AcrB homológ membrán transzporterek vizsgálata = Investigation of AcrB homologue membrane transporters

Különböző AcrB homológ fehérjéket vizsgáltunk. Kettő a Brucella melitensis baktériumban kódolt (BMEI 1645, BMEI 0895) egy-egy pedig Haemophilus influenzae-ban (HI 0895). Acinetobacter baumannii-ban (ACIAD0783), Pseudomonas aeruginosa-ban (PA0158), Pectobacterium carotovorum-ban (ECA1169), Helicobacter pylori-ban (HP0607), Klebsiella pneumoniae-ban (KPN00443) valamint Bacillus cereus törzsekből: Bacillus cereus ATCC 10987 (BCE 0788), és Bacillus cereus ATCC 14579 (BC0714). Sikeres klónozást a következő gének esetén értünk el: BMEI 1645, BMEI 0895, HI 0895, BCE 0788, BC0714. A felsorolt gének közül a BMEI 1645-ös fehérje over-expresszálódott egyedül Escherichia coliban. Ezt a fehérjét szolubilizáltuk, tisztítottuk affinitás oszlopon, majd gélszűréssel. A fehérje két fő populációt mutatott a gélszűrés eredményként, melyeket jellemeznünk szükséges a fehérje kristályosítása előtt. Az AcrB fehérjét, mint kontrollt, sikeresen klónoztuk, expresszáltuk Escherichia coliban, nagy mennyiségben tisztítottuk és kristályosítottuk. A kristályosítás során ß-peptid foldamerek hatását vizsgáltuk és megállapítottuk, hogy a kristályosítás során segédanyagként használt foldamer megkönnyíteni, lerövidíteni látszik kristályosításhoz szükséges időt. | Different AcrB homologue transporters were examined. Two of them are coded in Brucella melitensis (BMEI 1645, BMEI 0895), one each is coded in Haemophilus influenzae (HI 0895). Acinetobacter baumannii (ACIAD0783), Pseudomonas aeruginosa (PA0158), Pectobacterium carotovorum (ECA1169), Helicobacter pylori (HP0607), Klebsiella pneumoniae (KPN00443) and two of them from different Bacillus cereus strains Bacillus cereus ATCC 10987 (BCE 0788) and Bacillus cereus ATCC 14579 (BC0714). The following genes were successfully cloned: BMEI 1645, BMEI 0895, HI 0895, BCE 0788, BC0714. BMEI 1645 protein was overexpressed in Escherichia coli. The protein was solubilized and purified by affinity chromatography and size exclusion chromatography. Two major populations of protein were observed after size exclusion chromatography and those need to be characterized before protein crystallization. AcrB protein as a control was successfully cloned, expressed in Escherichia coli, purified in large scale and crystallized. The effect of a ß-peptid foldamer was investigated and we determined that the ß-peptid foldamer as a crystallization adjuvant might help to decrease the time necessary for crystal formation

A perzsa tudományosság kialakulása a klasszikus korban (mesterség és elmélet) = The development of Persian Scholarship in the Classical Period (Practice and Theory)

Az iszlámkori Iránban a perzsa nyelvű tudományos tevékenység megjelenése és első eredményei döntően az arab nyelvű tudományok nyomdokain születettek meg. Az első évszázadokban a tudományok nyelve az arab volt, de a tudományok művelői között nagy számban megtalálhatóak voltak az iráni, többségükben perzsa származású tudósok, államférfiak és udvari tisztségviselők is, akik az abbászida birodalom szellemi életében kiemelkedő szerepet játszottak. A most záruló kutatásunk alapvetően két-irányú volt: egyrészt konkrét (grammatikai, logikai, irodalomelméleti, művészettörténeti stb.) forrásokkal foglalkoztunk (a), majd megpróbáltuk az ezekből a vizsgálatából adódó tanulságokat (terminológia, elemzések, definíciók) a szakterület korabeli elméleti kérdéseket tárgyaló forrásaival egybevetni (b). Végül mindezeket a részterületi kutatási eredményeket, tanulságokat egy általánosabb perzsa tudománytörténet szélesebb keretébe illesztettük, egy korai iszlámkori perzsa tudománytörténet ill. művészettörténet megírásával (c). Pályázatunk lezárásaként, az eredményeket, résztanulmányok (angol és magyar nyelven) mellett, egy könyvben foglaltuk össze, mely magyar nyelven először tárgyalta ezeket a kérdéseket (2007). | Iranian scholarship in the Persian language appeared comparatively late in the 10-11th centuries following in the wake of Muslim scholarship in Arabic. Nevertheless, from the very outset scholars of Iranian stock helped develop various branches of human and rational sciences such as grammar, lexicography, logic, literary sciences, history, history of fine art, medicine, mathematics, astronomy, or geography, etc. Our research aimed at twofold goals: it scrutinized sources (manuscripts, lithographs, printed matters) and carried out field works by collecting various sorts of data concerning literary and linguistic sciences and fine art history in Iran (a). Relying on evidences gained from the analyses of the sources under investigation (e.g. terminological facets, types of definitions, etc.) a detailed account of some important points in the development of human sciences could be given (b). The results gained from this research have been published in a separate volume (c: 2007)

A ferritin szerepe a szőlő stressztűrő képességének fokozásában = The role of ferritin in enhancing the stress tolerance of grapevine

Embriogén kalluszt állítottuk elő Richter110 (alany) és Chardonnay (nemes) szőlő fajták portokajiból. Ezeket Medicago sativa ferritint (MsFerr) tartalmazó Agrobacterium vektorokkal transzformáltunk. A DNS beépülését genomikus PCR-rel ellenőriztük. Poliklonális ellenanyagot állítottunk elő, mellyel megállapítottuk, hogy a transzláció magas szintű volt, a transzkriptumból nagy mennyiségű, megfelelően processzált fehérjetermék keletkezett. A transzgenikus szőlő növények elkészültéig dohányban teszteltük az MsFerr gént tartalmazó konstrukciókat. A teljes növényeken végzett UV-B kezelés, ill. levélkorongok közvetlen oxidatív stresszre adott válaszai alapján megállapítottuk, hogy az MsFerr növények toleránsabbak voltak, mint a nem expresszáló kontrollok. Az MsFerr Richter 110 növények regenerálása, szelekciója és felszaporítása sikeres volt, az MsFerr Chardonnay növények felszaporítása azonban hajtásnövekedési problémák miatt nem sikerült. Három MsFerr Richter 110 vonalat vizsgáltunk. Gyökér stresszként fás szárú dugványok tápoldatához hidrogénkarbonátot adtunk, ami klorotikus és levél száradási tünetek okozott Ebben nem kaptunk lényeges különbséget a transzgenikus és transzformálatlan növények között. Ezzel szemben, a leveleket érő hatásokkal: paraquat, NaCl só-stressz és tBHP indukált lipid peroxidációval szemben az MsFerr expresszáló vonalak toleránsabbak voltak (kisebb stressz-indukált fotoszintézis csökkenést mutattak) mint a transzformálatlanok. | Embryogenic calli were started from anthers of Richter 110 (rootstock) and Chardonnay (scion) grapevine and transformed with Agrobacterium harbouring Medicago sativa ferritin gene (MsFerr). Genomic PCR and protein immunoblotting using a polyclonal antibody confirmed that the transcription and processing of MsFerr was successful. Regeneration, selection and propagation of MsFerr Richter 110 plants was successful, but transformed MsFerr Chardonnay plants did not grow sufficiently. Until transgenic grapevine plants became available, preliminary experiments were carried out with MsFerr expressing tobacco. UV-B irradiation of whole plants as well as treatments of leaf disks with various chemical elicitors showed that MsFerr plants were more stress tolerant than non-expressing controls. After regeneration and propagation, three transgenic MsFerr Richter 110 lines were tested. Roots of green cuttings were stressed by flooding and in this experiment transgenic plants did not show significantly higher tolerance to hypoxia/bicarbonate than non-transferred ones. Leaves, however, showed increased tolerance to paraquat, salt stress and tBHP induced lipid peroxidation: their photosynthesis was less affected by these stressors than those from non-transformed plants

Gyermekkori akut lymphoid leukaemia genetikai eltéréseinek vizsgálata multicolor-FISH (M-FISH) módszer segítségével = Detection of genetic alterations of childhood acute lymphoblastic leukemia by multicolor-Fish (M-FISH)

2005 és 2008 között 31 új ALL-es beteg genetikai vizsgálatát végeztük el. A diagnózis felállításakor a hagyományos citogenetika mellett a prognosztikai értékű transzlokációk, t(9;22), t/del 11q23 kimutatására FISH, a t(12;21) FISH és RT-PCR módszereket alkalmaztunk. Közülük az M-FISH vizsgálat 18 mintán volt értékelhető, ebből 16 esetben kaptunk új genetikai információt. A G-sávozással észlelt specifikus transzlokációkat, t(1;19), t(9;22), t(2;8), t(8;14); t(11;14), az M-FISH analízis minden esetben megerősítette, egy kivételével valamennyi esetben további, új információt is nyújtott. Tisztáztuk a specifikus transzlokációkhoz társuló derivált kromoszómák eredetét, új transzlokácókat ismertünk fel, azonosítottuk a marker kromoszómák összetételét. A két vagy több kromoszómát érintő komplex kariotípusú esetekben tisztáztuk a szerkezetileg átrendeződött kromoszómák pontos eredetét. A magas hiperdiploid csoportba sorolt esetekben a számfeletti kromoszómák azonosítása mellett társuló, hagyományos citogenetikával nem azonosítható, valamint rejtett szerkezeti átrendeződéseket, új sejtvonalakat mutattunk ki. A prognózist kedvezőtlenül befolyásoló társuló szerkezeti kromoszóma eltérések felismerése lehetővé teszi az. ALL-es gyermekek finomabb prognosztikai besorolását, új fúziós gének felismerését és ezáltal új terápiás eljárások kidolgozását. Az M-FISH módszerrel kapott információk klinikai, prognosztikai jelentőségének megítéléséhez további esetek tanulmányozása szükséges. | We performed the cytogenetic testing of 31 acute lymphoid leukemia (ALL) patients in 2005-2008. Besides traditional cytogenetic evaluation FISH was used to detect translocations of prognostic value, such as t(9;22), t/del 11q23, and t(12;21). Latter was verified with RT-PCR technique as well. M-FISH was performed in 18 samples, providing new genetic information in 16 out of them. Specific and highly important translocations [t(1;19), t(9;22), t(2;8), t(8;14); t(11;14)] revealed by traditional G-banding was verified in all positive cases using M-FISH, and in all but one we gained further information about the origin of translocation-related derived chromosomes and that of marker chromosomes, several new translocations were recognized also. M-FISH proved to be an essential diagnostic tool in the precise cytogenetic evaluation of patients presenting multiple chromosomal rearrangements, and of those with hyperdiploidy presenting extra number chromosomes, hidden rearrangements and/or new cell lines. Children with ALL might gain a refined prognostic classification and therefore receive a more efficient cytostatic therapy if their cytogenetic evaluation is based on the knowledge of structural chromosomal imbalances including new translocations and fusion genes. M-FISH is of great importance in the diagnostic and prognostic evaluation of children with ALL. However, to refine data and gain further information on the clinical use of the technique, further studies are needed

A gluten-enteropathia kialakulását befolyásoló tényezők vizsgálata = Factors influencing the development of coeliac disease

Kutatásunk során új hajlamosító géneket írtunk le, melyet közrejátszhatnak a gluten-enteropathia (coeliakia) kialakulásában, ezek befolyásolják a T lymphocyták érését és kollaborációját a B sejtekkel, a toll-like receptorokat és a gyulladás során termelődő cytokineket. Megállapítottuk, hogy a coeliakia kialakulása és klinikai megjelenése asszociációt mutat a haptoglobin polimorfizmussal is, melyről a mi közlésünket követően független kutatók igazolták, hogy egyik altípusa azonos vékonybél permeabilitásában kulcsszerepet játszó zonulin molekulával. A kutatás során azonosítottuk a coeliakia-specifikus autoantitestek fő kötőhelyét az autoantigén, a 2-es típusú transzglutamináz enzim felszínén. Megállapítottuk, hogy a coeliakia antitestek betegség-specifikusan ugyanazt a komplex, háromdimenziós epitópot ismerik fel. Sejtkultúrában a coeliakia antitestek gátolják az erek képződését és fokozzák azok permeabilitását, elsősorban a RhoA túlzott aktiválásán keresztül. Megszerveztük és elvégeztük az első reprezentatív coeliakia szűrővizsgálatot Magyarországon. Megállapítottuk, hogy a coeliakia hazai előfordulása 1.3% körül van a magyar gyermekek és fiatal felnőttek körében. A szűrővizsgálatokra egyszerű, helyszíni antitest kimutatáson alapuló szűrő eljárást validáltunk. Kimutattuk, hogy a klinikailag fel nem ismert coeliakia kedvezőtlenül befolyásolja a hepatitis védőoltásra adott immunválaszt és az antitestek szerepet játszanak idegrendszeri szövődmény (ataxia) kialakulásában. | This research identified new susceptibility genes for coeliac disease, a common autoimmune enteropathy triggered by gluten peptides ingested with dietary cereals. The novel genes are mostly related to T-lymphocyte development, collaboration of T and B cells, toll-like receptors and cytokines. We also described association with haptoglobin polymorphism, a master regulator of intestinal permeability also known as zonulin. Predisposing alleles of these genes create a more inflammatory environment in the gut and in multiple copies confer additional risk to HLA-DQ alleles. We identified the main binding epitope of coeliac disease anti-transglutaminase 2 autoantibodies. This epitope has a complex, three-dimensional structure and is disease-specific. Patient antibodies targeting this epitope enhance the enzymatic activity of transglutaminase 2 and cause disturbances in the angiogenesis and vascular permeability in cell culture models via the inappropriate activation of RhoA. We performed the first representative population screening for coeliac disease in Hungary and established that the prevalence is around 1.3% in both children and young adults. The methodology of the screening has been advanced by the application of rapid, onsite antibody detection. Unrecognised coeliac disease was found to predispose to a defective immune response to hepatitis B vaccination (reversible after treatment) and we showed the contribution of coeliac disease antibodies in the late neural complications

Ismeretlen eredetű mentális retardáció vizsgálata subtelomerikus FISH módszerrel = Molecular genetic analysis of idiopathic mental retardation by using subtelomeric FISH

A kromoszómák szubtelomerikus régiói génben gazdag területek, átrendeződésük hagyományos kromoszóma analízissel nem detektálható. Mivel a mentális retardációk közel 7%-áért felelősek, kimutatásuk diagnosztikai szempontból jelentős és lehetőséget nyújt az ismétlődés megakadályozására is. Kimutatásukra alkalmas módszerek egyike a szubtelomerikus fluoreszcencia in situ hibridizáció. Kilencvenhét idiopathiás mentálisan retardált beteget választottunk ki a nemzetközi irodalomban ajánlott kritériumok alapján. Közülük kilenc beteg (9.2 %) esetében mutattunk ki szubtelomerikus aberrációt, hat familiáris (három család), három de novo esetnek bizonyult. A kilenc beteg közül kettőben 8pter deléciót és 12pter duplikációt, háromban 21qter deléciót és 10pter duplikációt, egy betegnél pedig 4pter deléciót és 8qter duplikációt azonosítottunk kiegyensúlyozatlan transzlokáció formájában. Egy betegnél de novo keletkezett 3qter deléciót és két betegnél 1pter deléciót detektáltunk. Az irodalmi adatokkal összhangban megállapítottuk, hogy a fenotípust a deléció és a duplikáció mérete, valamint transzlokációk esetén az érintett partner kromoszómák együttesen határozzák meg. Az értelmi fogyatékosság genetikai hátterének tisztázásával familiáris esetekben a kiegyensúlyozott transzlokáció hordozó szülők és családtagok következő terhessége esetén megakadályozhatjuk újabb beteg gyermek születését. | Subtelomeric regions of chromosomes are rich in genes, their rearrangements cannot be identified by traditional chromosome analysis. Since these subtelomeric aberrations are responsible for about 7% of cases with mental retardation, their detection is important both from the diagnostic point of view and to prevent recurrence in the family. Subtelomeric chromosomal alterations can be detected by fluorescence in situ hybridization. Ninety-seven patients with mental retardation have been selected based on international criterias. In nine patients (9.2 %) subtelomeric rearrangements were revealed (six familial, three de novo cases) whereas the subtelomeric FISH result was normal in 88 cases. In two patients a deletion of 8pter along with a duplication of 12pter were detected, while in three others a deletion of 21qter and duplication of the 10pter in one patient 4pter deletion and 8qter duplication due to an unbalanced translocation were found. De novo deletion of 3qter was observed in one patient and de novo 1pter deletion wasdetected in two cases. We concluded that the phenotype is mostly influenced by the size of regions involved in deletion/duplication and - in translocations - by the partner chromosomes involved. Identification of familiar subtelomeric aberrations could prevent the recurrent appearance of the disease in the family affected

Sejt- és molekuláris biológiai tulajdonságok vizsgálata gyermekkori akut lymphoblastos leukaemiában. A minimális reziduális betegség nyomonkövetése, új kezelés stratégia kialakítása = Cellular and molecular biological properties of childhood acute lymphoblastic leukemia. Assessment of minimal residual disease and development of novel therepautic strategies

A gyermekkor leggyakoribb neoplasztikus elváltozásai a rosszindulatú vérképzőszervi betegségek. Fő célunk a gyermekkori akut lymphoblastos leukaemia (ALL), az akut myeliod leukaemia (AML), valamint a myelodysplasiás szindróma (MDS) kezelési eredményeinek és a tartós életminőség javítása volt új sejt- és molekuláris biológiai diagnosztikai és terápiás eljárások bevezetésével. Elemeztük a kombinált citosztatikus ALL-BFM-95 protokollal elért kezelési eredményeket gyermekkori ALL-ben. Tanulmányoztunk új leukaemia-asszociált marker (FXIII-A) kifejeződését AML és ALL blasztokban és négyszínű immunfluoreszcens jelölés alkalmazási lehetőségeit. Ezen módszerek alkalmasak a leukaemiás sejtpopuláció megbízható azonosítására és a minimális maradék betegség (MRD) meghatározására, ezért szerepet játszhatnak a rizikóbecslésben. Elemeztük serkentő és gátló hatású citokinek szabályozó hatásait gyermekkori ALL-ben, MDS-ben, essentiális thrombocythemiában és összehasonlításként lobos folyamatokban. Vizsgáltuk a hagyományos citosztatikus kezelés kiegészítésére lehetőséget teremtő innovatív terápiás eljárásokat, rituximab, interferon-alfa, cisz-retinsav és bcl-2 antisense oligonukleotid preparatum in vitro és in vivo terápiás effektusait. A sejtterápiás eljárások fejlesztése céljából modellként tanulmányoztuk Glanzmann thrombasthaeniás beteg rendellenességét komplex molekuláris módszerekkel, valamint a kóros és a vad típusú gének transzfektálásának hatékonyságát emlős sejtekben. | Hematopietic malignancies represent the most frequent form of cancer in children. The major aim of the present project was to improve treatment results and quality of life in children with acute lymphoblastic leukemia (ALL), acute myeloid leukemia (AML) and myelodysplastic syndromes (MDS) by introducing novel cellular and molecular biological diagnostic and therapeutic methods. Nationwide results in children with ALL treated with the conventional combined cytostatic ALL-BFM-95 protocol were analyzed retrospectively. Expression of a novel leukemia-associated marker (FXIII-A) was studied in AML és ALL blasts and four color flow cytometric immunophenotyping was introduced. These methods allow the exact identification of the leukemic cell population rendering them powerful tools for assessing minimal residual disease and risk estimation. Regulatory effects of stimulatory and inhibitory cytokines were analyzed in childhood ALL, MDS and essential thrombocythemia as compared to inflammatory lesions. Innovative adjuvant treatment approaches, such as in vitro and in vivo therapeutic effects of rituximab, interferon-alpha, cis-retinoic acid and bcl-2 antisense oligonuleotide preparation were studied. As a molecular model for developing cell therapeutical methods, aberration of a patient with Glanzmann thrombasthenia was assessed by applying complex molecular methods and transfecting the mutant and wild-type genes into mammalian cells

The main transition management issues and the effects of environmental accounting on financial performance: with focus on cement industry

L