肾透明细胞癌差异表达基因的筛选及其核心基因相应miRNA和lncRNA预测分析

【目的】筛选肾透明细胞癌(ccRCC)中差异表达基因并其相关miRNA和lncRNA,寻找可作为ccRCC诊断及治疗的生物标志物。【方法】通过从TCGA数据库和GEO数据库筛选ccRCC差异表达基因并取交集,对差异表达基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,使用MCODE软件筛选出差异表达基因中的核心基因,并利用mirDIP数据库和STARBASE数据库对核心基因上游的miRNA和lncRNA进行预测。【结果】共筛选出427个差异表达基因,这些差异表达基因在GO功能分析上主要与催化活性、受体活性和细胞黏附分子活性等功能相关,KEGG信号通路富集结果则表明其主要与PPAR、Rap1以及细胞因子受体相互作用等信号通路相关。从这些差异表达基因中筛选出11个核心基因,并预测到134个相应miRNA,接着对5个与ccRCC总体生存率相关的miRNA在STARBASE中共预测到6个相应lncRNA。最后将lncRNA、miRNA、核心基因以及相应信号通路在CYTOSCAPE中构建出一个互作网络。【结论】利用生物信息学技术将TCGA数据库与GEO数据库结合起来,筛选出ccRCC中差异表达基因,并对其中的核心基因进行miRNA与lncRNA预测分析,为后续找到可用于ccRCC临床诊断的靶标与治疗的靶点提供了有力帮助。国家自然科学基金(81570748);;福州总医院杰出青年培养专项(2017Q05

肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析

目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因(DEGs),寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用Fun Rich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个。进一步使用MCODE筛选出36个关键基因,GO功能分析发现这些基因与细胞粘附分子活性、趋化因子活性、细胞通讯和信号转导等密切相关;KEGG通路富集结果则表明差异基因主要集中在趋化因子信号通路、TNF信号通路以及NF-κB信号通路等多种与肿瘤相关的通路上。结论运用生物信息学方法筛选出肾透明细胞癌Caki-1细胞系中DEGs,其中数个核心基因广泛参与多种肿瘤的病理进程,但尚未在肾透明细胞癌有相关研究报道,提示其可能是治疗肾透明细胞癌的潜在靶点。国家自然科学基金(81570748);;福州总医院杰出青年培养专项(2017Q05

基于数据挖掘分析PEG3基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

目的:阐述印迹基因PEG3在肾细胞癌中的表达及意义。方法:利用Oncomine数据库及GEPIA分析PEG3在肾透明细胞癌组织中的表达情况;利用KM-Plotter做PEG3与肾透明细胞癌患者生存期的相关性分析,经Meth HC分析PEG3启动子区甲基化水平,String-DB数据库分析PEG3相互作用蛋白;通过The Human Protein Atlas分析PEG3蛋白在肾透明细胞癌中的蛋白表达情况。结果 :在mRNA水平上,PEG3在肾透明细胞癌中较正常肾组织显著低表达,表达水平与肾癌预后呈负相关(Log-rank P=0.001 1),PEG3蛋白在肾透明细胞癌中也较正常肾脏组织低表达,且其启动子甲基化水平则显著增高。与PEG3相关蛋白有NLRP7、MEST、SIAH1、PEG10、CDC25 B等,可能参与细胞有丝分裂周期调节及遗传印迹等细胞功能。结论 :通过肿瘤基因数据库信息挖掘发现,PEG3在肾透明细胞癌组织中呈低表达,且与患者生存期有关,将为后续的肿瘤研究提供重要的理论依据。国家自然科学基金(编号:81570748,81370948

基于数据挖掘分析ATP1A1基因在肾透明细胞癌中的表达及意义

目的:通过数据挖掘分析ATP1A1在肾透明细胞癌中的表达及意义。方法:通过Oncomine数据库检索关于ATP1A1的mRNA信息,采用The Human Protein Atlas分析ATP1A1蛋白在正常肾组织和肾透明细胞癌中表达情况,GEPIA网站中TCGA数据对ATP1A1低表达的肾透明细胞癌患者进行生存分析,Meth HC数据库分析ATP1A1甲基化水平和蛋白相互作用,利用String-DB数据分析ATP1A1与上下游蛋白的相互作用。结果:肾透明细胞癌(Clear cell Renal Cell Carcinoma,cc RCC)组织中ATP1A1的mRNA表达水平较正常对照组明显降低。免疫组化结果证实ATP1A1蛋白质表达变化与mRNA相似。TCGA数据中得出ATP1A1低表达患者的总体生存期明显短于高表达组患者。此外,ATP1A1基因启动子区在肾透明细胞癌中的甲基化水平明显高于正常肾组织中。同时,ATP1A1与ATP1B1、FXYD2、ATP1B2等蛋白可能存在相互作用。结论:大数据分析结果表明ATP1A1在肾透明细胞癌中低表达,并与其发生发展相关,可能作为其潜在的治疗靶点。国家自然科学基金项目(81370948;81570748

分散度对负载型铂基催化剂CO氧化性能的影响(英文)

摘要:以氧化铈、氧化硅和氧化铝为载体,采用浸渍法制备了一系列不同负载量的Pt基催化剂,并利用透射电子显微镜、X射线粉末衍射和X射线光电子能谱等技术对催化剂进行了表征.结果表明,对于Pt/CeO2催化剂,随着负载量减小,Pt的分散度提高;对于相同负载量的Pt基催化剂,各催化剂上Pt分散情况为:Pt/SiO2<Pt/γ-Al2O3<Pt/CeO2.CO氧化反应结果表明,0.25%Pt/CeO2催化剂表现出更加优良的低温活性,室温下其单位Pt原子上CO2的生成速率为2.2×10-3s-1

液晶性树状高分子

对树状高分子进行功能化,使之成为具有特定性能的新型材料是目前很热门的课题,树状液晶就是其中之一。树状高分子长径比很小,似乎难以形成液晶态,但人们已发现多种树状液晶分子,几乎囊括了所有在其他高分子中出现过的液晶相。本文按液晶相分类,介绍树状液晶高分子的研究进展

Abundance and production of bacteria and their correlations with environmental factor

以2014年8月南海北部海水样品为研究对象,利用平板计数法和流式细胞仪计数法对南海北部表层和垂直海域可培养细菌和细菌总数分布状况进行研究,对细菌; 生产力进行测定,并结合环境因子进行相关性分析。结果表明:珠江口到南海北部海域,水平方向可培养细菌总数变化范围是3.70*10~2 ~; 1.42*10~3 CFU/mL,细菌总数变化范围是5.12 * 10~5 ~1.61 * 10~6; cells/mL,细菌生产力的变化范围是0.03 ~0.40 mg/m~3/h;垂直方向上可培养细菌变化范围是1.08 *10~3 ~9.00; *10~3 CFU/mL,细菌生产力变化范围是0.01 ~0.08; mg/m~3/h,其中表层海水中的细菌生产力明显高于底层。与环境因子相关性分析表明,水平方向上,影响南海北部表层海水细菌总数和细菌生产力的主要因; 素是温度、盐度、硝酸盐(NO_3-N)、硅酸盐(SiO_3-Si)、亚硝酸盐(NO_2-N)和磷酸盐(PO_4-P)(P<0.05);垂直方向上; ,影响南海北部可培养细菌总数的主要因素是NO_2-N(P<0.05),影响细菌生产力的主要影响因素是温度和盐度(P; <0.05)。可见,南海北部表层海水中细菌总数高于可培养细菌总数2; ~3个数量级,表明该海域表层海水存在大量不可培养细菌;细菌的生命活动在海水表层相较底层更为活跃。Distribution of abundance and production of bacteria and their; correlations with environmental factor were investigated, using plate; count method and flow cytometry, in the surface and vertical waters of; the northern south China sea in August 2014. The cultivable bacterial; abundance ranged from 3.70 * 10~2 CFU/mL to 1.42 * 10~3 CFU/ mL, the; total bacterial abundance ranged from 5.12 * 10~5 cells/mL to 1.61 *; 10~6 cells/mL and the bacterial productions varied from 0.03 mg/m~3/h to; 0.40 mg/m~3/h in horizontal distribution. In vertical distribution, the; cultivable bacterial abundance ranged from 1.08 * 10~3 CFU/mL to 9.00 *; 10~3 CFU/mL and the bacterial productions varied from 0.01 mg/m~3/h to; 0.08 mg/m~3/h, respectively. The correlation analysis results showed; that the environmental factors affecting the abundance of total bacteria; and bacterial productivity included temperature, salinity,; nitrate(NO_3-N),silicate (SiO_3-Si), nitrite (NO_2-N),and phosphate; (PO_4-P) (P<0.05). NO_2-N was the main influencing factor to cultivable; bacteria abundance (P < 0.05), while bacterial productivity was highly; correlated with temperature and salinity in vertical distribution of; northern south China sea (P < 0.05). The total bacterial abundance was 2; ~ 3 orders of magnitude higher than cultivable bacteria, suggesting that; there were many uncultured bacterium in surface water of northern south; China sea and bacterial activities in the surface maybe more active than; in the bottom.全球变化与海气交互作用; 国家重点研发计划全球变化及应对专项; 海洋公益性行业科研专

U型拱梁失稳有限元分析

U型拱梁在隧道支护和矿山巷道支护中应用广泛,实际工程中的地压作用以及注浆加固过程中产生的集中力都可能引起支架的失稳破坏。本文利用有限元数值分析软件ANSYS采用我们提出的瞬态分析计算失稳临界载荷方法对不同对称位置受径向集中力作用的U型钢拱梁的稳定性进行了研究,并分别采用特征值屈曲分析和几何非线性分析方法进行了分析,将得到的失稳临界荷载值进行了对比分析。研究结果为工程应用提供了可行方法和理论依据

聚多巴胺修饰六方氮化硼及其环氧复合涂层的腐蚀行为

为了提高六方氮化硼在溶剂和有机涂层中的分散并探究其对环氧涂层耐蚀性能的影响,采用聚多巴胺(PDA)修饰六方氮化硼改善其在溶剂和环氧涂层中分散性的方法,通过SEM、TEM、XPS、Raman、TG表征了改性六方氮化硼的形貌、化学组成和热稳定性;除此之外,采用电化学方法研究了改性六方氮化硼掺入环氧复合涂层在3.5%NaCl溶液中的腐蚀行为。结果表明:与环氧涂层相比,h-BN@PDA/环氧复合涂层在长效腐蚀测试过程中表现出更正的腐蚀电位(-0.1 V)、高的阻抗模值和涂层阻抗值(~10~(10)Ω·cm~2)、低的特征频率值(~0.1 Hz);且金属基底表面无明显腐蚀,显示优异的抗腐蚀性能。这主要是因为纳米层状六方氮化硼的添加可以降低涂层的孔隙率并且能够延缓腐蚀介质的渗入,进而提高了其耐腐蚀性能

氮化硼分散剂、液相剥离二维氮化硼纳米片的方法及其应用

本发明公开了一类氮化硼分散剂、液相剥离二维B3N4纳米片的方法及其应用。所述氮化硼分散剂包括能够通过物理作用与氮化硼结合而使氮化硼稳定分散于分散介质中的苯胺低聚物。本发明利用易于合成、低成本的苯胺低聚物作为氮化硼分散剂，并将该分散剂与氮化硼在分散介质，例如有机溶剂中简单混合，通过两者之间的物理相互作用，即可大幅提升氮化硼，特别是氮化硼二维纳米材料在有机溶剂中的分散度及分散稳定性；而且，籍由所述苯胺低聚物，还可以通过简单的液相剥离方法获得氮化硼纳米片，其无损于氮化硼的物理结构和化学性能；另外本发明中应用于氮化硼分散或氮化硼纳米片剥离的分散介质可以循环使用，能够降低成本、减少有机物排放，利于规模化实施