Specificity and performance evaluation of a novel RNA-FISH probe for the identification of Rhodotorula sp.

To distinguish Rhodotorula sp., from other microorganisms that produce the same type of alterations on CH materials, proper identification methods must be applied. RNA-fluorescence and in situ hybridization (RNA-FISH) has the potential to specifically identify the target microorganism of interest in complex microbial communities (it is based on hybridization of fluorescently-labeled oligonucleotide probes targeting to specific regions of the ribosomal RNA). Thus, the aim of this study was to design a novel genus specific RNAFISH probe against Rhodotorula sp., and to evaluate its specificity and performance both in silico and experimentally. This will contribute for facilitating Rhodotorula sp., identification in degraded CH materials by RNA-FISH.This work was co-financed by FCT through PTDC/BBB-IMG/0046/2014 project and SFRH/BPD/100754/2014 grant and by ALT20-03-0246-FEDER-000004-ALENTEJO 2020 project

Controle de cancro-do-enxerto (Lasiodiplodia theobromae (Pat) Griff & Maubl em seringueira utilizando-se a técnica do plantio profundo.

bitstream/item/40149/1/Circ-Teec-73-CPATU.pd

In-depth annotation of SNPs arising from resequencing projects using NGS-SNP

Summary: NGS-SNP is a collection of command-line scripts for providing rich annotations for SNPs identified by the sequencing of whole genomes from any organism with reference sequences in Ensembl. Included among the annotations, several of which are not available from any existing SNP annotation tools, are the results of detailed comparisons with orthologous sequences. These comparisons can, for example, identify SNPs that affect conserved residues, or alter residues or genes linked to phenotypes in another species

Observational study in Takotsubo cardiomyopathy

INTRODUCTION: Takotsubo cardiomyopathy (TC) is a still rarely diagnosed clinical syndrome, which is characterized by transient cardiac dysfunction with reversible wall motion abnormalities. AIM: Determine the demographic characteristics, clinical presentation and prognosis of patients with TC. METHODS: Retrospective study of 39 patients admitted for TC in a cardiology center during a period of 3 years. RESULTS: In the population studied, the mean age was 67.15±12.01 years and women were predominant.The most frequent comorbidities were hypertension (76.9%), dyslipidemia (51.3%), psychiatric illness (23.1%) and diabetes mellitus (12.8%). The emotional stress was the most common triggering event (n=10), however, in 17 patients we were not able to identify any precipitating factor. Cardinal symptoms which led to admission, were acute chest pain (n=28) and dyspnoea (n=15). The most common ECG findings were ST segment elevation (n=21), inversion of the T wave (n=21) and QTc prolongation (n=22). All patients had typical wall motion abnormalities in the echocardiography and/or ventriculography. The mean ejection fraction was 35.59±5.54%. The most common in-hospital complication was acute heart failure (n=16, 41%), whereas 3 patients developed cardiogenic shock. The presence of moderate to severe LVS dysfunction (p=0.048) and higher levels of C reactive protein (p=0.02) and pBNP (p=0.042) were associated with the development of acute heart failure. Rhythm disturbances occurred in 3 patients and there was only one non-cardiovascular death. At follow-up at 6 months all patients showed recovery of LVS function; there was one recurrence and 3 deaths from non-cardiovascular causes. CONCLUSION: According to the literature, our review shows higher prevalence of TC in women and a clinical and electrocardiographic presentation similar to the picture of an acute coronary syndrome. In the acute phase, the TC is not necessarily a benign entity, because we observed a high prevalence of acute heart failure

Regressão linear para predição do estado nutricional de bananeiras tipo prata.

A avaliação do estado nutricional de bananeiras é fundamental para recomendação de adubação e manejo da cultura. Diversos métodos analíticos são utilizados, mas a segurança dos dados e a demora para a obtenção dos resultados dificulta a tomada de decisão que favorece o aparecimento de sintomas de deficiência e consequente queda de produtividade da lavoura

Eficiência de bio e imunoensaio para detecção de semente de soja geneticamente modificada tolerante ao glifosato em lotes de sementes de soja não transgênica.

A produção de semente de soja livre de sementes de outras cultivares ou outras sementes, dentro dos limites estabelecidos pela legislação, é facilitada pelo fato da soja ser espécie autógama. No caso específico das cultivares geneticamente modificadas (GM), a baixa taxa de fecundação cruzada que ainda pode existir é um dos pontos críticos de contaminação genética dos campos de sementes convencionais por transgênicos. O objetivo deste trabalho foi verificar a eficiência de dois métodos de detecção de misturas de semente GM em amostras de soja convencional, para avaliar lotes de sementes quanto aos limites exigidos pela legislação. Foram utilizadas amostras de semente da cultivar BRSMG 810C (convencional) e da cultivar BRSMG 850GRR. Foram avaliados dois tamanhos de amostras (200 e 400 sementes), com quatro níveis de contaminação (semente GM adicionada às amostras convencionais, para se obter 0%, 0,5%, 1% e 1,5%), e dois métodos de detecção: imunoensaio de fluxo lateral e bioensaio (pré-embebição em solução de herbicida a 0,6% do equivalente ácido, na proporção de 2,5 vezes o peso do substrato, por 16 horas no escuro a 25oC). O método de bioensaio é eficiente na detecção da presença de GM em amostras de semente convencional de soja, desde que as mesmas apresentem alta qualidade fisiológica. Existe correlação significativa entre os valores obtidos pelo método de detecção por bioensaio e os níveis de contaminação estabelecidos (r= 0,82; p< ou = 0,0001). O tamanho da amostra não influenciou a eficiência dos dois métodos na detecção da presença de sementes adventícias (GM)

Mesalamine-induced myocarditis following diagnosis of Crohn's disease: a case report

Mesalamine is a common treatment for Crohn's disease, and can be rarely associated with myocarditis through a mechanism of drug hypersensitivity. We present the case of a 19-year-old male who developed chest pain two weeks after beginning mesalamine therapy. The electrocardiogram showed slight ST-segment elevation with upward concavity in the inferolateral leads; blood tests demonstrated elevated troponin I and the echocardiogram revealed moderately depressed left ventricular systolic function with global hypocontractility. Cardiac magnetic resonance imaging confirmed the diagnosis of myocarditis, revealing multiple areas of subepicardial fibrosis. The onset of symptoms after mesalamine, and improvement of chest pain, cardiac biomarkers and left ventricular systolic function after discontinuing the drug, suggest that our patient suffered from a rare drug-hypersensitivity reaction to mesalamine

Estudo do potencial de degradação de toxina Cry por bactéria isolada de solo. I - Estudo da influência do pH e do tampão de ativação.

Microrganismos da rizosfera sofrem influência direta de exsudados de raízes das plantas. Plantas transgênicas podem exsudar novas proteínas produzidas a partir de respostas de genes instalados nessas plantas, o que poderia gerar impactos à microbiota do solo. Este trabalho teve por objetivo avaliar a dinâmica de crescimento de um microrganismo isolado em meio mínimo, a partir de solo rizosférico de algodão Bt, em dois pH e na presença e ausência de tampão carbonato (tampão de ativação). Estas respostas são essenciais para a etapa futura do trabalho de estudo da degradação da proteína Cry. O crescimento foi realizado em meio mínimo líquido mineral, a pH 7,0 e 8,0 na presença e ausência de tampão ativador da proteína, a 180 rpm, 28º C por 72 horas. Verificou-se o crescimento bacteriano, em nutriente ágar, após 48 horas de incubação a 28º C, sendo expresso em unidades formadoras de colônias por mL (UFC/mL). Observou-se que não houve diferença significativa entre os crescimentos a diferentes pH e na presença ou ausência do tampão

Conservação ambiental forte alcançada através de sistemas agroflorestais multiestratificados: 1 - agroflorestas e a restauração ecológica de florestas.

O objetivo deste trabalho foi verificar se um sistema agroflorestal multiestratificado (agrofloresta) agroecológico pode ser considerado como tendo uma sustentabilidade ambiental forte, com base em uma análise dos serviços ecossistêmicos de restauração florestal. Para tanto, foi utilizado resultados de pesquisas que compararam agroflorestas e regenerações naturais. Os resultados sugerem que as agroflorestas apresentam uma sustentabilidade ambiental forte e potencial de promover a restauração florestal, no entanto, é um sistema produtivo e não uma metodologia de restauração. Este fato, ao mesmo tempo em que impõe desafios legais e conceituais, aponta para uma alternativa de restauração para as florestas brasileiras.Edição do 1º Seminário de Agroecologia da América do Sul; 5º Seminário de Agroecologia de Mato Grosso do Sul; 4º Encontro de Produtores Agroecológicos de Mato Grosso do Sul; 1º Seminário de Sistemas Agroflorestais em Bases Agroecológicas de Mato Grosso do Sul, 2014, Dourados, MS - AGROECOL