Design and Simulation of Punctured Woven Convolutional Codes

编织(Woven)码是一类包容性极强的新型纠错码,由于其自身的组合性导致它的编码效率不高、译码延迟大及硬件复杂性高,这些缺点制约了编织卷积码(WCCs)的应用。为了推动WCCs在实际通信系统中的应用,提高其编码效率,该文采用了删余技术,提出将其内外成员码分别进行删余。对删余WCCs在加性的变斯噪声(AWGN)信道上进行了设计与仿真,证实了删余后的外经结构WCCs在相同的码率和相同的外编码器个数情况下有比非删余的WCCs更优的误码率(BER)性能,且大大降低了其编译码的复杂性,提高了其编码效率。Woven convolutional codes(WCCs) is a novel class error-correcting codes with high compatibility.But woven convolutional codes has some disadvantages,such as lower coding efficiency,higher decoding delay,and complexity of hardware realization.These flaws restrict the applications of WCCs.In this paper the puncturing technology is employed to enhance the coding efficiency and promote the application of WCCs.The puncturing technology is used to punctured outer warp and inner warp at first,respectively.Over additional white Gaussian noise(AWGN) channel,simulations show that the performance of punctured WCCs with outer warp is better than that of non-punctured WCCs with outer warp in same rate and same number outer encoders,and the complexity of encoding and decoding for WCCs based on puncturing is reduced greatly and the coding efficiency is improved.国家自然科学基金(60272005);; 教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-04-0601);; 重庆市科委自然科学基金(CSTC,2007BB2387

Applications of LDPC Codes on GF (2--2) in Deep-space Communications

提出了一种近似等效信道模型,实现了gf(22)域上的ldPC码在深空通信系统中的嵌入设计。仿真结果表明:当数据帧长为1784bITS,bITErrOrrATE(bEr)为2x10-6,采用ffT-bP译码算法,50次迭代时,gf(22)域上的ldPC码相比rS码与卷积码级联码具有4.8db的编码增益;如果采用MAX-lOg-bP简化译码算法,10次迭代时,前者仍然能获得约3.8db的增益,且复杂度可以接受。An approximate equivalent channel model was proposed to realize the design of LDPC codes on GF(22) embedded in deep-space communication systems.Simulation results show that an LDPC code on GF(22) obtains 4.8 dB coding gain compared with a serial concatenation of a RS code with a convolutional code using the FFT-BP decoding algorithm with 50 iterations,when data block size is 1784bits,ber 2*10-6.However,based on the MAX-LOG-BP simplified algorithm with 10 iterations,the former has also about 3.8 dB gain,and the complexity can be accepted.国家自然科学基金(60972053);教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-04-0601

Interleave-division-multiple space-time system using LDPC codes

交织分复用空时码(IdM-ST)技术是第四代移动通信的关键技术之一,设计了一种基于ldPC编码的交织分复用空时码系统,并将它与传统的基于卷积码编码的IdM-ST系统在准静态的瑞利衰落信道下进行了比较。仿真结果表明,在不同帧长,不同天线数情况下,基于ldPC编码的IdM-ST系统和基于卷积码编码系统各有其优势。整个系统具有接收简单,复杂度低等优点。在实际应用中,适合于高速的数据传输业务。IDM-ST is one of key technologies in the fourth generation of mobile telecommunication.A LDPC coded IDM-ST system was designed and it has been compared with a convolutional coded IDM-ST system over quasi-static Rayleigh fading channels.Simulation results show that the proposed system and the convolutional coded system have their own predominances with different frame length and different antenna numbers.The proposed system has simple receiver and low complexity.In practical application,it is very suitable for high-speed transmission operation.教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-04-0601);重庆市科委自然科学基金项目(CSTC;2007BB2387

Characteristic and Application of Convolutional Codes

用卷积码的活性距离来分析卷积码的性能是随着分析Turbo码的性能而开始的,卷积码的活性距离是自由距离的扩展,它主要是由一个参数来决定的,即活性距离的斜率α。在对卷积码的活性距离进行简要介绍后,主要针对应用α对编织卷积码进行优化作出了探讨,指出了卷积码的活性距离α是分析用卷积码作为成员码的组合编码性能的重要参数。这对优化用卷积码作为成员码的组合编码,降低其编码复杂性有重要作用,也对推动该类组合码的应用有较高的价值。最后给出了仿真结果。The active distance of the convolutional codes is used to analyse the performance of the convolutional codes with the turbo codes was discovered.The active distence of convolutional codes is the extension of the free distance,and it is determined by the parameter α,viz.the slope of the active distance.The active distance of the convolutional codes are presented in this paper.This paper discusses how to optimize woven convolutional codes.It also points that the parameter α is important to analyse and optimize the performance of combinational codes with covolutional codes as the component codes,which also sinplize the encoding complication. This promotes the application of combined codes.Finally the simulation results are shown.国家自然科学基金资助项目(60272005);; 重庆邮电学院青年教师基金资助项目(2005-29

改良分子信标-实时PCR快速检测志贺菌

目的:建立改良分子信标-实时PCR检测志贺菌的快速方法,应用于志贺菌食物中毒的快速诊断和门诊肠道致病菌的检测。方法:根据GenBank公布志贺菌ipaH基因的保守序列,设计引物和改良分子信标探针,建立实时PCR-改良分子信标检测体系,应用于对志贺菌食物中毒的快速诊断和门诊肠道致病菌的检测。结果:改良分子信标-实时PCR反应体系DNA灵敏度为93 fgμ/l,菌液灵敏度为64 cfu/m l或2 cfu/PCR反应体系,无交叉反应。此反应体系检测67株志贺菌,均出现特异的荧光信号。对细菌性食物中毒样本等共657份样品进行志贺菌检测,42份志贺菌实时PCR阳性,其中41份志贺菌细菌培养阳性。从样品处理到检测结果仅需2 h~1 d时间。结论:改良分子信标-实时PCR检测体系快速、灵敏度高,特异性强,可用于志贺菌食物中毒的快速诊断,为食源性疾病的分子流行病学调查提供新的检测手段,对于提高肠道门诊的工作效率有重要意义

改良分子信标实时PCR快速检测大肠杆菌O_(157):H_7

目的建立改良分子信标实时PCR快速检测大肠杆菌O157H7的快速方法。方法根据GenBank公布O157H7的rfbE保守序列,设计一对引物和改良分子信标探针,用FAM荧光剂标记探针的5’端,建立改良分子信标实时PCR检测O157H7的反应体系,应用于食物中毒快速诊断和食品微生物检测。结果共检测11种细菌,只有大肠杆菌O157H7有荧光信号,其余10种全无荧光信号,且与其他细菌无交叉反应,DNA灵敏度为64fg,菌液灵敏度为59cfu/ml或2cfu/PCR反应体系。应用改良分子信标实时PCR反应体系检测10株O157H7均出现特异的荧光信号,无干扰。对89份食品样品进行检测,5份O157H7实时PCR阳性,其余样品为阴性,检测仅需2h。5份阳性样本,经传统方法培养,有3份检出大肠杆菌O157H7。结论改良分子信标实时PCR检测体系快速、灵敏度高,特异性强,可用于大肠杆菌O157H7食物中毒的快速诊断和食品微生物检测,为食源性疾病的分子流行病学调查提供新的检测手段

养正消积胶囊辅助GP方案治疗晚期非小细胞肺癌临床研究

目的观察养正消积胶囊辅助GP方案治疗晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的临床疗效。方法采用随机数字表法将89例晚期NSCLC患者分为对照组44例及观察组45例。2组均采用GP方案;观察组并予养正消积胶囊,每次4粒,每日3次,口服。2组均21d为1个周期,连续治疗2个周期,随访1年。观察2组治疗前后Ki67、Bax、Bcl-2蛋白表达及肿瘤标志物[血管内皮生长因子(VEGF)、骨桥蛋白(OPN)、癌胚抗原(CEA)、糖类抗原199(CA199)]、中医症状评分、生活质量评分,比较2组客观缓解率(ORR)、疾病控制率(DCR)、无进展生存时间(PFS),监测不良反应。结果观察组ORR、DCR明显优于对照组(P<0.05)。与本组治疗前比较,观察组治疗后、随访1年VEGF、OPN、CEA、CA199水平明显降低(P<0.05);对照组治疗后上述指标明显降低(P<0.05),随访1年CEA水平明显降低(P<0.05)。与本组治疗前比较,2组治疗后Ki67、Bcl-2蛋白表达明显降低,Bax蛋白表达明显升高(P<0.05);2组治疗后比较,观察组Ki67、Bcl-2蛋白表达低于对照组(P<0.05),Bax蛋白表达高于对照组(P<0.05)。与本组治疗前比较,2组治疗后中医症状评分(神疲乏力、胃纳少馨、腰膝无力、夜尿频多、头晕目眩)、生活质量评分(躯体功能、认知功能、社会功能、情绪功能)明显改善(P<0.05);2组治疗后比较,观察组上述评分改善明显优于对照组(P<0.05)。观察组PFS明显长于对照组(P<0.05),不良反应明显低于对照组(P<0.05)。结论养正消积胶囊辅助GP方案治疗晚期NSCLC可有效降低患者肿瘤标志物水平,改善生存质量,减少吉西他滨和顺铂的不良反应,提高疗效。福建省卫生厅中医药科研专项课题(wst201210

类泛素蛋白及其中文命名

泛素家族包括泛素及类泛素蛋白,约20种成员蛋白.近年来,泛素家族领域取得了迅猛发展,并已与生物学及医学研究的各个领域相互交叉.泛素家族介导的蛋白质降解和细胞自噬机制的发现分别于2004和2016年获得诺贝尔奖.但是,类泛素蛋白并没有统一规范的中文译名. 2018年4月9日在苏州召开的《泛素家族介导的蛋白质降解和细胞自噬》专著的编委会上,部分作者讨论了类泛素蛋白的中文命名问题,并在随后的\"泛素家族、自噬与疾病\"(Ubiquitinfamily,autophagy anddiseases)苏州会议上提出了类泛素蛋白中文翻译草案,此草案在参加该会议的国内学者及海外华人学者间取得了高度共识.冷泉港亚洲\"泛素家族、自噬与疾病\"苏州会议是由美国冷泉港实验室主办、两年一度、面向全球的英文会议.该会议在海内外华人学者中具有广泛影响,因此,参会华人学者的意见具有一定的代表性.本文介绍了10个类别的类泛素蛋白的中文命名,系统总结了它们的结构特点,并比较了参与各种类泛素化修饰的酶和它们的生物学功能.文章由45名从事该领域研究的专家合作撰写,其中包括中国工程院院士1名,相关学者4名,长江学者3名,国家杰出青年科学基金获得者18名和美国知名高校华人教授4名.他们绝大多数是参加编写即将由科学出版社出版的专著《泛素家族介导的蛋白质降解和细胞自噬》的专家

Trisomy 21-induced Dysregulation of Microglial Homeostasis in Alzheimer’s Brains is Mediated by USP25

阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease, AD）是一种最为常见的与记忆、认知能力退化相关的渐进性神经退行性疾病。唐氏综合征（Down’s syndrome, DS）是早发型阿尔茨海默病的一个重要风险因素，作为最常见的智力障碍遗传疾病，厦门大学医学院神经科学研究所王鑫教授团队揭示了治疗阿尔茨海默病和唐氏综合征新的治疗靶点，并且在小鼠模型上利用USP25小分子抑制剂成功地改善了阿尔茨海默病小鼠的认知功能，缓解了神经退行性病变的病理进程。该研究工作由王鑫教授指导完成，厦门大学医学院助理教授郑秋阳和博士生李桂林完成主要实验工作，王世华、朱琳、高月、邓青芳、张洪峰、张丽珊、吴美玲、狄安洁参与了部分研究工作。厦门大学医学院许华曦、赵颖俊和孙灏教授在研究过程中给予大力帮助和支持，清华大学董晨教授提供了Usp25基因敲除小鼠，厦门大学附属妇女儿童医院周裕林教授和郑良楷博士帮助收集了脑组织样品。Down syndrome (DS), caused by trisomy of chromosome 21, is the most significant risk factor for early-onset Alzheimer’s disease (AD); however, underlying mechanisms linking DS and AD remain unclear. Here, we show that triplication of homologous chromosome 21 genes aggravates neuroinflammation in combined murine DS-AD models. Overexpression of USP25, a deubiquitinating enzyme encoded by chromosome 21, results in microglial activation and induces synaptic and cognitive deficits, whereas genetic ablation of Usp25 reduces neuroinflammation and rescues synaptic and cognitive function in 5×FAD mice. Mechanistically, USP25 deficiency attenuates microglia-mediated proinflammatory cytokine overproduction and synapse elimination. Inhibition of USP25 reestablishes homeostatic microglial signatures and restores synaptic and cognitive function in 5×FAD mice. In summary, we demonstrate an unprecedented role for trisomy 21 and pathogenic effects associated with microgliosis as a result of the increased USP25 dosage, implicating USP25 as a therapeutic target for neuroinflammation in DS and AD.This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (31871077, 81822014, and 81571176 to X.W.; 81701130 to Q.Z.), the National Key R&D Program of China (2016YFC1305900 to X.W.), the Natural Science Foundation of Fujian Province of China (2017J06021 to X.W.), the Fundamental Research Funds for the Chinese Central Universities (20720150061 to X.W.), and the BrightFocus Foundation (A2018214F to Yingjun Zhao). 该研究工作得到国家重点研发计划项目、国家自然科学基金、福建省自然科学基金、厦门大学校长基金的资助和支持