大鳞副泥鳅7个群体遗传变异的微卫星分析

利用泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)的微卫星引物跨种扩增大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus),通过家系扩增、PCR产物测序筛选出6个座位,用于大鳞副泥鳅7个野生群体的遗传结构分析。结果显示,群体的平均等位基因数在3.167～4.833,平均观测杂合度(Ho)在0.248～0.417,平均期望杂合度(He)在0.379～0.505,多个座位存在零等位基因、杂合子缺失现象,显示大鳞副泥鳅种群遗传多样性较低。采用UPGMA法对7个群体基于DA遗传距离进行聚类,可分为4类,位于长江中下游的沙市、澧县、武汉、鄱阳湖群体先聚为一类,后与石首群体聚类,最后与珠江水系的广州群体聚类,而位于长江上游的泸州群体则单独聚为一类。群体的F-统计量(Fst)为0.2987,表明群体间存在显著的遗传分化,主要由泸州群体与其它地区群体间的遗传分化引起

干扰素防治草鱼出血病的效果初探

对人工诱导的鲫鱼干扰素防治草鱼出血病的效果进行了初步探讨。结果表明 ,人工诱导的鲫鱼干扰素确能有效防治草鱼出血病 ,腹腔注射和药浴浸泡两种途径均有一定效果。在病毒感染前使用干扰素处理的效果好于在病毒感染后使用干扰素处理。多次使用干扰素处理的效果好于一次性处

鳙gh基因单核苷酸多态性及其与生长性状相关性研究

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是一种研究养殖动物遗传变异及其与经济性状相关性的重要的分子标记。本研究通过直接测序和单链构象多态性(PCR-SSCP)等方法检测和鉴定鳙生长激素基因(growth hormone gene,GH)内的SNP变异,并对SNP基因型以及二倍型与生长性状(全长,体重,体长,体高,肥满度)进行了关联性分析。我们在鳙GH基因的第二个内含子发现了5个变异位点,并将它们命名为SNP1(676delC和677A>G),SNP2(715T>G和737T>A)和SNP3(982C>T)。广义线性模型(GLM)分析显示,SNP3与鳙全长,体长,体重相关性显著,而SNP1和SNP2与生长性状不相关。在三个SNP位点基因型的组合分析中,具有二倍型D5(SNP1AA,SNP2AA,SNP3AB)的个体在全长,体长,头长和体重性状上均显著高于二倍型D7(SNP1BB,SNP2AA,SNP3AA)(P<0.05或0.01)。本研究结果表明,鳙GH基因的SNP3和二倍型D5与生长性状有显著相关性,可作为候选基因标记,用于鳙经济性状的分子标记辅助育种研究

草鱼Sox基因的克隆及其在鱼类基因组加倍和进化研究中的意义

Sox基因家族已经在各种脊椎中被广泛发现,它们编码一些调节蛋白,参与许多重要的发育过程(例如性别决定和分化、心脏和中枢神经系统发育等)。Sox基因的共同特征是都包含有一个HMG盒(high mobility group,HMG box)。迄今仅在少数鱼类中报道了Sox基因,在我国重要的经济鱼类中还未见到报道。草鱼 (Ctenopharyngodon idella)是我国最重要的经济鱼类之一,也是目前世界上养殖产量最大的淡水鱼类。草鱼基因组的研究是我国水产养殖动物今后的重要对象之一。利用兼并引物,我们从草鱼基因组中克隆了Sox基因家族的一些成员,经过测序和序列比对分析,发现我们所克隆的12个基因,属于Sox基因家族中的B1,B2和C组,它们分别是Sox1,Sox2,Sox3,Sox4a,Sox4b,Sox11a,Sox11b,Sox12,Sox14a,Sox14b,Sox21a, Sox21b。在人类中,Sox4,Sox11和Sox14都只有1个拷贝,但是草鱼中都是2个拷贝。我们还发现,Sox4和Sox11加倍的时间发生在草鱼与斑马鱼分歧之前。本研究发现的这些草鱼Sox基因的加倍现象,证实了过去有关动物进化中鱼类经历了基因组加倍事件的推断。草鱼Sox基因家族的克隆和初步分析鉴定,为进一步研究鱼类Sox 基因的功能以及基因组进化研究提供了较好的素材

三峡库区5个鲢群体遗传变异的微卫星分析

研究利用10个高度多态的微卫星标记对三峡水库秭归、巫山、云阳、忠县、木洞等5个库区鲢（Hypophthalmichthys molitrix）的野生群体进行了遗传多样性分析。检测到161个等位基因,群体共有等位基因84个,每个微卫星位点的等位基因数7—29不等。平均观测杂合度Ho为0.784—0.846,平均期望杂合度He为0.828—0.847,平均多态信息含量PIC为0.797—0.817。Fst值为–0.001—0.009,表明5个鲢群体间没有遗传分化。Hardy-Weinberg平衡检验表明巫山、云阳、木洞群体在一些位点上偏离遗传平衡。Bottleneck分析显示长江三峡库区江段的鲢群体可能在历史上经历了遗传瓶颈。5个群体间的遗传相似系数为0.891—0.950,遗传距离为0.050—0.115,根据Nei’s遗传距离所绘制的聚类图,表明鲢群体间的遗传距离与其地理距离基本一致。贝叶斯分析结果也证实三峡库区5个鲢群体可视为一个类群。尽管没有检测到遗传分化,数据清晰地表明三峡库区的鲢群体仍有很高的遗传多样性,研究结果为三峡地区和长江上游的鲢种质资源保护和种群评估提供了参考

鲤鱼多态性EST标记的筛选与特性分析

表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)标记在基因组作图和分子标记辅助育种研究中具有重要价值。筛选和开发可用于遗传作图的鲤鱼多态性EST标记,对研究鲤鱼的基因组结构、遗传多样性研究和遗传育种有重要意义。本研究根据GenBank数据库中鲤鱼EST序列设计了67对EST引物,有47对在鲤鱼基因组DNA中成功扩增得到稳定的特异性条带,经单链构象多态性(SSCP)分析,12对(25.5%)引物扩增的EST在1个鲤鱼回交家系中具有多态性,其中6个为鲤鱼功能基因,5个与斑马鱼(Dani

鲢和鳙单倍体和二倍体单个囊胚的细胞培养

对鲢、鳙单倍体和二倍体单个囊胚胚胎进行培养,结果表明,单倍体和二倍体细胞对培养条件的要求相差不大,其原代培养细胞的生长特点表现为新生细胞主要沿着组织块边缘重叠生长,向外扩展生长的速度非常缓慢,二倍体的鲢和鳙胚胎细胞培养物成活率相对高于单倍体,其中鲢二倍体胚胎细胞传代细胞占细胞培养数的18.06％。本结果对深入开展鲢、鳙核移植及胚胎干细胞研究具有积极意义

冷休克和热休克诱发大鳞副泥鳅的雌核发育

人工雌核发育(gynogenesis)是构建鱼类纯系和研究性别决定机制的遗传学方法之一。大鳞副泥鳅不仅是一种小型的经济鱼类,也是许多生物学研究的良好实验材料。大鳞副泥鳅是目前我国学者报道的具有异形性染色体的少数鱼类之一,但并没有进一步的细胞遗传或分子遗传证据。本文报道采用冷休克和热休克诱导大鳞副泥鳅的雌核发育,并用分子遗传标记监测雌核发育后代的母性遗传和基因重组情况,试图为大