Presentamos EasyLecto, un sistema de simplificación léxica de efectos adversos presentes en prospectos de fármacos en español. El método de simplificación léxica que utiliza EasyLecto se basa en la frecuencia de las palabras para determinar los sinónimos más simples. Este sistema propone los mejores sinónimos y definiciones, obtenidos a partir de los recursos MedlinePlus y MedDRA. El sistema puede ayudar a los lectores con bajo nivel de alfabetización, con problemas cognitivos o discapacidad a la hora de entender los efectos adversos presentes en prospectos de fármacos.We introduce EasyLecto, a lexical simplification system of adverse effects in patient information leaflet in Spanish. The method of lexical simplification using EasyLecto is based on the frequency of words to determine the simplest synonyms. This system proposes the best synonyms and meanings, obtained from the Medline-Plus and MedDRA resources, representing their benefit for readers with low literacy, with cognitive problems or handicapped in understanding the adverse drug effects in patient information leaflet in Spanish.Este trabajo ha sido financiado por el proyecto eGovernAbility-Access (TIN2014-52665-C2-2-R)

Martínez Fernández, Paloma

Núñez-Gómez, Luis

Segura Bedmar, Isabel

EasyLecto: A lexical simplification system for adverse drug effects in Spanish patient information leaflets

Repositorio Institucional de la Universidad de Alicante

EasyLecto: Un sistema de simplificacio´n le´xica de efectosadversos presentes en prospectos de fa´rmacos en espan˜olEasyLecto: A lexical simplification system for adverse drug effects inSpanish patient information leafletsLuis Nu´n˜ez-Go´mez, Isabel Segura-Bedmar, Paloma Mart´ınezUniversidad Carlos III de MadridAv. Universidad, 30, 28913lununezg@pa.uc3m.es,{isegura, pmf} @inf.uc3m.esResumen: Presentamos EasyLecto, un sistema de simplificacio´n le´xica de efectosadversos presentes en prospectos de fa´rmacos en espan˜ol. El me´todo de simplificacio´nle´xica que utiliza EasyLecto se basa en la frecuencia de las palabras para determinarlos sino´nimos ma´s simples. Este sistema propone los mejores sino´nimos y definiciones,obtenidos a partir de los recursos MedlinePlus y MedDRA. El sistema puede ayudar alos lectores con bajo nivel de alfabetizacio´n, con problemas cognitivos o discapacidada la hora de entender los efectos adversos presentes en prospectos de fa´rmacos.Palabras clave: Simplificacio´n le´xica, Procesamiento de Lenguaje NaturalAbstract: We introduce EasyLecto, a lexical simplification system of adverse effectsin patient information leaflet in Spanish. The method of lexical simplification usingEasyLecto is based on the frequency of words to determine the simplest synonyms.This system proposes the best synonyms and meanings, obtained from the Medline-Plus and MedDRA resources, representing their benefit for readers with low literacy,with cognitive problems or handicapped in understanding the adverse drug effectsin patient information leaflet in Spanish.Keywords: Lexical simplification, Natural Language Processing1 Introducio´nLa simplificacio´n automa´tica de textos tie-ne como objetivo transformar un texto com-plejo en uno sencillo de leer y de entender.Es una tarea en Procesamiento de Lengua-je Natural (PLN) que en los u´ltimos an˜os hacrecido considerablemente (Abrahamsson etal., 2014) y que puede beneficiar a distintosgrupos de usuarios como las personas mayo-res, personas con bajo nivel de alfabetizacio´n,personas con discapacidad lectora o inclusopersonas que esta´n aprendiendo un idioma.Para simplificar un texto es aconsejable apli-car las pautas de lectura fa´cil1, que puedenresumirse en: uso de lenguaje directo y sen-cillo, empleo de voz activa, expresar una ideapor oracio´n, evitar el uso de jerga y tecni-cismos as´ı como abreviaturas, estructurar eltexto de forma clara y coherente, y usar pala-bras que representen un u´nico concepto. Enla simplificacio´n automa´tica de textos las ora-ciones complejas se dividen en oraciones ma´s1www.lecturafacil.es/essimples y el vocabulario complejo se reempla-za por un vocabulario ma´s fa´cil de entender.La aplicacio´n de te´cnicas de simplificacio´n detextos puede ser beneficiosa para disminuirla complejidad de los textos en dominios tandiversos como la administracio´n electro´nica,la ensen˜anza o la salud, entre muchos otros.En este art´ıculo nos centramos en el dominiode la salud y en particular en la simplificacio´nde prospectos de medicamentos. Los prospec-tos de fa´rmacos no son fa´ciles de comprenderya que contienen un gran nu´mero de te´rmi-nos te´cnicos del a´mbito me´dico y porque susoraciones suelen contener un gran nu´mero deestructuras gramaticales complejas (Davis etal., 2006). Por lo general, las personas desco-nocen la terminolog´ıa me´dica y cuando tra-tan de entender los efectos adversos de unfa´rmaco no logran hacerlo y terminan quitan-do importancia. Por esta razo´n es importantereducir la complejidad de los prospectos y deesta manera contribuir a evitar un uso inade-cuado y peligroso de los medicamentos.Procesamiento del Lenguaje Natural, Revista nº 57, septiembre de 2016, págs. 177-180 recibido 28-03-2016 revisado 11-04-2016 aceptado 20-04-2016ISSN 1135-5948 © 2016 Sociedad Española para el Procesamiento del Lenguaje NaturalFigura 1: Esquema del proceso de simplificacio´n le´xica de EasyLecto.Aunque existen herramientas de PLN ba-sadas en te´cnicas de simplificacio´n le´xica quepermiten reducir la complejidad de documen-tos, muy pocas esta´n orientadas al espan˜ol yal dominio de la salud (Bott, Saggion, y Mi-lle, 2012; Grigonytea et al., 2014).En las siguientes secciones se presenta laherramienta EasyLecto, un sistema de sim-plificacio´n le´xica de los efectos adversos pre-sentes en los prospectos de fa´rmacos en es-pan˜ol. La herramienta combina recursos ter-minolo´gicos para obtener los sino´nimos de losefectos adversos y el ca´lculo de sus frecuen-cias en una coleccio´n de textos recopilada dela enciclopedia online MedLinePlus2. Nues-tra principal hipo´tesis es que el sino´nimo ma´sfrecuente deber´ıa ser el ma´s simple. En el si-guiente apartado, se describe con ma´s detalleel me´todo de simplificacio´n propuesto.2 Proceso de simplificacio´nLe´xica de EasyLectoEl sistema EasyLecto propone los mejoressino´nimos para cada efecto adverso presenteen un prospecto de medicamentos. El me´todo2https://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/de simplificacio´n le´xica que utiliza EasyLectoes la frecuencia de te´rminos para determinarel sino´nimo ma´s simple; siendo el ma´s fre-cuente. Figura 1 muestra la arquitectura delsistema EasyLecto.El ı´ndice de terminolog´ıa me´dica se creautilizando la herramienta Elasticsearch 3, ungestor de base de datos distribuido y orienta-do a documentos, el cual permite almacenargran cantidad de informacio´n, facilita las con-sultas mediante JSON 4 y esta´ basado en tec-nolog´ıa Apache Lucene 5. El proceso de crea-cio´n del ı´ndice empieza con un algoritmo web-crawler que utiliza jsoup6, una biblioteca enjava que permite extraer y manipular datosde la web. El algoritmo recupera los art´ıculosde la enciclopedia de MedlinePlus de formaalfabe´tica; la enciclopedia incluye una grancantidad de art´ıculos acerca de temas de sa-lud como enfermedades, exa´menes me´dicos,s´ıntomas, lesiones y procedimientos quiru´rgi-cos. Una vez descargado, cada art´ıculo deMedLinePlus se representa como un objeto3https://www.elastic.co4http://www.json.org5https://lucene.apache.org/core/6http://jsoup.org/Luis Núñez Gómez, Isabel Segura Bedmar, Paloma Martínez Fernández178JSON, donde adema´s de almacenar el conte-nido de su pa´gina web, tambie´n se guarda unconjunto de sino´nimos del concepto descritoen el art´ıculo (dichos sino´nimos esta´n identi-ficados con los metadatos “Otros nombres” y“Nombres alternativos” en la pa´gina web delart´ıculo) y la primera oracio´n del texto delart´ıculo, que sera´ considerada como la defini-cio´n del concepto descrito en el art´ıculo. Deesta forma, adema´s de obtener un ı´ndice delos te´rminos y sus frecuencias en MedLine-Plus, tambie´n se ha construido de forma au-toma´tica un posible diccionario de te´rminosme´dicos y sus sino´nimos. En total se alma-cenaron un total de 6900 documentos en elı´ndice de terminolog´ıa me´dica (ver Figura 1).EasyLecto utiliza un sistema de reconoci-miento de entidades, basado en diccionarios,para identificar las menciones de efectos ad-versos descritos en un prospecto. El lectorpuede encontrar informacio´n ma´s detalladasobre dicho sistema en (Segura-Bedmar et al.,2015).Para cada uno de los efectos adversos de-tectados, se obtiene un conjunto de sino´nimosy definiciones a partir de los recursos Med-DRA y MedlinePlus. En el caso de MedLi-nePlus, en concreto se utiliza la informacio´nalmacenada en la base de datos de Elastic-Search, descrita en el apartado anterior. Med-DRA 7, un tesauro multilingu¨e me´dico coninformacio´n sobre productos me´dicos y coninformacio´n sobre los efectos de los medica-mentos. Desde el punto de vista de EasyLec-to, la principal ventaja de MedDRA es quelos efectos esta´n agrupados en conjuntos desino´nimos.La te´cnica de simplificacio´n le´xica que uti-liza EasyLecto, como ya se ha mencionado,es la frecuencia de los sino´nimos en el ı´ndi-ce de terminolog´ıa me´dica creado a partir dela coleccio´n MedLinePlus. Nuestra hipo´tesises que el sino´nimo ma´s frecuente sera´ el ma´ssencillo para sustituir cada efecto adverso.Despue´s de recuperar los sino´nimos de losrecursos, en el subproceso “obtener frecuen-cia de efectos adversos y sus sino´nimos”, seconsulta el ı´ndice de terminolog´ıa me´dica; pa-ra recuperar la frecuencia de los efectos ad-versos y de sus sino´nimos candidatos. El al-goritmo realiza consultas mediante JSON atodos los documentos de nuestro ı´ndice. En elsubproceso “proponer mejor sino´nimo segu´n7http://www.meddra.org/su frecuencia”, y una vez obtenidas las fre-cuencias de los efectos adversos y sus sino´ni-mos candidatos, se propone el sino´nimo ma´ssimple. En caso que el efecto adverso es ma´sfrecuente que todos los sino´nimos candida-tos, el efecto adverso no sera´ reemplazadopor otro sino´nimo. Para mejorar los tiemposde ejecucio´n, una vez procesado un documen-to, EasyLecto almacena sus efectos adversosy sus mejores sino´nimos en la base de datos“Efectosdb”, como se puede ver en la Figura1. De esta forma, cada vez que se simplifi-que, EasyLecto en primer lugar buscara´ losefectos y sus mejores sino´nimos en la base dedatos, y so´lo en el caso de no existir, bus-cara´ sus sino´nimos y sus frecuencias en losrecursos MedDRA y en el ı´ndice de termino-log´ıa me´dica.3 Funcionamiento del sistemaEasyLectoEl sistema de simplificacio´n le´xica EasyLec-to, permite identificar y simplificar los efec-tos adversos en un prospecto. A modo deejemplo, al abrir el prospecto “Ceftriaxona”,si el usuario necesita saber cua´l es el mejorsino´nimo para el efecto adverso “trombofle-bitis”, basta que el usuario haga clic sobredicho efecto adverso y de manera inmediatase abrira´ una ventana emergente. La Figura2 muestra la salida que proporciona la herra-mienta EasyLecto para el te´rmino trombofle-bitis. El mejor sino´nimo que propone Easy-Lecto en el recurso MedlinePlus para el efectoadverso “tromboflebitis” es “trombosis veno-sa profunda”, sin embargo, MedDRA propo-ne como mejor sino´nimo el mismo te´rmino.La definicio´n que ofrece MedlinePlus para es-te sino´nimo es “la trombosis venosa profundao tvp, es un coa´gulo sangu´ıneo que se for-ma en una vena profunda en el cuerpo”, co-mo se puede ver en la Figura 2. Como Med-DRA so´lo propone sino´nimos, nuestro siste-ma EasyLecto toma como posible definicio´nel te´rmino MedDRA de mayor longitud.4 Conclusiones y trabajo futuroEn este trabajo se presento´ EasyLecto, elprimer sistema de simplificacio´n le´xica deefectos adversos en prospectos de fa´rmacosen espan˜ol. Una demo del sistema esta´ dis-ponible en http://163.117.129.251:8080/EasyLecto. En la actualidad, se esta´ crean-do un corpus gold-standard anotado con efec-tos y sus sino´nimos, que nos permitira´ darEasyLecto: Un sistema de simplificación léxica de efectos adversos presentes en prospectos de fármacos en español179Figura 2: Simplificacio´n le´xica de los efectos adversos.una evaluacio´n cuantitativa de los resultadosde la herramienta EasyLecto. En un futurose pretende integrar otros recursos como Ba-belNet8 y abordar la simplificacio´n de otrosconceptos me´dicos (pruebas me´dicas, trata-mientos, enfermedades, etc). Tambie´n se ex-plorara´n otras te´cnicas para la seleccio´n delmejor sino´nimo, como por ejemplo el uso demodelos de vectores de palabras.AgradecimientosEste trabajo ha sido financiado por el proyec-to eGovernAbility-Access (TIN2014-52665-C2-2-R).Bibliograf´ıaAbrahamsson, E., T. Forni, M. Skeppstedt,y M. Kvist. 2014. Medical text simplifi-cation using synonym replacement: Adap-ting assessment of word difficulty to acompounding language. Proceedings ofThe 3rd Workshop on Predicting and Im-proving Text Readability for Target ReaderPopulations, pa´ginas 57–65.Bott, S., H. Saggion, y S. Mille. 2012.Text simplification tools for spanish. EnN. C. C. Chair) K. Choukri T. DeclerckM. U. Dog˘an B. Maegaard J. MarianiA. Moreno J. Odijk, y S. Piperidis, edi-tores, Proceedings of the Eight Interna-tional Conference on Language Resourcesand Evaluation (LREC’12), Istanbul, Tur-key, may.Davis, T. C., M. S. Wolf, P. F. Bass, J. A.Thompson, H. H. Tilson, M. Neuberger,y R. M. Parker. 2006. Literacy and mi-sunderstanding prescription drug labels.8http://babelnet.org/Annals of Internal Medicine, 145(12):887–894.Grigonytea, G., M. Kvistbc, S. Velupillaib, yM. Wire´na. 2014. Improving readabilityof swedish electronic health records th-rough lexical simplification: First results.EACL 2014, pa´ginas 74–83.Segura-Bedmar, I., P. Mart´ınez, R. Revert,y J. Moreno-Schneider. 2015. Exploringspanish health social media for detectingdrug effects. BMC medical informaticsand decision making, 15 Suppl 2(Suppl2):S6.Luis Núñez Gómez, Isabel Segura Bedmar, Paloma Martínez Fernández180

EasyLecto: A lexical simplification system for adverse drug effects in Spanish patient information leaflets

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

RUA

Repositorio Institucional de la Universidad de Alicante