Prevalencia de mastitis subclínica en sistemas de producción bovina doble propósito de la vereda Matepiña del municipio de Arauca

In Arauca Department, specifically in the town of Arauca, have not done enough research on mastitis in cattle production systems, it is necessary that the region of the state and hears milk quality as this directly affects the health and status of livestock in general, for this reason this research was conducted in Matepiña path, which consists of 10 farms that have been implementing major technological packages strengthening livestock in the region. This trail has 2810 head of cattle of which 830 are females and 240 are in production. Proof of California Mastitis Test (CMT) was performed, it was determined that the prevalence of mastitis is 54.6% plus etiologic agents in the positive to the CMT test udders were isolated. It was established that the principal agent of the 247 positive mammary quarters isolated in the laboratory was Staphylococcus aureus with 43.72% corresponding to 108 infected mammary quarters. The second pathogen was Staphylococcus epidermis 82/4 with 33.20%, followed by Corynebacterium bovis was found in 19 quarters being 7.70% of the positive samples. Subsequently, at 17 quarters Streptococcus agalactiae (6.89%), Corynebacterium pyogenes in 11 quarters (4.45%) and isolated lesser proportion Streptococcus disgalactiae and Escherichia coli of seven and three quarters which corresponds to 2.83% and 1.21% respectively. It could stipulate as in other research that farms with a high prevalence of subclinical mastitis, have great management problems. Mastitis is a disease to prevent, not to try, since you can control considering that it is primarily a management problem, so that should make great efforts to avoid it, by sanitary measures in the phases of pre-milking, milking and post-milking, because they are critical of the process by high risk of infection among animals affected and healthy, reducing the number of cases of clinical mastitis in a herd sub ​​clinical.En el Departamento de Arauca y específicamente en el municipio de Arauca, no se han realizado los suficientes trabajos de investigación sobre mastitis en sistemas de producción bovina, es necesario que la región se entere del estado y calidad de la leche ya que esto afecta directamente la salud y el estado de la ganadería en general, por esta razón se realizó esta investigación en la vereda Matepiña, la cual está conformada por 10 fincas que han venido implementando importantes paquetes tecnológicos fortaleciendo la ganadería de la región. Esta vereda cuenta con 2810 cabezas de ganado de las cuales 830 son hembras y 240 se encuentran en producción. Se realizó la prueba de California Mastitis Test (CMT), se determinó que la prevalencia de mastitis es de 54.6% además se aislaron los agentes etiológicos presentes en las ubres positivas a la prueba CMT. Se estableció que el principal agente patógeno de los 247 cuartos mamarios positivos aislados en el laboratorio fue Staphylococcus aureus con 43.72% correspondiente a 108 cuartos mamarios infectados. El segundo agente patógeno en 82 cuartos fue Staphylococcus epidermis con 33.20%, le sigue Corynebacterium bovis con 19 cuartos siendo 7.70% de las muestras positivas. Posteriormente en 17 cuartos se observó Streptococos agalactiae (6.89%) en 11 cuartos Corynebacterium pyogenes (4.45%) y se aislaron en menor proporción Streptococos disgalactiae (2.83%) y Escherichia coli en siete y tres cuartos respectivamente. Se pudo estipular al igual que en otras investigaciones que las fincas con alta prevalencia de mastitis subclínica, tienen grandes problemas de manejo. La mastitis es una enfermedad para prevenir, no para tratar, puesto que se puede controlar, teniendo en cuenta que es primordialmente un problema de manejo, por lo que se deben hacer grandes esfuerzos para evitarla, mediante medidas sanitarias en las fases de pre-ordeño, ordeño y post-ordeño, debido a que son puntos críticos del proceso por el alto riesgo de contagio entre animales afectados y sanos, reduciendo el número de casos de mastitis clínica o sub clínica en un hato

Microbiota de la leche cruda de bovinos infectados con mastitis subclínica analizados mediante secuenciación del gen 16S rRNA

La metagenómica del gen 16S rRNA se ha convertido en una herramienta eficiente para caracterizar las comunidades bacterianas de la leche cruda infectada por mastitis bovina dado que las técnicas dependientes de cultivo no permiten recuperar todos los microorganismos causantes de la enfermedad. En esta investigación se usó la secuenciación de próxima generación (NGS) Illumina MiSeq de la región hipervariable V4 del gen 16S rRNA para identificar la composición bacteriana de la leche cruda de bovinos infectados con mastitis subclínica. El estudio se desarrolló en el departamento del Valle del Cauca y las muestras se tomaron en tres hatos con diferentes niveles tecnológicos. El análisis bioinformático se desarrolló con el software Mothur V1.35.1 usando la base de datos SILVA como referencia, se alinearon 5.318.994 secuencias con longitud media de 272 pb, se obtuvieron 1.975.322 secuencias únicas y finalmente se obtuvieron los filotipos asignados a nivel género. Los perfiles filogenéticos revelaron que independiente del nivel tecnológico los cuatro filos dominantes fueron: Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria y Bacteroidetes. Se detectaron alrededor de 394 géneros con abundancia variable donde Pseudomonas y Acinetobacter fueron los géneros predominantes en hatos de nivel tecnológico alto y medio, contrario a esto en el hato de nivel tecnológico bajo predominó el género Staphylococcus. El microbioma central mostró que los taxones bacterianos compartidos por todas las muestras fueron en orden descendente: Acinetobacter, Pseudomonas, Staphylococcus, Streptococcus, Delftia, Stenotrophomonas. También se identificaron microorganismos patogénicos importantes como el género Escherichia-Shigella. Esta investigación permitió identificar y comparar en las muestras de leche bacterias patógenas asociados a la mastitis subclínica. Los hallazgos de este estudio pueden ayudar a formular estrategias para la prevención y el tratamiento de la mastitis pues se identificó de manera precisa las bacterias causales de la enfermedad y por consiguiente reducir las pérdidas económicas que incurren por ello.//Abstract: Metagenomics has become an efficient tool to characterize the bacterial communities of raw milk infected by bovine mastitis since culture-dependent techniques do not allow recovering of all the microorganisms that cause the disease. In this research, the next-generation sequencing (NGS) of Illumina MiSeq was used to identify the bacterial composition of raw milk from cattle infected with subclinical mastitis using the hypervariable V4 region of the 16S rRNA gene. The study took place in the department of Valle del Cauca and the samples were taken in three dairy herds with different technological development. The bioinformatic analysis was developed with Mothur V1.35.1 using the SILVA database as a reference. 5,318,994 sequences with an average length of 272 bp were aligned, and 1,975,322 unique sequences were obtained. Finally, the assigned phylotype were obtained at the genus level. The phylogenetic profiles revealed that, regardless of the technological development, the four dominant phyla were: Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. About 394 genera were identified with variable abundance where Pseudomonas and Acinetobacter were the predominant genera in dairy herds of high and medium technological development. On the contrary, at the dairy herd of low technological development, the genus Staphylococcus was the predominated one. The core microbiome showed that the bacterial taxa shared by all the samples were in descending order as follows: Acinetobacter, Pseudomonas, Staphylococcus, Streptococcus, Delftia, Stenotrophomonas. In addition, important pathogenic microorganisms such as the genus Escherichia-Shigella were also identified. This research allowed to identify and compare pathogenic bacteria associated with subclinical mastitis in milk samples. The findings of this study can help to formulate strategies for the prevention and treatment of mastitis since the causal bacteria of the disease were precisely identified and, consequently, the economic losses incurred were reduced.Doctorad

Evaluación de la actividad antibacteriana de bacteriocinas producidas por bacterias ácido lácticas, frente a cepas de Staphylococcus aureus causantes de mastitis bovina

Prácticas inapropiadas en el control de las infecciones, como lo es el uso indiscriminado de antimicrobianos (ATMs), conducen al desarrollo de cepas resistentes. Los tratamientos convencionales se vuelven ineficaces, incrementando el riesgo de propagación y duración de la enfermedad. La resistencia se ha convertido en una amenaza apremiante para la salud pública y animal en el mundo actual. En busca de alternativas se planteó como objetivo de esta tesis, cuantificar la actividad antibacteriana in vitro de las bacteriocinas procedentes de bacterias ácido lácticas (BAL), frente a cepas de Staphylococcus aureus causantes de mastitis bovina. De vacas en lactancia del departamento Río Segundo, se tomaron 390 muestras de leche. La prevalencia de mastitis causada por S. aureus fue del 11,8%. A partir de cultivos de BAL (2 de Lactobacillus,brevis, 1 de Lactobacillus rhamnosus y 1 de Enterococcus faecium) tratados por adsorcióndesorción, diálisis, liofilización y electroforesis SDS PAGE, se recuperaron 4 péptidos antimicrobianos (PAs). Sus actividades antimicrobianas frente a S. aureus se valoraron por técnica de difusión en agar. Por espectrometría de masas se identificaron como bacteriocina rhamnosin A (PA1); proteína de inmunidad a bacteriocina Brevicin 174A (PA2); proteína asociada a bacteriocina de E. faecium (PA3) y ABC transportador de escisión / exportación de bacteriocina de L. brevis (PA4). PA1 y PA2 fueron los de menor (36,96%) y mayor (43,48%) porcentaje de inhibición del crecimiento microbiano, respectivamente. Las CIM90 de oxitetraciclina y tilosina se mantuvieron inferiores a los puntos de cortes clínicos y epidemiológicos (CLSI, 2013; EUCAST, 2015). En el caso de la penicilina se evidenció una resistencia del 45,83% y 33,33% según los puntos de corte clínicos de EUCAST y CLSI, respectivamente. La CIM90 de la gentamicina fue inferior al punto de corte clínico de CLSI, pero superior al de EUCAST (12,5% de resistencia). La CIM90 de la cloxacilina fue inferior al punto de corte clínicos de CLSI. Penicilina, ampicilina y cloxacilina expresaron sensibilidad acotada con CIM90 superiores al punto de corte epidemiológico (EUCAST). Las CIM35 de los cuatro PAs fueron superiores a las CIM35, CIM50 y CIM90 de los ATMs. Excepcionalmente, las CTM35 de los PA2 y PA3 fueron inferiores a las CIM90 de gentamicina, ampicilina y penicilina, y la del PA4 inferior a la de ampicilina y penicilina. Futuras experimentaciones serán necesarias para lograr una identidad más precisa. Comprender las relaciones existentes entre la estructura y la actividad de los PAs resulta esencial para el diseño y desarrollo de alternativas terapéuticas antimicrobianas.Fil: Aguirre, Gabriela Edith. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentin