会议简讯

2012年6月22-30日,第11届国际水产养殖遗传学研讨会(International Symposium on Genetics in Aquaculture,ISGS)在美国阿拉巴马州奥本大学(Auburn University)召开,来自30多个国家和地区的150多名学者参与了此次大会。会议由奥本大学Rex Dunham教授组织,主题之一是"将基因组学应

大鳞副泥鳅7个群体遗传变异的微卫星分析

利用泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)的微卫星引物跨种扩增大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus),通过家系扩增、PCR产物测序筛选出6个座位,用于大鳞副泥鳅7个野生群体的遗传结构分析。结果显示,群体的平均等位基因数在3.167～4.833,平均观测杂合度(Ho)在0.248～0.417,平均期望杂合度(He)在0.379～0.505,多个座位存在零等位基因、杂合子缺失现象,显示大鳞副泥鳅种群遗传多样性较低。采用UPGMA法对7个群体基于DA遗传距离进行聚类,可分为4类,位于长江中下游的沙市、澧县、武汉、鄱阳湖群体先聚为一类,后与石首群体聚类,最后与珠江水系的广州群体聚类,而位于长江上游的泸州群体则单独聚为一类。群体的F-统计量(Fst)为0.2987,表明群体间存在显著的遗传分化,主要由泸州群体与其它地区群体间的遗传分化引起

鱼类免疫应答的遗传研究

通过经典血清学试验首次在红鲫(Carassius auratus,简称R C Carp)群体中发现一种RBC抗原的个体差异性，有四种表型，把这种存在于红鲫中的RBC抗原多型性现象称之为S血型系统，该系统中有2种抗原因子S~1，S~2，另有缺乏抗原类型S~0，四种血型表型是：S~1，S~2，S~1，S~2，S~0，推测是由一个座位上的二个显性等位基因S~1和S~2以及另一个零等位基因S~0组成的复等位基因系列所决定。不同的血型表型交配一子裔分析结果证明，红鲫群体中存在着可能的6种基因型：S~1S~1，S~1S~0，S~2S~2，S~2S~0，S~1S~2，S~0S~0。X~2测验值均P>0.05。通过计算基因频率和基因型频率而得到的各种表型的理论数与实际数值非常接近(P>0.05)，证明红鲫S血型系统由一个座位(locus)的三个等位基因(S~1，S~2，S~0)所控制的假设是可以接受的。试验结果还证明S血型与人类ABO血型没有吻合的抗原因子类型。雌核发育是研究鲫类MHC分子的良好方法。红鲤雌核发育二代(GF_2-8413和GF_2-8305)在鳞片移植－排斥反应中的移植成活时间(MST)比对照鲤鱼(普通红鲤以及红鲤杂交鲤<->杂交鲤)高出2－3倍，并且分别有11％左右和80％左右的移植永久存活（超过35天），表明G_2的MHC单倍型的纯合性程度已相当高。GF_2-8305更适合于作为遗传育种研究中的纯系。用杀死的GCRV作为抗原对草鱼(Ctenipharyngodon idellis)进行人工超免疫(superimmune)得到了一代IGF：在正常状态下与对照草鱼无异(Ig水平无差异)。但是用活的或死的GCRV攻击时，其反应敏感性和强度似乎比对照鱼来得要高（在Ig变化中平均有一个－log2滴度差异）。在活的GCRV攻击时，Ig开始有一个较剧烈的下降过程，然后鱼的成活与Ig的升高有相关性，Ig继续下降的个体则全部死亡(JGF，R 保护作用为68％，对照组为46.7％)。IGF与对照鱼表现出一定的应答差异，初步认为可能与草鱼对GCRV抗原的记忆的的传递有关。讨论了免疫记忆的遗传的可能原因

SNPs及其在水产动物遗传学与育种学研究中的应用

1 SNP简介1.1 SNP的概念单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)指基因组DNA序列中某个特定位点的单个核苷酸发生变异而引起的序列多态性,包括单碱基的转换、颠换、插入及缺失等形式,其中一种等位基因在群体中的

三个鲤品种线粒体基因片段序列保守性

在红鲤、镜鲤和野鲤中进行线粒体 1 6SrRNA和Cytb基因片段的序列测定。结果发现 ,3个鲤品种在多达 859个碱基长度上无变异 ,但是与已报道的鲤全序列中的同源序列则有约 1 5%的趋异。这个结果提示 3个鲤品种可能在起源中是独立的一支 ,并且分化极

红鲫血型的血清学研究

运用经典血清学方法首次在红鯽中证明了一种与金枪鱼中的A-B-O血型及人类的ABO血型模式相似的红细胞抗原系统,命名为S血型系统。该系统有四种血型表型:S~1,S~2,S~2S~2和S~0,推测它由S~1、S~2和S~0三个复等位基因决定

三个鲤品种线粒体基因片段序列保守性

在红鲤、镜鲤和野鲤中进行线粒体 1 6SrRNA和Cytb基因片段的序列测定。结果发现 ,3个鲤品种在多达 859个碱基长度上无变异 ,但是与已报道的鲤全序列中的同源序列则有约 1 5%的趋异。这个结果提示 3个鲤品种可能在起源中是独立的一支 ,并且分化极

三个鲤品种线粒体基因片段序列保守性

在红鲤、镜鲤和野鲤中进行线粒体 1 6SrRNA和Cytb基因片段的序列测定。结果发现 ,3个鲤品种在多达 859个碱基长度上无变异 ,但是与已报道的鲤全序列中的同源序列则有约 1 5%的趋异。这个结果提示 3个鲤品种可能在起源中是独立的一支 ,并且分化极

福尔马林固定铜鱼基因组DNA的提取与扩增

铜鱼(Coreius heterodon)作为长江中、上游的重要经济鱼类是研究三峡大坝阻隔效应的重要材料之一。然而,过去的铜鱼标本都保存在福尔马林溶液中,有必要探讨从福尔马林固定的铜鱼标本中有效提取基因组DNA的方法以及这些DNA用于微卫星和线粒体分析的可行性。本实验通过改进的酒精梯度浸泡法去除标本中的甲醛,然后用酚-氯仿抽提法成功地提取到了铜鱼标本的基因组DNA;设计引物后进行了线粒体和微卫星的PCR扩增,扩增产物经银染检测。微卫星扩增结果显示只有部分个体可以扩出目的带,而线粒体控制区部分区段在所有个