Chronic hepatitis C virus infection: Serum biomarkers in predicting liver damage

Currently, a major clinical challenge in the management of the increasing number of hepatitis C virus (HCV) infected patients is determining the best means for evaluating liver impairment. Prognosis and treatment of chronic hepatitis C (CHC) are partly dependent on the assessment of histological activity, namely cell necrosis and inflammation, and the degree of liver fibrosis. These parameters can be provided by liver biopsy; however, in addition to the risks related to an invasive procedure, liver biopsy has been associated with sampling error mostly due to suboptimal biopsy size. To avoid these pitfalls, several markers have been proposed as non-invasive alternatives for the diagnosis of liver damage. Distinct approaches among the currently available non-invasive methods are (1) the physical ones based on imaging techniques; and (2) the biological ones based on serum biomarkers. In this review, we discuss these approaches with special focus on currently available non-invasive serum markers. We will discuss: (1) class I serum biomarkers individually and as combined panels, particularly those that mirror the metabolism of liver extracellular matrix turnover and/or fibrogenic cell changes; (2) class II biomarkers that are indirect serum markers and are based on the evaluation of common functional alterations in the liver; and (3) biomarkers of liver cell death, since hepatocyte apoptosis plays a significant role in the pathogenesis of HCV infection. We highlight in this review the evidence behind the use of these markers and assess the diagnostic accuracy as well as advantages, limitations, and application in clinical practice of each test for predicting liver damage in CHC.Fil: Valva, Pamela. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rios, Daniela Alejandra. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentin

Changes in EBV Association Pattern in Pediatric Classic Hodgkin Lymphoma From a Single Institution in Argentina

In classic Hodgkin lymphoma (cHL), Epstein Barr virus (EBV) association varies worldwide. Aims: Our aim was to analyze EBV association with pediatric cHL for the last 28 years. Methods: EBV presence was evaluated by EBERs in situ hybridization and LMP1 immunohistochemistry. Results: Until 2008, we found in pediatric cHL a similar percentage of EBV presence to those observed in adult cHL from developed populations. Nevertheless, in the last 8 years, an unexpected difference in cHL EBV association was proven, along with a slight bias of EBV association with the nodular sclerosis (NS) subtype. Concerning histological subtype distribution, even though MC still prevailed in the whole series, those cases diagnosed as NS showed a sustained rise from 1989 until today. Conclusion: Variations of EBV association of cHL related to geography, age, ethnicity, and histological type have been largely described when compared with different world regions, but interestingly, this single-center revised series brought to light the dynamic process behind the evolution of this relationship over time.Fil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: García Lombardi, Mercedes. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentin

Analysis of Epstein-Barr virus infection models in a series of pediatric carriers from a developing country

Epstein-Barr virus (EBV) is a B lymphotropic human herpesvirus. Two models, germinal center (GC)and direct infection, describe how EBV infects B-cells. Since in Argentina primary infection is mostly subclinical at young ages, children represent an interesting population where to analyze EBV infection, especially considering that most studies are usually performed in adults. Tonsil biopsies from pediatriccarriers were studied to describe infection characteristics. EBV+ lymphocytes at the interfollicular region were mainly observed. Latency III pattern in subepithelial (SubEp) lymphocytes was observed at young ages, probably indicating a recent infection. In older patients EBV was mostly detected in epithelial cells, suggesting that they could have been infected some time ago. This finding was sustained by tonsillar viral load, which was higher in cases with LMP1+SubEp cells vs. LMP1+nonSubEp cells (p = 0.0237, Mann-Whiney test). Latency III was prevalent and related to the GC, while latency II was associated with non-GC (p = 0.0159, χ2 test). EBERs+/IgD+ cells were statistically prevalent over EBERs+/CD27+ cells (p = 0.0021, χ2 test). These findings indicated that both EBV infection models arenot mutually exclusive and provide some basis for further understanding of EBV infection dynamics. Moreover, we provide a more accurate explanation of EBV infection in pediatric asymptomatic carriers from a developing country.Fil: Vistarop, Aldana Georgina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Cohen, Melina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; ArgentinaFil: Chabay, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez". Servicio de Anatomía Patológica; Argentin

Differences in Epstein-Barr virus characteristics and viral-related microenvironment could be responsible for Lymphomagenesis in children

In Argentina, Epstein-Barr virus (EBV) presence is associated with Hodgkin lymphoma (HL) in patients younger than 10 years, suggesting a relationship between low age of EBV infection and HL. Given that HL is derived from germinal centers (GC), our aim was to compare EBV protein expression and microenvironment markers between pediatric HL patients and EBV+GC in children. Methods: EBV presence and immune cell markers were assessed by in situ hybridization and immunohistochemistry (IHC). Results: Viral latency II pattern was proved in all HL patients and in 81.8% of EBV+ tonsillar GCs. LMP1 and LMP2 co-expression were proved in 45.7% HL cases, but only in 7.7% EBV+ GC in pediatric tonsils. An increase in CD4+, IL10, and CD68+ cells was observed in EBV+ GC. In pediatric HL patients, only the mean of IL10+ cells was statistically higher in EBV+ HL. Conclusions: Our findings point us out to suggest that LMP1 expression may be sufficient to drive neoplastic transformation, that an immune regulatory milieu counteracts cytotoxic environment in EBV-associated Hodgkin lymphoma, and that CD4+ and CD68+ cells may be recruited to act in a local collaborative way to restrict, at least in part, viral-mediated lymphomagenesis in tonsillar GC.Fil: Vistarop, Aldana Georgina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Jimenez, Oscar Eduardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Cohen, Melina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentin

Distinctive EBV infection characteristics in children from a developing country

Background: In developing countries, Epstein–Barr virus (EBV) infection is mostly asymptomatic in early childhood. EBV persistence may lead to different malignancies, such as B cell derived lymphomas. In Argentina, most children are seropositive at three years and an increased association between EBV and lymphoma was proved in children under 10 years old by our group. Objective: Our aim was to characterize EBV infection at the site of entry and reactivation of viral infection —the tonsils— in order to better understand the mechanism of viral persistence in pediatric patients. Methods: A cohort of 54 patients was described. We assessed specific antibodies profiles in sera; viral proteins presence by IHC on FFPE samples and EBV type from fresh tissue. Results: EBV type 1 was prevalent, mostly in the youngest patients. Asymptomatic primary infected patients presented higher viral loads and Latency 0/I or II patterns, whereas the Latency III pattern was observed mostly in healthy carriers. There were no differences between groups in the expression of viral lytic antigens. This study discloses new features in patients undergoing primary infection from a developing population. Low viral inoculum and restricted viral antigen expression may be responsible for the lack of symptoms in children from our country.Fil: Ferressini Gerpe, Natalia Marina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Vistarop, Aldana Georgina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Moyano, Agustina Ayelén. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentin

M1-like macrophage polarization prevails in young children with classic Hodgkin Lymphoma from Argentina

The microenvironment in classical Hodgkin lymphoma (cHL) comprises a mixture of different types of cells, which are responsible for lymphoma pathogenesis and progression. Even though microenvironment composition in adult cHL has been largely studied, only few groups studied pediatric cHL, in which both Epstein Barr virus (EBV) infection and age may display a role in their pathogenesis. Furthermore, our group described that EBV is significantly associated with cHL in Argentina in patients under the age of 10 years old. For that reason, our aim was to describe the microenvironment composition in 46 pediatric cHL patients. M1-like polarization status prevailed in the whole series independently of EBV association. On the other hand, in children older than 10 years, a tolerogenic environment illustrated by higher FOXP3 expression was proved, accompanied by a macrophage polarization status towards M2. In contrast, in children younger than 10 years, M1-like was prevalent, along with an increase in cytotoxic GrB+ cells. This study supports the notion that pediatric cHL exhibits a particular tumor microenvironment composition.Fil: Jimenez, Oscar Eduardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Barros, M. H.. Unfallkrankenhaus Berlin; AlemaniaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Garcia Lombardi, M.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Niedobitek, G.. Unfallkrankenhaus Berlin; AlemaniaFil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentin

PD-1 and LAG-3 expression in EBV-associated pediatric Hodgkin lymphoma has influence on survival

In pediatric Hodgkin lymphoma (HL), the inability of the cytotoxic microenvironment induced by EBV presence to eliminate tumor cells could reflect the fact that the virus might be able to induce the expression of exhaustion markers to evade an immune response. Therefore, the expression of exhaustion markers in pediatric EBV–associated HL was evaluated. A balance between cytotoxic GrB and Th1 Tbet markers with regulatory Foxp3 was proved in EBV+ cases. In addition, exclusively in EBV-associated cHL, a correlation between PD-1 and LAG-3 expression was observed. Furthermore, those cases also displayed a trend to worse survival when they expressed LAG-3 and inferior event-free survival when both PD-1 and LAG-3 molecules were present. Therefore, even though a cytotoxic and inflammatory environment was supposed to be triggered by EBV presence in pediatric cHL, it seems that the virus may also induce the synergic effect of inhibitory molecules LAG-3 and PD-1 in this series. These observations may reflect the fact that the permissive and exhausted immune microenvironment succeeds to induce lymphomagenesis.Fil: Jimenez, Oscar Eduardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Mangiaterra, Tamara Soledad. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Colli, Sandra Lorena. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: García Lombardi, Mercedes. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentin

Epstein Barr virus in relation to apoptosis markers and patients' outcome in pediatric B-cell Non-Hodgkin lymphoma

In this study, we investigated Epstein Barr virus (EBV) presence, associated to proliferation and apoptosis proteins in pediatric B-cell Non-Hodgkin lymphoma (B-NHL). EBERs, Ki67, active caspase 3, Bax and Bcl2 were analyzed on B-NHL tissue from 40 patients. Forty percent showed EBV expression, significantly higher among patients ≤10. years (P= 0.027), and associated with immunosuppression (P= 0.020), but not associated apotosis markers. However, EBV was associated with a worse event-free survival (P= 0.016), particularly under immunosuppression. Even though EBV did not seem to alter apoptotic pathways, it exhibited survival disadvantage and could be an important cofactor in B-cell lymphomagenesis in younger children.Fil: Chabay, Paola Andrea. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lara, María Julia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Lorenzetti, Mario Alejandro. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Cambra, P.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Acosta Haab, G.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Aversa, L.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Molecular alterations in the integrated diagnosis of pediatric glial and glioneuronal tumors: A single center experience

Objectives: Tumors of the central nervous system (CNS) are the most common pediatric solid tumors, where low grade (LGG) and high grade gliomas (HGG) represent up to 55% of CNS tumors. Current molecular classification of these tumors results in a more accurate diagnosis and risk stratification, which ultimately enables individualized treatment strategies. Identifying known alterations is a suitable approach, particularly in developing countries, where NGS approaches are not easily accessible. We sought to assess molecular alterations in BRAF and histone 3 genes. Study design: FISH, IHC and Sanger sequencing were performed in a series of 102 pediatric glial and glioneuronal tumors. We also correlated these results with clinical and histological findings to evaluate their usefulness as diagnostic and/or prognostic tools. Results: We found that the KIAA1549-BRAF gene fusion was a relevant diagnostic tool for pilocytic astrocytoma, but not related to progression free survival (PFS) and overall survival (OS). BRAFV600E mutation was associated with a decreased OS in LGG, and with decreased PFS and OS among pilocytic astrocytomas. All HGG of the midline were H3K27M mutants, while H3G34R mutant cases were located in brain hemispheres. HGG harboring the H3K27M variant were associated with a decreased PFS and OS. Conclusions: Assessing druggable molecular markers with prognostic value is particularly important in those cases where complete resection or further radiation therapy is not possible. These potential diagnostic/prognostic markers may be suitable as further screening tests to reduce the requirement on NGS, which is not available in all laboratories. Furthermore, these results broaden data on BRAF and Histone 3 alterations in children from geographic regions, other than USA and Europe.Fil: Colli, Sandra Lorena. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Cardoso, Nazarena. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Massone, Carla Antonella. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Cores, María. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: García Lombardi, Mercedes. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Lorenzetti, Mario Alejandro. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentin

Comprehensive evolutionary analysis of complete Epstein Barr virus genomes from Argentina and other geographies

The sequence variability of the Epstein–Barr virus has been extensively studied throughout previous years in isolates from various geographic regions and consequent variations at both genetic and genomic levels have been described. However, isolates from South America were underrepre-sented in these studies. Here, we sequenced 15 complete EBV genomes that we analyzed together with publicly available raw NGS data for 199 EBV isolates from other parts of the globe by means of a custom-built bioinformatic pipeline. The phylogenetic relations of the genomes, the geographic structure and variability of the data set, and the evolution rates for the whole genome and each gene were assessed. The present work contributes to overcoming the scarcity of complete EBV genomes from South America and is the most comprehensive geography-related variability study, which involved determining the actual contribution of each EBV gene to the geographic segregation of the entire genome. Moreover, to the best of our knowledge, we established for the first time the evolution rate for the entire EBV genome based on a host–virus codivergence-independent assumption and assessed their evolution rates on a gene-by-gene basis, which were related to the encoded protein function. Considering the evolution of dsDNA viruses with a codivergence-independent approach may lay the basis for future research on EBV evolution. The exhaustive bioinformatic analysis performed on this new dataset allowed us to draw a novel set of conclusions regarding the genome evolution of EBV.Fil: Blazquez, Ana Catalina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Berenstein, Ariel José. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquimica. Instituto de Investigaciones En Bacteriologia y Virologia Molecular; ArgentinaFil: Izquierdo, Agustin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Fundación de Endocrinología Infantil. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada"; ArgentinaFil: Lezama, Carol. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Niños "Ricardo Gutiérrez"; ArgentinaFil: Moscatelli, Guillermo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: de Matteo, Elena Noemí. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Lorenzetti, Mario Alejandro. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; ArgentinaFil: Preciado, María Victoria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologías Pediátricas; Argentin