope KK10 in chronic HIV-1 infection based on the use of multiparametric flow cytometry together with molecular clonotypic analysis and viral sequencing. We show that B27-KK10–specific CD8+ T cells are characterized by polyfunctional capabilities, increased clonal turnover, and superior functional avidity. Such attributes are interlinked and constitute the basis for effective control of HIV-1 replication. These data on the features of effective CD8+ T cells in HIV infection may aid in the development of successful T cell vaccines

Une histoire de la virologie

La virologie est née à la fin du XIXe siècle de la reconnaissance d’agents infectieux, dits filtrables, qui franchissaient les filtres destinés à retenir les bactéries. L’étude de ces agents, en particulier celle du virus de la mosaïque du tabac et les bactériophages, a conduit à montrer l’originalité de leurs propriétés structurales et physico-chimiques, tout en stimulant le développement de la biologie moléculaire. Les virus des animaux, en plus de leur caractérisation, ont servi de sondes pour explorer le fonctionnement moléculaire des cellules eucaryotes, notamment l’organisation du génome, la régulation transcriptionnelle et les mécanismes d’oncogenèse. Au début des années 1960, une définition précise des virions et du mode de réplication des virus, ainsi qu’une classification internationalement reconnue fondée sur les propriétés moléculaires de ces agents, ont été publiées. Au cours des dernières décennies, la compréhension de la physiopathologie des infections virales a conduit à identifier de nombreux nouveaux virus et à développer des procédures standardisées de diagnostic virologique, une chimiothérapie antivirale spécifique et des vaccinations efficaces. Associées au succès des études plus fondamentales, ces avancées ont contribué au bilan exceptionnellement positif de la virologie au cours des cent dernières années

Infections virales du système nerveux central chez l’homme

International audienceLes virus qui sont capables d’infecter le système nerveux central des êtres humains sont nombreux et forment un ensemble hétérogène par leurs propriétés structurales, fonctionnelles et épidémiologiques. Les mécanismes physiopathologiques qui conduisent aux maladies neurologiques associées, principalement les méningites et les encéphalites, sont aussi complexes et souvent intriqués. Globalement, les signes cliniques neurologiques correspondent soit à des maladies aiguës associées à une primo-infection virale soit à des maladies aiguës, subaiguës ou chroniques associées à des infections virales persistantes. La fréquente gravité de la situation clinique impose dans tous les cas la pratique du diagnostic virologique pour lequel les techniques de PCR appliquées aux échantillons de liquide céphalorachien occupent une place de premier plan. La sévérité des manifestations cliniques justifie le recours à la vaccination préventive quand elle est disponible et aux traitements antiviraux dès que le virus causal est identifié ou suspecté