État des lieux de la science participative sur les algues et proposition de voies d'utilisation et de valorisation des données intrantes

Les algues sont extrêmement difficiles, voire impossibles, à identifier sur la base de caractères morphologiques ce qui compromet leur étude dans le cadre de la science participative. L’objectif de cet essai est de proposer des pistes pour surmonter ce verrou afin d’acquérir et de valoriser des données citoyennes sur les algues dans des domaines d'étude de la diversité spécifique et fonctionnelle. À cette fin, un état des lieux des programmes de science participative est réalisé. Il considère à la fois les programmes portant sur les algues, aux échelles nationale (française) et internationale, les programmes visant le milieu marin et pouvant intégrer la collecte de données sur les algues, ainsi que des programmes s’inscrivant dans d’autres domaines, mais dont le concept pourrait être transféré ou adapté à la phycologie. Par ailleurs, des outils et réseaux pouvant soutenir la collecte et l’exploitation des données sur les algues sont également recensés. Une première série de recommandations est émise à partir des leviers et freins mis en évidence. Ensuite, différentes voies potentielles pour la valorisation et l’utilisation des données sur les algues, inspirées de la base de données réalisée, sont proposées et décrites. Une évaluation multicritères permet de discriminer leurs perspectives d'application et d’identifier les projets à prioriser. Enfin, les cinq voies sélectionnées à l’issu de l’analyse sont décrites en terme de modalités de mises en œuvre, et des recommandations générales finalisent l’essai. Les principales conclusions de cette évaluation explicitent qu'il est, dans l'immédiat, préférable d'opter pour des voies d'utilisation et de valorisation des données existantes sur les algues en créant, entre autres, des relais français de programmes de science participative internationaux fonctionnels et populaires. Néanmoins, des voies innovantes avec une application inédite sur les algues ont également été proposées et restent très pertinentes, malgré un classement en « non prioritaires » à l'issue de l'analyse multicritères, du fait des moyens matériels, humains, temporels et/ou financiers nécessaires. Ainsi, les voies proposées concernent l'exploitation des photographies, mais également des intrants de données alternatives, ce qui permet une diversification dans la collecte pour les participants. De nombreuses pistes sont donc envisageables pour surmonter la difficulté d'identification des espèces d'algues et promouvoir l'exploitation des données de science participative dans différents domaines de la recherche sur les algues. Cependant, la communication auprès de la société est primordiale en amont afin d'informer et de sensibiliser le public sur les algues et rendre cet objet d'étude attrayant pour solliciter une participation citoyenne propice à de telles initiatives

Dynamique de la diversité génétique et effets fondateurs : l'exemple du mouflon (Ovis aries) de Kerguelen

Le maintien de la diversité génétique des populations d'espèces fragiles, en voie de disparition, est un sujet primordial de la biologie de la conservation. Dans ce cadre, la compréhension des mécanismes qui vont affecter la diversité génétique au cours du temps est essentielle. Mon travail de doctorat a consisté en l'étude de la dynamique de la diversité génétique d'une population de mouflons Ovis aries, fondée en 1957 par un unique couple sur une île de l'archipel de Kerguelen (océan Indien). Durant cette étude, j'ai tout d'abord suivi les variations de l'hétérozygotie (He, évaluée à partir du typage génétique des individus à 25 marqueurs microsatellites) depuis la fondation jusqu'à 2003. J'ai montré que la valeur observée de He est supérieure à celle attendue à partir de modèles théoriques. Nos résultats, complétés par une étude par simulation, suggèrent que cette forte He pourrait être due à la sélection. Puis, pour mesurer la dérive, je me suis intéressé à la taille efficace de la population de mouflons. Malgré des conditions défavorables (démographie cyclique et système de reproduction de \ud promiscuité caractérisé par une forte compétition entre les mâles), la dérive est apparue limitée. Mes résultats suggèrent que les variations de densité diminuent la compétition entre mâles, ce qui permet à la plupart de se reproduire, limitant ainsi la perte de la diversité génétique. La structure génétique des populations peut aussi influencer la perte de la diversité génétique. A partir d'un logiciel couramment utilisé (STRUCTURE, Pritchard et al. 2000), j'ai pu détecter une structure génétique dans la population de mouflons. Pourtant cette structure ne semble pas avoir de sens biologique et serait causée par des particularités des marqueurs génétiques utilisés. Enfin, j'ai mesuré les effets de la diversité génétique sur la valeur sélective des individus. J'ai tout d'abord pu révéler les effets négatifs de la diversité génétique et de la charge parasitaire sur la condition physique des femelles de mouflon, en mettant en évidence des effets simples de chacun de ces facteurs mais aussi en interaction. Contrairement à toutes les attentes, les femelles les plus consanguines ont une plus grande probabilité de donner naissance à des jumeaux. Des effets de sélection densité-dépendante à l'encontre des femelles seraient un des facteurs qui permettrait le maintien d'une forte hétérozygotie dans la population de mouflons de l'archipel de Kerguelen. Ces résultats originaux permettent de mieux comprendre l'évolution de la diversité génétique des populations. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Diversité génétique, Structure génétique, Taille efficace, Démographie cyclique, Ovis aries