Expression of genes related to the virulence of acanthamoeba culbertsoni

의학과/박사[한글] 자유생활아메바는 토양이나 하천, 호수, 대기중 등 여러 환경에서 분리되며, Acanthamoeba속에 속하는 아메바들은 종종 granulomatous amoebic encephalitis와 심각한 시력장애를 유발하는 아메바성 각막염을 야기시키는 것으로 보고된 바 있다. 본 연구는 실험실에서 계대배양 되어온 자유생활아메바중 Acanthamoeba culbertsoni가 뇌내 계대감염을 시킨 후 그 병독성이 급격히 증가하는 사실에 입각하여 뇌내 계대감염에 따른 아메바의 병독성 변화, 즉 병원성 관련인자의 발현에 관여하는 유전자를 differential display reverse transcription-polymerase chain reaction(DDRT·PCR) 분석법에 의해 동정하고자 수행하였으며 다음과 같은 결과를 확인하였다. A. culbertsoni를 마우스에 3회 뇌내 계대감염을 실시함으로써 아메바의 병독성이 증가함을(사망률: 63.3%) 확인하였으며, 뇌내 계대감염에 의한 아메바의 병원성 관련 유전자의 발현상의 변화를 확인하기 위해서 뇌내 계대감염 후 특이적으로 발현되는 mRNA로부터 역전사된 cDNA를 증폭할 수 있는 DDRT-PCR을 수행하여 뇌내 계대감염 특이 증폭산물을 96개 확인하였다. 이들 뇌내 계대감염시킨 아메바에서만 특이적으로 증폭된 증폭산물들을 PCR에 의해 재증폭하여 slot blot법에 의해 nylon membrane에 고정시키고 DDRT-PCR 분석에 사용하고 남겨둔 증폭산물들을 한데 모아서 탐침으로 사용하는 DNA slot blot hybridization 분석법에 의해 12개의 증폭산물들이 뇌내 계대감염에 의해 특이적으로 발현된 mRNA로부터 증폭된 것임을 확인하였다. 이들 12개의 뇌내 계대감염 특이 증폭산물들을 slot b lot법에 의해 nylon membrane에 고정시키고 A. culbertsoni의 genomic DNA로부터 PCR에 의해 증폭시킨 cysteine proteinase유전자의 일부분을 탐침으로 사용하여 분석한 결과 1개의 증폭산물(650bp)이 cysteine proteinase mRNA로부터 증폭된 것으로 확인되어 뇌내 계대감염에 의해 A. Culbertsoni의 병독성이 증가되는 것에 cysteine proteinase가 관여하는 것으로 추정할 수 있었다. [영문] Free-living amoebae in the genus Acanthamoeba are ubiquitous in environment(fresh water, soil and, air free-living amoebae) and some of them facultatively cause humans of granulomatous amoebic encephalitis and amoebic keratitis. In this study, based on the fact that the virulence of an amoeba(Acanthamoeba culbertsoni) which has been cultured in laboratory is restored via consecutive brain passages, identification of the genes responsible for restoring virulence in the brain passaged A. culbertsoni was attempted via differential display reverse transcription-polymerase chain reaction(DDRT-PCR) analysis. Restoring of the virulence of the long-term cultured Acanthamoeba culbertsoni in the laboratory was verified via 2 consecutive mouse brain passages. Mortality of the infected mice was raised from 3.3% in the first infection to 63.3% in the third infection(the second brain passage). By DDRT-PCR analysis, 96 brain passaged amoeba specific amplicons were observed and screened to identify the amplicons which were not amplified in non-brain-passaged amoeba mRNAs by all the primer combinations used in DDRT-PCR via DNA slot blot hybridization. For DNA slot blot hybridization, 5 μl of each DDRT-PCR reaction, which was saved from the DDRT-PCR analysis, was pooled and used as probes after labeling with biotin. Twelve of the 96 brain passaged amoeba specific amplicons were turned out to be amplified only from the brain passaged amoeba mRNAs. Further characterization of the 12 brain passage specific amplicons by DNA slot blot hybridization using PCR amplified cysteine proteinase gene as a hybridization probe revealed that 1 of the 12 amplicons, whose size was approximately 657bp, was amplified from the A.culbertsoni cysteine poteinase mRNA. In conclusion, a cysteine proteinase may be played an important role in restoring virulence of A. culbertsoni via the mouse brain passage.restrictio

InAs(InGaAs)InP 적층 양자점 구조의 파장 조절

Thesis(doctoral)--서울대학교 대학원 :재료공학부,2005.Docto

Blastogenic responses of splenic lymphocytes to Naegleria fowleri lysates and T-cell mitogen in mice with primary amoebic meningoencephalitis

의학과/석사[한글] Naegleria fowleri는 자연환경에 널리 존재하며 인체에 감염되어 원발성 아메바성 뇌수 막염을 일으키는 것으로 보고되었다 (Carter,1970). 마우스 비강을 통해 N. fowleri를 감염시킬 경우 인체에서와 똑같은 뇌수막염을 유발시킨다는 것이 보고된 이래(Martinez등, 1973), 마우스를 사용하여 N. fowleri를 감염시킬때 발현되는 숙주의 면역반응에 대한 연구보고는 있으나 감염경과에 따른 T임파구의 기능과 혈청내 항체가의 변동에 대해서는 보고된 바 없다. 마우스를 secobarbital로 마취시킨 후 CGVS배지에서 무균배양된 N. fowleri 0359주(株) 7 × 10**4개가 함유된 생리식염수 5μl를 비강내로 떨어뜨려 감염시켰다. 배양된 N. fowleri 영양형을 ultrasonicator로 파괴시킨 후 20,000g에서 60분간 원심침전하였다. 그 상층액을 0.2μm여과지로 여과시킨후 T임파구 기능을 측정하기 위한 lysate로 사용하였으며, 또한 항체를 검출하기 위한 효소표식 면역검사법(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA)에 있어 항원으로도 사용하였다. 감염시킨 후 0, 3, 7, 11, 15일째에 마우스 심장에서 혈액을 채취하고 마우스를 희생시켜 비장을 분리하였다. Polystyrene place에 well당 비장세포 10**6개가 200μl의 RPMI 1640 배지에 포함되도록 하였다. 배지에는 4μg/ml의 concanavalin A(con A.) 또는 100μg /ml의 N. fowleri lysate를 넣었다. 5% CO^^2항온기에서 37℃로 42시간 배양한 후 methyl-[**3 H]-thymidine을 well당 1μCi씩 넣어 6시간 반응시켰다. 혈청내 항체가는 Voller등(1976)이 기술한 효소표식 면역검사법(ELISA)으로 측정하였다. T임파구의 기능은 사용된 mitogen con. A. fowleri lysate에 관계없이 감염후 3일부터 감소되어 11일까지 대조군에 비해 유의하게 감소되었다. 감염 후 15일에는 N. fowleri lysate를 넣은 경우는 T임파구의 기능이 여전히 감소되어 있으나 con. A를 넣은 배양에는 정상 대조군과 같은 정도로 기능이 회복되었다. 혈청내 항체가는 감염후 7일에 증가하기 시작하여 감염 후 15일에는 최고치에 달했다. 이상의 성적으로 보아 마우스에 N. fowleri를 감염시켰을 때 감염 15일 후까지 계속 T임파구의 기능은 정상대조군보다 저하됨을 관찰하였고 혈청내 항체가는 감염 후 7일부터 증가하기 시작하여 15일 후에 최고치에 달함을 알 수 있었다. [영문] Naegleria fowleri is a pathogenic free-living amoeba causing primary amoebic meningoencephalitis (PAM) in human (Carter, 1970) and mouse (Martinez et al., 1973). Several reports on the immune responses in this amoebic infection have shown in mice, but no observation on cell mediated immunity. This study was to observe the changes of blastogenic responses of splenic lymphocytes to T-cell mitogens, N. fowleri lysate and concanavalin A, and serum antibody titer during the course of experimental PAM in mice. Naegleria fowleri, strain 0359, was cultured in the CGVS medium axenically and inoculated intranasally with 7 × 10**4 trophozoites in 5μl of saline under the secobarbital anesthesia for the development of experimental PAM in mice. The amoeba were subjected to ultrasonication and centrifuged at 20,000g for 60 minutes, and filtered through 0.2μm filter membrane. The supernatant, N. fowleri lysate, was used as T-cell mitogen, and antigen for ELISA. The serum antibody was examined by ELISA using peroxidase conjugate. Two bundled μl of 10**6 splenocytes in RPMI 1640 containing 10% fetal calf serum were added to each well of a microtiter plate. To each well was added T-cell mitogens, 100μg/ml of N. fowleri lysate or 4μg/ml of con. A, and the plates were incubated fort 42 hours at 37℃ in 5% CO^^2 incubator. Cultures were pulsed with 1 μCi of methyl-(**3 H)-thymidine 6 hour before harvesting. The mean blastogenic response of the splenocytes to N. fowleri lysate, measured by the stimulation index, was reduced, whereas that to con. A was also reduced up to on day 11 after infection. Both of these results were statistically significant compared with those of uninfected control group. The serum antibody titers were increased gradually up to day. The results indicate that there is an impairment of the blastogenic response of splenocytes to T-cell mitogen during the acute course of experimental PAM in mice.restrictio

Model-Based Development and Test Method for The AUTOSAR Embedded Software

Automotive systems have tended to be equipped with many electronic contents to satisfy safety, comport, convenience, and entertainment services over the past years. As a result, the amount of vehicle embedded software in electrical/electronic(E/E) systems is steadily increasing to manage these requirements. This leads to the traditional, document-based software development in the vehicle embedded systems being increasingly displaced by a model-based development in order to reduce software development time and cost. Due to the application of model-based development, a great evolution is being realized in the aspect of efficiency, but the development is being made without sufficient testing. So, erroneous automotive embedded software may cause serious problems such as car accidents which relate to human safety. Therefore, efficient methods for model-based test and validation are needed to improve software reliability in the stage of embedded software development. This paper presents the model-based development and test method for AUTOSAR embedded software to improve its reliability and safety, and it is demonstrated based on the case study.2

Automated testing method and system for embedded software

본 발명은 TTCN-3를 기반으로 한 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템에 관한 것이다. 상기 시스템은, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하고, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세는 XML 형식으로 작성되며, 테스트 시스템 생성부, 테스터, 타겟 시스템은 TTCN-3을 기반으로 동작하는 것이 바람직하다.외부로부터 입력된 테스트 케이스 명세 및 내장형 소프트웨어 명세를 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 자동으로 테스트할 수 있는 내장형 소프트웨어 자동화 시스템에 있어서, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하는 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템.외부로부터 입력된 테스트 케이스 명세 및 내장형 소프트웨어 명세를 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 자동으로 테스트할 수 있는 내장형 소프트웨어 자동화 시스템에 있어서, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하는 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템.외부로부터 입력된 테스트 케이스 명세 및 내장형 소프트웨어 명세를 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 자동으로 테스트할 수 있는 내장형 소프트웨어 자동화 시스템에 있어서, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하는 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템.외부로부터 입력된 테스트 케이스 명세 및 내장형 소프트웨어 명세를 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 자동으로 테스트할 수 있는 내장형 소프트웨어 자동화 시스템에 있어서, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하는 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템.외부로부터 입력된 테스트 케이스 명세 및 내장형 소프트웨어 명세를 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 자동으로 테스트할 수 있는 내장형 소프트웨어 자동화 시스템에 있어서, 상기 테스트 케이스 명세 및 상기 내장형 소프트웨어 명세를 파싱하고 특정 정보를 추출하고, 추출된 정보들을 이용하여 테스트 데이터, 테스트 ID/템플릿, 타겟 시스템 시뮬레이션 모듈, 테스트ID/SUT 매핑 정보들을 생성하는 테스트 시스템 생성부; 상기 테스트 시스템으로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 타겟 시스템으로 송신하고 타겟 시스템으로부터 수행된 결과값을 수신하여 테스트 결과의 합격 여부를 결정하는 테스터; 상기 테스터로부터 입력된 테스트 데이터 및 테스트 ID/템플릿을 이용하여 테스트 대상 소프트웨어를 수행하고 그 결과값을 상기 테스터로 송신하는 타겟 시스템;을 구비하는 내장형 소프트웨어 테스트 자동화 시스템

DOOR HAVING WINDOW SAFETY DEVICE

영구 자석을 이용하여 도어의 윈도우 글라스가 윈도우에 닫히기 전에 윈도우 글라스에서 출력되는 구동력과 윈도우 글라스의 속도를 감소시켜 윈도우 글라스와 윈도우 사이에 신체 일부가 끼이는 사고를 방지할 수 있는 윈도우 안전 장치를 구비한 도어가 개시된다.윈도우를 개폐하도록 승강 운동하는 윈도우 글라스를 포함하는 도어에 있어서, 상기 윈도우 글라스의 저면을 지지하며, 영구자석이 장착된 글라스 지지대; 상기 글라스 지지대의 승강 운동을 안내하도록 상기 도어의 상하 방향으로 형성된 가이드 레일; 및 상기 가이드 레일의 사이에 형성되고, 상기 영구자석에 의해 생성된 자속을 차단하여 상기 글라스 지지대의 승강 운동에 제동을 가하는 브레이크 부재; 를 포함하는 윈도우 안전 장치를 구비한 도어.윈도우를 개폐하도록 승강 운동하는 윈도우 글라스를 포함하는 도어에 있어서, 상기 윈도우 글라스의 저면을 지지하며, 영구자석이 장착된 글라스 지지대; 상기 글라스 지지대의 승강 운동을 안내하도록 상기 도어의 상하 방향으로 형성된 가이드 레일; 및 상기 가이드 레일의 사이에 형성되고, 상기 영구자석에 의해 생성된 자속을 차단하여 상기 글라스 지지대의 승강 운동에 제동을 가하는 브레이크 부재; 를 포함하는 윈도우 안전 장치를 구비한 도어.윈도우를 개폐하도록 승강 운동하는 윈도우 글라스를 포함하는 도어에 있어서, 상기 윈도우 글라스의 저면을 지지하며, 영구자석이 장착된 글라스 지지대; 상기 글라스 지지대의 승강 운동을 안내하도록 상기 도어의 상하 방향으로 형성된 가이드 레일; 및 상기 가이드 레일의 사이에 형성되고, 상기 영구자석에 의해 생성된 자속을 차단하여 상기 글라스 지지대의 승강 운동에 제동을 가하는 브레이크 부재; 를 포함하는 윈도우 안전 장치를 구비한 도어

electric power steering system based on AUTOSAR and method thereof

AUTOSAR(automotive open system architecture) 기반 전기식 조향(electric power steering) 시스템에 관한 기술이 개시(disclosure)된다. 일 실시 예에 있어서, AUTOSAR 기반 전기식 조향 시스템은 차량 조향 상태를 감지하는 센서부 및 상기 센서부에 의해 감지된 정보와 차량 상태 정보를 이용하여 모터 구동 전류 또는 전압을 모터 구동 회로에 전달하는 조향 시스템을 포함한다. 상기 조향 시스템은 상기 센서부로부터 감지된 정보로부터 차량 조향 상태 정보를 생성하는 정보 센서 소프트웨어 컴포넌트, 상기 차량 조향 상태 정보와 상기 차량 상태 정보로부터 상기 모터 구동 전류 또는 전압을 계산하는 제어 소프트웨어 컴포넌트 및 상기 모터 구동 전류 또는 전압을 상기 모터 구동 회로에 전달하는 모터 출력 소프트웨어 컴포넌트를 포함한다.차량 조향 상태를 감지하는 센서부; 상기 센서부로부터 감지된 정보로부터 차량 조향 상태 정보를 생성하는 정보 센서 소프트웨어 컴포넌트와, 상기 차량 조향 상태 정보 및 차량 상태 정보로부터 모터 구동 전류 또는 전압을 계산하는 제어 소프트웨어 컴포넌트와, 상기 모터 구동 전류 또는 전압을 모터 구동 회로에 전달하는 모터 출력 소프트웨어 컴포넌트를 포함하여 이루어지는 조향 시스템; 그리고,상기 정보 센서 소프트웨어 컴포넌트, 상기 제어 소프트웨어 컴포넌트 및 상기 모터 출력 소프트웨어 컴포넌트 간의 데이터 교환을 가능하게 하며, PI_StaOperationMode, PI_VehicleLongtitudinalSpeed, PI_EngineSpeed, PI_DriverSteerTorqueBase, PI_StaMotorPosition, PI_StaMotorSpeed, PI_StaMotorCurrent, PI_StaMotorVoltage, PI_StaEPSEnable, PI_CmdDesiredCurrent, PI_CmdMotorEnable 및 PI_CmdMotorDrive를 포함하는 AUTOSAR 인터페이스를 포함하여 이루어지는 AUTOSAR 기반 전기식 조향 시스템

Modeling and Dynamic Analysis for Electric Vehicle Powertrain Systems

일반적인 내연기관 자동차와는 달리, 전기자동차는 파워트레인을 구성하는 배터리, 인버터, 모터 등의 전기 동력 시스템들이차량의 주행성능과 동역학 특성에 직접적인 영향을 준다. 따라서 전기 차량의 최종 운동 및 동특성을 예측하기 위해서, 기계및 전기전자 복합 시스템을 세부적으로 모델링하고 이를 통한 전체 파워트레인의 해석이 필요하다. 본 논문에서는 전기자동차의 최종 출력 성능을 예측하고 분석하기 위한 전기자동차의 파워트레인 시스템의 동적 모델을 유도하였다. 전기적인 신호로부터 최종 기계 동력 시스템으로 전달되는 입출력 변수의 상관관계를 수학적으로 모델링하여 개발하였다. 또한, 전기자동차의 동특성을 시뮬레이션 할 수 있는 기준모델을 Matlab/Simulink 플랫폼 기반으로 개발하였으며, 이를 이용하여 유도된 수학적 분석 모델을 검증하였다. 이를 통하여 속도, 가속도, 추진력 등의 주요 차량 주행성능을 비교 분석하였다.2

Scheduling Design and Simulation of Software Components for EPS System based on AUTOSAR

Through the AUTOSAR methodology, the embedded software shall become more flexible, reusable, maintainable than ever. However, it is not mentioned about specific timing constraints of software components in AUTOSAR. There are a few basic principles for mapping runnable entities. At this point, AUTOSAR software design with optimal scheduling method is one of the enabling technologies in vehicle embedded system. This paper presents an approach based on mapping runnable entities and task scheduling design method for EPS (Electric Power Steering) software components, based on AUTOSAR. In addition, the experimental results of concurrent simulation show that the proposed scheduling technique and timing synchronization in the software component design can achieve the improved torque ripple performance and it well suited for EPS application software.1