Poravnanje proteinskih struktura

U ovom radu opisan je jedan algoritam za poravnanje proteinske strukture različitih duljina. Na početku smo definirali matrice udaljenosti točaka za dvije proteinske strukture zasebno. Pomoću tih matrica smo napravili novu koja uspoređuje njihove vektore određene duljine (koju smo sami zadali parametrom wind) i govori koliko su bliski. Kako bismo odredili što je relativno blisko, uveli smo novi parametar (trash), te sve vrijednosti koje su manje od parametra postavili na 1, a ostale na 0. Nakon toga smo tražili uzastopne pozicije, koje u matrici imaju vrijednost 1, i koje zapravo predstavljaju točke iz dva skupa točaka sa početka. Pozicije najduljih nizova smo spremili u polje iz kojeg smo kasnije izbacivali one koji su najlošiji prema ostalima. Tim postupkom smo došli do pozicija u proteinima koje međusobno imaju najmanje udaljenosti iz kojih zaključujemo na kojim dijelovima se proteini podudaraju, odnosno na kojim dijelovima su poravnati.This paper describes an algorithm for protein structure alignment of different lengths. At the beginning, we define the matrix of distances between points for two protein structures separately. Using these matrices, we made a new one that compares their vectors of a certain length (which we have set with parameter wind) and tells us how close they are. To determine which is relatively close, we introduced a new parameter (trash), and all values that are less than the parameter set to 1, and the rest to 0. After that we were looking for consecutive positions, which in the matrix have a value 1, and that actually represent points from the two sets of points from the beginning. Positions of longest strings are stored in the field, from which we later evicted those who are worst to others. With this process, we come to positions in proteins that have the least distance from each other. From that, we conclude what parts of the proteins coincide, ie which parts are aligned

Organizacijska struktura u industriji

Organiziranje, planiranje i organizacijske strukture kao ekonomske kategorije vrlo su vaţne u poslovnoj ekonomiji i suvremenom poslovnom svijetu. Trţišni subjekt, odnosno poduzeće, ne moţe zamisliti poslovanje i opstanak na trţištu ukoliko ne vodi brigu o pravilnom, pravovremenom i kvalitetnom odabiru organizacijskog ustroja te sustavnom odrţavanju i unapreĎenju istog. Nakon što su postavljeni ciljevi poduzeća, izvršen izbor strategije za njihovo ostvarenje, oblikovana adekvatna misija i vizija te angaţirani odgovarajući ljudski resursi, pred menadţment se postavlja zadatak da osigura kvalitetan organizacijski ustroj poduzeća. Predmet analize u ovom završnom radu je upravo izučavanje organizacije industrije te odabira i provoĎenja odgovarajuće organizacijske strukture koje će biti temeljito teorijski predstavljeno i pojašnjeno na primjeru industrije „Podravka“.Organizing, planning and organizational structures as economic categories are very important in bussines economics and modern bussines world. Market operators, respectively industry, can't even imagine competitive business and market survival if they do not care about proper, well-timed and high-quality selection of the organizational structure and systematic maintenance and improvement of the same. After the main goals of the industry are set, strategy chosen, adequate mission and vision designed and appropriate human resources engaged, task in front of the management is to ensure quality organizational structure of the company. Organizational structures of the industry and the way on which they are chosen and conducted are the main objectives of this work and they will be closely presented and explained using the exanple of „Podravka“ industry

Struktura płac w przedsiębiorstwie

Zadanie pt. „Digitalizacja i udostępnienie w Cyfrowym Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego kolekcji czasopism naukowych wydawanych przez Uniwersytet Łódzki” nr 885/P-DUN/2014 zostało dofinansowane ze środków MNiSW w ramach działalności upowszechniającej nauk

Struktura i funkcija lipidnih splavi

Lipidne splavi su regije stanične membrane bogate kolesterolom i sfingolipidima. Do stvaranja dolazi zbog povezivanja dugih zasićenih acilnih lanaca sfingolipida s kolesterolom. Iako su to male regije one se mogu stabilizirati formiranjem većih platformi kroz proteinsko – proteinske i proteinsko – lipidne interakcije. Postoje u dvije faze, tekuća - neuređena faza i tekuća - uređena faza za koju se smatra da je pravi model za prikaz lipidnih splavi. Mogu se ravnomjerno proširiti po površini membrane ili mogu nastati male invaginacije koje se zovu kaveole. One nastaju polimerizacijom kaveolina. Glavna funkcija splavi je prijenos signala. Splavi sadrže signalne proteine koji se mogu povezati nakon stimulacije primarnim glasnikom što dovodi do povezivanja komponenti i aktivacije signalnog puta. Ali, splavi isto tako mogu odvojiti interakcijske komponente kako bi blokirale ili potisnule aktivnost signalnih proteina. Smatra se da lipidne splavi sudjeluju i u procesu endocitoze

Ionski kristali - struktura i svojstva

Ionski kristali građeni su od pozitivno i negativno nabijenih iona među kojima djeluje elektrostatska privlačna sila. Elektrostatsko privlačenje među suprotno nabijenim ionima predstavlja najveći dio energije ionske veze. Ioni se slažu u kristalne strukture tako da svaki kation bude okružen sa što većim brojem aniona i obrnuto, a broj aniona koji se mogu smjestiti oko kationa određen je omjerom radijusa pozitivno i negativno nabijenog iona. Ionska kristalna struktura opisuje se koordinacijskim poliedrima tako da su jezgre aniona spojene linijama kao bridovi tog poliedra, a jezgra kationa smještena je u njegovom središtu. Svojstva ionskih kristala posljedica su njihove građe. Karakterizira ih velika tvrdoća, visoka tališta i vrelišta, u čvrstom stanju ne provode električnu stuju, dok kao taline ili vodene otopine provode električnu struju. Uglavnom su dobro topljivi u vodi i drugim polarnim otapalima, te se mogu i kalati

Struktura skalarnih i D mezona

The qq spectrum is studied within a chiral constituent quark model. It provides with a good fit of the available experimental data from light (vector and pseudoscalar) to heavy mesons. The new D states measured at different B-factories are studied. The 0++ light mesons are analyzed as qq pairs or tetraquark structures.Proučavamo spektar qq pretpostavljajući kiralni model sastavnih kvarkova. Dobiva se dobro slaganje s eksperimentalnim podacima od lakih (vektorskih i pseudoskalarnih) do teških mezona. Proučavamo i nova stanja D izmjerena u više B-tvornica. Lake mezone 0++ analiziramo kao parove q¯q ili kao tetrakvarkove

Uzdužna spinska struktura pri COMPASSU

COMPASS is a fixed-target experiment at CERN\u27s Super-Proton-Synchrotron. Part of its physics program is dedicated to the spin structure of the nucleon, which it studies with a 160 GeV polarized muon beam and polarized targets. An overview of its measurements performed with longitudinal target polarization is given. In particular, recent results, concerning the gluon polarization, the separation of the contributions of the individual quark flavors and the test of the Bjorken sum rule, are presented.COMPASS su mjerenja na mirnoj meti pri super protonskom sinkrotronu u CERNu. Dio programa njegovih istraživanja posvećen je spinskoj strukturi nukleona što se proučava sa snopom polariziranih muona energije 160 GeV i polariziranim metama. Izlaže se pregled mjerenja izvedenih s uzdužno polarizaciranim metama. Posebice se izlažu nedavni ishodi za gluonsku polarizaciju, razdjela doprinosa pojedinačnih kvarkovskih okusa i provjera Bjorkenovog pravila suma

Urban Land Use Planning

Published in: Origin Spatial Development of Contemporary Poland in Łódź University Geographical Research, edited by T.MarszałUrban land-use planning is still one of the key questions in research conducted by the Faculty of Geography at the University of Łódź. The particular character of works conducted in Łódź derives from the strong emphasis which is put on their practical application; the basis of many publications is the need to solve emerging practical problems. It also means constant cooperation with local administration, urban planners and other people involved in the practical activity, which is easier thanks to the fact that many members of the local administration staff are graduates from the Faculty of Geography in Łódź. A serious difficulty in preparing this chapter laid in choosing appropriate publications which, due to the limited capacity, were chosen subjectively and selectively, and were classified ambiguously. An indisputable gap was left in reference to the data and research results that had never been published. Nevertheless, they constitute a great number of works created by staff members of the Faculty of Geography, adding up to over 30%. 1 It is also worth mentioning that many studies have been carried out as responses to particular needs of certain organizations, or ordered by local or national administration, as well as state institutions involved in land-use planning in Poland. The cooperation is usually temporary, based on handling particular works and achieving specific goals. They result in preparing e.g. development strategies (e.g. in towns of Inowrocław and Uniejów), projects of new administrative division (dividing Łódź into local units, delimitation of the Łódź Voivodship), land use inventory (e.g. in Aleksandrów Łódzki), city revitalisation conceptions (e.g. Pabianice), experts’ reports on changing administrative borders (Szadek, Skierniewice), cooperation of metropolitan areas (Łódź and Warsaw) and many more. Undoubtedly, the above proves the great value of the competences of the Faculty of Geography staff members

Hiperfina struktura sustava Ω-jezgra

We discuss the hyperfine structure of a bound state of the Ω hyperon and a nucleus with an electric quadrupole moment. We note a new type of contact term, analogous to the Fermi contact interaction for magnetic dipoles, this time in P-wave states.Raspravljamo o hiperfinoj strukturi vezanog stanja Ω hiperona i jezgre s električnim kvadrupolnim momentom. Ističemo novu vrstu kontaktnog međudjelovanja, koja je slična Fermijevom kontaktnom međudjelovanju za magnetske dipole, ali ovdje u P-stanjima