晶体结构数据库CRYDB的功能简介和应用前景

<正> 一、引言英国剑桥大学的剑桥结构数据库(CSD系统)是国际知名的五个晶体结构数据库之一。在引进CSD系统磁带的基础上,经过软件系统的部分改造,功能的扩充,建立了对国内各界公开服务的有机

VF算法在化学结构检索中的应用

实现了一种基于属性关系图的二维子结构匹配算法 (VF算法),该算法运行时所需的存储空间较小,适合于处 理大批量数据。算法程序用Java语言实现,在NCI开放数据库中经过了3DFS程序的检验,并在已建立的化学结构数 据库中作为子结构检索的工具得到了应用

基于WWW的信息服务系统结构模式

介绍了基于WWW的Client/Server和Browser/Server信息服务系统的结构模式。Client/Server结构具有交互性强 ,安全 ,网络通讯量低 ,速度快等特点。Browser/Server结构是以Web技术发展起来的 ,具有系统开发和维护简单 ,对用户端几乎没有要求 ,界面友好 ,操作简单 ,适于网络信息发布等特点。分析认为 ,Browser/Server结构是WWW信息服务系统结构模式的发展趋势

化学结构二维子结构检索的开发

将图形通用匹配VF算法应用到化学结构子结构检索中，用面向对象的方法，实现了化学结构数据库中二维子结构检索功能，程序各模块之间相互独立、可移植性强、健壮性好．通过与3DFS比较，结果正确，适于处理大型化学结构数据库，现已应用于中药数据库系统药物先导化合物的发现

药物设计中的三维结构搜索方法

利用分子的三维特征，在三维结构数据库中进行三维结构搜索的方法是一种发现先导化合物的快捷而有效的方法，已经得到了广泛的重视。本文综述了三维结构搜索方法的原理、发展及其近年来在药物分子设计中的应用

基于药效团的三维数据库搜索

用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的药效团作为提问结构在三维数据库中进行了搜索．从得到的命中结构中挑选了12个化合物用柔性受体模型方法对其活性进行了预测，发现有2个化合物具有一定的预测活性．这2个化合物可能具有酪氨酸激酶抑制剂的活性，可能作为先导化合物进行结构优化

VF算法在化学结构检索中的应用

实现了一种基于属性关系图的二维子结构匹配算法 (VF算法),该算法运行时所需的存储空间较小,适合于处 理大批量数据。算法程序用Java语言实现,在NCI开放数据库中经过了3DFS程序的检验,并在已建立的化学结构数 据库中作为子结构检索的工具得到了应用

JSP技术在化学结构检索系统中的应用

讨论了如何使用JSP技术设计和开发基于Web的化学结构检索系统.JSP是一种与平台无关的、有效的创建动态页面的技术,本文使用JSP技术建立了分子结构检索系统,通过Oracle数据库内部的Java存储过程实现了子结构匹配的功能,最后,系统还提供了图形化的二维结构输入界面和显示界面

基于药效团的三维数据库搜索

用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的药效团作为提问结构在三维数据库中进行了搜索．从得到的命中结构中挑选了12个化合物用柔性受体模型方法对其活性进行了预测，发现有2个化合物具有一定的预测活性．这2个化合物可能具有酪氨酸激酶抑制剂的活性，可能作为先导化合物进行结构优化

柔性构象搜索:遗传算法与POWELL优化法的比较

在三维结构搜索中采用何种算法作构象搜索对系统的搜索速度和命中率有极大的影响。本文在自行研制的三维结构搜索系统３ＤＦＳ的基础上对遗传算法和ＰＯＷＥＬＬ法的构象搜索能力进行了比较。五个典型药效团的搜索结果表明，两种算法在速度和优化能力上各有优势，应视系统的要求区别使用