Przezroczysta integracja zasobów relacyjnych do obiektowego wirtualnego repozytorium

Prezentowana w artykule idea polega na wirtualnej integracji rozproszonych heterogenicznych zasobów bazodanowych w scentralizowaną, jednorodną, spójną i pozbawioną fragmentacji oraz nadmiarowości całość tworzącą wirtualne repozytorium zapewniające pewne powszechne funkcjonalności i usługi, włączając w to infrastrukturę zaufania (bezpieczeństwo, prywatność, licencjonowanie, płatności, itp.), Web Services, rozproszone transakcje, zarządzanie procesami (workflow management), itd. Opisane poniżej metody integracji skupiają się właśnie na najpopularniejszych zasobach relacyjnych, do których zostaje umożliwiony w pełni przezroczysty dostęp poprzez niezwykle elastyczny obiektowy język zapytań. Opracowane specjalnie do tego celu mechanizmy optymalizacyjne stanowią kombinację dedykowanych technik obiektowych z niezwykle wydajnymi optymalizatorami relacyjnymi.The presented idea aims to virtually integrate distributed heterogeneous database resources into a centralised consistent and non-fragmented and non-redundant whole creating a virtual repository. The repository provides common functionalities and services, including trust infrastructure (like security, privacy, licensing, payments), Web Services, distributed transactions, workflow management, etc. The described integration methods focus on the most popular and commonly used relational resources. Such resources become fully transparently accessible with an extremely flexible object-oriented query language. The dedicated optimisation mechanisms are a combination of object-oriented techniąues and very efficient relational optimisers

Semiautomatic generation of CORBA interfaces for databases in molecular biology

The amount and complexity of genome related data is growing quickly. This highly interrelated data is distributed at many different sites, stored in numerous different formats, and maintained by independent data providers. CORBA, the industry standard for distributed computing, offers the opportunity to make implementation differences and distribution transparent and thereby helps to combine disparate data sources and application programs. In this thesis, the different aspects of CORBA access to molecular biology data are examined in detail. The work is motivated by a concrete application for distributed genome maps. Then, the different design issues relevant to the implementation of CORBA access layers are surveyed and evaluated. The most important of these issues is the question of how to represent data in a CORBA environment using the interface definition language IDL. Different representations have different advantages and disadvantages and the best representation is highly application specific. It is therefore in general impossible to generate a CORBA wrapper automatically for a given database. On the other hand, coding a server for each application manually is tedious and error prone. Therefore, a method is presented for the semiautomatic generation of CORBA wrappers for relational databases. A declarative language is described, which is used to specify the mapping between relations and IDL constructs. Using a set of such mapping rules, a CORBA server can be generated automatically. Additionally, the declarative mapping language allows for the support of ad-hoc queries, which are based on the IDL definitions