Search for primers and optimization of determination techniques of ADN markers microsatelites in argentinian shrimp (Pleoticus muelleri)

El langostino argentino (Pleoticus muelleri) se distribuye a lo largo de las costas del Océano Atlántico Sudoccidental, entre los 20º y 50º de Latitud S. En Argentina constituye en la actualidad uno de los recursos de mayor importancia para la actividad pesquera. El elevado valor comercial de este crustáceo en los mercados internacionales lo ha situado como uno de los principales productos de exportación pesquera argentina, representando una participación del 61% del total de exportaciones del sector, con un ingreso anual superior a los 1.200 millones de dólares estadounidenses. En la actualidad, se dispone para la especie de un estudio genético restringido a la zona sur de su distribución (entre los 42 y 47º de latitud S) y que analiza la diversidad de un segmento de ADN mitocondrial del gen COI, y otro que estudia la variabilidad genética del langostino P. muelleri en toda su área de distribución geográfica mediante el análisis de un fragmento de ADN mitocondrial correspondiente al gen región control (CR). Este trabajo tiene como objetivo evaluar marcadores moleculares microsatélites como información de base para el estudio poblacional en el langostino argentino. A partir de bibliografía se seleccionaron cuatro (4) primers que permitieron amplificar microsatélites en otras especies de la misma familia (Solenoceridae). Solo se han obtenidos resultados de amplificación a partir de un par de iniciadores (ZG-71). La secuenciación de estos fragmentos no permitió detectar la conservación de los microsatélites esperados para el desarrollo del marcador específico.The Argentine shrimp (Pleoticus muelleri) is distributed along the coasts of the South West Atlantic Ocean, between 20º and 50º of Latitude S. In Argentina, it is currently one of the most important resources for fishing activity. The high commercial value of this crustacean in the international markets has placed it as one of the main export products of Argentina, representing a participation of 61% of the total exports of the sector, with an annual income of more than 1,200 million US Dollars. Currently, a restricted genetic study is available for the species to the south of its distribution (between 42 and 47º latitude S) and it analyzes the diversity of a mitochondrial DNA segment of the COI gene, and another that studies the genetic variability of P. muelleri shrimp throughout its geographic range by analyzing a fragment of mitochondrial DNA corresponding to the control region (CR) gene. The objective of this work is to evaluate microsatellite molecular markers as basic information for the population study of Argentine shrimp. From the bibliography, four (4) primers were selected that allowed to amplify microsatellites in other species of the same family (Solenoceridae). Only amplification results have been obtained from a pair of primers (ZG-71). The sequencing of these fragments did not allow to detect the conservation of the microsatellites expected for the development of the specific marker.Fil: Gesto, Estefania Soledad Malvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Santa Cruz. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Unidad Académica Río Gallegos; ArgentinaFil: Marcucci, Valeria Cecilia. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Unidad Académica Río Gallegos; ArgentinaFil: de Carli, Pedro. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Unidad Académica Río Gallegos; Argentin

Biblioteca de RADSeq de Pleoticus muelleri

Secuencias (paired end) de ADN asociado a sitios de restricción de individuos de P. muelleri recolectados en todo su rango de distribución.Fil: Gesto, Estefania Soledad Malvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Santa Cruz. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz; ArgentinaFil: Ceballos, Santiago Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; ArgentinaFil: de Carli, Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Santa Cruz. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz; ArgentinaFil: Confalonieri, Viviana Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Perez Barros, Patricia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Population genomic analysis of the commercially important shrimp Pleoticus muelleri (Crustacea: Decapoda: Solenoceridae) reveals the existence of two, northern and southern, lineages with adaptive genetic differences

Identifying the population genetic structure and adaptive diversity of fishery resources is essential for their resilience and sustainability. Pleoticus muelleri is one of the most important fishing resources in Argentina. It inhabits the Southwestern Atlantic Ocean from 20° to 50° S. We genotyped 1740 SNPs in 42 individuals using Restriction Site-Associated DNA Sequencing and discovered two genetic lineages, one in the south (Golfo San Jorge and off Rawson), and the other in the north of its distribution (Macaé). Individuals found in intermediate locations (Punta del Diablo and Rio Grande do Sul) suggested the existence of admixture between these two groups. In addition, we found loci correlated with some environmental variables suggesting the existence of divergent selection between both populations. The STRUCTURE analysis including only putatively neutral loci gave similar results to the one with all loci, indicating either differentiation originated because of a physical barrier to dispersion, or that the lack of gene flow because of selection has already affected neutral loci. This knowledge can contribute to its sustainable management and conservation.Fil: Gesto, Estefania Soledad Malvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Santa Cruz. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz; ArgentinaFil: Ceballos, Santiago Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; ArgentinaFil: de Carli, Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Santa Cruz. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz. Universidad Nacional de la Patagonia Austral. Centro de Investigaciones y Transferencia de Santa Cruz; ArgentinaFil: Confalonieri, Viviana Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Pérez Barros, Patricia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Maimonides. Centro de Ciencias Naturales, Ambientales y Antropologicas. Departamento de Biologia Marina.; Argentin