USP2의 DNA 손상 부위 결합 특성 연구

학위논문(석사) -- 서울대학교대학원 : 사범대학 과학교육과(생물전공), 2023. 2. 이준규.DNA double strand break (DSB), the most detrimental DNA lesion in human genome, triggers DNA damage response such as DNA repair, cell cycle regulation, replication stress response. In response to DNA damage, the MRE11-RAD50-NBS1 (MRN) complex contributes to the sensing and repair of DNA damage, which is critical for genomic integrity and cell survival. Thus, MRN complex could be a target of various post-translational modification (PTM) to control its stability or function. Recently, USP2 was identified as a new deubiquitinase that prevents NBS1 ubiquitination to stabilize MRN complex at DSB site. In this study, I showed the mechanism of USP2 recruitment to DSB site through performing live-cell imaging of eGFP fused USP2 after laser-microirradiation treatment. Then, I found out USP2 recruitment to DSB site is dependent on ATM, PARP, and RECQL4 during the DNA damage response. Furthermore, I showed ATM-dependent phosphorylation of two critical residues, Serine 2 and Threonine 137, in N-terminus of USP2 is essential for its recruitment to the DSB site. Collectively, this study discovered a new mechanism of USP2 recruitment to the DSB site which is a prerequisite process for MRN complex stability.인간 유전체에서 가장 해로운 DNA 손상인 DNA 이중나선손상(DSB)은 DNA 수선과 같은 DNA 손상 반응을 유발한다. 인간의 유전체 항상성과 세포 생존에 필수적인 MRE11-RAD50-NBS1(MRN) 복합체는 DNA 손상을 감지하고 수선에 기여한다. 그러므로 MRN 복합체는 자신의 안정성 및 기능 유지를 위해 다양한 번역 후 변형(Post-translational modification)의 타깃이 될 수 있다. 최근에 밝혀진 문헌에 따르면, USP2는 DSB 부위에서 NBS1의 유비퀴틴화를 억제하므로 MRN 복합체를 안정화시키는 새로운 탈유비퀴틴화 효소로 밝혀졌다. 이에 본 연구에서는 DSB가 일어난 상황에서 MRN 복합체를 안정화시킬 수 있는 USP2의 DNA 손상부위 결합 메커니즘을 보여주고 있다. 연구자는 USP2 단백질을 과발현 시킨 U2OS 세포에 레이저 미세 조사 통해 실시간 세포 영상 찰영하고, 이를 분석하여 이중가닥손상 부위에 대한 USP2 결합이 ATM, PARP, 및 RECQL4에 의존적으로 일어난다는 것을 발견하였다. 또한, USP2가 이중가닥손상 부위에 모집되는 데에 USP2 N-말단에 위치한 2번 Serine 과 137번 Threonine의 인산화가 필수적임을 확인했다. 따라서 본 연구는 MRN 복합체 안정성을 위한 전제 과정인 DNA 이중가닥손상 부위에 대한 USP2의 새로운 모집 메커니즘을 규명하였다.1. Introduction 1 1.1 Study Background 1 1.2 Purpose of Research 4 2. Materials and Methods 6 2.1 Cell culture, Transfection of DNA, and Antibodies 6 2.2 Plasmid Preparation 7 2.3 Immunoprecipitation 7 2.4 Laser Microirradiation and Live cell Imaging of Fluorescent protein 7 2.5 Statistics Analysis 8 2.6 Table of Plasmid DNA Used in This Study 9 2.7 Abbreviation 9 3. Result 10 3.1 USP2 is recruited to laser-induced DNA damage site and interacts with NBS1 10 3.2 USP2 recruitment to DSB site is dependent on ATM, PARP, and RECQL4, respectively. 12 3.3 N-termnus of USP2 domain is crucial for ATM dependent recruitment to DSB site. 17 3.4 ATM phosphorylates two critical residues in USP2 N-termius (S2 and T137) and promotes its recruitment to the DNA damage site. 23 4. Discussion 27 References 30 Abstract in Korean 35석

A study on optimal selection of reference accelerometers for active road noise control

학위논문 (석사) -- 서울대학교 대학원 : 공과대학 기계공학부, 2020. 8. 강연준.Active noise control (ANC) is gradually expanding its application in the automotive industry. One of the reason is that passive noise control (PNC) methods are not advantageous for lightweighting as they increase the weight of the vehicle, and ANC is more effective to control low frequency range noise as compared to PNC methods. In terms of ANC application, the performance of ANC systems is directly affected by the selection of the reference signal. Currently, the issue of sensor placement leads to a compromise between time cost and performance of ANC systems. Trial and error methods that are commonly used consist of a brute-force approach simulating the result outcomes for all candidate sensor locations and present high computing costs. Consequently, a process that allows engineers to reduce the set of candidate sensor locations while obtaining target noise reduction results is needed to avoid the overwhelming time cost of the brute-force and trial-error approaches. This study suggests a method that determines candidates for the locations of the reference signal sensors by using the correlation between the input acceleration signal and output sound pressure level signal, which is a partial coherence function. This process evaluates the correlation of each acceleration signal with the interior noise and eliminates redundant sensor locations by maximizing the Fisher information matrix. This method enables the re duction of the total number of candidate locations, which in turn leads to a decrease in the total time cost while obtaining locally optimal results.능동형 소음제어(ANC)가 자동차 산업에서 점차 적용 범위를 넓혀가고 있다. 그 이유 중 하나는 패시브 노이즈 컨트롤(PNC) 방식이 차량 중량을 늘려 경량화에 유 리하지 않고, ANC 방식이 PNC 방식에 비해 저주파 범위의 소음을 더 효과적으로 제어할 수 있기 때문이다. ANC 적용 측면에서 ANC 시스템의 성능은 참조 신호 의 선택에 직접적인 영향을 받는다. 현재 센서선정 문제는 소요시간과 성능 사이의 절충으로 이어진다. 일반적으로 사용되는 시행착오 방법은 모든 후보 센서 위치에 대한 소음저감량을 얻기 위해 시뮬레이션을 진행하고 이에 따라 많은 시간이 소요 된다. 따라서 시행착오 방법을 통해 얻은 최적결과에 근접한 결과를 얻으면서 후보 센서 위치 개수를 감소 시킬 수 있도록 하는 프로세스가 필요하다. 본 연구에서는 입력 가속도 신호와 출력 음압 수준 신호의 상관관계를 이용하여 참조 신호 센서의 위치 후보를 결정하는 기법을 제안한다. 이 프로세스는 각 가속 신호와 내부 노이 즈의 부분 기여도함수를 바탕으로 구성된 피셔 정보 매트릭스를 극대화하여 중복 센서 위치를 제거한다. 이 방법을 통해 초기 참조신호 후보군을 줄일 수 있으며, 이 는 목표했던 결과를 얻으면서 총 시간비용의 감소로 이어진다.INTRODUCTION 1 2. METHODOLOGY 4 2.1 Overview 4 2.2 Wienerfilter 4 2.3 Partialcoherence 5 2.4 Partial coherence-based reference sensor selection method 6 3. Result 10 3.1 Method 1 – ANC simulation with total sensor combination 11 3.2 Method 2 – multiple coherence function-based reference sensor selec- tionmethod 12 3.3 Method 3 – partial coherence function-based reference sensor selec- tionmethod 13 4. Conclusion 26 Abstract (In Korean) 31 Acknowledgment 32Maste

The Effect of Retained Austenite Stability on High Speed Deformation Behavior of TRIP Steels

The safety of passengers is very important during an automobile collision. Because the collision event involves high speed deformation, property data and deformation mechanisms of materials under high strain rate conditions are needed to choose proper materials for automobiles. Therefore, in this study, dynamic mechanical properties of low carbon TRIP steels with varying retained austenite stabilities were evaluated over a wide range of strain rates using a high-velocity hydraulic tensile testing machine. Tensile tests were performed at strain rates ranging from 10-2 to 6x102/sec using normal ASTM E-8 specimens with an elastic strain gage attached to the sample grip end to measure load and a plastic strain gage mounted on the gage section to measure strain precisely. Ultimate tensile strengths, strain rate sensitivities, and strain hardening behaviors are reported. The strength of TRIP steels increased with increasing strain rate, that is, positive strain rate sensitivity was observed.1. 서 론 1 2. 이론적 배경 3 2.1 TRIP(Transformation Induced Plasticity) 냉연강판 3 2.1.1 변태유기소성(TRIP) 현상 4 2.2 잔류오스테나이트 형성에 영향을 미치는 인자 8 2.2.1 합금원소의 영향 8 2.2.2 열처리 조건의 영향 9 2.3 잔류오스테나이트의 안정도 11 2.3.1 잔류오스테나이트 안정도에 미치는 합금원소의 영향 11 2.3.2 연성 향상에 기여하는 잔류오스테나이트 기구 12 2.4 고속인장시험 14 2.4.1 TRIP강의 고속인장특성 14 2.4.2 고속변형에서의 TRIP 냉연강판 21 3. 실 험 방 법 23 3.1 TRIP 냉연강판의 제조 23 3.2 이상영역 열처리 및 항온변태처리 24 3.3 고속인장시험 27 3.4 미세조직 관찰 30 3.5 잔류오스테나이트 부피분율 측정 30 4. 실험결과 및 고찰 32 4.1 미세조직 관찰 32 4.2 진응력 - 진변형률 곡선 36 4.3 Strain Rate Sensitivity 41 4.4 Elongation 43 4.5 Absorbed Energy 43 5. 결 론 49 참고문헌 51 Abstract 5

Association of proteinuria and incident atrial fibrillation in patients with diabetes mellitus: a population-based senior cohort study

Diabetes mellitus (DM) is considered an independent risk factor for atrial fibrillation (AF). The excess risk in relation to the presence of proteinuria has not been well elucidated. Our aim was to determine the association between the incidence of AF and proteinuria in diabetic population. A total of 240,499 individuals aged ≥ 60 years from the Korea National Health Insurance Service-Senior cohort from 2004 to 2014 were included. 4.2% of individuals with DM and 3.7% of controls were diagnosed with AF during a median follow-up period of 7.2 years. Amongst controls (participants without proteinuria and DM), DM only, proteinuria only, and DM with proteinuria groups, the crude incidences of AF were 0.58, 0.70, 0.96, 1.24 per 100 person-years respectively. Compared with controls, the weighted risk of AF was increased by 11% (hazard ratio = 1.11, 95% confidence interval = 1.02-1.20, P = .001), 48% (hazard ratio = 1.48, 95% confidence interval = 1.30-1.69, P < .001), and 66% (hazard ratio = 1.66, 95% confidence interval = 1.26-2.18, P < .001) in the DM only, proteinuria only, and DM with proteinuria groups, respectively (P for trend < .001). Degree of proteinuria in diabetic patients was associated with a significantly higher rate of incident AF in dose dependent manner. Thus, assessing proteinuria by a simple urine dipstick test could provide a useful adjunct to risk assessment for AF in elderly population with DM.ope

뇌경색이 없는 환자에서 심방세동 발생이 치매 발생에 미치는 영향: 건강보험공단

Aims: Atrial fibrillation (AF) is generally regarded as a risk factor for dementia, though longitudinal studies assessing the association between AF and dementia have shown inconsistent results. This study aimed to determine the effect of AF on the risk of developing dementia using a longitudinal, population-based, stroke-free elderly cohort. Methods: The association of incident AF with the development of incident dementia was assessed from Jan 1, 2005 to Dec 31, 2012 in 260,638 dementia- and stroke-free participants aged ≥60 years in the Korea National Health Insurance Service-Senior cohort. Results: Incident AF was observed in 10,975 participants over an observational period of 1,613,322 person-years (0.68% per year). During the observational period, the incidence of dementia was 2.5 and 1.6 per 100 person-years in the incident AF and propensity score matched AF-free groups, respectively. After adjustment, the risk of dementia was significantly increased by incident AF with a hazard ratio (HR) of 1.84 [95% confidence interval (CI): 1.71-1.98], even after censoring for stroke (1.64, 95% CI: 1.51-1.79). Incident AF increased the risk of both Alzheimer (HR 1.63, 95% CI 1.50-1.78) and vascular dementia (HR 3.09, 95% CI 2.56-3.72). Among patients with incident AF, oral anticoagulant (OAC) use was associated with a preventive effect on dementia development (0.67, 95% CI: 0.57-0.79, p<0.001), and an increasing CHA2DS2-VASc score was associated with a higher risk of dementia. Conclusion: Incident AF was associated with an increased risk of dementia, independent of clinical stroke in an elderly population. OAC use was linked with a decreased incidence of dementia. 배경 및 목적: 심방세동은 일반적으로 치매 발생의 위험인자로 알려져 있으나 아직까지 전향적인 연구에서는 일관적인 결과를 보이고 있지는 못하다. 본 연구는 노인 인구로 구성된 전향적인 자료를 통해, 뇌경색이 없었던 인구에서도 심방세동이 치매 발생과 연관이 있는지 확인하고자 한다. 방법: 심방세동과 치매 발생과의 연관성을 확인하기 위해 건강보험관리공단의 노인코호트를 이용하였다. 2005년 1월 1일부터 2012년 12월 31일까지 등록된 환자 중 기존에 뇌경색 및 치매가 없는 260,638 명의 참가자를 분석하였다. 결과: 심방세동은 관찰 기간 1,613,322 인-년 동안 10,975 명에서 발생하였다(0.68%/년). 관찰 기간 동안 치매 발생 건수는 심방세동 군에서 2.5건/100인-년, 성향 점수 매칭 일반 인구에서 1.6건/100인-년으로 나타났다. Cox 회귀분석을 통해 기타 독립 변수를 보정한 후, 심방세동의 치매 발생 위험비는 1.84 [95% 신뢰구간: 1.71-1.98]이었으며 이는 추적관찰 중 발생한 뇌경색을 제외하고도 유의하였다(1.64, 95% 신뢰구간: 1.51-1.79). 심방세동은 알츠하이머 치매(위험비 1.63, 95% 신뢰구간 1.50-1.78) 및 혈관성 치매를(위험비 3.09, 95% 신뢰구간 2.56-3.72) 모두 증가시키는 것으로 나타났다. 심방세동 환자 중, 경구 항응고제를 사용한 경우 치매 발생이 적었다(위험비 0.67, 95% 신뢰구간: 0.57-0.79, p<0.001), 또한 높은 CHA2DS2-VASc 점수는 치매 발생의 위험도를 높이는 것으로 나타났다. 결론: 추적관찰 중 발생한 심방세동은 임상적인 뇌경색과는 독립적으로 치매 발생의 위험성을 증가시켰다. 경구 항응고제 치료를 통해 심방세동으로 인한 치매 발생을 감소시킬 수 있었다.open박

삶의 有限性과 정치질서 : Platon의 정치사상을 중심으로

학위논문(석사) --서울대학교 대학원 :정치학과,2008.Maste

Characteristics of Commentary on Chunchu Published in the Joseon Dynasty Focused on Commentaries on Chunchu Stored in Kyujanggak

이 논문은 2015년 10월 23~24일 서울대학교 규장각한국학연구원과 한국경학학회가 공동 으로 주최한 국제학술대회 <한국 경학의 위상과 경서류 문헌: 규장각 소장 經部자료를 중심으로>의 발표문을 수정 보완한 것임.현재 한국 학계에서 조선조 경학 연구는 사서오경을 중심으로 비교적 활발하게 진행되고 있다. 그렇지만 각 경전별 연구 현황을 살펴보면, 몇몇 경전에 대한 연구는 아직까지 미진한 형편이며, 그 중에서도 특히 분야는 초보적인 단계에 머물고 있다고 해도 과언이 아니다. 최근 조선조 춘추학을 대표하는 학자들에 대한 개별적인 연구 성과가 몇 편 발표되기는 했지만, 특정 학자의 해석의 특징을 밝히는 데 그칠 뿐 그 학술적 의미와 사상사적 가치를 밝히는 단계까지는 나아가지 못하고 있다. 조선조 춘추학의 성립과 발전 과정, 대표적인 학자들의 사상적 특징이나 학적 연계성 등과 같이 조선조 춘추학의 전체적인 흐름과 사상적 맥락을 파악할 수 있는 기초 연구가 선행되어 있지 않기 때문이다. 따라서 현재 조선조 경학 분야에서 가장 시급한 과제는 조선조 춘추학의 거시적인 양상을 보여줄 수 있는 토대 연구라고 할 수 있다.This paper examines trends and distinctive characteristics in publication of commentaries on Chunchu (Four Seasons; Confucian classic) in the Joseon Dynasty. Among commentaries on Chunchu, Chunchugyeongjeonjibhae, published during the reign of King Sejong, Chunchujibjeondaejeon, published during the King Seongjongs reign, and one of the books published during the King Jeongjos reign, Chunchujuasijeon were selected as subjects for this study. These classics titles are identical with similar books published in China, yet they are different in structuring and content after redaction. Through this process, shortcomings in format or errors in content of commentaries published in China were corrected, giving birth to a standard text with perfected structure and content. What is worth noticing particularly in this paper is that kings in the Joseon Dynasty ordered in person to publish the commentaries, and put support and efforts at the government level such as their engagement in structuring of the books content. This represents a special attention to required readings for a classic study as well as a will to create an independent and standard text on Chunchu. These three commentaries demonstrate the Joseon Dynastys academic prowess and achievement

(A)Study on corporate spin-offs and its implications

학위논문(박사)--서울대학교 대학원 :법학과 상사법전공,2003.Docto

會社의 分割制度의 導入과 그 問題點에 관한 硏究

학위논문(석사)--서울대학교 대학원 :법학과 상사법전공,1999.Maste