Categorical Abstract Rewriting Systems and Functoriality of Graph Transformation

Rewriting systems are often defined as binary relations over a given set of objects. This simple definition is used to describe various properties of rewriting such as termination, confluence, normal forms etc. In this paper, we introduce a new notion of abstract rewriting in the framework of categories. Then, we define the functoriality property of rewriting systems. This property is sometimes called vertical composition. We show that most of graph transformation systems are functorial and provide a counter-example of graph transformation systems which is not functorial

Les traductions françaises d’Isidore de Séville au Moyen Âge

Despite its impressive fortune in Latin, the work of Isidore of Seville was only rarely translated in medieval French. This article intends to identify and describe briefly all the French translations : two of the Synonyma and a French version of the Monita (a centon of the Synonyma) as well as a translation of the Chronicle.Malgré son impressionnante fortune latine, l’œuvre d’Isidore de Séville n’a fait l’objet que de très rares traductions en français médiéval. Cet article entend toutes les recenser. Il présente rapidement deux traductions des Synonyma et une version française des Monita (un centon des Synonyma) ainsi qu’une traduction de la Chronique

Le Miroir des classiques

Catalogue informatisé des traductions médiévales en français et en occitan des auteurs classiques, le Miroir des classiques a commencé à paraître sur le site de l’École des chartes, en mars 2007, dans la collection de publications électroniques Elec . Il est rédigé par Frédéric Duval et Françoise Vielliard. Sont présentées, sous le titre de chaque ouvrage traduit, les différentes traductions dans leur ordre chronologique ainsi que leurs remaniements éventuels. Pour chaque traduction, caractér..

Comment interpréter les anachronismes ? Le cas de l’histoire romaine écrite en français au début du xiiie siècle

Si l’anachronisme suscite des prises de position contrastées chez les historiens contemporains, son étude dans les textes médiévaux traitant de l’Antiquité a donné lieu à des conclusions franchement contraires : les érudits ne s’accordent ni sur leur identification ni sur leur analyse. S’appuyant sur des histoires romaines rédigées en français dans la première moitié du xiiie siècle, cet article est avant tout méthodologique. Il voudrait prolonger les réflexions engagées par A. Petit en tirant parti de principes herméneutiques qui conduisent à reconsidérer les facteurs d’anachronisme et à prendre plus nettement en considération les contraintes linguistiques.If anachronism has given rise to contrasted stands among contemporary historians, its study in medieval texts dealing with Antiquity has resulted in starkly opposite conclusions: scholars do not agree either on their identification or on their analysis. Relying on Roman histories written in French in the early half of the XIIIth century, this article is first and foremost methodological. It aims at carrying forward the reflections engaged by A.Petit, by taking advantage of the hermeneutical principles that lead one to reconsider the factors of anachronism and to take the linguistic constraints more strictly into consideration

Le Livre des commentaires Cesar sur le fait des batailles de Gaule par Robert Gaguin (1485)

Ce n’est pas tant la figure de César que la réception française du De bello Gallico à la fin du XVe siècle et au début du XVIe siècle qui nous retiendra. La France a joué un rôle considérable dans la tradition manuscrite des Commentaires puisque l’on en conserve encore aujourd’hui trois manuscrits copiés au IXe siècle dans le royaume. Ce texte occupait déjà une place à part dans l’historiographie française. Les exploits de César rapportés par Suétone et surtout par Lucain, dont la Pharsale ét..

Rôle de la voie de signalisation Notch dans la réponse lymphocytaire T CD8 suite à une infection aiguë ou chronique

Lors d’une infection, les lymphocytes T (LT) CD8 naïfs entre dans une phase de prolifération rapide durant laquelle ils se différencient en LT effecteurs (LTe) capables d’éliminer l’agent infectieux par activité cytolytique directe ou par la production de cytokines. Au pic de la réponse, il existe deux sous-populations de LT effecteurs : d’une part, les SLEC pour «short lived effector cells» (CD127faibleKLRG1fortT-betfortEOMESfaible) qui meurent par apoptose suite à l’élimination du pathogène et d’autre part, les MPEC pour «memory precursor effector cells» (CD127fortKLRG1faibleT-betfaibleEOMESfort) dont certains survivent et se différencier au cours du temps en LT CD8 mémoires (LTm) qui nous protége alors contre une seconde infection par le même pathogène. Toutefois, les mécanismes moléculaires permettant l’établissement d’une mémoire immunitaire fonctionnelle à long terme sont encore méconnus. De plus, dans le cas d’infection chronique ou de cancer, la persistance de l’antigène (Ag) et de l’inflammation conduisent à un gain d’expression de récepteurs inhibiteurs (RI) (PD-1, Lag-3, 2B4, etc.) à la surface des LTe provoquant une perte progressive de leur fonctionnalité (production de cytokines et cytotoxicité), les empêchant ainsi de se différencier en LT CD8 mémoires. Toutefois, il est possible de les revigorer par un traitement inhibant l’interaction entre les RI et leurs ligands. Lors d’une infection chronique, il existe deux sous-populations de LT CD8 épuisés, les progéniteurs (PD-1intT-Betfort) qui ont gardé certaines fonctions effectrices et qui peuvent donner naissance, en se divisant, aux LT CD8 épuisés de façon terminale (PD-1fortTBetfaible). Seules les cellules exprimant un niveau intermédiaire de PD-1 peuvent être revigorées. Ainsi, mieux comprendre les mécanismes moléculaires à l’origine de la différenciation des LT CD8 à la suite d’une réponse immunitaire aiguë ou chronique pourrait permettre 1) d’améliorer les stratégies de vaccinations actuelles pour générer plus de LTm CD8 fonctionnels à longue durée de vie, et 2) empêcher ou diminuer l’état d’épuisement des LT dans le cas d’infection chronique ou de cancer. Nous avons émis l’hypothèse que la voie de signalisation Notch contrôle la différenciation des LT CD8 suite à une infection aiguë ou lors d’une infection chronique. Des souris sauvages ou déficientes pour Notch ont été soit vaccinées, soit infectées avec la bactérie intracellulaire Listeria monocytogenes (Lm-OVA) ou encore infectée avec la souche clone13 du virus de la chorioméningite lymphocytaire qui établit une infection chronique chez la souris. Suite à une réponse lymphocytaire CD8 aiguë, l’absence de la voie de signalisation Notch provoque une baisse de la production de cytokines, une diminution de la génération des SLEC associée à une plus faible expression de CD25 sans toutefois affecter la génération des LTm. De plus, la diminution de la génération de SLEC n’est pas le résultat d’un défaut d’expression des facteurs de transcription T-bet, EOMES ou Blimp-1. Enfin, la surexpression de la molécule CD25 dans les LTe déficients pour Notch ne permet pas de restaurer la génération de SLEC. Tous ces résultats suggèrent que la voie de signalisation Notch contrôle la génération de SLEC par la régulation de l’expression d’un régulateur transcriptionnel essentiel à la génération des SLEC encore inconnu. Une autre explication pourrait être que cette voie collabore au promoteur de gènes cibles avec les facteurs de transcription connus pour être essentiels à la génération de SLEC. Suite à une infection chronique, nous avons démontré que l’absence de la voie de signalisation Notch corrèle avec une augmentation des niveaux d’expression de récepteurs inhibiteurs PD-1 et Lag-3. Ce phénotype est associé à une diminution de l’expression de cytokines 15 et 30 jours post-infection. De plus, les LT CD8 épuisés déficients pour Notch se différencient préférentiellement de façon terminale, ce qui conduit à une augmentation de la charge virale 30 jours post-infection. En conséquence, les LT CD8 déficients pour la voie de signalisation Notch ne peuvent être revigorés par un traitement bloquant la voie de PD-1. En conclusion, nous avons découvert que la voie de signalisation Notch est un acteur essentiel à la différenciation des LT CD8 que cela soit à la suite d’une infection aiguë ou d’une infection chronique. Cette voie permet la différenciation terminale en SLEC des LT CD8 suite à une infection aiguë alors qu’elle protège les LT CD8 lors d’infection chronique.Following an infection, naïve CD8 T cells expand and differentiate into effectors able to eliminate the pathogen by direct cytolysis or by cytokine production. At the peak of the response, two populations of effectors are distinguishable: short-lived effector cells (SLECs) (CD127lowKLRG1highT-bethighEOMESlow) meant to die by apoptosis and memory precursor effector cells (MPECs) (CD127highKLRGlowT-betlowEOMEShigh) destined to survive as memory cells that will confer long-term protection. Thus, following activation, the CD8 T cell faces a binary cell fate decision. Furthermore, following cancer or chronic infection, persistence of antigen and sustained inflammation direct the effector to differentiate into an exhausted state. As the chronic infection progresses, CD8 T cells gain expression of inhibitory receptors leading to a progressive loss of their functionality and fail to differentiate into memory CD8 T cells. In-vivo blockade of the inhibitory receptors PD-1 during chronic infection or during cancer lead to gain of function of CD8 T cells and decreased viral load or tumor burden revealing a crucial role for this receptor in CD8 T cell exhaustion. Two subpopulations of exhausted CD8 T cells exist: the progenitor subset, which expresses low level of PD1, those cells maintain residual proliferative capacity and are still able to produce some cytokines such as IFN-gamma and TNF-alpha. The other subset corresponds to the terminally differentiated subset that coexpresses PD-1 along with another IR like CD160 and Lag-3. However, PD-1/PDL1 blockade will only reinvigorate cells expressing intermediate level of PD-1 (PD-1int). Thereby, a better understanding of the molecular mechanism by which CD8 T cell differentiates following acute or chronic infection will allow to 1) improve actual and future vaccination strategies to generate large numbers of highly functional memory CD8 T cells and 2) to counteract the exhausted phenotype of CD8 T cells following chronic infection or cancer. In CD8 T cell, it was known that Notch directly controls the expression of cytokines as interferon-gamma (IFN-g) and effector molecules as granzyme B (GrzmB) but also controls the expression of the transcription factors T-bet and EOMES. However, those transcription factors are known to be important for SLEC/MPEC differentiation. Indeed, T-bet is essential for SLEC generations while EOMES is highly expressed in MPEC. Moreover, T-bet expression support the differentiation of progenitors while EOMES defines terminally differentiated CD8 T cell following chronic infection. We hypothesized that the Notch signaling pathway controls CD8 T cell differentiation following acute or chronic infection. Thereby, we used mice in which only mature CD8 T cells are deficient for Notch1 and Notch2. As, Notch3 and Notch4 are not expressed in CD8 T cells, this allows us to study the role of this pathway. Those mice were either vaccinated with OVApulsed dendritic cells or were acutely infected with Listeria monocytogenes expressing OVA (Lm-OVA) or were chronically infected with lymphocytic choriomeningitis virus (LCMVcl13). Following infection with Listeria monocytogenes (Lm) or vaccination with antigenpulsed dendritic cells, Notch deficiency induced a decrease in cytokines production but also a decreased SLEC generation along with a weaker expression of CD25, the high affinity chain of the IL-2 receptor without impairing memory generations. This defective SLEC generation is not due to a decreased expression of the transcription factors T-bet, EOMES or BLIMP-1. However, restoration of CD25 in Notch deficient T cells did not correct SLEC differentiation. These results suggest either that Notch regulates the expression of new players involved in SLEC differentiation or Notch signalling collaborates with already known actors of SLEC differentiation such as T-bet or Blimp-1. Following a chronic infection with LCMVcl13, Notch-deficient virus-specific CD8 T cells express higher levels of IRs and produce less cytokines and granzyme B when compared to Notch-sufficient CD8 T cells at days 15 and 30 post-infection. Moreover, Notch-deficient effectors preferentially differentiate into the terminal-progeny subset at the expense of the progenitor subset. As of consequence, Notch-deficient exhausted CD8 T cells cannot be reinvigorated following PD-1/PDL-1 blockade and cannot properly control viral load. In conclusion, we uncover a new role for the Notch signaling pathway controlling CD8 T cell differentiation following acute or chronic infection. This pathway controls SLEC generation following vaccination or acute infection while protecting CD8 T cell from exhaustion following a chronic infection

Le Miroir des classiques

Catalogue informatisé des traductions médiévales en français et en occitan des auteurs classiques, le Miroir des classiques a commencé à paraître sur le site de l’École des chartes, en mars 2007, dans la collection de publications électroniques Elec . Il est rédigé par Frédéric Duval et Françoise Vielliard. Sont présentées, sous le titre de chaque ouvrage traduit, les différentes traductions dans leur ordre chronologique ainsi que leurs remaniements éventuels. Pour chaque traduction, caractér..