From Data to Software to Science with the Rubin Observatory LSST

The Vera C. Rubin Observatory Legacy Survey of Space and Time (LSST) dataset will dramatically alter our understanding of the Universe, from the origins of the Solar System to the nature of dark matter and dark energy. Much of this research will depend on the existence of robust, tested, and scalable algorithms, software, and services. Identifying and developing such tools ahead of time has the potential to significantly accelerate the delivery of early science from LSST. Developing these collaboratively, and making them broadly available, can enable more inclusive and equitable collaboration on LSST science. To facilitate such opportunities, a community workshop entitled "From Data to Software to Science with the Rubin Observatory LSST" was organized by the LSST Interdisciplinary Network for Collaboration and Computing (LINCC) and partners, and held at the Flatiron Institute in New York, March 28-30th 2022. The workshop included over 50 in-person attendees invited from over 300 applications. It identified seven key software areas of need: (i) scalable cross-matching and distributed joining of catalogs, (ii) robust photometric redshift determination, (iii) software for determination of selection functions, (iv) frameworks for scalable time-series analyses, (v) services for image access and reprocessing at scale, (vi) object image access (cutouts) and analysis at scale, and (vii) scalable job execution systems. This white paper summarizes the discussions of this workshop. It considers the motivating science use cases, identified cross-cutting algorithms, software, and services, their high-level technical specifications, and the principles of inclusive collaborations needed to develop them. We provide it as a useful roadmap of needs, as well as to spur action and collaboration between groups and individuals looking to develop reusable software for early LSST science.Comment: White paper from "From Data to Software to Science with the Rubin Observatory LSST" worksho

From Data to Software to Science with the Rubin Observatory LSST

editorial reviewedThe Vera C. Rubin Observatory Legacy Survey of Space and Time (LSST) dataset will dramatically alter our understanding of the Universe, from the origins of the Solar System to the nature of dark matter and dark energy. Much of this research will depend on the existence of robust, tested, and scalable algorithms, software, and services. Identifying and developing such tools ahead of time has the potential to significantly accelerate the delivery of early science from LSST. Developing these collaboratively, and making them broadly available, can enable more inclusive and equitable collaboration on LSST science. To facilitate such opportunities, a community workshop entitled "From Data to Software to Science with the Rubin Observatory LSST" was organized by the LSST Interdisciplinary Network for Collaboration and Computing (LINCC) and partners, and held at the Flatiron Institute in New York, March 28-30th 2022. The workshop included over 50 in-person attendees invited from over 300 applications. It identified seven key software areas of need: (i) scalable cross-matching and distributed joining of catalogs, (ii) robust photometric redshift determination, (iii) software for determination of selection functions, (iv) frameworks for scalable time-series analyses, (v) services for image access and reprocessing at scale, (vi) object image access (cutouts) and analysis at scale, and (vii) scalable job execution systems. This white paper summarizes the discussions of this workshop. It considers the motivating science use cases, identified cross-cutting algorithms, software, and services, their high-level technical specifications, and the principles of inclusive collaborations needed to develop them. We provide it as a useful roadmap of needs, as well as to spur action and collaboration between groups and individuals looking to develop reusable software for early LSST science

Provincia del Neuquén

Fil: Leanza, Héctor A. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Hugo, Carlos A. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Repol, David. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: González, Rafael. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Danieli, Juan C. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Lizuain, Antonio. Ministerio de Economía. Subsecretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.La Hoja 3969-I, ZAPALA, se encuentra ubicada en la provincia del Neuquén, oeste central de la Argentina, y corresponde enteramente a la región conocida como Cuenca Neuquina. La unidad más antigua es la Formación Los Molles, cuya sedimentación en nuestra área de estudio se inició en el Toarciano. Esta unidad, junto con las Formaciones Lajas y Tábanos, completan el Grupo Cuyo, que finaliza en el Calloviano temprano. Durante el Calloviano medio sobreviene la depositación de la Formación Lotena, compuesta por conglomerados fluviales y sedimentitas marinas acumuladas por mecanismos turbidíticos. En el Oxfordiano, el proceso de somerización iniciado en el Calloviano superior tiene su acmé, originándose una nueva restricción de la cuenca que permite la acumulación de unidades evaporíticas (Formaciones La Manga y Auquilco). Durante el Kimmeridgiano se emplaza la Dorsal de Huincul, causando la inversión estructural de mayor envergadura registrada en la cuenca, la cual es la responsable de la Discordancia Araucánica. Esta inversión estructural restringió la cuenca, formándose depósitos fluviales y lacustres (Formación Tordillo). A partir del Tithoniano inferior tardío (Zona de Mendozanus) se produce la máxima inundación marina registrada en la cuenca, depositándose margas bituminosas con bochones calcáreos (Formación Vaca Muerta). En el Tithoniano superior y Berriasiano inferior tiene lugar en la región suroriental de la cuenca el desarrollo de una plataforma carbonática (Formación Picún Leufú) con arreglo progradacional sobre la unidad anterior. En el sector sur de la Hoja se intercalan, en la Formación Vaca Muerta, calizas micríticas (Miembro Los Catutos) que se adjudican al Tithoniano medio/superior, en tanto que en el sector septentrional se verifica una delgada y continua faja de areniscas (Miembro Huncal), que se forman en el límite entre el Berriasiano y el Valanginiano. Como resultado de una nueva inversión tectónica, en el Valanginiano inferior se verifica un cambio importante en el patrón de subsidencia, que deriva en una más restringida paleogeografía, con desarrollo de facies fluviales, mareales y deltaicas (Formación Mulichinco) según un arreglo progradante hacia áreas depocentrales de la cuenca. Durante el Valanginiano tardío y el Hauteriviano se depositaron pelitas negras con numerosos niveles fosilíferos (Formación Agrio), produciéndose en su tramo medio una breve somerización caracterizada por sedimentitas de ambiente fluvial (Miembro Avilé). Durante el Barremiano, Aptiano y Albiano se comprueba una nueva somerización, con desarrollo alternante de evaporitas y clásticos en un contexto de subsidencia regional (Formaciones Huitrín y Rayoso). A partir del Cenomaniano inferior se origina una renovación de la actividad tectónica con intrusión de plutonitas (Granodiorita Tres Puntas), produciéndose a partir de entonces y hasta el Santoniano la depositación sinorogénica de capas rojas del Grupo Neuquén (Formaciones Candeleros, Huincul, Cerro Lisandro, Portezuelo, Plottier y Bajo de la Carpa). En el Campaniano se registra la intrusión de volcanitas mesosilícicas (Andesita El Sillero), en tanto que la Discordancia Huantráiquica separa al Grupo Neuquén del Grupo Malargüe desvinculando por primera vez a la Cuenca Neuquina del océano Pacífico, no es visible en nuestra área de estudio. A lo largo del Cenozoico tuvieron lugar importantes procesos de deformación que resultaron en la actual configuración de la cordillera de los Andes. En el Eoceno inferior y medio se produce la intrusión de andesitas (Formación Colipilli). Posteriormente, se registra la depositación de unidades sinorogénicas (Formaciones Cerro Bandera y Puesto Burgos), cuyas edades se asignan al Oligoceno tardío y al Mioceno temprano, vinculándose también en edad la intrusión de los Basaltos Cerro Atravesado y Michacheo. Durante el intervalo que va desde el Mioceno medio a tardío ocurre el plegamiento de las unidades sedimentarias previamente citadas y de la discordancia que las separa de las Formaciones La Bardita y Rincón Bayo, que se acumularon durante el Mioceno medio y superior y quizás el Plioceno inferior, cuando acaeció también la intrusión de la Formación Desfiladero Negro. Ya en el Plioceno se verifica el derrame del Basalto Zapala, tanto como de las unidades del ciclo eruptivo Tilhuelitense que se identifican en la comarca con la Formación Carrancul (volcanitas mesosilícicas) y la Ignimbrita Carreri. En el límite entre el Plioceno y el Pleistoceno se elaboró un importante nivel de agradación (Formación Pampa Encima). A principios del Pleistoceno se constatan episodios fluvioglaciales (Formaciones Las Coloradas y Codihue), los que son sobrepuestos por lavas olivínicas del Basalto Macho Viejo, equiparables al ciclo efusivo Chapualitense. Posteriormente, tiene lugar el primer proceso importante de erosión (Depósitos que cubren el I nivel de pedimentos) en tanto que en estrecha vinculación con antiguos cursos fluviales se depositaron las Formaciones Agua de la Caldera y Huarenchenque. A renglón seguido se acumularon los Depósitos del I nivel de terrazas del río Neuquén y los Depósitos del antiguo abanico aluvial del cañadón Santo Domingo. A fines del Pleistoceno medio se constata el derrame de coladas (Basalto Los Mellizos) vinculadas con importantes centros efusivos tales como los cerros Cansino o Llamuco. En el Pleistoceno superior se han registrado episodios de acumulación vinculados con varios niveles de terrazas de cursos como los del Neuquén, Agrio, Covunco o Santo Domingo, en tanto que los episodios de erosión se relacionan con Depósitos que cubren el II nivel de pedimentos y Depósitos que cubren superficies pedimentadas de flanco, estos últimos vinculados con niveles de base locales. Finalmente completan el cuadro estratigráfico del Cuaternario los Depósitos de remoción en masa, Depósitos de bajos, mallines y lagunas, Depósitos eólicos que forman médanos, Depósitos fluviales y eólicos, Depósitos aluviales y coluviales y Depósitos aluviales actuales, que se adjudican al Holoceno. La región cuenta con importantes recursos de hidrocarburos (petróleo y gas), cuya explotación es una de las principales actividades económicas en la zona. También posee abundantes recursos de depósitos de minerales industriales, entre los que se encuentran arcillas, bentonita, baritina, celestina, calcita, caliza, yeso, fosforita y áridos. Entre los minerales metalíferos existen depósitos de cobre sedimentario y manifestaciones hidrotermales de plomo, zinc y plata

Geología y Geomorfología del Sector Septentrional del Parque Nacional Lanin, Provincia de Neuquén

Fil: Cucchi, Rubén. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Leanza, Héctor A. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Repol, David. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Escosteguy, Leonardo Darío. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: González, R. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Danieli, Juan C. Ministerio de Energía y Minería. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina

Provincia del Neuquén

Fil: Cucchi, Rubén. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Leanza, Héctor A. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Repol, David. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Escostegut, Leonardo Darío. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: González, Rafael. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Danieli, Juan C. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Franchi, Mario. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.La Hoja Geológica 3972-IV, JUNÍN DE LOS ANDES, está ubicada en la provincia del Neuquén, oeste central de la Argentina. Los grandes lagos Huechulafquen, Tromen, Quillén y Rucachoroi, los ríos Aluminé y Catán Lil y el majestuoso volcán Lanín constituyen sus elementos geográficos más destacados. La unidad litoestratigráfica más antigua es la Formación Colohuincul, compuesta por metamorfitas débilmente inyectadas que se atribuyen al Proterozoico superior. Ectinitas de la Formación Piedra Santa han sido datadas como devónicas. Estas unidades son intruidas por los granitoides de los Complejos Plutónicos Huechulafquen y del Chachil atribuidos al Carbonífero - Pérmico inferior. Durante el lapso Pérmico superior a Triásico medio se desarrolló un gran evento volcánico representado por un amplio espectro de volcanitas mesosilícicas asignadas a Formación Choiyoi, las cuales se disponen en discordancia sobre las unidades basamentales previamente citadas. A raíz de fenómenos extensionales, el relleno de la cuenca Neuquina comienza en el Triásico superior con la depositación de la Formación Lapa. Durante el Pliensbachiano y el Calloviano inferior tiene lugar la acumulación del Grupo Cuyo, integrado por un conjunto de sedimentitas mixtas constituido por las Formaciones Sierra Chacaicó, Chachil, Piedra Pintada, Los Molles, Lajas y Challacó. Durante el Calloviano superior y el Oxfordiano se acumularon sedimentitas lotenianas, en este caso identificadas con las Formaciones Lotena y Fortín 1º de Mayo. A este ciclo sedimentario seguirá el que corresponde al Grupo Mendoza, acaecido entre el Kimmeridgiano y el Hauteriviano inferior, representado en la comarca por las Formaciones Quebrada del Sapo, Vaca Muerta, Carrín Curá, Picún Leufú, Bajada Colorada y Agrio. Durante el Cretácico inferior tardío y el Cretácico superior tiene lugar un evento magmático representado por la Granodiorita Paso de Icalma. A comienzos del Cenozoico se reconocen andesitas y tobas de la Formación Auca Pan atribuidas al Paleoceno. Luego de un período de erosión se produce, en el Eoceno superior, la depositación de la Formación Lolog, de ambiente continental. Durante el Mioceno medio al Plioceno inferior se acumulan sedimentitas tobáceas y tufíticas de la Formación Chimehuín. En parte concomitantemente, tiene lugar el derrame del Basalto Rancahué. El ciclo efusivo siguiente se desarrolla en el Mioceno superior Plioceno y comprende al Basalto Tipilihuque y a las andesitas y tobas de la Formación Aseret. Como resultado de la existencia de un importante nivel de agradación se produce durante el Pliopleistoceno la acumulación de conglomerados de la Formación Pampa Curacó y posteriormente, ya en el Pleistoceno, el derrame del Basalto Hueyeltué. El primer depósito glacifluvial corresponde a la Formación Las Coloradas. El Basalto Huechahué, también con andesitas, antecede a los depósitos morénicos de la Formación Los Helechos y a los glacifluviales de la Formación Collún Có. En el Holoceno se derrama el Basalto Malleo y se desarrollan superficies de pedimentos cubiertas por conglomerados, gravas y arenas. El vulcanismo retoma su actividad con el derrame del Basalto Mallín y el más reciente Basalto Lanín, de registros históricos. En los bordes de mesetas basálticas se produjeron depósitos de remoción en masa; en tanto que los coluviales se ubican en laderas de serranías y los aluviales se vinculan con los ríos y arroyos actuales. Los recursos minerales más importantes de la Hoja consisten en depósitos de minerales metalíferos que incluyen el yacimiento de cobre de tipo pórfiro cuprífero (La Voluntad), tanto como manifestaciones de plomo y oro. Entre los minerales industriales se conocen depósitos de caolín, cuarzo y gabro

Hoja Geológica 3772-IV

Informe geológico sobre la región de Andacollo, en la provincia de Chubut. La misma se encuentra dentro de la hoja geológica 3772-IV.Fil: Rovere, Elizabeth I.. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Caselli, Alberto. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Tourn, Selvia. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Leanza, Héctor A. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Hugo, Carlos A. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Folguera, Andrés. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Escosteguy, Leonardo Darío. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Geuna, Silvana. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: González, Rafael. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Colombino, Juan E. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina.Fil: Danieli, Juan C. Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios. Secretaría de Minería. Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR); Argentina

Identification of a new putative functional IL18 gene variant through an association study in systemic lupus erythematosus

Interleukin-18 (IL-18) is a proinflammatory cytokine that plays an important role in chronic inflammation and autoimmune disorders. In this study, we aimed to determine the potential role of the IL18 gene in SLE. To define the genetic association of the IL18 and SLE, we have genotyped nine SNPs in an independent set of Spanish cases and controls. The IL18 polymorphisms were genotyped by PCR, using a predeveloped TaqMan allele discrimination assay. Two SNPs were still significant after fine mapping of the IL18 gene. The SNP (rs360719) surviving correction for multiple tests was genotyped in two replication cohorts from Italy and Argentina. After the analysis, a significance with rs360719 C-allele remained across the sets and after the meta-analysis (Pooled OR 5 1.37, 95% CI 1.21-1.54, combined P 5 3.8E-07, Pc 5 1.16E-06). Quantitative real-time PCR was performed to assess IL18 mRNA expression in PBMC from subjects with different IL18 rs360719 genotypes. We tested the effect of the IL18 rs360719 polymorphism on the transcription of IL18 by electrophoretic mobility shift assay and western blot. We found a significant increase in the relative expression of IL18 mRNA in individuals carrying the rs360719 C-risk allele; in addition we show that the polymorphism creates a binding site for the transcriptional factor OCT-1. These findings suggest that the novel IL18 rs360719 variant may play an important role in determining the susceptibility to SLE and it could be a key factor in the expression of the IL18 gene. © The Author 2009. Published by Oxford University Press. All rights reserved

Kallikrein genes are associated with lupus and glomerular basement membrane-specific antibody-induced nephritis in mice and humans

Immune-mediated nephritis contributes to disease in systemic lupus erythematosus, Goodpasture syndrome (caused by antibodies specific for glomerular basement membrane [anti-GBM antibodies]), and spontaneous lupus nephritis. Inbred mouse strains differ in susceptibility to anti-GBM antibody-induced and spontaneous lupus nephritis. This study sought to clarify the genetic and molecular factors that may be responsible for enhanced immune-mediated renal disease in these models. When the kidneys of 3 mouse strains sensitive to anti-GBM antibody-induced nephritis were compared with those of 2 control strains using microarray analysis, one-fifth of the underexpressed genes belonged to the kallikrein gene family, which encodes serine esterases. Mouse strains that upregulated renal and urinary kallikreins exhibited less evidence of disease. Antagonizing the kallikrein pathway augmented disease, while agonists dampened the severity of anti-GBM antibody-induced nephritis. In addition, nephritis-sensitive mouse strains had kallikrein haplotypes that were distinct from those of control strains, including several regulatory polymorphisms, some of which were associated with functional consequences. Indeed, increased susceptibility to anti-GBM antibody-induced nephritis and spontaneous lupus nephritis was achieved by breeding mice with a genetic interval harboring the kallikrein genes onto a disease-resistant background. Finally, both human SLE and spontaneous lupus nephritis were found to be associated with kallikrein genes, particularly KLK1 and the KLK3 promoter, when DNA SNPs from independent cohorts of SLE patients and controls were compared. Collectively, these studies suggest that kallikreins are protective disease-associated genes in anti-GBM antibody-induced nephritis and lupus