Analyse des conditions d’efficacité de la formation à distance dans les établissements d’enseignement supérieur rwandais

L’objectif de cette recherche doctorale est d’analyser les conditions qui influencent l’efficacité de la formation à distance (FAD) dans les établissements d’enseignement supérieur rwandais, en intégrant les perspectives des principales parties prenantes. Notre intérêt pour ce phénomène découle de trois considérations principales. Premièrement, la FAD se développe en Afrique depuis la fin des années 1990 (Depover & Orivel, 2012). La pandémie de COVID-19 a accru sa popularité, rendant permanente cette transformation de l’enseignement et de l’apprentissage. Il est donc essentiel de mieux comprendre les conditions qui affectent le succès de ce mode de formation. Deuxièmement, les études existantes sur le sujet au Rwanda ont principalement ciblé une institution publique, négligeant les réalités distinctes des institutions privées, qui accueillent pourtant un peu moins des deux tiers des étudiants du pays. Enfin, elles ont rarement intégré les perceptions de multiples parties prenantes, limitant ainsi la compréhension systémique des conditions nécessaires à l’efficacité de la FAD. Notre étude s’appuie sur une revue récente de la littérature sur les conditions affectant le succès de la FAD dans l’enseignement supérieur en Afrique (Kagorora et al., 2023) et sur quatre cadres théoriques, soit le modèle d’acceptation de la technologie (Davis et al., 1989), le modèle de succès des systèmes d’information (DeLone & McLean, 2003), la théorie socioculturelle de l’activité (Engeström, 2001) et le modèle des 3P (Presage, Process, Product) de Biggs (2003). Ces cadres nous permettent de classer les conditions identifiées en trois dimensions interdépendantes : technologique, pédagogique et institutionnelle. En utilisant une approche méthodologique mixte, nous avons recueilli des données auprès de quatre parties prenantes de la FAD, soit les étudiants (n=314), les enseignants (n=71), les chefs de départements (n=12) et le personnel de soutien (n=8), ainsi que des données sur la FAD dans deux établissements, l’un public et l’autre privé. Les résultats ont révélé un ensemble de conditions interconnectées couvrant les dimensions technologiques, pédagogiques et institutionnelles. En termes de technologie, les résultats soulignent que la qualité de la connexion Internet, l’accès à un appareil numérique approprié et la possession de compétences technologiques de base sont des conditions préalables. Considérant l’influence des enseignants sur la dimension pédagogique (qualité des interactions, conception des cours et soutien pédagogique), leur implication active est essentielle au succès de la FAD. Enfin, l’étude souligne l’importance cruciale du soutien organisationnel apporté aux enseignants et aux étudiants. Le cadre proposé offre aux décideurs politiques, aux établissements d’enseignement et aux autres parties prenantes un guide pour identifier les conditions nécessaires à l’amélioration de l’efficacité de la FAD dans les établissements d’enseignement supérieur rwandais et dans des contextes similaires.The objective of this doctoral research is to analyze conditions that influence the effectiveness of e-learning in Rwandan higher learning institutions, by integrating perspectives of key stakeholders. Our interest in this phenomenon stems from three primary considerations. First, e-learning has been developing in Africa since the late 1990s (Depover & Orivel, 2012). The COVID-19 pandemic has further popularized it, making this transformation of teaching and learning permanent. It is therefore essential to better understand the conditions that affect the success of this mode of training. Second, existing studies on the subject in Rwanda have mainly focused on one public institution, neglecting distinct realities of private institutions, which nevertheless host a bit less than two-thirds of the country’s students. Finally, they have rarely incorporated the perceptions of multiple stakeholders, thus limiting systemic understanding of the conditions necessary for e-learning to be effective. Our study is based on a recent literature review on the conditions affecting e-learning success in African higher education (Kagorora et al., 2023) and four theoretical frameworks, namely Technology acceptance model (Davis et al., 1989), Information Systems Success model (DeLone & McLean, 2003), sociocultural activity theory (Engeström, 2001) and 3P (Presage, Process, Product) model of teaching and learning (Biggs, 2003). These frameworks allow us to categorize the identified conditions into three interdependent dimensions: technological, pedagogical, and institutional. Using a mixed methodological approach, we collected data from four e-learning stakeholders, namely students (n=314), teachers (n=71), heads of departments (n=12) and support staff (n=8), as well as data on e-learning in two institutions, one public and another private. The findings revealed a set of interconnected conditions spanning technological, pedagogical, and institutional dimensions. In terms of technology, the results highlight that the quality of Internet connection, access to an appropriate digital device and possessing basic technological skills are prerequisites. Considering the influence of teachers on the pedagogical dimension (the quality of interactions, course design and pedagogical support), their active involvement is crucial for the success of e-learning. Finally, the study highlights the crucial importance of organizational support to both teachers and students. The proposed framework offers guidance to policymakers, educational institutions, and other stakeholders in identifying the necessary conditions for improving the effectiveness of e-learning in Rwandan higher learning institutions and similar settings

Association entre l’ethnicité haïtienne et les hospitalisations pédiatriques au Québec

Contexte : La population haïtienne constitue la plus grande communauté noire du Québec. Les Haïtiens ont des risques plus élevés de morbidités néonatales comparés aux non-Haïtiens. La situation demeure inconnue au niveau pédiatrique. Objectif : L’objectif est de décrire l’association entre l’ethnicité haïtienne, la mortalité et les hospitalisations pour des morbidités pédiatriques. Méthodes : Une cohorte longitudinale rétrospective de 736,498 enfants nés au Québec entre 2008 et 2020 a été analysée. L’exposition était l’origine haïtienne des enfants, déterminée par leurs parents, comparée aux enfants non-haïtiens. Le résultat primaire était la mortalité et les hospitalisations pour diverses morbidités chez les <13 ans. Les résultats secondaires incluaient les morbidités infantiles et maternelles pendant l’admission à la naissance. Les associations ont été décrites par des rapports de risques instantanés (HR) avec des intervalles de confiance de 95% (IC). Un modèle de Cox ajusté pour les caractéristiques personnelles a été utilisé. Résultats : Comparativement aux non-Haïtiens, les Haïtiens avaient un risque de mortalité plus élevé chez les 0-23 mois (HR 1,56; IC à 95% 1,00-2,45), malgré un risque d’hospitalisation plus faible (HR 0,61; IC à 95% 0,59-0,63) durant l’enfance. Les Haïtiens avaient un risque plus élevé d’anémie nutritionnelle (HR 2,53; IC à 95% 2,22-2,88) et hémolytique (HR 22,95; IC à 95% 19,53-26,96), ainsi que de complications néonatales et maternelles. Conclusion : L’ethnicité haïtienne est associée à un risque plus faible d’hospitalisation pédiatrique malgré des complications néonatales plus élevées. Les barrières et une utilisation différente du système de santé pourraient expliquer ces disparités.Context: The Haitian population is the largest Black community in Quebec. Haitians have a higher risk of neonatal morbidity than non-Haitians. However, pediatric outcomes remain unknown. Objective: The aim was to describe the association between Haitian ethnicity and the risk of mortality and hospitalization for pediatric morbidities. Methods: Data from a retrospective longitudinal cohort of 736,498 children born in Quebec between 2008 and 2020 were analyzed. Exposure was children of Haitian ethnicity, as determined by their parents, compared with non-Haitian children. The primary outcome was mortality and hospitalization for various morbidities in children <13 years of age. Secondary outcomes included neonatal and maternal morbidities during birth admissions. Associations were estimated using hazard ratios (HR) with 95% confidence intervals (CI) from a Cox model adjusted for personal characteristics. Results: Compared with non-Haitians, Haitians had a higher risk of mortality at 0-23 months (HR 1.56, 95% IC 1.00-2.45), but a lower risk of hospitalization during childhood (HR 0.61, 95% CI 0.59-0.63). Haitians had an elevated risk of hospitalization for nutritional anemia (HR 2.53, 95% IC 2.22-2.88) and hemolytic anemia (HR 22.95, 95% IC 19.53-26.96), as well as neonatal and maternal complications. Conclusion: Haitian ethnicity is associated with a lower risk of hospitalization compared with non-Haitians, despite higher neonatal complications. Barriers and different use of the healthcare system could explain these disparities

La physique à l’ère de l’information : relecture algorithmique de la mécanique statistique

Cette thèse considère l’information dans un contexte physique en interprétant l’entropie thermodynamique comme une mesure du contenu informationnel d’un système. L’entropie se voit attribuer sa propre unité : le bit. Ceci a pour conséquence une redéfinition des unités de la température en joules par bit (J/bit). Cette approche mène à l’élaboration d’une théorie non-probabiliste de la mécanique statistique classique fondée sur la théorie algorithmique de l’information. Finalement, en se basant sur l’existence conjecturée d’un constructeur universel, cette thèse explore une possible généralisation de la complexité algorithmique.This thesis considers information within a physical context by interpreting thermodynamic entropy as a measure of a system’s informational content. Entropy is assigned its own unit: the bit. This results in a redefinition of the unit of temperature in joules per bit (J/bit). This approach leads to the development of a non-probabilistic theory of classical statistical mechanics based on algorithmic information theory. Finally, drawing on the conjectured existence of a universal constructor, this thesis explores a possible generalization of the algorithmic complexity

Les effets de l'abolition de l'obligation de résidence chez l'employeur sur les droits fondamentaux des travailleuses domestiques migrantes

Le présent projet de recherche vise à évaluer la liberté de choix des travailleuses domestiques migrantes quant à leur lieu de résidence. Ces femmes, qui étaient connues auparavant sous le nom d’aides familiales résidantes, migrent au Canada afin de prodiguer des soins aux enfants, aux personnes âgées ou aux personnes handicapées. Le régime migratoire qui était en vigueur au Canada obligeait les aides familiales à résider au domicile de leur employeur. Suite à de nombreuses critiques faites à l’égard de cette obligation de résidence et des abus qu’elle pouvait engendrer, cette obligation a été abrogée en 2014, ainsi que la catégorie des aides familiaux résidants, afin de laisser le libre choix aux travailleuses domestiques de choisir leur lieu de résidence. Le fait de vivre chez l’employeur menait à de nombreuses violations des droits des travailleuses domestiques en matière de travail et engendrait des conditions de travail difficiles. Depuis l’abrogation de cette restriction, nous nous questionnons à savoir si les travailleuses domestiques ont réellement la liberté de choisir leur lieu de résidence, compte tenu de leur statut migratoire et de leur statut socioéconomique précaires. La liberté de choisir le lieu de résidence sera ainsi évaluée en regard d’une théorie permettant d’évaluer le libre choix, soit la Théorie des capabilités. Il sera ainsi possible de déterminer si le nouveau régime migratoire mis en place permet réellement aux travailleuses de choisir leur lieu de résidence. De plus, nous cherchons à déterminer si ce changement de régime a permis une amélioration des conditions de travail des travailleuses domestiques et si leur droit à des conditions de travail justes et raisonnables est mieux respecté depuis l’instauration du nouveau régime. Ce projet de recherche applique une méthode de collecte de données empiriques visant à mieux comprendre le contexte migratoire des travailleuses domestiques, leurs conditions de travail, ainsi que leurs processus de choix. À travers des entrevues réalisées auprès des travailleuses domestiques migrantes, nous avons pu découvrir les principales contraintes dans le cadre de leur emploi et les difficultés qu’elles rencontrent à travers leur processus migratoire.The present research project aims to assess the freedom of choice of migrant domestic workers regarding their place of residence. These women, who were previously known as live-in caregivers, migrate to Canada to provide care to children, the elderly or people with disabilities. The migration regime which was in force in Canada required caregivers to reside in the home of their employer. Following numerous criticisms with regard to the residency obligation and the possible abuses generated from it, this obligation was repealed in 2014, as well as the category of live-in caregivers, in order to give domestic workers, the freedom of choice with respect to their place of residency. Living with the employer led to numerous violations with respect to domestic workers labor rights and created difficult working conditions. Since the repeal of this restriction, we question whether workers truly have freedom of choice concerning their place of residency, given their precarious migratory and socio-economic status. The freedom to choose the place of residence will thus be evaluated with regard to a theory allowing to evaluate free choice, namely the Capability Approach. It will thus be possible to determine whether the new migration regime implemented truly allows workers to choose their place of residency. In addition, we seek to determine whether this change in regime has led to an improvement in the working conditions of domestic workers and whether their rights to fair and reasonable working condition are better respected since the establishment of the new regime. This research project uses a method of empirical data collection aimed at better understanding the context of migratory domestic workers, their working conditions, as well as the process of their choices. Through interviews carried out with migrant domestic workers, we were able to discover the main constraints in the context of their employment and the difficulties they encounter through their migration process

Étude des techniques de segmentation et correction pour le déplacement du positron en tomographie par émission de positrons

La Tomographie par Émission de Positrons (TEP) est une modalité d’imagerie. Elle permet d’imager la concentration d’un composé radiopharmaceutique de manière non-invasive dans un patient. La taille des détecteurs, la reconstruction des images et la portée du positron sont des facteurs physiques affectant la résolution spatiale de la TEP. L’imagerie TEP dynamique est utilisée dans plusieurs contextes d’application, dont la biodistribution. Le but de cette thèse est d’évaluer les méthodes actuelles de segmentation en TEP dans un contexte dynamique et de déterminer une méthode de correction du déplacement du posi- tron, qui a un impact sur la résolution spatiale. Dans les études TEP pharmacocinétiques, il est souvent nécessaire de segmenter les images d’un tissu d’intérêt ou d’un organe. Dans un premier temps, cette thèse analyse la notion que les segmentations statiques de médecine nucléaire ne sont pas adéquates dans un contexte dynamique. Ensuite, une infrastructure numérique a été développée. Le résultat est une interface graphique, baptisée Techniques for Reliable Use of Images in Medical Physics ou TRU-IMP. La flexibilité rend cet outil pertinent dans un contexte de recherche clinique et académique, puisqu’il est facile de le modifier pour ajouter des outils adaptés aux besoins. Finalement, une méthode pour corriger la perte de résolution due au déplacement du positron est présentée. Cette correction est faite au niveau de la courbe d’activité temporelle. Cette estimation de la perte de résolution en imagerie TEP permet une meilleure précision des analyses pharmacocinétiques. Cette méthode est implémentée dans l’interface TRU-IMP. L’ensemble de cette thèse se penche sur la méthodologie d’analyse en TEP dynamique quantitative. Les retombées cliniques et scientifiques sont importantes, dans la mesure où les études deviendront plus précises. De nombreuses pistes de recherche ultérieures sont présentées, dont l’application en TEP/IRM, la propagation à d’autres formes de pertes de résolution et le développement de nouveaux algorithmes de segmentation.Positron Emission Tomography (PET) is an imaging procedure. It allows the user to visualize the concentration of radiopharmaceutical compound in-vivo in a patient. The size of the detectors, image reconstruction and positron range are physical factors affecting the spatial resolution of PET. Dynamical PET imaging is used in applications to assess biodistribution. This thesis analyses the current static segmentation schemes in a dynamical PET context. A novel way to correct for positron displacement, which has an impact on spatial resolution, is presented. In pharmacokinetic PET studies, it is necessary to segment the images of tissues or organs of interest. This thesis starts by analysing current static segmentation schemes in a dynamic context, showing that they are not adequate. Then, a numerical infrastructure was devised. This led to the creation of a graphical interface, named Techniques for Reliable Use of Images in Medical Physics or TRU-IMP. The flexibility of this tool makes it relevant in a academic and clinical research context, since users can modify it to satisfy their needs. Finally, a method to correct for the positron range is developed. This correction is made on the time-activity curves. This estimation of resolution loss in PET imaging allows a greater precision in pharmacokinetic analyses. The whole method is implemented in the TRU-IMP interface. This thesis put emphasis on the analytical methodology in quantitative dynamical PET. Clinical and scientific impacts are important, since studies will become more precise. Many future projects can stem from this thesis and are presented, including applications in PET/MRI, reassessment of other causes of loss of resolution and the development of new segmentation algorithms

Regards croisés sur l’humain globalisé et les émotions : Actes des quatrième et cinquième éditions du Colloque Annuel du Département d’Anthropologie, Université de Montréal 2022-2023

Cette édition des Actes du Colloque Annuel du Département d’Anthropologie (CADA) de l’Université de Montréal se distingue par son approche unique, regroupant les contributions des colloques de 2022 et 2023 en un seul volume. Le volume réunit donc les travaux du quatrième CADA, intitulé L’Humain Globalisé et tenu les 21 et 22 mars 2022, ainsi que ceux du cinquième CADA, axé sur le thème Les Émotions, qui s’est déroulé du 20 au 22 mars 2023.Introduction / Yassmine Ghalem ; Stratégies de sécurisation linguistique sur les réseaux socionumériques : lorsque le chiac rencontre le monde sur tiktok / Tommy Berger ; « Je dois dire, monsieur est très, très angoissé par la cour » : un tribunal de santé mentale vu sous le prisme des émotions / Sandrine Carle-Landry ; Expressivism and boundary formation in online religious groups : the neotribalization of religion’s emotive functions on christian reddit /Zackari Bourgeoi

Bibliothèques à l'international : un manuel ouvert. Tome 4

Les auteurs et les autrices de cet ouvrage sont les étudiant.e.s du cours SCI 6002 (Introduction aux sciences de l’information : Bibliothéconomie) de l’École de bibliothéconomie et des sciences de l’Information (EBSI) de l’Université de Montréal à l’automne 2023. Ouvrage collectif sous la direction de Marie D. Martel.par Asimwe Vajeru, Levi; Astudillo, Christopher; Baron, Julie; Barré, Caroline; Bergeron-Côté, Sarah; Bérubé, Marjorie; Bigras, Jacynthe N.; Binette, Pascal; Blackburn Barbeau, Noémie; Bodron, Maria; Boivin, Elyse; Bouchdoug, Mariam; Bouchelaghem, Moncif; Buchet, Tanya; Cardoso de Sousa, Wanessa; Carmel, Alix; Carrière, Anthony; Chabaane, Hamza; Chalifoux Vachon, David; Charest-Bourdon, Noémie; Chénier, William; Côté-Muckler, Mathieu; Davidson, Joséphine; Delorme, Catherine; Desnoyers, Samuel; Dessureault, Rachel; Duchesne, Virginie; Dufour, Audrey; Dussault, Stéphanie; Fonseca Acosta, Alejandro; Garrido, Eva; Genest, Catherine; Gervais, Chloé; Gilbert-Samson, Bruno; Giovarruscio, Élise; Gravel, Jeannie; Grenier, Francis; Grimaldi, Christian; Grondin, Nadia; He, Xigetu; Huot, Marianne; Jafiarova, Renata; Jeanson, Anne-Sophie; Jingyi, Peng; Kononova, Galina; Lachapelle-Scullion, Jessica; Lafrenière, Myriam; Lamarche, Joséphine; Lambert, Catherine; Lamoureux, Francis; Lanteigne, Vanessa; Laravine, Maëlyne; Larivière, Mégann; Lavoie, Elizabeth; Leblond, Liza; Leclerc, Francis; Leduc, Billie-Anne; Lefebvre, Émile; Lemaitre, Claire; Long, Clotilde; Marcil, Roxanne; Marin, Marie Annabelle; Masella, Romy; Medjdoub, Samia; Moisan, Jade Maria; Newman, David-Marc; Obad-Fathallah, Hind; Oei, Gabrielle; Pagé, Mélanie; Pelletier, Dominique; Poirier, Élise; Potvin, Camille; Préfontaine, Mathieu; Rainville, Julie; Razafiarimanana, Arielle; Richer, Daniel; Rivard, Alex; Robinson, Caroline; Roussy, Nathanaël; Toussaint, Tanya Kerline; Tracey, Adelaide; Trân,Thuy-Nam-Trân; Tremblay, Louise; Vary, Félix; Wei, Fan; et Xue, SunUne version en ligne, avec, le cas échéant, des éléments de contenu interactif, est disponible au https://rel.bib.umontreal.ca/bibliotheques-a-l-international4/ An online version, including interactive content where applicable, is available at https://rel.bib.umontreal.ca/bibliotheques-a-l-international4/REL ressources éducatives libres

Effets combinés des changements climatiques et des changements d’utilisation des sols sur les populations de moustiques en Ontario

The entomological context in Canada is undergoing significant transformations, marked by an increase in mosquito species over the last decade, bringing the total to approximately 80. Among these species, a minority pose a significant risk to public health due to their ability to transmit disease agents, primarily arboviruses in the Canadian context. In recent years, we have witnessed the emergence and re-emergence of human mosquito-borne diseases (MBD), caused by West Nile virus (WNV) and viruses from the California serogroup (CSV), including those of Snowshoe hare (SSHV) and Jamestown Canyon (JCV). Additionally, some diseases that affect mainly animals, like the Eastern equine encephalitis, also remain a concern for public health. These phenomena of emergence and re-emergence are often linked to climate change, which is the most studied and best-documented factor to date. However, other elements, such as land use, though less popularized, have also had scientific interest in recent years, highlighting the complexity of the issue and the importance of considering a broader range of variables in modeling mosquito populations and MBDs. Existing literature abounds with studies analyzing the separate impacts of climate or land use on mosquito populations, but the joint consideration of these two factors has rarely been addressed, particularly in the context of Canada. This gap underscores the need for investigations that explore the combination of climatic conditions and land use for a more comprehensive understanding of their influence on mosquito population dynamics. Our study aims to bridge this gap by examining specifically Eastern Ontario. First, our research used entomological data collected in the Greater Ottawa area between 2017 and 2018 to assess whether integrating land use improves understanding of observed variations in mosquito species occurrence and abundance. This involved correlating entomological data with Daymet weather data and annual crop inventory information for the same period. We analyzed two types of models: one considering only weather variables, and other including both weather and land use variables. Results highlighted the importance of considering land use, and its impact varied by species, underscoring the need to adjust models according to the species being studied. Our results have also highlighted unexplained variance, indicating that factors not considered in our study could influence the outcomes. We then extended our study area to Eastern Ontario, where we developed and modeled land use scenarios suited to the ecology of mosquitoes. The Dyna-CLUE model was used to simulate these land use scenarios until 2070, based on historical trends. We proposed five scenarios reflecting different levels of urbanization, agricultural expansion, and the conservation of natural areas. The results showed a good match between predicted and observed maps in 2020, predicting significant changes by 2050, and notable deforestation by 2070. These scenarios, developed to be combined with climate projections, were used to estimate mosquito populations. Finally, our focus shifted to Culex pipiens-restuans abundance, the main vector for WNV in the region, and to mosquito diversity, as a more general indicator of species. For this phase, the study period covered 2002 to 2020, and the study area was Eastern Ontario. The objective was to determine how Cx. pipiens-restuans abundance and mosquito diversity would evolve in the future in response to climate and land use changes. For this purpose, the previously developed and modeled land use scenarios were integrated with climate scenarios to carry out projections. Results demonstrated that land use is a relevant factor for predicting Cx. pipiens-restuans abundance. As for mosquito diversity, only the impact of climate changes proved to be decisive. Our analyses also revealed a characteristic spatial pattern of the regional landscape, showing stability in western natural areas compared to more pronounced changes in the east, more affected by human activities. Our results suggest that incorporating land use enhances our understanding of the spatio-temporal dynamics of mosquito populations. They also shed light on human activities as a factor facilitating changes in mosquito populations, thereby impacting disease transmission. This study underscores the significant role of land use and climatic conditions in the dynamics of mosquito populations, highlighting the impact of human activities on MBD transmission. Our findings emphasize that preserving natural habitats could be an effective strategy to mitigate the effects of climate change and reduce the risks associated with vector-borne diseases, adapting to changing environmental realities.Le contexte entomologique au Canada connaît une transformation notable avec une augmentation du nombre d'espèces de moustiques recensées au cours de la dernière décennie, portant leur total à environ 80 à ce jour. Parmi ces espèces, une minorité représente un risque pour la santé publique en raison de leur capacité à transmettre des agents infectieux, principalement des arbovirus dans le contexte canadien. Au cours des dernières années, nous avons assisté à l'émergence et à la réémergence de maladies humaines transmises par les moustiques (MTM), telles que le virus du Nil occidental (VNO) et les virus du sérogroupe Californie (VSC), y compris ceux de Snowshoe hare (VSSH) et de Jamestown Canyon (VJC). Par ailleurs, certaines maladies affectant principalement les animaux, comme le virus de l'encéphalite équine de l'Est (VEEE), restent également préoccupantes pour la santé publique. Ces phénomènes d’émergence et de réémergence sont souvent associés aux changements globaux et climatiques, qui constituent le facteur le plus étudié et le mieux documenté à ce jour. Cependant, d'autres facteurs tels que l'utilisation des sols, parmi d'autres facteurs moins populaires, ont également éveillé l'intérêt de la communauté scientifique ces dernières années, soulignant la complexité de la problématique et l'importance de considérer un éventail plus large de variables dans l’étude des moustiques et des MTM. La littérature existante présente une panoplie d'études analysant séparément les impacts du climat ou de l'utilisation des sols sur les populations de moustiques, mais la considération conjointe de ces deux facteurs est rarement abordée, en particulier en ce qui concerne le Canada. Cette lacune souligne le besoin d'investigations qui explorent la combinaison des conditions climatiques et d'utilisation des sols pour une compréhension plus complète de leur influence sur les dynamiques des populations de moustiques. Notre étude vise à pallier cette lacune en prenant spécifiquement pour cas d'étude l'est de l'Ontario. D’abord, notre étude a utilisé des données entomologiques recueillies dans la grande région d'Ottawa entre 2017 et 2018, pour évaluer si l'intégration de l'utilisation des sols améliore la compréhension des variations de présence et d'abondance des espèces de moustiques dans cette zone. Pour cela, nous avons mis en relation ces données entomologiques avec les données météorologiques de Daymet et les informations des inventaires annuels des cultures de la même période. Nous avons analysé deux types de modèles : l'un considérant uniquement les variables météorologiques, et l'autre incluant à la fois les variables météorologiques et d'utilisation des sols. Les résultats ont mis en évidence l'importance de considérer l'utilisation des sols, révélant un impact variant selon les espèces. Ceci souligne la nécessité d'ajuster les modèles en fonction des espèces étudiées. Nos résultats ont également mis en évidence une part de variance non expliquée, indiquant que d’autres facteurs non considérés dans notre étude pourraient influencer les résultats. Nous avons ensuite étendu notre zone d'étude à l'est de l'Ontario, où nous avons développé et modélisé des scénarios d'utilisation des sols adaptés à l'écologie des moustiques. Le modèle Dyna-CLUE a été utilisé pour simuler ces scénarios d'utilisation des sols jusqu'en 2070, en se basant sur des tendances historiques. Nous avons proposé cinq scénarios reflétant l'urbanisation, l'expansion agricole et la conservation des espaces naturels. Les résultats ont montré une concordance entre les cartes réelles et celles prédites de 2020 et prévoient des changements importants d'ici 2050, ainsi qu’ne déforestation notable d'ici 2070. Ces scénarios, développés pour être combinés avec des projections climatiques, serviront à prédire les populations de moustiques, sujet que nous aborderons ci-après. Finalement, notre attention s'est concentrée spécifiquement sur l'abondance de Culex pipiens-restuans, vecteur du VNO dans la région, et sur la diversité des moustiques, en tant qu'indicateur plus généraliste des espèces. Cette phase de l’étude a couvert la période de 2002 à 2020 et s’est focalisée sur la région de l’est de l’Ontario. L'objectif était de déterminer comment l’abondance de Cx. pipiens-restuans et la diversité des moustiques évolueraient dans le futur en réponse aux changements climatiques et à l'utilisation des sols. Pour ce faire, les scénarios d'utilisation des sols développés et modélisés précédemment ont été intégrés à des scénarios climatiques pour réaliser des projections. Les résultats ont démontré que l'utilisation des sols était un facteur pertinent pour prédire l'abondance de Cx. pipiens-restuans. En ce qui concerne la diversité des espèces, seul l'impact des changements climatiques s'est avéré déterminant. Nos analyses ont aussi mis en évidence un modèle spatial caractéristique du paysage régional, montrant une stabilité dans les zones naturelles de l'ouest face à des changements plus prononcés dans l'est, plus affecté par les activités humaines. Nos résultats suggèrent que l'intégration de l'utilisation des sols enrichit notre compréhension de la dynamique spatio-temporelle des populations de moustiques. Ils mettent en lumière l'influence des activités humaines comme un élément favorisant les changements des populations de moustiques, impactant ainsi la transmission des MTM. Cette étude met en lumière le rôle pertinent de l'utilisation des sols et des conditions climatiques dans la dynamique des populations de moustiques, soulignant l'impact des activités humaines sur la transmission des maladies vectorielles. Nos conclusions soulignent que la préservation des habitats naturels pourrait être une stratégie efficace pour atténuer les effets des changements climatiques et réduire les risques liés aux maladies à transmission vectorielle, en s'adaptant aux réalités environnementales changeantes

Towards accurate RNA structural evaluation : a study of RNA tertiary structural evaluation and ARES performance improvement

L’évaluation précise des structures 3D de l’ARN reste un défi fondamental en biologie computationnelle, en raison de la complexité et de la variabilité du repliement de l’ARN. L’objectif de cette thèse est d’explorer comment le problème de la sélection des structures d’ARN peut être abordé en utilisant l’Atomic Rotationally Equivariant Scorer (ARES), un modèle de réseau neuronal conçu pour l’évaluation des structures d’ARN, comme étude de cas. Ce travail vise à examiner les défis et opportunités pour améliorer l’évaluation des structures 3D de l’ARN, en se concentrant sur trois axes d’amélioration grâce à l’utilisation d’ARES : (1) l’utilisation d’un outil alternatif de génération de structures : MC-SYM au lieu de FARFAR2, (2) l’élargissement du jeu de données d’entraînement avec une représentation plus large des familles et motifs d’ARN pour capturer des caractéristiques structurelles variées, et (3) le perfectionnement de la métrique d’évaluation en passant de la Déviation Quadratique Moyenne (RMSD) à l’Indice de Déformation (DI), qui offre une évaluation plus nuancée de la précision structurelle. Les résultats de cette étude ont mené à plusieurs enseignements clés sur l’évaluation des structures d’ARN à l’aide d’ARES. En remplaçant FARFAR2 par MC-SYM pour générer le jeu de données, nous avons amélioré les performances du modèle pour certains ARN. De plus, l’utilisation de MC-SYM a permis de générer des structures 3D pour un plus grand nombre de motifs d’ARN, surmontant ainsi les limitations liées au temps d’exécution long de FARFAR2. En outre, le remplacement du RMSD par l’Indice de Déformation (DI) comme métrique d’évaluation a conduit à d’autres améliorations, les prédictions les mieux classées montrant une meilleure précision dans l’approximation des structures correctes. Ces résultats mettent en évidence la capacité du DI à fournir une évaluation plus nuancée et informative par rapport au RMSD. Sur le plan des limitations, aucun des modèles n’a systématiquement atteint une forte corrélation entre les scores prédits et les valeurs RMSD réelles, soulignant les défis persistants pour apprendre efficacement les caractéristiques structurelles de l’ARN. Cela souligne la nécessité de jeux de données d’entraînement plus diversifiés et standardisés pour améliorer la robustesse et la généralisation des modèles. Ce travail met en lumière des domaines d’exploration futurs, visant à améliorer l’iden- tification des modèles structurels plus proches des conformations natives de l’ARN et à ouvrir la voie à de nouvelles avancées dans la modélisation de l’ARN. Mots-clés : Structure 3D de l’ARN, biologie computationnelle, Atomic Rotationally Equivariant Scorer (ARES), outils de génération de structures, indice de déformation (DI), écart quadratique moyen (RMSD), repliement de l’ARN, évaluation structurelle, apprentissage automatique, réseaux de neurones.The accurate evaluation of RNA 3D structures remains a fundamental challenge in compu- tational biology, driven by the complexity and variability of RNA folding. The objective of this thesis is to explore how the RNA structure selection problem can be addressed using the Atomic Rotationally Equivariant Scorer (ARES), a neural network model de- signed for RNA structural evaluation, as a case study. This work aims to investigate the challenges and opportunities in improving RNA 3D structure evaluation, focusing on three key areas of improvement by utilizing ARES: (1) employing an alternative struc- ture generation tool: MC-SYM instead of FARFAR2, (2) expanding the training dataset with a broader representation of RNA families and motifs to capture diverse structural features, and (3) refining the evaluation metric by transitioning from the traditional Root Mean Square Deviation (RMSD) to the Deformation Index (DI), which provides a more nuanced assessment of structural accuracy. The results of this study revealed several key insights into RNA structure evalua- tion using ARES. By replacing FARFAR2 with MC-SYM to generate the dataset, we improved the model’s performance for certain RNAs. Moreover, using MC-SYM en- abled the generation of 3D structures for a larger number of RNA motifs, overcoming the limitations posed by the long runtime of FARFAR2. Additionally, replacing RMSD with the Deformation Index (DI) as the evaluation metric led to further improvements, with high-ranking predictions demonstrating better accuracy in approximating the cor- rect structures. These findings underscore DI’s ability to provide a more nuanced and informative evaluation compared to RMSD. On the limitations side, neither model con- sistently achieved a high correlation between predicted scores and actual RMSD values, highlighting persistent challenges in effectively learning RNA structural features. This underscores the necessity for more diverse and standardized training datasets to enhance model robustness and generalization. This work highlights areas for future exploration, aiming to improve the identification of structural models closer to native RNA conformations and pave the way for further advancements in RNA modeling. Keywords: RNA 3D structure, computational biology, Atomic Rotationally Equi- variant Scorer (ARES), structure generation tools, Deformation Index (DI), Root Mean Square Deviation (RMSD), RNA folding, structural evaluation, machine learning, neural networks

Entre interactions et influences autour du golfe du Mexique : étude comparative des gorgerins anthropomorphes mississippiens et huastèques (900-1500 DNÈ)

Les sociétés mississippiennes et huastèques ont confectionné des gorgerins à partir de larges conques marines avec une intensité et une période de production et d’usage marquée entre environ 900 et 1500 DNÈ. Ces bijoux portés sur la poitrine sont fréquemment dotés d’une iconographie richement gravée. Les archéologues du Mexique et des États-Unis ont parfois remarqué des similarités iconographiques entre les artefacts des deux régions, bien que peu d'études archéologiques comparent systématiquement les artefacts entre les deux. Les Mississippiens et les Huastèques auraient même possiblement interagi entre eux entre 900 et 1500, mais ces relations sont encore peu connues. Cette étude vise à examiner comment l’imagerie anthropomorphe des gorgerins peut nous aider à appréhender les interactions des populations des aires du Mississippi et de la Mésoamérique. Nous avons d’abord produit une base de données mettant en commun les gorgerins mississippiens et huastèques répertoriés illustrant des humanoïdes. Nous avons ensuite comparé ces artefacts en nous intéressant aux scènes narratives dépeintes, aux personnages et à leurs attributs corporels et aux autres motifs gravés. Nous avons finalement procédé à une synthèse de cette comparaison en retenant les aspects les plus importants et en examinant d’autres types d’artefacts. Nos observations suggèrent que les interactions entre les cultures de la région mississippienne et de la région huastèque étaient probablement indirectes et limitées, s’appuyant sur des réseaux où de multiples parties telles que des marchands, des commerçants-diplomates et des guerriers étaient impliquées.Huastec and Mississippian societies crafted gorgets from large marine shells with an intensity and marked period of production and use between 900 and 1500 CE. These ornaments, which were worn over the chest, are frequently engraved with a rich array of designs and figures. While few studies have systematically analyzed artifacts between the two regions, Mexican and American archaeologists have sometimes noted iconographic similarities between them. Mississippian and Huastec populations possibly had contacts between 900 and 1500 CE, but these interactions are still poorly understood. This study aims to examine the ways in which anthropomorphic imagery engraved on shell gorgets can increase our understanding of cultural contacts between the Mississippian and Huastec areas. To analyze these artifacts, a database incorporating all known shell gorgets containing human figural iconography of both groups was established. These artifacts were compared with a focus on narrative scenes, characters, bodily attributes, and other anthropomorphic motifs. Lastly, the most important shared traits of both cultural groups’ gorgets were analyzed in a synthesis which incorporates other types of artifacts. The results of this study suggest that the interactions between the Mississippian and Huastec regions were probably limited to indirect and sporadic contacts involving networks of merchants, merchant-diplomats and warriors