Genomic diversity of Escherichia coli from healthy children in rural Gambia

Little is known about the genomic diversity of Escherichia coli in healthy children from sub-Saharan Africa, even though this is pertinent to understanding bacterial evolution and ecology and their role in infection. We isolated and whole-genome sequenced up to five colonies of faecal E. coli from 66 asymptomatic children aged three-to-five years in rural Gambia (n = 88 isolates from 21 positive stools). We identified 56 genotypes, with an average of 2.7 genotypes per host. These were spread over 37 seven-allele sequence types and the E. coli phylogroups A, B1, B2, C, D, E, F and Escherichia cryptic clade I. Immigration events accounted for three-quarters of the diversity within our study population, while one-quarter of variants appeared to have arisen from within-host evolution. Several isolates encode putative virulence factors commonly found in Enteropathogenic and Enteroaggregative E. coli, and 53% of the isolates encode resistance to three or more classes of antimicrobials. Thus, resident E. coli in these children may constitute reservoirs of virulence- and resistance-associated genes. Moreover, several study strains were closely related to isolates that caused disease in humans or originated from livestock. Our results suggest that within-host evolution plays a minor role in the generation of diversity compared to independent immigration and the establishment of strains among our study population. Also, this study adds significantly to the number of commensal E. coli genomes, a group that has been traditionally underrepresented in the sequencing of this species

Les vases Bès à l'époque perse (Égypte-Levant). Essai de classification

International audienceOrganisation des pouvoirs et contacts culturels dans les pays de l'empire achéménide, Actes du colloque organisé au Collège de France par la « Chaire d'histoire et civilisation du monde achéménide et de l'empire d' Alexandre » et le « Réseau international d'études et de recherches achéménides » (GDR 2538 CNRS), 9-10 novembre 2007, sous la direction de Pierre Briant et Michel Chauvea

Le poids de l'orientalisation et de l'hellénisation au travers des échanges et des productions céramiques dans l'angle nord-est du Delta égyptien

With the material of Tell el-Herr, situated at the north-eastern edge of the Egyptian Delta, a ceramic chronology could be established, from the first Persian domination (5th c. BC) to the eve of Alexander's conquest. After the Saïte dynasty, during which the Delta opened to the Mediterranean, the following periods reveal intense, regular commercial links for this part of Egypt, marked by the importation of products from the Levantine coast and especially from the Aegean world, in the 5th and 4th c. BC. The study of ceramics from Tell el-Herr and of neighbouring sites indicates the rarity of local productions of Achemenid type. On the other hand, from the end of the 5th c. onwards, the ceramics repertoire presents a development in technical and morphological aspects. In this field particularly, a new range of ceramics seems to reflect foreign influences, particularly Greek (lecythoi and small bowls). Produced in small quantites, they may have been intended for a foreign community settled on the site.À partir du matériel de Tell el-Herr, situé dans l'angle nord-est du Delta égyptien, un tableau évolutif de la céramique a pu être dressé, de la Première domination perse (Ve s. av. J.-C.) à la veille de la conquête d'Alexandre. Après la dynastie saïte au cours de laquelle le Delta s'ouvre sur la Méditerranée, les époques suivantes révèlent, dans cette partie de l'Égypte, des courants commerciaux intenses et réguliers, marqués par l'importation de produits en provenance de la côte levantine et, surtout, du monde égéen, aux Ve et IVe s. av. J.-C. L'étude de la céramique de Tell el-Herr et des sites voisins permet d'observer la rareté des productions locales de type achéménide. En revanche, à partir de la fin du Ve s. le répertoire céramique rend compte de certaines tendances évolutives, sur les plans technique et morphologique. Dans ce domaine tout particulièrement, une nouvelle gamme de récipients semble refléter des influences étrangères, et notamment grecques (lécythes et coupelles). Produits en faibles quantités, ils seraient peut-être destinés à une communauté étrangère établie sur le site.Defernez Catherine. Le poids de l'orientalisation et de l'hellénisation au travers des échanges et des productions céramiques dans l'angle nord-est du Delta égyptien. In: Céramiques hellénistiques et romaines, productions et diffusion en Méditerranée orientale (Chypre, Égypte et côte syro-palestinienne). [Actes du colloque tenu à la Maison de l'Orient méditerranéen Jean Pouilloux du 2 au 4 mars 2000] Lyon : Maison de l'Orient et de la Méditerranée Jean Pouilloux, 2002. pp. 235-245. (Travaux de la Maison de l'Orient méditerranéen, 35

D’Amathonte au Nord-Sinaï : sur les traces d’un scarabée tétraptère

International audiencePoste-frontière majeur de l’époque perse à la pointe orientale du Delta égyptien (Nord-Sinaï), le site fortifié de Tell el-Herr est aussi connu pour ses nombreux vestiges matériels indiquant de fructueux échanges commerciaux et économiques avec ses partenaires limitrophes. Dès sa fondation, sa localisation géographique privilégiée et stratégique – à proximité du littoral méditerranéen, de l’une des branches les plus importantes du Nil, la branche pélusiaque, et de la seule route terrestre reliant le pays de Canaan à l’Égypte –, a privilégié des liens étroits avec les grands centres du bassin méditerranéen oriental, principalement situés en Grèce et au Levant. L’île de Chypre, plaque-tournante incontournable du commerce à longue distance dans l’Antiquité, fut aussi un point de contact important dans les activités, multiples, développées dans la région, sous l’Empire perse. Divers témoignages révèlent la diffusion de la culture matérielle chypriote sur le site : terres-cuites figurées (images de la fécondité), petite statuaire, éléments de mobilier, bijoux, vaisselles fines et amphores. L’une des trouvailles les plus éloquentes dont il est question ici, un large sceau amathousien figurant un scarabée à quatre ailes déployées, paraît bien confirmer l’intensité des relations entre l’angle nord-ouest du Sinaï et la péninsule chypriote

Le poids de l’orientalisation et de l’hellénisation au travers des échanges et des productions céramiques dans l’angle nord-est du Delta égyptien

International audienceWith the material of Tell el-Herr, situated at the north-eastern edge of the Egyptian Delta, a ceramic chronology could be established, from the first Persian domination (5th c. BC) to the eve of Alexander's conquest. After the Saïte dynasty, during which the Delta opened to the Mediterranean, the following periods reveal intense, regular commercial links for this part of Egypt, marked by the importation of products from the Levantine coast and especially from the Aegean world, in the 5th and 4th c. BC. The study of ceramics from Tell el-Herr and of neighbouring sites indicates the rarity of local productions of Achaemenid type. On the other hand, from the end of the 5th c. onwards, the ceramics repertoire presents a development in technical and morphological aspects. In this field particularly, a new range of ceramics seems to reflect foreign influences, particularly Greek (lekythoi and small bowls). Produced in small quantities, they may have been intended for a foreign community settled on the site.À partir du matériel de Tell el-Herr, situé dans l'angle nord-est du Delta égyptien, un tableau évolutif de la céramique a pu être dressé, de la Première domination perse (Ve s. av. J.-C.) à la veille de la conquête d’Alexandre. Après la dynastie saïte au cours de laquelle le Delta s'ouvre sur la Méditerranée, les époques suivantes révèlent, dans cette partie de l'Égypte, des courants commerciaux intenses et réguliers, marqués par l’importation de produits en provenance de la côte levantine et, surtout, du monde égéen, aux Ve et IVe s. av. J.-C. L’étude de la céramique de Tell el-Herr et des sites voisins permet d'observer la rareté des productions locales de type achéménide. En revanche, à partir de la fin du Ve s. le répertoire céramique rend compte de certaines tendances évolutives, sur les plans technique et morphologique. Dans ce domaine tout particulièrement, une nouvelle gamme de récipients semble refléter des influences étrangères, et notamment grecques (lécythes et coupelles). Produits en faibles quantités, ils seraient peut-être destinés à une communauté étrangère établie sur le site

Remarques à propos du mobilier récent découvert sur le site de Tell el-Herr (saison 2010)

International audienc

: Tell el-Herr

Présentation synthétique du site de Tell el-Herr (Nord-Sinaï

Karnak. La chapelle d’Osiris Ounnefer Neb-Djefaou

International audienceÉtude préliminaire du matériel céramique extrait de la fouille des vestiges d'une chapelle d'époque saïte, dédicacée à Osiris maître des aliments dans le temple d'Amon-Rê de Karnak (Louqsor)

La céramique préptolémaïque de Tell el-Herr. Présentation préliminaire

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La céramique d'Ayn Soukhna : observations préliminaires

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