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Selección y regeneración in vitro de somaclones de tomate de árbol (Solanum betacea cav. Sendt) utilizando filtrados de cultivo de Colletotrichum acutatum con actividad pectinasa
Se utilizaron filtrados de cultivo de Colletotrichum acutatum, agente causal de la antracnosis del tomate de árbol, para la selección in vitro de variantes somaclonales de ésta planta con resistencia potencial a la enfermedad. El filtrado, utilizado a varias concentraciones, demostró ser un agente de selección efectivo cuando se integró al medio de cultivo, pues causó niveles elevados de mortalidad de los explantes comparado con los tratamientos sin filtrado. Igualmente, se estudió el efecto de la benziladenina (BA ó BAP) sobre la respuesta organogénica de explantes de tejido foliar de tomate de árbol.Tomate de árbol-Cyphomandra betace
Selección y regeneración in vitro de somaclones de tomate de árbol (solanum betacea cav. sendt) utilizando filtrados de cultivo de colletotrichum acutatum con actividad pectinasa.
Se utilizaron filtrados de cultivo de Colletotrichum acutatum, agente causal de la antracnosis del tomate de árbol, para la selección in vitro de variantes somaclonales de ésta planta con resistencia potencial a la enfermedad. El filtrado, utilizado a varias concentraciones, demostró ser un agente de selección efectivo cuando se integró al medio de cultivo, pues causó niveles elevados de mortalidad de los explantes comparado con los tratamientos sin filtrado. Igualmente, se estudió el efecto de la benziladenina (BA ó BAP) sobre la respuesta organogénica de explantes de tejido foliar de tomate de árbol
Caracterización de las poblaciones de phytophthora infestan en antioquia, colombia.
De la colección de Phytophthora infestans de la Universidad Nacional de Colombia, se evaluaron aquellos aislamientos provenientes de diferentes localidades de Antioquia, Colombia entre 1994 y 2000. Dichos aislamientos fueron obtenidos de lesiones de tizón tardío en diferentes hospederos. En el año 2000 se caracterizaron por el tipo de apareamiento, haplotipo mitocondrial y razas de virulencia. Todos los aislamientos correspondieron al tipo de apareamiento A1 y se presentaron dos haplotipos mitocondriales: IIa, en aislamientos de todos los hospederos evaluados, y Ib solamente en aislamientos colectados de tomate y pepino de agua (Solanum muricatum). La población antioqueña de P. infestans presenta una amplia complejidad de factores de virulencia (10 de 11), especialmente para los aislamientos colectados de papa, mientras que la población de tomate fue menos compleja. El tipo de apareamiento A1 y el haplotipo mitocondrial IIa han sido asociados a la población EC1 que posiblemente está desplazando la población US1
Análisis de variabilidad genética en Moniliophthora roreri con AP-PCR y RAPD en Antioquia, Colombia
Moniliophthora roreri es el agente causante de la moniliasis del cacao, la enfermedad más severa en las plantaciones de cacao en el departamento de Antioquia, Colombia. Los marcadores moleculares RAPD (Random Amplyfied Polymorphism of DNA) y AP-PCR (Arbitraly Primed Polymerase Chain Reaction) fueron usados para estudiar la variabilidad genética de 170 aislamientos de M. roreri colectados en doce municipios de Antioquia. El análisis dividió la población en seis grupos, el grupo G1 fue el más grande y contenía el 95% de los aislamientos con una alta similitud genética (coeficiente de similitud de 0,7 a 1), mientras los otros cinco grupos contenían solo aislamientos de Apartadó y Dabeiba con una similitud genética moderadamente baja (coeficiente de similitud entre 0,45 a 0,55). El análisis de componentes principales mostró una alta similitud genética entre la población excepto entre los aislamientos de Apartadó y Dabeiba, que registraron los más altos niveles de variabilidad genética con valores altos del índice de Shannon y el porcentaje de loci polimórficos, mientras los otros aislamientos registraron una baja variabilidad genética. Los valores de diversidad y diferenciación genética en la población muestran una introducción reciente de M. roreri en las plantaciones de cacao de Antioquia, y una reproducción predominantemente clonal en la población. De acuerdo con Amova, la mayoría de la variación genética se encontró dentro de los municipios (75,68%) con solo un 5,94% presente entre las subregiones
Análisis de variabilidad genética en Moniliophthora roreri con AP-PCR y RAPD en Antioquia, Colombia
Moniliophthora roreri es el agente causante de la moniliasis del cacao, la enfermedad más severa en las plantaciones de cacao en el departamento de Antioquia, Colombia. Los marcadores moleculares RAPD (Random Amplyfied Polymorphism of DNA) y AP-PCR (Arbitraly Primed Polymerase Chain Reaction) fueron usados para estudiar la variabilidad genética de 170 aislamientos de M. roreri colectados en doce municipios de Antioquia. El análisis dividió la población en seis grupos, el grupo G1 fue el más grande y contenía el 95% de los aislamientos con una alta similitud genética (coeficiente de similitud de 0,7 a 1), mientras los otros cinco grupos contenían solo aislamientos de Apartadó y Dabeiba con una similitud genética moderadamente baja (coeficiente de similitud entre 0,45 a 0,55). El análisis de componentes principales mostró una alta similitud genética entre la población excepto entre los aislamientos de Apartadó y Dabeiba, que registraron los más altos niveles de variabilidad genética con valores altos del índice de Shannon y el porcentaje de loci polimórficos, mientras los otros aislamientos registraron una baja variabilidad genética. Los valores de diversidad y diferenciación genética en la población muestran una introducción reciente de M. roreri en las plantaciones de cacao de Antioquia, y una reproducción predominantemente clonal en la población. De acuerdo con Amova, la mayoría de la variación genética se encontró dentro de los municipios (75,68%) con solo un 5,94% presente entre las subregiones
Análisis de variabilidad genética en Moniliophthora roreri con AP-PCR y RAPD en Antioquia, Colombia Analysis of genetic variability in Moniliophthora roreri with AP-PCR and RAPD in Antioquia, Colombia
Moniliophthora roreri es el agente causante de la moniliasis del cacao, la enfermedad más severa en las plantaciones de cacao en el departamento de Antioquia, Colombia. Los marcadores moleculares RAPD (Random Amplyfied Polymorphism of DNA) y AP-PCR (Arbitraly Primed Polymerase Chain Reaction) fueron usados para estudiar la variabilidad genética de 170 aislamientos de M. roreri colectados en doce municipios de Antioquia. El análisis dividió la población en seis grupos, el grupo G1 fue el más grande y contenía el 95% de los aislamientos con una alta similitud genética (coeficiente de similitud de 0,7 a 1), mientras los otros cinco grupos contenían solo aislamientos de Apartadó y Dabeiba con una similitud genética moderadamente baja (coeficiente de similitud entre 0,45 a 0,55). El análisis de componentes principales mostró una alta similitud genética entre la población excepto entre los aislamientos de Apartadó y Dabeiba, que registraron los más altos niveles de variabilidad genética con valores altos del índice de Shannon y el porcentaje de loci polimórficos, mientras los otros aislamientos registraron una baja variabilidad genética. Los valores de diversidad y diferenciación genética en la población muestran una introducción reciente de M. roreri en las plantaciones de cacao de Antioquia, y una reproducción predominantemente clonal en la población. De acuerdo con Amova, la mayoría de la variación genética se encontró dentro de los municipios (75,68%) con solo un 5,94% presente entre las subregiones.<br>Moniliophthora roreri is the causal agent of moniliasis in cocoa, the most severe disease affecting cocoa plantations in the Antioquia department in Colombia. RAPD (random amplified polymorphism of DNA) and AP-PCR (arbitrarily-primed polymerase chain reaction) molecular markers were used for studying the genetic variability of 170 M. roreri isolates collected from twelve municipalities in Antioquia. Cluster analysis divided the population into six groups: the G1 group was the largest containing 95% of the isolates having high genetic similarity (0.70 to 1.0 similarity coefficients) whilst the other five groups only contained isolates from Apartado and Dabeiba having moderately low genetic similarity (0.45 to 0.55 similarity coefficients). Principal component roanalysis revealed high genetic similarity amongst populations except for isolates from Apartado and Dabeiba which registered the highest levels of genetic variability, having high Shannon’s index values and polymorphic loci percentage whilst low genetic variability was recorded for the other isolates. Genetic diversity and differentiation values in the population showed the recent introduction of M. roreri in cocoa plantations in Antioquia and predominantly clonal reproduction in the population. ANOVA revealed most genetic variation within municipalities (75.68%); only 5.94% variation was present in the sub-regions
SELECCIÓN Y REGENERACIÓN in vitro DE SOMACLONES DE TOMATE DE ÁRBOL (Solanum betacea cav. Sendt) UTILIZANDO FILTRADOS DE CULTIVO DE Colletotrichum acutatum CON ACTIVIDAD PECTINASA SELECTION AND in vitro REGENERATION OF SOMACLONES OF TREE TOMATO (Solanum betacea cav. Sendt) USING CULTURE FILTRATES OF Colletotrichum acutatum WITH PECTINASA ACTIVITY
Se utilizaron filtrados de cultivo de Colletotrichum acutatum, agente causal de la antracnosis del tomate de árbol, para la selección in vitro de variantes somaclonales de ésta planta con resistencia potencial a la enfermedad. El filtrado, utilizado a varias concentraciones, demostró ser un agente de selección efectivo cuando se integró al medio de cultivo, pues causó niveles elevados de mortalidad de los explantes comparado con los tratamientos sin filtrado. Igualmente, se estudió el efecto de la benziladenina (BA ó BAP) sobre la respuesta organogénica de explantes de tejido foliar de tomate de árbol.Culture filtrates of Colletotrichum acutatum, causal agent of the anthracnose disease in tree tomato, were used for the in vitro selection of somaclonal variants with potential resistance to this disease. Culture filtrates used at different concentrations, showed to be an effective agent of selection when they were mixed with the growth media. The findings indicated a high level of mortality for the explants growing on the ammended media as compared with these growing on non ammended one. The effect of the benziladenina (BA ó BAP) on the organogenic response of leaf explants of tomato tree was also studied
Análisis de la variación genética en clones de caucho (Hevea brasiliensis) de Asia, Suramérica y Centroamérica usando marcadores RAPD
El caucho natural (Hevea brasiliensis) representa a especies potenciales para reforestación y programas de explotación comercial en ciudades tropicales como Colombia. La variabilidad genética de una colección de caucho que se encuentra en la Estación experimental de Paraguaycito en Buenavista, departamento del Quindio en Colombia fue estudiada para aumentar el conocimiento en cuanto a las especies y realizar un mejor uso de los árboles disponibles. Un total de 25 clones, seis de Sur América, 17 de Asia y 2 de América Central fueron seleccionados y analizados usando RAPDs. Las muestras aisladas de ADN de los árboles fueron con 102 primers, 23 de los cuales mostraron polimorfismos. Aunque se encontró un alto grado de similaridad, los análisis grupales de datos llevaron a diferenciar los árboles de de caucho en términos de su origen geográfico. Por lo tanto, las relaciones genéticas que se encontraron entre los clones podrían ayudar a seleccionar parentales para uso en programas de reproducción y diseño de estrategias para la conservación de los clones que tengan características agronómicas deseables
<i>Colletotrichum</i> Species Complexes Associated with Crops in Northern South America: A Review
Colletotrichum genus comprises a high number of plant pathogens causing anthracnose disease in different tropical and non-tropical crops. We aimed to review northern South American studies in the online SCOPUS database to: create a taxonomically updated list of the species complexes found in the region, describe their most important phytopathological characteristics, revise the methods used in the region to control disease, and discuss the role of fungus as a plant endophyte. A total of 19 Colletotrichum species within five complexes—acutatum, boninense, gigasporum, gloeosporioides, and orbiculare—have been reported in northern South America. Few studies have been conducted, particularly in Peru and Ecuador, despite the diversity of Colletotrichum hosts cultivated in the region. Important information can be extracted from our review: species do not appear to show host specificity, although some isolates show host preferences, certain plant species can host several Colletotrichum species, some studies show the importance of using plant extracts to control the disease, but biological control using microorganisms is certainly an open area of research in the region. In northern South America, only a few hosts have been reported to harbor Colletotrichum as endophyte, and the potential of these endophytes as biological control agents has not yet been explored
Análisis de la variación genética en clones de caucho (Hevea brasiliensis) de Asia, Suramérica y Centroamérica usando marcadores RAPD
El caucho natural (Hevea brasiliensis) representa a especies potenciales para reforestación y programas de explotación comercial en ciudades tropicales como Colombia. La variabilidad genética de una colección de caucho que se encuentra en la Estación experimental de Paraguaycito en Buenavista, departamento del Quindio en Colombia fue estudiada para aumentar el conocimiento en cuanto a las especies y realizar un mejor uso de los árboles disponibles. Un total de 25 clones, seis de Sur América, 17 de Asia y 2 de América Central fueron seleccionados y analizados usando RAPDs. Las muestras aisladas de ADN de los árboles fueron con 102 primers, 23 de los cuales mostraron polimorfismos. Aunque se encontró un alto grado de similaridad, los análisis grupales de datos llevaron a diferenciar los árboles de de caucho en términos de su origen geográfico. Por lo tanto, las relaciones genéticas que se encontraron entre los clones podrían ayudar a seleccionar parentales para uso en programas de reproducción y diseño de estrategias para la conservación de los clones que tengan características agronómicas deseables.
Palabras clave: identificación de cultivos, distancia genética, diversidad genética, Hevea brasiliensis, marcadores RAPD