Prospective, population-based surveillance of the burden of Streptococcus pneumoniae in community-acquired pneumonia in older adults, Chrzanów County, Poland, 2010 to 2012

INTRODUCTION: Community-acquired pneumonia (CAP) caused by Streptococcus pneumoniae is a substantial cause of morbidity and mortality among older adults. This study estimated incidences of CAP, chest x-ray−confirmed CAP (CXR+CAP), S pneumonia- positive CAP, S pneumonia-positive CXR+CAP, and S. pneumoniae serotype distribution among 46,000 at-risk adults aged ≥ 50 years residing in Chrzanów County, Poland. MATERIAL AND METHODS: From January 2010 to January 2012, all facilities providing ambulatory and inpatient care enrolled all consenting resident patients with suspicion of CAP. Chest x-rays, urine, blood, and sputum samples were analyzed. Annualized incidence rates were determined. Presence of S pneumonia-positive CAP and/or S. pneumoniae serotype distribution was determined using the urine antigen detection assay (capable of detecting the serotypes in the 13-valent pneumococcal conjugate vaccine [PCV13]), BinaxNOW®, and/or microbiology cultures. RESULTS: Among 5055 enrolled patients, 1195 (23.7%) were diagnosed with CAP and 1166 (23.4%) had CXR+CAP. S. pneumoniae was detected in 144 (12.1%) and 131 (11.2%) patients from the CAP and CXR+CAP cohorts, respectively. Annualized incidence rates of CAP, CXR+CAP, S pneumonia-positive CAP, and S. pneumonia-positive CXR+CAP were 12.8, 12.5, 1.6, and 1.4 per 1000 residents, respectively. Among CXR+CAP patients, 39.7% were aged 50 to 64 years and 60.3% were aged ≥ 65 years. Incidence rates generally increased with age. The most common serotypes in S. pneumoniae-positive CXR+CAP patients were 3 (n = 15), 23F (n = 10), 18C (n = 9), and 9V (n = 6). CONCLUSIONS: CAP due to PCV13 serotypes is a source of morbidity among adults >50 years and may be reduced by greater access to pneumococcal vaccines.INTRODUCTION: Community-acquired pneumonia (CAP) caused by Streptococcus pneumoniae is a substantial cause of morbidity and mortality among older adults. This study estimated incidences of CAP, chest x-ray−confirmed CAP (CXR+CAP), S pneumonia- positive CAP, S pneumonia-positive CXR+CAP, and S. pneumoniae serotype distribution among 46,000 at-risk adults aged ≥ 50 years residing in Chrzanów County, Poland. MATERIAL AND METHODS: From January 2010 to January 2012, all facilities providing ambulatory and inpatient care enrolled all consenting resident patients with suspicion of CAP. Chest x-rays, urine, blood, and sputum samples were analyzed. Annualized incidence rates were determined. Presence of S pneumonia-positive CAP and/or S. pneumoniae serotype distribution was determined using the urine antigen detection assay (capable of detecting the serotypes in the 13-valent pneumococcal conjugate vaccine [PCV13]), BinaxNOW®, and/or microbiology cultures. RESULTS: Among 5055 enrolled patients, 1195 (23.7%) were diagnosed with CAP and 1166 (23.4%) had CXR+CAP. S. pneumoniae was detected in 144 (12.1%) and 131 (11.2%) patients from the CAP and CXR+CAP cohorts, respectively. Annualized incidence rates of CAP, CXR+CAP, S pneumonia-positive CAP, and S. pneumonia-positive CXR+CAP were 12.8, 12.5, 1.6, and 1.4 per 1000 residents, respectively. Among CXR+CAP patients, 39.7% were aged 50 to 64 years and 60.3% were aged ≥ 65 years. Incidence rates generally increased with age. The most common serotypes in S. pneumoniae-positive CXR+CAP patients were 3 (n = 15), 23F (n = 10), 18C (n = 9), and 9V (n = 6). CONCLUSIONS: CAP due to PCV13 serotypes is a source of morbidity among adults >50 years and may be reduced by greater access to pneumococcal vaccines

Shotgun Lipidomic Analysis for Differentiation of Niche Cold Pressed Oils

The fast-growing food industry is bringing significant number of new products to the market. To protect consumers’ health and rights, it is crucial that food control laboratories are able to ensure reliable quality testing, including product authentication and detection of adulterations. In our study, we applied a fast and eco-friendly method based on shotgun-lipidomic mass spectrometry for the authentication of niche edible oils. Comprehensive lipid profiles of camelina (CA), flax (FL) and hemp (HP) seed oils were obtained. With the aid of principal component analysis (PCA), it was possible to detect and distinguish each of them based on their lipid profiles. Lipidomic markers characteristic ofthe oils were also identified, which can be used as targets and expedite development of new multiplexed testing methods

Prospective, Population-Based Surveillance of the Burden of Streptococcus pneumoniae in Community-Acquired Pneumonia in Older Adults, Chrzanów County, Poland, 2010 to 2012

Introduction: Community-acquired pneumonia (CAP) caused by Streptococcus pneumoniae is a substantial cause of morbidity and mortality among older adults. This study estimated incidences of CAP, chest X-ray−confirmed CAP (CXR+CAP), S pneumoniae-positive CAP, S pneumoniae-positive CXR+CAP, and S. pneumoniae serotype distribution among 46,000 at-risk adults aged ≥ 50 years residing in Chrzanów County, Poland. Material and methods: From January 2010 to January 2012, all facilities providing ambulatory and inpatient care enrolled all consenting resident patients with suspicion of CAP. Chest X-rays, urine, blood, and sputum samples were analyzed. Annualized incidence rates were determined. Presence of S pneumoniae-positive CAP and/or S. pneumoniae serotype distribution was determined using the urine antigen detection assay (capable of detecting the serotypes in the 13-valent pneumococcal conjugate vaccine [PCV13]), BinaxNOW®, and/or microbiology cultures. Results: Among 5055 enrolled patients, 1195 (23.7%) were diagnosed with CAP and 1166 (23.4%) had CXR+CAP. S. pneumoniae was detected in 144 (12.1%) and 131 (11.2%) patients from the CAP and CXR+CAP cohorts, respectively. Annualized incidence rates of CAP, CXR+CAP, S pneumoniae-positive CAP, and S. pneumoniae-positive CXR+CAP were 12.8, 12.5, 1.6, and 1.4 per 1000 residents, respectively. Among CXR+CAP patients, 39.7% were aged 50 to 64 years and 60.3% were aged ≥ 65 years. Incidence rates generally increased with age. The most common serotypes in S. pneumoniae-positive CXR+CAP patients were 3 (n = 15), 23F (n = 10), 18C (n = 9), and 9V (n = 6). Conclusions: CAP due to PCV13 serotypes is a source of morbidity among adults >50 years and may be reduced by greater access to pneumococcal vaccines

Prospektywna, populacyjna obserwacja występowania Streptococcus pneumoniae w przebiegu pozaszpitalnego zapalenia płuc wśród osób starszych, Chrzanów, Polska, 2010−2012

WSTĘP: Pozaszpitalne zapalenie płuc wywołane przez S. pneumoniae jest istotną przyczyną chorobowości i śmiertelności wśród osób starszych. Badanie to ocenia występowanie pozaszpitalnego zapalenia płuc (CAP, community acquired pneumonia), CAP potwierdzonego radiologicznie (CXR+CAP), S. pneumoniae dodatniego CAP, S. pneumoniae dodatniego CAP potwierdzonego radiologicznie oraz dystrybucję serotypów S. pneumoniae u ponad 46 000 dorosłych powyżej 50. roku życia mieszkających w powiecie chrzanowskim w Polsce. MATERIAŁ I METODY: Od stycznia 2010 do stycznia 2012 roku wszystkie placówki zapewniające amulatoryjną i szpitalną opiekę medyczną włączały wszystkich wyrażających zgodę pacjentów z podejrzeniem CAP. Wykonywano zdjęcie RTG klatki piersiowej, badanie moczu, krwi i plwociny. Uzyskano roczne wskażniki zapadalności. Potwierdzenie S. pneumoniae-dodatniego CAP i/lub rozkład serotypów S. pneumoniae uzyskiwano w analizie antygenowej moczu (BINAX NOW®) (wykrywający serotypy obecne w 13-walentnej szczepionce PCV 13) i posiewach mikrobiologicznych. WYNIKI: Wśród 5055 pacjentów włączonych do badania u 1195 (23,7%) zdiagnozowano pozaszpitalne zapalenie płuc, w tym 1166 (23,4%) miało zmiany radiologiczne (CAP+CXR). S. pneumoniae stwierdzono u 144 pacjentów z CAP (12,1%) i u 133 w grupie z CAP+CXR (11,2%). Roczne wskaźniki zapadalności na CAP, CAP+CXR, S. pneumonia-dodatniego CAP oraz S. pneumonia-dodatniego CAP+CXR wynosiły odpowiednio 12,8, 12,5, 1,6 i 1,4 na 1000 mieszkańców. Wśród pacjentów z CAP+CXR 39,7% było w grupie wiekowej 50−64, a 60,3% miało ≥ 65 lat. Częstość występowania rosła z wiekiem. Najczęstsze serotypy S. pneumoniae u pacjentów z CAP+CXR to 3 (n = 15), 23F (n = 10), 18C (n = 9), 9V (n = 6). WNIOSKI: CAP spowodowane serotypami PCV13 jest przyczyną chorobowości u dorosłych powyżej 50. roku życia, która może być zredukowana większym dostępem do szczepionki.WSTĘP: Pozaszpitalne zapalenie płuc wywołane przez S. pneumoniae jest istotną przyczyną chorobowości i śmiertelności wśród osób starszych. Badanie to ocenia występowanie pozaszpitalnego zapalenia płuc (CAP, community acquired pneumonia), CAP potwierdzonego radiologicznie (CXR+CAP), S. pneumoniae dodatniego CAP, S. pneumoniae dodatniego CAP potwierdzonego radiologicznie oraz dystrybucję serotypów S. pneumoniae u ponad 46 000 dorosłych powyżej 50. roku życia mieszkających w powiecie chrzanowskim w Polsce. MATERIAŁ I METODY: Od stycznia 2010 do stycznia 2012 roku wszystkie placówki zapewniające amulatoryjną i szpitalną opiekę medyczną włączały wszystkich wyrażających zgodę pacjentów z podejrzeniem CAP. Wykonywano zdjęcie RTG klatki piersiowej, badanie moczu, krwi i plwociny. Uzyskano roczne wskażniki zapadalności. Potwierdzenie S. pneumoniae-dodatniego CAP i/lub rozkład serotypów S. pneumoniae uzyskiwano w analizie antygenowej moczu (BINAX NOW®) (wykrywający serotypy obecne w 13-walentnej szczepionce PCV 13) i posiewach mikrobiologicznych. WYNIKI: Wśród 5055 pacjentów włączonych do badania u 1195 (23,7%) zdiagnozowano pozaszpitalne zapalenie płuc, w tym 1166 (23,4%) miało zmiany radiologiczne (CAP+CXR). S. pneumoniae stwierdzono u 144 pacjentów z CAP (12,1%) i u 133 w grupie z CAP+CXR (11,2%). Roczne wskaźniki zapadalności na CAP, CAP+CXR, S. pneumonia-dodatniego CAP oraz S. pneumonia-dodatniego CAP+CXR wynosiły odpowiednio 12,8, 12,5, 1,6 i 1,4 na 1000 mieszkańców. Wśród pacjentów z CAP+CXR 39,7% było w grupie wiekowej 50−64, a 60,3% miało ≥ 65 lat. Częstość występowania rosła z wiekiem. Najczęstsze serotypy S. pneumoniae u pacjentów z CAP+CXR to 3 (n = 15), 23F (n = 10), 18C (n = 9), 9V (n = 6). WNIOSKI: CAP spowodowane serotypami PCV13 jest przyczyną chorobowości u dorosłych powyżej 50. roku życia, która może być zredukowana większym dostępem do szczepionki