Campylobacter and food safety : analysis, assessment and risk management

Thermotolerant Campylobacter species (C. jejuni, C. coli, C. lari et C. upsaliensis) are considered as one of the main causes of bacterial gastroenteritis in man. Most of campylobacteriosis cases are caused by C. jejuni. Contamination sources are numerous, especially in the animal reservoir with its population of asymptomatic carriers among farm animals. Transmission to man is rarely due to direct contact with a reservoir and more often to ingestion of contaminated products (chicken, raw milk, water…). Frequent controls and appropriate hygiene measures adapted to every level of the food chain, from farmer to consumer, limit the Campylobacter risk.Les Campylobacter thermotolérants (C. jejuni, C. coli, C. lari et C. upsaliensis) sont désignés comme l'une des causes principales de gastro-entérites bactériennes humaines. C. jejuni est à l'origine de la majorité des cas de campylobactériose. Les sources de contamination sont nombreuses, particulièrement au sein du réservoir animal où l'on note des portages sains chez les animaux d'élevage. La transmission à l'homme se fait rarement par contact direct avec un réservoir mais est souvent due à l'ingestion d'aliments contaminés (poulet, lait cru, eau...). Des contrôles fréquents et des mesures d'hygiène adaptées à chaque étape de la chaîne agro-alimentaire, depuis l'éleveur jusqu'au consommateur lui-même, permettent de limiter le risque Campylobacter

Campylobacter jejuni et stress oxydant (Étude de la survie à différentes températures et recherche des mécanismes de défense par approches protéomique et transcriptomique)

Campylobacter jejuni est la première cause bactérienne d entérites humaines d origine alimentaire dans le monde. Ce pathogène est adapté à un milieu microaérobie et sa température optimale de croissance est de 42 degres C. Cependant, il est capable de survivre dans l environnement et à l abattoir, subissant des périodes d exposition à l oxygène atmosphérique à différentes températures (42 degrés C, froid ou température ambiante). Ce travail a eu pour but d étudier les effets combinés du stress oxydant et de la température sur C. jejuni. Tout d abord, la survie de différentes souches de C. jejuni d origines différentes (souches aviaires, cliniques ou de référence) a été étudiée en conditions de stress oxydant à 4, 25 et 42 degrés C. Un effet souche indépendant de l origine a été observé. Si la bactérie apparaît sensible au stress oxydant à 42 degrés C, elle résiste très bien à ce stress à 4 degrés C. Des analyses protéomiques et transcriptomiques ont ensuite été réalisées avec ou sans stress oxydant à 4 et 42 degrés C. A 4 degrés C sans stress oxydant, des protéines de stress oxydant (SodB, AhpC et Cft) sont surexprimées, ce qui pourrait conférer à C. jejuni une protection croisée, expliquant la forte résistance au stress oxydant à cette température. A 42C, un régulateur à deux composants dont la fonction est encore inconnue chez C. jejuni semble jouer un rôle important dans l induction de la réponse au stress oxydant. Enfin, une surexpression de protéines de virulence est observée en conditions de stress oxydant à température élevée. Le stress oxydant rencontré chez l hôte humain pourrait constituer un signal pour la bactérie d induire ses facteurs de virulenceCampylobacter jejuni is the first bacterial cause of foodborne human enteritis in the world. This pathogen is adapted to a microaerobic environment and its optimal growth temperature is 42 degrees C. However, it is able to survive in the environment and in slaughterhouses, encountering exposure to atmospheric oxygen at different temperatures (42 degrees C, cold or room temperature). This work aimed at studying combined effects of oxidative stress and temperature on C. jejuni. First, survival of different C. jejuni strains from different origins (poultry isolates, clinical isolates or reference strains) was studied under oxidative stress conditions at 4, 25 and 42 degrees C. A strain effect independent from origin was observed. If bacteria seem very sensitive to oxidative stress at 42 degrees C, they are very resistant to this stress at 4 degrees C. In addition, proteomic and transcriptomic analyses were realized with and without oxidative stress at 4 and 42 degrees C. At 4 degrees C without oxidative stress, oxidative stress related proteins are overexpressed (SodB, AhpC and Cft), potentially conferring a cross-protection to C. jejuni that could explain its high resistance to oxidative stress at this temperature. At 42 degrees, a two-component regulator whose function is still unknown in C. jejuni seems to play an important role in oxidative stress response induction. Finally, virulence proteins (FlaA, CadF and a VacJ homolog) were found overexpressed at high temperature under oxidative stress conditions. Oxidative stress encountered inside the human host could constitute a signal for C. jejuni to induce its virulence factorsNANTES-BU Sciences (441092104) / SudocSudocFranceF

Mining genomic islands with Synteruptor, a new strategy for identifying secondary metabolism gene clusters

International audienc

Genome-guided exploration of streptomyces ambofaciens secondary metabolism

International audienceMembers of the Streptomyces genus are among the most prolific microorganisms producing secondary metabolites with wide uses in medicine and in agriculture. Sequencing of the genome of the model Streptomyces, Streptomyces coelicolor, has highlighted an unexpected feature, i.e. that the potential of these organisms to synthesise secondary metabolites has been largely underestimated. They indeed possess many more gene clusters encoding natural product-like biosynthetic pathways than there are known natural products. Similar observations have since been made for other bacterial or fungal genomes. Thus, it became clear that microbial secondary metabolism had been seriously underestimated and that genome-based approaches were very promising for the search of new bioactive compounds. Here, we present an overview of the secondary metabolite biosynthetic potential of Streptomyces ambofaciens, a species known for decades as producer of the macrolide spiramycin and the pyrrolamide congocidine. Interestingly, genome analysis has revealed that despite of the close phylogenetic relatedness between S. coelicolor and S. ambofaciens, most of its secondary metabolite gene clusters are species-specific