Caracterización de las variantes genéticas del gen THBD en una muestra de población colombiana y su impacto funcional mediante herramientas in silico

Abstract

El gen THBD, desempeña un papel clave en la regulación de la coagulación y función endotelial, así como a nivel inmunológico y en el embarazo. Su desbalance está relacionado con enfermedades trombóticas y preeclampsia, las cuales representan un problema de salud pública. Adicionalmente, se ha descrito en enfermedades con patrón de herencia autosómica dominante, susceptibilidad a síndrome hemolítico urémico atípico (OMIM 612926) y trombofilia 12 por defecto de la trombomodulina (OMIM6144886). En Colombia, la frecuencia y distribución de variantes genéticas en este gen aún no ha sido explorada. Por esta razón, este proyecto tiene como objetivo caracterizar las variantes genéticas del gen THBD en una muestra de población colombiana. Para esto, se evaluaron 800 individuos colombianos, con estudio por NGS almacenados en GenCell. De esta muestra, 748 (93,5%) presentaron al menos una variante en dicho gen y 52 (6,5%) no presentaron ninguna variante. Se identificaron 59 variantes, 20 (33,9%) se encontraron en la región codificante, 13 (65,0%) missense y 7 (35,0%) sinónimas. 39 (66,1%) variantes se encontraron en la región no codificante, 37 (94,8%) SNVs y 2 (5,2%) deleciones. La variable más frecuente fue la rs1962, ubicada en 3‘UTR, encontrada en 729 (91,1%) individuos. 3 de las variantes se ubican en el dominio Similar a Lectina de la proteína y 11 en el dominio EGF. La caracterización de variantes genéticas permite avanzar en la comprensión del riesgo genético asociado a enfermedades, contribuyendo a la implementación de herramientas de diagnóstico y medicina personalizada.Magíster en Ciencias del Laboratorio ClínicoMaestrí