Research information management at ISCTE-IUL: the library’s role

ISCTE-IUL is a Portuguese public university with approximately 9000 students enrolled in undergraduate (46%) and postgraduate (54%) programs. The Repository of ISCTE-IUL is running since 2007 sustained by an Open Access Policy approved in the same year. In 2013, the current research information system – Ciência-IUL – became interoperable with the Repository bringing new challenges to SID, and allowing work collaboratively with other services to collect information, improve processes, and reduce duplication of efforts. SID seeks to support researchers throughout the research life cycle aiming to raise awareness of the academic community for Open Science best practices.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Cell clustering mediated by the adhesion protein PVRL4 is necessary for alpha6beta4 integrin-promoted ferroptosis resistance in matrix-detached cells

Ferroptosis is an iron-dependent form of programmed cell death characterized by the accumulation of lipid-targeting reactive oxygen species that kill cells by damaging their plasma membrane. The lipid-repair enzyme glutathione peroxidase 4 (GPX4) protects against this oxidative damage and enables cells to resist ferroptosis. Recent work has revealed that matrix-detached carcinoma cells can be susceptible to ferroptosis and that they can evade this fate through the signaling properties of the alpha6beta4 integrin, which sustains GPX4 expression. Although these findings on ferroptosis are provocative, they differ from those in previous studies indicating that matrix-detached cells are prone to apoptosis, via a process referred to as anoikis. In an effort to reconcile these discrepant findings, here we observed that matrix-detached epithelial and carcinoma cells cluster spontaneously via a mechanism that involves the cell adhesion protein PVRL4 (also known as Nectin-4). We found that this clustering process allows these cells to survive by stimulating a PVRL4/alpha6beta4/Src signaling axis that sustains GPX4 expression and buffers against lipid peroxidation. In the absence of alpha6beta4, PVRL4-mediated clustering induced an increase in lipid peroxidation that was sufficient for triggering ferroptosis. When the clustering was inhibited, single cells did not exhibit a significant increase in lipid peroxidation in the absence of alpha6beta4, and they were more susceptible to apoptosis than to ferroptosis. These results indicate that ferroptosis induction depends on cell clustering in matrix-detached cells that lack alpha6beta4 and imply that the fate of matrix-detached cells can be determined by the state of their cell-cell interactions

Interoperabilidade: da preservação da produção científica à monitorização do acesso aberto

A interoperabilidade do sistema CRIS – Current Research Information System – com o Repositório Institucional é uma aposta vantajosa para as Instituições de Ensino Superior. Os Repositórios Institucionais, para além da sua função de armazenar e preservar a produção científica institucional podem, nos dias de hoje, ter funções bem mais alargadas. Através da interoperabilidade com um sistema CRIS, o repositório pode aumentar a produção depositada permitindo cumprir as políticas de acesso aberto das entidades financiadoras. Existe igualmente uma relação direta entre o aumento do número de depósitos e o aumento do número de consultas, de downloads e de pedidos de cópia. Comparando as publicações registadas no sistema CRIS com os depósitos no repositório é possível fazer uma monitorização do grau de cumprimento do acesso aberto.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

O que nos dizem as métricas produzidas nas redes sociais? O exemplo da Biblioteca ISCTE-IUL no Facebook

A utilização pelas Bibliotecas de Ensino Superior da rede social Facebook permitiu-lhes uma maior interação com os seus utilizadores, sejam eles internos ou externos (Arroyo-Vásquez, 2018). A divulgação de informação nas redes sociais trouxe, aos profissionais das bibliotecas, um trabalho acrescido de produção de conteúdos dinâmicos e diversificados (vídeos, imagens, entre outros). Este investimento em comunicação implica recursos humanos e tempo e deverá traduzir-se em maior impacto, alcance e interação. Este estudo pretende identificar um conjunto de Indicadores Chave de Desempenho e aplicar uma Taxa de Interação que permitam medir a relação entre Bibliotecas e os seus utilizadores no contexto do Facebook.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Auto-arquivo e cumprimento das Políticas de Acesso Aberto: o caso do ISCTE-IUL

Em 2013 a Comissão Europeia apresentou as Guidelines on Open Access to Scientific Publications and Research Data in Horizon 2020. A 5 de maio de 2014, a Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) publicou a Política de Acesso Aberto referente aos projetos que financia. No seguimento dessas orientações, em 2015, por despacho da Reitoria, o ISCTE-IUL atualizou a sua política. Os três documentos obrigam ao depósito da produção científica em repositórios institucionais em acesso aberto, com possibilidade de embargo máximo de 12 meses (no caso da área das ciências sociais), sendo aceites versões postprint e de editor. Com este trabalho pretendemos identificar o nível de cumprimento destas políticas e como editores, repositórios e serviços de biblioteca têm respondido às mesmas.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Protocol for the separation of extracellular vesicles by ultracentrifugation from in vitro cell culture models

Extracellular vesicles (EVs) play key roles in transporting key molecular constituents as cargo for extracellular trafficking. While several approaches have been developed to extract EVs from mammalian cells, the specific method of EV isolation can have a profound effect on membrane integrity and yield. Here, we describe a step-by-step procedure to separate EVs from adherent epithelial cells using differential ultracentrifugation. Separated EVs can be further analyzed by immunoblotting, mass spectrometry, and transmission electron microscopy to derive EV yield and morphology. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Brown et al. (2019)

The alpha6beta4 integrin promotes resistance to ferroptosis

Increases in lipid peroxidation can cause ferroptosis, a form of cell death triggered by inhibition of glutathione peroxidase 4 (GPX4), which catalyzes the reduction of lipid peroxides and is a target of ferroptosis inducers, such as erastin. The alpha6beta4 integrin protects adherent epithelial and carcinoma cells from ferroptosis induced by erastin. In addition, extracellular matrix (ECM) detachment is a physiologic trigger of ferroptosis, which is evaded by alpha6beta4. The mechanism that enables alpha6beta4 to evade ferroptosis involves its ability to protect changes in membrane lipids that are proferroptotic. Specifically, alpha6beta4-mediated activation of Src and STAT3 suppresses expression of ACSL4, an enzyme that enriches membranes with long polyunsaturated fatty acids and is required for ferroptosis. Adherent cells lacking alpha6beta4 require an inducer, such as erastin, to undergo ferroptosis because they sustain GPX4 expression, despite their increase in ACSL4. In contrast, ECM detachment of cells lacking alpha6beta4 is sufficient to trigger ferroptosis because GPX4 is suppressed. This causal link between alpha6beta4 and ferroptosis has implications for cancer biology and therapy

A Systematic Review of Electronic Portal Usage Among Patients with Diabetes

The objectives of this review were (1) to examine characteristics associated with enrollment and utilization of portals among patients with diabetes and (2) to identify barriers and facilitators of electronic patient portal enrollment and utilization. PubMed and the Cumulative Index to Nursing and Allied Health Literature (CINAHL) were systematically searched for papers reporting original research using quantitative or qualitative methods on characteristics, barriers, and facilitators associated with portal enrollment and utilization among patients with diabetes in the United States. The search was limited to articles published between February 1, 2005 (the date of the national symposium on personal health records) and January 1, 2014. Sixteen articles were identified. Of these, nine were quantitative, three were qualitative, and four used mixed-methods. Several demographic characteristics, having better-controlled diabetes, and providers who engaged in and encouraged portal use were associated with increased portal enrollment and utilization. Barriers to portal enrollment included a lack of patient (1) capacity, (2) desire, and (3) awareness of portal/portal functions. Barriers to portal utilization included (1) patient capacity, (2) lack of provider and patient buy-in to portal benefits, and (3) negative patient experiences using portals. Facilitators of portal enrollment and utilization were providers and family members recommending and engaging in portal use. Improved usability, increased access, educating patients how to use and benefit from portals, and greater endorsement by providers and family members might increase portal enrollment and utilization. As more providers and hospitals offer portals, addressing barriers and leveraging facilitators may help patients with diabetes achieve potential benefits

As Bibliotecas de Ensino Superior e a gestão de ciência

As Bibliotecas de Ensino Superior (BES) com sistemas CRIS e repositórios institucionais a seu cargo têm vindo a adaptar-se no sentido de responder às necessidades dos seus utilizadores. Passaram a incluir funções de gestão de ciência com benefícios para a comunidade científica e para a instituição. Com a proliferação de plataformas digitais dedicadas à disseminação e comunicação de ciência surgiu a necessidade de apoiar os docentes e investigadores na atualização da sua produção científica e proceder à validação de metadados, ajudando a manter a qualidade e veracidade da informação e contribuir para a simplificação e transparência dos processos de avaliação da instituição. Pretende-se, com este trabalho, descrever a atividade de uma Biblioteca de Ensino Superior com funções de gestão de ciência, enfatizando a interação CRIS-repositório institucional, o processo de validação de metadados e a atualização de perfil de investigador e respetivos currículos dos docentes e investigadores.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

As Bibliotecas de Ensino Superior e a Gestão de Ciência

As Bibliotecas de Ensino Superior (BES) com sistemas CRIS e repositórios institucionais a seu cargo têm vindo a adaptar-se no sentido de responder às necessidades dos seus utilizadores. Passaram a incluir funções de gestão de ciência com benefícios para a comunidade científica e para a instituição. Com a proliferação de plataformas digitais dedicadas à disseminação e comunicação de ciência surgiu a necessidade de apoiar os docentes e investigadores na atualização da sua produção científica e proceder à validação de metadados, ajudando a manter a qualidade e veracidade da informação e contribuir para a simplificação e transparência dos processos de avaliação da instituição. Pretende-se, com este trabalho, descrever a atividade de uma Biblioteca de Ensino Superior com funções de gestão de ciência, enfatizando a interação CRIS-repositório institucional, o processo de validação de metadados e a atualização de perfil de investigador e respetivos currículos dos docentes e investigadores.info:eu-repo/semantics/publishedVersio