Breeding for the milk market: the French situation compared to the EU mediterranean countries

*INRA/SAGA Toulouse Diffusion du document : INRA/SAGA ToulouseInternational audienc

New objectives of selection related to udder health, morphology and milkability in dairy sheep

24 ref. *INRA Station d'Amélioration génétique des animaux domestiques Toulouse (FRA) Diffusion du document : INRA Station d'Amélioration génétique des animaux domestiques Toulouse (FRA)International audienc

The French Lacaune dairy sheep breed : use in France and abroad in the last 40 years

Session 2 *INRA SAGA 31326 Castanet-Tolosan (FRA) Diffusion du document : INRA SAGA 31326 Castanet-Tolosan (FRA)International audienc

Génétique et sélection de la durée de la fertilité de la cane commune mère du Mulard : Synthèse de résultats expérimentaux

National audienc

Système de contrôle laitier automatisé des petits ruminants

« chantier qualité spécifique auteur avant départ en retraite : lien auteur au référentiel HR-Access uniquement »International audienc

Dynamique énergétique et des réserves corporelles en début de lactation chez les brebis laitières

Séance : AlimentationInternational audienceThe objective of this study conducted on two experimental dairy sheep flocks and eight commercial farms was to evaluate the use of two blood metabolites, beta-hydroxy-butyrate (BHB) and non-esterified fatty acids (NEFA), to assess energy balance and body reserve mobilization in dairy sheep. The kinetics of blood BHB during the day confirm that the composition of the ration and the postprandial delay are major factors of variation. Finally, assays from whole blood, serum, or heparinized or EDTA plasma differed slightly. These results emphasize the need for caution in the use of BHB and NEFA values in the exploration of metabolic disorders in dairy sheep. On 9 farms, body condition scoring (BCS) was performed on 3 occasions (one month before farrowing, during lactation and after weaning at the time of the first official milk recording) for a total of 2125 ewes. In parallel, blood BHB and NEFA concentrations were measured during lactation and at the first milk check on 466 ewes in 2nd lactation in these flocks. While plasma NEFA values were found to be positively correlated with the extent of BCS loss since late gestation, no significant relationship could be demonstrated for blood BHB.Cette étude menée sur deux troupeaux ovin lait de stations expérimentales et dans huit fermes commerciales avait pour objectif d’évaluer l’utilisation de deux métabolites sanguins, le béta-hydroxy-butyrate (BHB) et les Acides Gras Non Estérifiés (AGNE) pour explorer le statut énergétique et la mobilisation des réserves corporelles en élevage de brebis laitières. La cinétique du BHB sanguin au cours de la journée confirme que la composition de la ration et le délai post-prandial sont des facteurs majeurs de variation. Enfin, les dosages réalisés à partir du sang total, du sérum ou du plasma hépariné ou EDTA diffèrent légèrement. Ces résultats soulignent la nécessité de prudence dans l’utilisation des valeurs de BHB et des AGNE dans l’exploration des troubles métaboliques chez la brebis laitière. Dans 9 élevages, des notes d’état corporel (NEC) ont été réalisées à 3 reprises (un mois avant la misebas, durant l’allaitement et après sevrage au moment du 1er contrôle laitier officiel) pour un total de 2 125 brebis. En parallèle, les concentrations de BHB et des AGNE sanguins ont été mesurées en allaitement et au 1er contrôle sur 466 brebis en 2e lactation dans ces troupeaux. Alors que les valeurs d’AGNE plasmatiques sont apparues positivement corrélées à l’ampleur de la perte de NEC depuis la fin de gestation, aucune relation significative n’a pu être mise en évidence pour le BHB sanguin

State of the art on electronic identification of sheep and goat using passive transponders

4 tables Meeting jointly organized with the Station d'Amélioration Génétique des Animaux, INRA (FRA)*INRA, Centre de Toulouse (FRA) Diffusion du document : INRA, Centre de Toulouse (FRA)International audienc

Projet de pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires.

RÉSUMÉ Le but du programme est de combler les déficits en marqueurs observés pour trois espèces aviaires : la caille, le canard et la poule. La stratégie choisie est l'obtention, à partir de plusieurs individus de lignées d'intérêt, de SNP (Single Nucleotide Polymorphism, polymorphisme d'un nucléotide) par une nouvelle technologie de séquençage à haut débit (séquenceur 454 GS-FLX, Roche). Nous séquençons des représentations réduites du génome, en sélectionnant d'une part des fragments de restriction d'ADN génomique - les mêmes chez tous les individus - et d'autre part les transcrits qui représentent globalement la partie du génome correspondant aux gènes exprimés. Ces expérimentations sont réalisées à partir d'échantillons d'ADN ou d'ARN issus d'individus de lignées à l'origine de croisements existants, pour chacune des trois espèces. Les données générées par plusieurs "runs" de séquence seront traitées in silico : contigage à haut débit, recherche de SNP, comparaison avec les banques de séquences connues... En plus de l'intérêt que représente la production d'un très grand nombre de SNP nouveaux, cette technologie devrait permettre de mieux séquencer les régions riches en (G+C) correspondant aux plus petits des microchromosomes pour lesquels il n'y a pas de séquence chez la poule. La comparaison des séquences des transcrits obtenues chez la caille et le canard avec la séquence du génome de la poule permettra d'établir une "cartographie virtuelle" des SNP obtenus, grâce à la grande conservation de synténie existant entre ces trois espèces. ABSTRACT The aim of the project is to fill the lack in markers observed for three avian species (quail, duck and poultry). The chosen strategy is to obtain, by using individuals from several lines of interest, SNP (Single Nucleotide Polymorphism) by a high-throughput sequencing technology (sequencer 454 GS-FLX, Roche). Two reduced representations of the genome are sequenced: size-selected digested genomic DNA and transcriptome, which globally represents the part of the genome corresponding to the expressed genes. These experiments are realized from samples of DNA or RNA from individuals of lines from existing crosses, for each species. The data generated by several sequencing runs will be in silico analyzed. Besides the interest of the production of a very large number of new SNP, this technology should allow to sequence GC rich regions corresponding to the smallest microchromosomes for which there is no sequence in chicken. The comparison of the transcriptome sequences in quail and duck with the chicken genome assembly will allow to establish a "virtual cartography" of the obtained SNP, thanks to the synteny conservation existing between these three avian species