Ciliary Phosphoinositide Regulates Ciliary Protein Trafficking in Drosophila

Cilia are highly specialized antennae-like cellular organelles. Inositol polyphosphate 5-phosphatase E (INPP5E) converts PI(4,5)P2 into PI4P and is required for proper ciliary function. Although Inpp5e mutations are associated with ciliopathies in humans and mice, the precise molecular role INPP5E plays in cilia remains unclear. Here, we report that Drosophila INPP5E (dINPP5E) regulates ciliary protein trafficking by controlling the phosphoinositide composition of ciliary membranes. Mutations in dInpp5e lead to hearing deficits due to the mislocalization of dTULP and mechanotransduction channels, Inactive and NOMPC, in chordotonal cilia. Both loss of dINPP5E and ectopic expression of the phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase Skittles increase PI(4,5)P2 levels in the ciliary base. The fact that Skittles expression phenocopies the dInpp5e mutants confirms a central role for PI(4,5)P2 in the regulation of dTULP, Inactive, and NOMPC localization. These data suggest that the spatial localization and levels of PI(4,5)P2 in ciliary membranes are important regulators of ciliary trafficking and function.ope

Absolute quantification of dual phosphorylation of mitogen-activated protein kinase using mass spectrometry

Thesis(masters) --서울대학교 대학원 :생명과학부,2008.2.Maste

Analysis on usefulness of economic evaluation of R&D preliminary feasibility study

학위논문 (석사)-- 서울대학교 행정대학원 : 행정대학원 정책학과 정책학 전공, 2016. 2. 금현섭.본 연구의 목적은 예비타당성조사를 통과하여 실제 수행되고 있는 국가 R&D사업의 경제적 성과를 분석하여 예비타당성조사의 경제성 평가의 유용성을 검증하고, 예비타당성조사의 경제성 평가가 제 기능을 하지 못하고 있다면 사례분석을 통해 그 원인을 파악하고 개선방안을 도출하는 데 있다. 먼저 08~14 예비타당성조사를 통과한 국가 R&D사업을 대상으로 경제성 평가 결과인 B/C(E/C)분석 값이 높을수록 실제 경제적 성과인 예산 100만원당 연평균 기술료 징수액 또는 예산 1000만원당 연평균 사업화 건수도 높은지를 분석하였다. 실증분석 결과, 이들 변수 간에는 매우 약한 상관관계가 나타났다. 즉 예비타당성조사가 투자 효율성 제고의 역할을 하지 못하고 있다는 것인데, 그 원인은 크게 예비타당성조사의 경제성 분석 자체의 예측이 잘못된 경우와 경제적 타당성이 확인된 사업이 계획대로 집행․관리되지 않는 경우로 나눌 수 있다. 전자의 경우 예비타당성조사의 경제성 분석의 한계 및 개선방향에 대한 연구가 지속적으로 이루어지고 있기 때문에 선행연구를 통해 대체하였고, 본 연구에서는 후자인 사업집행 및 관리상의 문제를 골든씨드 프로젝트사업과 정지궤도복합위성개발사업 사례를 통해 분석하였다. 두 사례에서 공통적으로 예비타당성조사를 통과한 사업예산에 준하는 정도의 예산 편성이 실제 이루어지지 않았음을 알 수 있다. 사업을 수행하기 위한 첫번째 요건인 적정 재원이 확보되지 않은 상태에서 당초 예상한 성과를 기대하기 어렵다. 분야별 특성에 따른 원인을 분석해 보면, 우주항공기술과 같이 미국 등 선진국 기술에 대한 추격형 R&D의 경우 선진국과의 공동개발이 필수적이므로 예비타당성조사의 경제성 예측시에 계약 상대국의 변수까지 고려하기 어렵다는 것이 특징적 한계이다. 생명공학기술의 경우 조류인플루엔자와 같이 예기치 않은 전염병의 확산으로 일부 사업단의 사업집행에 차질이 생기는 등 환경적 영향에 더 많이 노출되어 있다. 이 밖에도 골든씨드 프로젝트와 같은 다부처 공동사업의 경우 사업 전반의 공통된 목표 달성을 위한 사업체계보다는 해당 부처 소관 업무 중심으로 추진 체계를 구성하여 사업의 효율성이 떨어지기도 한다. 마지막으로 예비타당성조사의 대상이 되는 500억이상 대규모 사업의 경우 장기간의 수행되기 때문에 구체적인 성과목표를 가지고 유지하는 데 어려움이 따른다. 예비타당성조사시 계획한 목표와 사업의 성과목표가 달라지면 사업 수행에 따른 경제적 편익도 예측치와 달라질 것으로 예상된다. 예비타당성조사의 도입취지인 재정 효율성 달성을 위해서는 예비타당성조사의 예측치를 높이는 것도 중요하지만 타당성을 입증받은 계획대로 사업을 집행․관리하는 것이 필요하다. 즉 사업 집행시 변화될 수 있는 환경적 제도적 요인에 대한 예측성을 높이고, 특히 성과목표가 변경되지 않도록 사업 계획 수립 시 해당 R&D에 대한 사전조사를 강화해야 한다. 또한 성과를 계획대로 관리하기 위해서는 회계연도와 사업기간을 일치시킬 필요가 있다. 그리고 예비타당성조사를 통과한 대규모 사업의 경우 자체‧상위‧특정평가의 결과를 통해 기존 계획과 실제 사업 집행상의 괴리가 생기는 원인을 분석하여 예비타당성조사 제도의 개선을 위한 선순환적 역할을 할 수 있도록 개별 평가가 구체적이고 실질적으로 이루어져야 한다. 마지막으로 계획에 충실한 사업집행 및 관리를 위한 가장 기본적이고도 중요한 요건은 계획에 준하는 예산편성이다.The objective of this research is to verify that preliminary feasibility studies are useful in evaluating the economic performance of national R&D projects that are currently in progress that has passed the feasibility studies. If the feasibility studies are proven not useful, its causes are sought to be identified through case studies to devise plans for improvement. First, for R&D projects that have passed the preliminary feasibility test during the period '08~'14, the correlation between the B/C(E/C) value and actual economic performance, namely the average annual technology fee collected per KRW 1 million or average number of annual commercialization cases per KRW 10 million budget showed positive correlation. The results showed that the correlation between the factors was extremely weak. Thus, feasibility studies have not been useful in increasing investment efficiency. This is either because the prediction of the preliminary feasibility study per se is inaccurate or because the businesses that have been confirmed through the tests are not being run according to the previously stated plans. Because the former reason is currently a topic of ongoing research, this research has analyzed the latter reason, business execution and managerial problems, through case studies. Through the case studies of the Golden Seed Product project and the Integrated geostationary multi-purpose satellite development project, the reason that businesses that have passed feasibility studies are not being run according to previously stated plans can be summarized into the following: 1. discrepancies existed between the budget plan in the feasibility study and the actual budget in reality, 2. for R&Ds that chase or benchmark technologies of advanced countries joint development is necessary, and it is difficult to consider factors that affect the situations of advanced countries when predicting the economic feasibility in the preliminary feasibility studies, and 3. businesses that engage in inter-departmental collaborative businesses deviate from the general goals of the business and instead shift towards fulfilling the tasks of the sub-departments.Ⅰ. 서론 1 A. 연구의 필요성 및 목적 1 B. 연구대상 및 연구방법 3 1. 연구 대상 3 2. 연구 방법 8 Ⅱ. 이론적 배경 및 선행연구 고찰 10 A. 연구개발사업 예비타당성조사 개요 10 1. 예비타당성조사의 도입배경 및 의의 10 2. 연구개발사업 예비타당성조사 대상사업 및 추진절차 11 3. 연구개발사업 예비타당성조사 분석방법 12 B. 선행연구 검토 14 1. R&D 예비타당성조사의 방법론에 대한 연구 14 2. R&D 예비타당성조사와 성과평가와의 연계에 관한 연구 16 3. R&D 예비타당성조사의 유용성에 관한 연구 18 Ⅲ. 08~14 예비타당성조사 통과 사업의 경제적 성과 분석 19 A. 연구 설계 19 1. 분석 대상 19 2. 분석 방법 21 3. 분석 대상 사업의 개요 및 특성 22 B. 성과 분석 결과 : NTIS DB를 토대로 한 실증분석 31 C. 소결 39 Ⅳ. 원인 분석 41 A. 사례 선정의 조건 41 B. 사례 연구 42 1. 골든 씨드 프로젝트 42 가. 사업개요 및 현황 42 나. 예산 반영의 적절성 43 다. 사업집행의 충실성 ： 성과목표, 추진전략, 추진체계, 사업내용 45 2. 정지궤도복합위성개발사업 50 가. 사업개요 및 현황 50 나. 예산 반영의 적절성 51 다. 사업집행의 충실성 ： 추진전략, 추진체계, 사업내용 53 C. 소결 56 Ⅴ. 결론 58 A. 연구결과 요약 및 시사점(개선방향) 58 B. 연구의 한계 및 향후 연구과제 60 참고문헌 62 부록 66 예비타당성조사 통과 후 추진 중인 사업 현황 (14년) 66 예타 통과 사업 명칭 및 예산 변화 (08~13) 68 예비타당성조사 통과 후 추진 중인 사업 목록 및 경제적 성과 현황(08~13) 72 Abstract 74Maste

효모세포 MAPK 신호 전달계에서의 티로신 질산화 단백질의 동정과 분석

학위논문 (박사)-- 서울대학교 대학원 : 생명과학부, 2015. 2. 박상현.Identification and characterization of a novel posttranslational modification is crucial for understanding of accurate signaling regulation mechanism. As many signaling pathways are conserved in eukaryotes from yeast to human, yeast could be a good model system for studying the mechanism of posttranslational modifications in cellular signaling pathways. Protein tyrosine nitration is a selective posttranslational modification that is involved in many diseases caused by oxidative stress. Recently, it is suggested that many signaling proteins are supposed to be nitrated on specific tyrosine residues and these tyrosine nitration regulate protein activity or localization and signaling flux. However, due to low abundance or tyrosine nitration and relevance of specific disease, protein tyrosine nitration in yeast was not studied well. In this study, we profiled and investigated the role of protein tyrosine nitration in yeast S. cerevisiae. Introducing enrichment methods using chemical and immunoprecipitation into LC-MS/MS, we successfully identified tyrosine nitrated proteins in yeast in vivo. This is the first nitroproteome study in yeast during signal transduction. 23 proteins were identified as nitrated in enrichment methods, and the overall level of nitration was increased after pheromone stimulation. Sequence and structural analysis showed that most tyrosine residues, surrounded by acidic residues and located in solvent accessible site, could be easily nitrated. These results imply that the environment of tyrosine residue is important to allow of tyrosine nitration, thus protein tyrosine nitration is a selective and reversible modification regulated during mating signal transduction. In addition, we showed that tyrosine nitration of Ste7 was increased during mating signaling and predicted Tyr 381 as a putative nitration residue. Substitution of Tyr 381 to Phe reduced mating signaling flux by inhibition of Ste7 activity, and this mechanism seems to be conserved in other MAPK signaling pathway in yeast such as Hog signaling pathway. Taken together, we suggest that tyrosine nitration is a novel modification which is regulated during MAPK signaling pathway in yeast. Also, proteins identified in this study could provide a clue for searching nitration targets in other signaling pathway or other species.ABSTRACT i COPYRIGHT INFORMATION iii TABLE OF CONTENTS iv LIST OF FIGURES ix LIST OF TABLES xi ABBREVIATION xii Chapter 1. Introduction 1 Chapter 2. Identification and analysis of protein tyrosine nitration in yeast model system 5 SUMMARY 6 INTRODUCTION 7 MATERIALS AND METHODS 10 Yeast strains and plasmids construction 10 Preparation of S. cerevisiae cellular extracts 10 Tryptic digestion of total cell lysate 11 Enrichment of nitroproteins using fluorinated carbon tags 11 LC-MS/MS analysis 12 Identification of nitrated peptides 12 Immunoprecipitation and western blot 13 Comparison of protein expression and nitration levels 14 Peptide sequences and protein structures analysis 14 Inference of nitroprotein functions from a functional network 15 Construction of network model 15 RESULTS 17 Identification of nitrated proteins from S. cerevisiae in vivo 17 Relative quantification of nitrated peptide in S.cerevisiae 19 Relationship between protein tyrosine nitration and the amount of protein in yeast 19 Selectivity of protein tyrosine nitration 20 Inference of functions and network analysis of nitroproteins in mating signal transduction pathway 23 DISCUSSION 36 Chapter 3. Protein tyrosine nitration in yeast mating signaling pathway 39 SUMMARY 40 INTRODUCTION 41 MATERIALS AND METHODS 44 Yeast strains and plasmids construction 44 Preparation of S. cerevisiae cellular extracts 44 Immunoprecipitation and western blot 45 Tryptic digestion of total cell lysate 45 LC-MS/MS analysis 46 Identification of nitrated peptides 46 Mating assay 47 RESULTS 48 Identification of nitrated proteins from Ste5 mating complex 48 Sequence and structural analysis of nitrated proteins from mating complex 49 Functional study of nitrated proteins from mating complex 51 DISCUSSION 62 Chapter 4. Catalytic activity of Ste7 MAPKK is regulated by tyrosine nitration at conserved Tyr 381 residue. 64 SUMMARY 65 INTRODUCTION 66 MATERIALS AND METHODS 68 Yeast strains and plasmids construction 68 Preparation of S. cerevisiae cellular extracts 68 Immunoprecipitation and western blot 69 Mating assay 69 RESULTS 71 Ste7 MAPKK is a candidate protein tyrosine nitration target. 71 Tyrosine nitration on Y381 ismay be important for proper mating signal transduction. 72 Mutation on Ste7 Y381 does not affect interactions with kinases or scaffold protein. 73 Y381F affects phosphorylation states of Ste7 74 Y381F decreases Ste7 catalytic activity itself 75 Ste7 Y381F act as dominant negative to inhibit endogenous Ste7 75 Hog pathway is downregulated by mutation on conserved nitration residue Y541 of Pbs2 MAPKK 76 DISCUSSION 101 Chapter 5. Conclusion 105 REFERENCES 107 ABSTRACT IN KOREAN 118Docto

한국형 차세대 원전에 적용 가능한 습도 센서 소자의 개발

Thesis (master`s)--서울대학교 대학원 :원자핵공학과,1997.Maste

원전 보호계통의 고안전성 소프트웨어에 대한 확인, 검증 및 시험의 통합적 접근 방법

Thesis (doctoral)--서울대학교 대학원 :원자핵공학과,2001.Docto

The Emergence and Meaning of Sporting women in North Korea: Focus on North Korean Female Elite Sports in 1950s-60s

이 글은 필자의 ｢2019 북한연구학회 신진학자 학술회의｣(2019.10.11. 북한대학원 대학교)에서 발표한 북한에서 운동하는 여성(Sporting women)의 등장과 의미: 1950-60년대 북한 여성 전문체육을 중심으로 논문을 토대로 수정 및 보완한 논문이다.남성 중심의 활동인 근대 체육은 여성이 체육활동에 있어 주변적 존재로 위치하게 했다. 또한 자본주의 체육이 상업화되고 미디어와 체육의 결합이 상업화를 가속화 시키면서 체육현장 내 젠더위계를 강화시키는 경향이 뚜렷해지고 있다. 이런 맥락에서 사회주의 북한에서 운동하는 여성들은 주변화되지 않았는지에 의문을 가지고 운동하는 여성에 대한 인식을 검토한 후 1950-60년대 북한에서 운동하는 여성이 처음 등장하는 배경과 이들에 대한 담론을 살펴본다. 사회주의 체육의 주요 목표는 인민의 체위를 향상함으로써 노동생산력을 높이고 국방력을 보장하는 데에 있었고 이것이 사회주의 여성들의 체육활동을 권장하는 중요한 이론적 근거였다. 북한의 체육 역시 소련의 체육정책을 도입하여 성별을 떠나 개인의 위생과 건강, 집단을 위한 몸을 만들기 위한 체육활동을 권장했다. 교육기회의 제공과 각 집단별로 진행되는 체육활동을 통해 북한의 운동하는 여성들이 등장하기 시작했다. 1950-60년대 역동적인 북한 사회 내부에서 강한 신체를 토대로 개별 능력을 계발하여 발전된 모습을 보여주는 운동하는 여성들은 북한 여성들의 새로운 역할모델로 등장했고 이들은 천리마운동의 상징이자 발전하는 녀성의 표본으로 담론화되었다. 북한의 매체에서 재현되는 운동하는 여성들의 강한 신체가 여성답지 못한 혹은 남성적인 신체로서 부각되는 것이 아니라 사회주의의 맥락 속에서 섹슈얼한 여성의 몸 대신 집단을 위한 튼튼한 몸의 추구를 반영하고 있음을 확인할 수 있었다.Modern sports which is a male-dominated activity, has allowed women to be positioned as peripheral in sports activities. In addition, as capitalist sports become commercialized and the combination of media and sports accelerates commercialization, there is a clear tendency to strengthen the gender order system in the sports arena. In this context, this article examines the perception of sporting women in the socialist North Korea, questioning whether they have not been marginalized and then, it will look at the background of the sporting womens emergence in the 1950s and 60s and their discourse on them. The main goal of socialist sports was to enhance labor productivity and build up national defense by improving the people's physique, which was an important theoretical basis for encouraging the sports activities of socialist women. Physical education and sports in North Korea has also introduced the Soviet Union's sports policy to encourage sports activities to create a body for individual hygiene, health and groupings, regardless of gender. Sporting women began to emerge through the provision of educational opportunities and sports activities conducted by works and schools. In the 1950s and 1960s, women who exercise in the North developed their individual abilities based on strong bodies became new role models for women in the North Korea The discourse on sporting women was symbols of the Cheollima Movement and a sample of the developing woman in republic. This study have confirmed that the strong bodies of sporting women recreated in the North Korean media do not emerge as unfeminine or male bodies, but reflect the strong body pursuit for groups instead of those of sexier women in the context of socialism

개에서 공막절개를 병행한 안구내용물 제거술 후 silicone 안와 충전물 적용시 의안의 운동성 평가

Thesis(doctor`s)--서울대학교 대학원 :수의학과 수의외과학전공,2006.Docto

Producing particles according to the age and the length of utterance of normal children in the period of basic grammar

언어병리학 협동과정/석사[한글]정상아동은 한 낱말 시기를 지나 두 세 낱말로 연결되는 발화로 발전하면서 문법형태소를 획득하는데, 문장의 의미를 정확하게 이해하기 위해서는 조사나 어미를 다양하게 변화시켜 산출하여야 한다. 정상아동의 조사 산출에 대한 자세한 발달 자료는 언어장애아동과 관련하여 조기진단 및 치료에 중요한 지표가 될 수 있는데, 특히 단순언어장애아동은 조사의 오류를 빈번히 보이기 때문에 이러한 자료가 더욱 요구된다. 따라서 본 연구에서는 서울 지역에 거주하는 만 2세 6개월부터 4세 6개월까지의 정상아동을 6개월 단위의 네 집단으로 나눈 뒤, 자발화를 수집하여 그들의 조사 발달을 살펴보고자 한다. 정상아동의 생활연령 및 평균발화길이(MLU)에 따라 조사의 총유형수, 총빈도수, 실수 횟수, 실수 유형을 비교한 결과는 다음과 같다. 첫째, 조사의 총유형수와 총빈도수는 2세 후반부터 3세 후반까지 점차적으로 증가하였지만, 3세 후반과 4세 전반에는 차이를 보이지 않았다. 둘째, 평균낱말길이(MLU-w)와 평균형태소길이(MLU-m)가 길어질수록 조사의 총유형수와 총빈도수가 유의하게 증가하였다. 셋째, 조사의 실수 횟수는 2세 후반에 가장 많이 나타났으며, 그 이후에는 감소하여 3세 전반부터 4세 전반에 이르기까지 비슷하였다. 조사의 실수 유형을 살펴보면, ‘대치(substitution)’의 경우 연령이 증가할수록 유의하게 감소하였지만, ‘생략(omission)’과 ‘이중사용(duplicative use)’의 경우 집단 간에 유의한 차이를 보이지 않았다. 넷째, 평균낱말길이(MLU-w)와 평균형태소길이(MLU-m)는 조사의 실수 횟수 및 실수 유형과 유의한 상관관계가 없었다. 2세 후반에서 4세 전반 아동들의 조사 발달을 평가하는 데 평균낱말길이나 평균형태소길이가 적절한 참고자료가 될 것으로 보인다. 또한 조사 산출의 실수 자료는 정상아동을 통해 조사의 오류가 빈번한 SLI 아동들을 변별해낼 수 있는 기준이 될 것으로 보인다. 이상의 결과는 정상발달과정의 조사 산출에 대한 정보를 제공함으로써 언어장애아동의 진단 및 치료에 준거(criteria)를 제공하였다는 의의를 지닌다. [영문]Detail information related with particle production in normal children could be an important index for early diagnosis and treatment of language disorder. This information is more important in children with specific language impairment(SLI) because they frequently show errors in the use of particles. In this study, children aged from 2 years 6 months to 4 years and 6 months residing in Seoul were divided into 4 groups in an age increment of 6 months and their spontaneous utterances were collected to examine their development in particle production. The following results were obtained after analyzing the number of total particle types, number of total particle frequencies, number of particle errors, and types of particle errors according to their chronological age and mean length utterance(MLU) in these normal children. First, the number of total particle types and number of total particle frequencies increased gradually from the late part of 2 years to the late part of 3 years. However, no significant difference was shown in children in late 3 years and those in late 4 years. Second, as MLU-w and MLU-m increased, the number of total particle types and number of total particle frequencies were significantly increased. Third, the number of particle errors was the highest in children in late 2 years and decreased afterwards. It was similar in children in early 3 years to those in early 4 years. In the case of the error types, substitution decreased as chronological ages increased. However, no significant differences were seen in the case of omission and duplicative use. Fourth, MLU-w and MLU-m showed no significant correlation with the number of particle errors and types of particle errors. MLU-w or MLU-m could be useful as a reference in evaluating the development of particles in children in late 2 years to early 4 years. Furthermore, errors related with particle production could be a criterion in differentiating normal children with SLI showing frequent errors in particle production. The results obtained in this study are significant for the diagnosis and treatment of language impairment by providing information related with particle production in normal children.ope

(A)Study of conflicting psychology through the deformed bodies

학위논문(석사)--서울대학교 대학원 :조소과 조소전공,2007.Maste