Aspects Phenotypiques De La Resistance Aux Β- Lactamines Des Souches De Pseudomonas aeruginosa Isolees Au Laboratoire De Bacteriologie Medicale Du Chu Sylvanus Olympio (Chu So) De Lome, Togo.

Objectif : Décrire les phénotypes de résistance aux bèta-lactamines des souches de Pseudomonas aeruginosa par la technique de l’antibiogramme en milieu gélosé.Matériel et méthode : Il s’agit d’une étude transversale réalisée du 1er septembre 2011 au 29 février 2012 sur des souches de Pseudomonas aeruginosa isolées au laboratoire de bactériologie médicale du CHU Sylvanus OLYMPIO. L’antibiogramme par la technique de diffusion en milieu gélosé a été réalisé pour la détermination des phénotypes de résistance. Les disques « Ticarcilline + acide clavulanique (TCC) » Céfotaxime, Ceftazidime, Cefsulodine, Ticarcilline, Aztréonam et Imipénème ont été testés. L’interprétation de l’antibiogramme s’est faite selon les recommandations du Comité Antibiogramme de la société française de Microbiologie. L’identification des phénotypes de résistance a été opérée selon la table proposée par Vedel et al.Résultats : Vingt-huit (28) isolats de Pseudomonas aeruginosa ont été obtenus. Parmi eux 16 (57,1%) étaient d’origine communautaire et 12 (42,9%) étaient d’origine hospitalière. Dix huit (64,3%) étaient de phénotype sauvage, 5 (17,9%) étaient de phénotype complexe, 2 (7,1%) étaient de phénotype BLSE, 2 (7,1%) étaient dephénotype céphalosporinases hyperproduites et 1 (3,6%) était de phénotype "imperméabilité spécifique à l’Imipenème ».Conclusion: L’identification des phénotypes de résistance de P.aeruginosa par la technique d’antibiogramme en milieu gélosé constitue une alternative pour les laboratoires de bactériologie médicale dans les pays aux ressources limitées comme le Togo, où les techniques de biologie moléculaire ne sont pas disponibles pour lasurveillance de la résistance aux antibiotiques et la prévention des infections nosocomiales.Mots clés : Antibiotiques, Phénotypes, Pseudomonas aeruginosa, résistance.Objective: Describe phenotypes pattern of susceptibility to beta-lactamines of clinicals strains of Pseudomonas aeruginosa by using agar plate method. Methods: It is a cross-sectional study lead from 1st September 2011 to 29 February 2012 on clinicals strains of Pseudomonas aeruginosa isolated at the laboratory of medical bacteriology CHU Sylvanus Olympio.The susceptibility test to antibiotics (Ticarcilline + clavulanic acid (TCC) » Céfotaxime, Ceftazidime, Cefsulodine, Ticarcilline, Aztreonam and Imipenem) were determined using paper disk diffusion method in well agar. The resultswereassessedusing the " Comité Antibiogramme de la société française de Microbiologie"’recommandations. Identification of phenotype was made by using the table proposed by Vedel and al.Results: Twenty-eight (28) Pseudomonas aeruginos aclinicalsstrains were obtained during six months. Among them 16 (57.1%) were isolated from the community and 12 (42.9%) were nosocomial strains. Eighteen (64.3%) were wild-type phenotype, 5 (17.9%) were complex phenotype, 2 (7.1%) were ESBL phenotypes, 2(7.1%) were phenotype high level cephalosporinase and 1 (3.6%) was a phenotype with impermeability to imipenem.Conclusion: Antibiotics susceptibility testing by using agar plate method can be use in resources setting countries like Togo to survey bacteria resistance and to prevent nosocomial infection due to Pseudomonas aeruginosa.Keywords: Antibiotics, phenotype, Pseudomonas aeruginosa, susceptibility.Article in Frenc

Performance of the biomerieux DBS puncher and dried blood spots to measure HIV-1 viral load by real-time nuclisenseasyq HIV-1 assay

Introduction: The latest World Health Organization recommendations request viral load (VL) testing, if possible, for monitoring HIV-1 infections. However, the use of plasma is an obstacle to realize this test in sub-Saharan Africa. In this context, the dried blood spot (DBS) is an interesting tool for sample collections. The objective of this study was to assess the performance of, the bioMérieux PUNCHER a new toolfor cutting DBS.Methods: Plasma and DBS samples were obtained from 102 patients, with17 HIV-1 negative patients and 85 HIV-1 infected patients (58% were antiretroviral therapy naïve). DBS were stored at room temperature for 15 days before testing. The PUNCHER’s performance used to cut DBS was evaluated with following criteria: contamination, time of cut and VL measurement. VL was measured in parallel on plasma and DBS samples using NucliSENS EasyQ HIV-1.Results: No contamination was observed with negative samples. Sixty two DBS were cut in one hour. The correlation between plasma and DBS results was strong (R = 0.91; P< 0.001). According to Bland-Altman approach the mean of differences was [-0.59 ± 0.65] log10 copies/ml.Conclusions: PUNCHER is highly efficient at cutting DBS, and the VL results from DBS correlated well with those obtained from plasma. bioMérieux puncher can be used to cut DBS for HIV-1 diagnosis and virological monitoring.Keywords: DBS, bioMérieux puntcher, performance, Viral loa

Aspects epidemiologiques et virologiques des diarrhees a rotavirus chez les enfants de 0 a 5 ans a Lome de 2007 a 2010

Objectif : Contribuer à la surveillance épidémiologique des diarrhées à Rotavirus au Togo Méthode : Il s’agit d’une étude descriptive transversale menée au Laboratoire National de Référence des Rotavirus duCHU Tokoin sur des échantillons de selles d’enfants de 0 à 5 ans hospitalisés dans le service de pédiatrie du même CHU. Les techniques d’Elisa, d’électrophorèse et de la RT PCR ont été utilisées.Résultats: Un total de 438 échantillons ont été collectés. Parmi eux, 172 échantillons étaient positifs au test ELISA soit une fréquence de 39,3%. Parmi les cas de diarrhée à Rotavirus, les enfants de 7 à 11 moiset ceux de 12 à 24 mois étaient les plus touchées avec des fréquences respectives de 57,6% et 31,97%. L’électrophorèse par PAGE a permis de retrouver 43,3% de profils longs et 56,7% de profils courts. Legénotypage a permis d’identifier au niveau du génotype G une prédominance de G1 (23,3%), G2 (18,7%) et G3 (31,3%) mais il a également révélé une émergence des génotypes G9 (4%) et G12 (10,7%). En ce qui concerne le génotype P, il a été identifié des souches P[4], P[6], P[8], P[6]P[8], P[4]P[6] et P[4]P[8] avec une prédominance de P[6] soit 65% des souches. La combinaison génotypique la plus fréquente était G3P[6] soit 27,14% des souches.Conclusion : les résultats obtenus dans cette étude plaident en faveur de la prise en compte des caractéristiques génotypiques des rotavirus pour le choix des vaccins dans la lutte contre les diarrhées virales chez l’enfant

Persistent difficulties in switching to second-line ART in sub-saharan Africa--a systematic review and meta-analysis.

OBJECTIVES: Switching to second-line antiretroviral therapy (ART) largely depends on careful clinical assessment and access to biological measurements. We performed a systematic review and meta-analysis to estimate the incidence of switching to second-line ART in sub-Saharan Africa and its main programmatic determinants. METHODS: We searched 2 databases for studies reporting the incidence rate of switching to second-line ART in adults living in sub-Saharan Africa. Data on the incidence rate of switching were pooled, and random-effect models were used to evaluate the effect of factors measured at the programme level on this incidence rate. RESULTS: Nine studies (157,340 patients) in 21 countries were included in the meta-analysis. All studies considered patients under first-line ART and conditions to initiate ART were similar across studies. Overall, 3,736 (2.4%) patients switched to second-line ART. Incidence rate of switch was in mean 2.65 per 100 person-years (PY) (95% confidence interval: 2.01-3.30); it ranged from 0.42 to 4.88 per 100 PY and from 0 to 4.80 per 100 PY in programmes with and without viral load monitoring, respectively. No factors measured at the programme level were associated with the incidence rate of switching to second-line ART. CONCLUSION: The low incidence rate of switching to second-line ART suggests that the monitoring of patients under ART is challenging and that access to second-line ART is ineffective; efforts should be made to increase access to second-line ART to those in need by providing monitoring tools, education and training, as well as a more convenient regimen