3 research outputs found
Automatic atlas-based segmentation of brain white-matter in neonates at risk for neurodevelopmental disorders
Dissertação de Mestrado Integrado em Engenharia Biomédica apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra.Na Europa, mais de meio milhão de bebés nasce prematuramente por ano. Os recémnascidos
com menos de 32 semanas de gestação estão especialmente em risco para
desordens de desenvolvimento neuronal. Para estes bebés, os principais problemas de
desenvolvimento surgem a nível cognitivo (40%). Reabilitação é possível, principalmente
se for feita nos primeiros tempos de vida quando o cérebro é caracterizado pela sua
enorme plasticidade. No entanto, não existem bio-marcadores que possibilitem prever
quais os bebés prematuros que estão em risco. Este trabalho tem como objetivo analisar
a maturação da matéria branca do cérebro em bebés prematuros e investigar a sua
usabilidade como possível marcador para desordens de desenvolvimento neuronal.
Um pipeline automático para segmentação atlas-based de matéria branca
visualizada com tratografia de Diffusion Tensor Imaging (DTI) foi implementado. O atlas
usado foi construído previamente com tratografias de bebés prematuros em term
equivalente age (TEA). Principais contribuições correspondem à automatização do
pipeline e desenvolvimento de algoritmos específicos para tratografias neonatais para:
registo entre tratografias, skull-stripping e sampling. O algoritmo para registo entre
tratografias foi inspirado no trabalho de O’Donnell (2012). Este tipo de registo utiliza a
informação relativa à conectividade global de regiões de matéria branca no cérebro,
característica dos dados de tratografia. Em comparação com métodos de segmentação
manual, este método consome menos tempo e é menos dependente do utilizador.
Os resultados são promissores, apenas 12% das segmentações contêm mais de
30% de fibras erroneamente segmentadas por estrutura anatómica. A performance da
segmentação não foi influenciada pela presença de patologias da matéria branca nos
pacientes. As estruturas anatómicas automaticamente segmentadas do corpus callosum
foram também analisadas relativamente aos seus volumes e valores de anisotropia.
Volume e difusão média são significamente correlacionados com a intensidade de
patologia da matéria branca. Estes resultados estão de acordo com descobertas prévias
sobre como patologia na matéria branca influencia os valores de anisotropia. Em
conclusão, tratografia neonatal pode ser segmentada nas principais estruturas
anatómicas de interesse para estudo de desordens do desenvolvimento neuronal