Full genome sequencing of a human-like H1N2 swine influenza virus.

Projeto/Plano de Ação: 02.11.01.006

Long non-coding RNAs differentially expressed in swine fetuses.

Long non-coding RNAs (lncRNAs) are non-coding transcripts involved in various biological processes. The Y chromosome is known for determining the male sex in mammals. LncRNAs on the Y chromosome may play important regulatory roles. However, knowledge about their action mechanisms is still limited, especially during early fetal development. Therefore, we conducted this exploratory study aiming to identify, characterize, and investigate the differential expression of lncRNAs between male and female swine fetuses at 35 days of gestation. RNA-Seq libraries from 10 fetuses were prepared and sequenced using the Illumina platform. After sequencing, a data quality control was performed using Trimmomatic, alignment with HISAT2, and transcript assembly with StringTie. The differentially expressed lncRNAs were identified using the limma package of the R software (4.3.1). A total of 871 potentially novel lncRNAs were identified and characterized. Considering differential expression, eight lncRNAs were upregulated in male fetuses. One was mapped onto SSC12 and seven were located on the Y chromosome; among them, one lncRNA is potentially novel. These lncRNAs are involved in diverse functions, including the regulation of gene expression and the modulation of chromosomal structure. These discoveries enable future studies on lncRNAs in the fetal stage in pigs

Structure and functional prediction of a microbial community involved in a full-scale biofilter treating wastewater odor.

Abstract: The efficiency of biofilters depends on the microbial community, so it is crucial to understand the structural/functional dynamics and identify the key microbial genera associated with treating toxic gases such as hydrogen sulfide (H2S). This study investigated the structural dynamics linked to the functional prediction of microbial communities in a full-scale biofilter installed near a sewage lift station. Sampling and analysis were conducted for 720 days. Illumina 16S rRNA sequencing was used to assess the taxonomic profile, followed by putative evaluation of functional genes. H2S removal efficiency reached 90% of the compound concentration at the inlet halfway up the filter bed height. Spatial variability had a greater effect on the microbial community. Studies focused on bacterial behavior and structure in biofiltration systems are still scarce, and only through further research can we fully understand the dynamics. Resumo: A eficiência dos biofiltros depende da comunidade microbiana, portanto é crucial conhecer a dinâmica estrutural/funcional e identificar os principais gêneros microbianos ligados ao tratamento de gases tóxicos, como o sulfeto de hidrogênio (H2S). Este trabalho investigou a dinâmica estrutural ligada à predição funcional das comunidades microbianas de um biofiltro em escala real instalado próximo a uma estação elevatória de esgoto. A amostragem e a análise foram conduzidas por 720 dias. O sequenciamento Illumina 16S rRNA foi usado para avaliar o perfil taxonômico, seguido pela avaliação putativa de genes funcionais. A eficiência de remoção de H2S atingiu 90% da concentração do composto na entrada já na metade da altura do leito filtrante. A variável espacial teve maio refeito sobre a comunidade microbiana. Estudos focados no comportamento e estrutura bacteriana em sistemas de biofiltração ainda são escassos, e somente com mais pesquisas poderemos entender a dinâmica comportamental

Caracterização ecofisiológica de linhagens de milho submetidas a baixa disponibilidade hídrica durante o florescimento.

O estudo de cultivares tolerantes a limitações hídricas é uma alternativa sustentável para mitigar os impactos negativos das mudanças climáticas globais. Este trabalho foi realizado com o objetivo de caracterizar linhagens de milho contrastantes quanto a resistência a seca no estádio de florescimento, baseando-se nas trocas gasosas e fluorescência da clorofila, em casa-de-vegetação. Foram avaliadas três linhagens de milho, sendo duas tolerantes (L 31.2.1.2 e L 29.1.1) e uma sensível (L 2.3.2.1) a deficiência hídrica. No pré-florescimento, dois tratamentos hídricos, sem (SD) e com deficiência hídrica (CD), foram impostos, e após cinco dias de imposição do estresse, foram avaliadas a taxa de fotossíntese foliar (A), a condutância estomática (gs), a transpiração foliar (T), a eficiência intrínseca do uso da água (EIUA, A/gs), o teor relativo de clorofila (SPAD) e parâmetros da fluorescência da clorofila (Fv/Fm, Fo/FM, Fv/Fo). As linhagens tolerantes a seca apresentaram maior eficiência no uso da água em comparação com a linhagem sensível. A linhagem L 29.1.1 apresentou maior eficiência no fotossistema II (Fv/Fm) do que as linhagens L 2.3.2.1 e L 31.2.1.2. Pode-se concluir que existem diferenças ecofisiológicas nas trocas gasosas e na fluorescência da clorofila, que caracterizam as linhagens tolerantes à seca em relação às linhagens sensíveis. Os resultados desta pesquisa fornecerão subsídios para os melhoristas selecionarem material tolerante a seca