The earliest known Italian case of bilateral non-osseous calcaneonavicular coalition from the mediaeval cemetery of Troina (Enna, Sicily)

In this article, we detail a case of tarsal coalition in the osteological remains of an adult female individual from the mediaeval cemetery of the Catena district of Troina (Enna, Sicily). The burial that contains the skeleton described in this work (Burial 2) was subjected to a multidisciplinary analysis starting from the excavation on the field and ending with a full palaeopathological study including palaeoradiology and 3D virtual reconstructions. The obtained results contribute to our understanding of this congenital condition in the past and represent, to the best of our knowledge, the first case ever reported from Sicily and the Italian peninsula of bilateral non-osseous calcaneonavicular tarsal coalition

Calibration of Tethered Particle Motion Experiments

The Tethered Particle Motion (TPM) method has been used to observe and characterize a variety of protein-DNA interactions including DNA loping and transcription. TPM experiments exploit the Brownian motion of a DNA-tethered bead to probe biologically relevant conformational changes of the tether. In these experiments, a change in the extent of the bead’s random motion is used as a reporter of the underlying macromolecular dynamics and is often deemed sufficient for TPM analysis. However, a complete understanding of how the motion depends on the physical properties of the tethered particle complex would permit more quantitative and accurate evaluation of TPM data. For instance, such understanding can help extract details about a looped complex geometry (or multiple coexisting geometries) from TPM data. To better characterize the measurement capabilities of TPM experiments involving DNA tethers, we have carried out a detailed calibration of TPM magnitude as a function of DNA length and particle size. We also explore how experimental parameters such as acquisition time and exposure time affect the apparent motion of the tethered particle. We vary the DNA length from 200 bp to 2.6 kbp and consider particle diameters of 200, 490 and 970 nm. We also present a systematic comparison between measured particle excursions and theoretical expectations, which helps clarify both the experiments and models of DNA conformation

Effect of promoter architecture on the cell-to-cell variability in gene expression

According to recent experimental evidence, the architecture of a promoter, defined as the number, strength and regulatory role of the operators that control the promoter, plays a major role in determining the level of cell-to-cell variability in gene expression. These quantitative experiments call for a corresponding modeling effort that addresses the question of how changes in promoter architecture affect noise in gene expression in a systematic rather than case-by-case fashion. In this article, we make such a systematic investigation, based on a simple microscopic model of gene regulation that incorporates stochastic effects. In particular, we show how operator strength and operator multiplicity affect this variability. We examine different modes of transcription factor binding to complex promoters (cooperative, independent, simultaneous) and how each of these affects the level of variability in transcription product from cell-to-cell. We propose that direct comparison between in vivo single-cell experiments and theoretical predictions for the moments of the probability distribution of mRNA number per cell can discriminate between different kinetic models of gene regulation.Comment: 35 pages, 6 figures, Submitte

Lac repressor mediated DNA looping: Monte Carlo simulation of constrained DNA molecules complemented with current experimental results

Tethered particle motion (TPM) experiments can be used to detect time-resolved loop formation in a single DNA molecule by measuring changes in the length of a DNA tether. Interpretation of such experiments is greatly aided by computer simulations of DNA looping which allow one to analyze the structure of the looped DNA and estimate DNA-protein binding constants specific for the loop formation process. We here present a new Monte Carlo scheme for accurate simulation of DNA configurations subject to geometric constraints and apply this method to Lac repressor mediated DNA looping, comparing the simulation results with new experimental data obtained by the TPM technique. Our simulations, taking into account the details of attachment of DNA ends and fluctuations of the looped subsegment of the DNA, reveal the origin of the double-peaked distribution of RMS values observed by TPM experiments by showing that the average RMS value for anti-parallel loop types is smaller than that of parallel loop types. The simulations also reveal that the looping probabilities for the anti-parallel loop types are significantly higher than those of the parallel loop types, even for loops of length 600 and 900 base pairs, and that the correct proportion between the heights of the peaks in the distribution can only be attained when loops with flexible Lac repressor conformation are taken into account. Comparison of the in silico and in vitro results yields estimates for the dissociation constants characterizing the binding affinity between O1 and Oid DNA operators and the dimeric arms of the Lac repressor. © 2014 Biton et al

Zoque archaeological sweatbaths. New data from western Chiapas

The archaeological researches carried out by the Rio La Venta Archaeological Project in the Selva El Ocote, Chiapas, led to the discovery and excavation of various sweatbaths in Zoque sites dated between the Late Classic and the Late Postclassic; foremost among them, a Late-Terminal Classic rectangular monumental sweatbath located in the site of El Higo, almost identical to those previously excavated in the sites of San Antonio, Chiapas, and Malpasito, Tabasco, both of them associated to ballcourts. The three Late Classic monumental sweatbaths, belong to the same typology ascribable to a period of great cultural flourishing of Zoquean groups in Chiapas and Tabasco. This suggests that a specific modality of ballgame and associated ritual practices helped foster sociopolitical cohesion in the Zoquean cultural sphere. The new data regarding the Postclassic sweatbaths, circular in shape and at times associated to circular platforms, constitutes a first contribution to increase our knowledge of a still poorly understood phase of pre-Hispanic Zoquean cultural history. In this article we summarize the archaeological data on Zoque sweatbaths in order to provide a meaningful context for the findings of the Rio La Venta Archaeological Project in the Selva El Ocote, systematically described herein for the first time.Las excavaciones arqueológicas llevadas a cabo por el Proyecto Arqueológico Río La Venta en la Selva El Ocote, Chiapas, han permitido investigar varios baños de vapor en sitios zoques fechados entre el Clásico Tardío-Terminal y el Posclásico Tardío; entre ellos destaca un monumental baño de vapor rectangular del periodo Clásico Tardío-Terminal, ubicado en el centro del sitio arqueológico de El Higo. Este temazcal es casi idéntico a los previamente excavados en los sitios de San Antonio, Chiapas, y Malpasito, Tabasco, ambos asociados a juegos de pelota. Los tres baños de vapor monumentales del Clásico Tardío-Terminal pertenecen a una misma tipología relacionada con una fase de gran florecimiento cultural de los grupos zoqueanos de Chiapas y Tabasco. Sus características sugieren que una modalidad específica de juego de pelota, junto con los rituales asociados a ella, constituyó un fuerte elemento de cohesión sociopolítica de la esfera cultural zoqueana. Los datos relativos a los baños de vapor posclásicos, de forma circular y a veces asociados a plataformas también circulares, son un primer acercamiento a una fase tardía de la cultura zoque, aún poco conocida desde el punto de vista arqueológico. En el presente artículo se resumen, asimismo, los datos arqueológicos relativos a otros baños de vapor hallados en el área zoque, contextualizando así los hallazgos del Proyecto Arqueológico Río La Venta, que se describen en forma sistemática por primera vez

Settlement Patterns and Household Archaeology in Selva El Ocote (Chiapas, Mexico)

Surveys carried out in the Selva El Ocote (Chiapas, Mexico) by the Rio La Venta Archaeological Project led to the discovery of several archaeological sites ascribable to the local Zoque cultural tradition. In this article we compare the settlement patterns of the Late/Terminal Classic (ca. AD 600-1000) and Late Postclassic (ca. AD 1200-1500) periods, discussing both their common traits \u2013 partially due to the ecological constraints of the karstic region \u2013, as well as differences that we correlate with changes in the political landscape. Parallel changes are also detected in the use of urban space, as shown by extensive excavations carried out in the site of El Higo, where spaces that in the Classic period were devoted to public activities were transformed into residential areas during the Late Postclassic. The available evidence suggests that the Late/Terminal Classic settlement patterns reflect a complex polycentric and hierarchically articulated local political system where public activities functioned as integrating socio-political devices; on the other hand, the Late Postclassic settlement patterns reflect a system composed by of modular, semi-autonomous households loosely bound to a quite ephemeral central authority, with much less emphasis on the organization of public performances

Baños de vapor en sitios arqueológicos zoques. Nuevos datos desde el occidente de Chiapas

Las excavaciones arqueológicas llevadas a cabo por el Proyecto Arqueológico Río La Venta en la Selva El Ocote, Chiapas, han permitido investigar varios baños de vapor en sitios zoques fechados entre el Clásico Tardío-Terminal y el Posclásico Tardío; entre ellos destaca un monumental baño de vapor rectangular del periodo Clásico Tardío-Terminal, ubicado en el centro del sitio arqueológico de El Higo. Este temazcal es casi idéntico a los previamente excavados en los sitios de San Antonio, Chiapas, y Malpasito, Tabasco, ambos asociados a juegos de pelota. Los tres baños de vapor monumentales del Clásico Tardío-Terminal pertenecen a una misma tipología relacionada con una fase de gran florecimiento cultural de los grupos zoqueanos de Chiapas y Tabasco. Sus características sugieren que una modalidad específica de juego de pelota, junto con los rituales asociados a ella, constituyó un fuerte elemento de cohesión sociopolítica de la esfera cultural zoqueana. Los datos relativos a los baños de vapor posclásicos, de forma circular y a veces asociados a plataformas también circulares, son un primer acercamiento a una fase tardía de la cultura zoque, aún poco conocida desde el punto de vista arqueológico. En el presente artículo se resumen, asimismo, los datos arqueológicos relativos a otros baños de vapor hallados en el área zoque, contextualizando así los hallazgos del Proyecto Arqueológico Río La Venta, que se describen en forma sistemática por primera vez

INFLUENZA DI TRATTAMENTI OMEOPATICI E DI CAMPI ELETTROMAGNETICI DEBOLI A BASSA FREQUENZA SU MODELLI VEGETALI

L\u2019efficacia dell\u2019omeopatia \ue8 tuttora oggetto di acceso dibattito e, nonostante le numerose ipotesi formulate, il suo meccanismo d\u2019azione non \ue8 ancora stato totalmente chiarito e non esiste una teoria comunemente accettata. Situazione analoga si riscontra per quanto riguarda gli effetti biologici dei campi elettromagnetici deboli a bassa frequenza. Tali effetti, che dipendono in modo complesso dalla intensit\ue0 e frequenza del campo magnetico e dalla durata del trattamento, sono stati ampiamente studiati sull\u2019uomo e sugli animali e, negli ultimi anni e in misura sicuramente minore, sulle piante. Anche in questo caso sono state formulate numerose ipotesi per spiegare l\u2019interazione di tali campi con il bio-oggetto, ma finora non si hanno risposte certe. Omeopatia ed elettromagnetismo potrebbero essere interpretate, alla luce del relativamente recente paradigma fisico quanto-elettrodinamico, come due facce della stessa moneta spendibile per soddisfare, in chiave sia teorica che sperimentale, le esigenze di complesse dinamiche biologiche in cerca di una propria riconoscibile e specifica identit\ue0. A tal proposito, i nostri campioni sono stati anche valutati geneticamente. Una migliore comprensione del meccanismo d\u2019azione sia dei medicinali omeopatici che dei campi elettromagnetici deboli potrebbe essere raggiunta grazie all\u2019uso di modelli in vitro e in vivo nei quali la correlazione trattamento/effetto \ue8 pi\uf9 diretta e quindi pi\uf9 facilmente interpretabile. Tra questi, i modelli vegetali presentano numerosi vantaggi come l\u2019assenza di effetto placebo e di problemi etici, l\u2019impiego di materiale biologico economico e pressoch\ue9 inesauribile, la possibilit\ue0 di condurre un elevato numero di prove in tempi ragionevolmente brevi e di poter quindi disporre di un\u2019ampia base di dati per un\u2019approfondita analisi statistica. Scopo della nostra ricerca \ue8: i) fornire un contributo sperimentale per la valutazione degli effetti biologici delle alte diluizioni omeopatiche e di trattamenti elettromagnetici, mediante esperimenti standardizzati basati su modelli vegetali; ii) identificare un\u2019eventuale similarit\ue0 tra gli effetti biologici della potentizzazione omeopatica e dell\u2019esposizione elettromagnetica. In particolare sono stati studiati un modello di germinazione in vitro del polline (Betti et al, Bioelectromagnetics, 2010, submitted) e un modello fitopatologico rappresentato dall\u2019interazione tabacco/virus del mosaico del tabacco (Betti et al, Homeopathy, 2003; Trebbi et al, Bioelectromagnetics, 2007)

INFLUENZA DI TRATTAMENTI OMEOPATICI E DI CAMPI ELETTROMAGNETICI DEBOLI A BASSA FREQUENZA SU MODELLI VEGETALI

L’efficacia dell’omeopatia è tuttora oggetto di acceso dibattito e, nonostante le numerose ipotesi formulate, il suo meccanismo d’azione non è ancora stato totalmente chiarito e non esiste una teoria comunemente accettata. Situazione analoga si riscontra per quanto riguarda gli effetti biologici dei campi elettromagnetici deboli a bassa frequenza. Tali effetti, che dipendono in modo complesso dalla intensità e frequenza del campo magnetico e dalla durata del trattamento, sono stati ampiamente studiati sull’uomo e sugli animali e, negli ultimi anni e in misura sicuramente minore, sulle piante. Anche in questo caso sono state formulate numerose ipotesi per spiegare l’interazione di tali campi con il bio-oggetto, ma finora non si hanno risposte certe. Omeopatia ed elettromagnetismo potrebbero essere interpretate, alla luce del relativamente recente paradigma fisico quanto-elettrodinamico, come due facce della stessa moneta spendibile per soddisfare, in chiave sia teorica che sperimentale, le esigenze di complesse dinamiche biologiche in cerca di una propria riconoscibile e specifica identità. A tal proposito, i nostri campioni sono stati anche valutati geneticamente. Una migliore comprensione del meccanismo d’azione sia dei medicinali omeopatici che dei campi elettromagnetici deboli potrebbe essere raggiunta grazie all’uso di modelli in vitro e in vivo nei quali la correlazione trattamento/effetto è più diretta e quindi più facilmente interpretabile. Tra questi, i modelli vegetali presentano numerosi vantaggi come l’assenza di effetto placebo e di problemi etici, l’impiego di materiale biologico economico e pressoché inesauribile, la possibilità di condurre un elevato numero di prove in tempi ragionevolmente brevi e di poter quindi disporre di un’ampia base di dati per un’approfondita analisi statistica. Scopo della nostra ricerca è: i) fornire un contributo sperimentale per la valutazione degli effetti biologici delle alte diluizioni omeopatiche e di trattamenti elettromagnetici, mediante esperimenti standardizzati basati su modelli vegetali; ii) identificare un’eventuale similarità tra gli effetti biologici della potentizzazione omeopatica e dell’esposizione elettromagnetica. In particolare sono stati studiati un modello di germinazione in vitro del polline (Betti et al, Bioelectromagnetics, 2010, submitted) e un modello fitopatologico rappresentato dall’interazione tabacco/virus del mosaico del tabacco (Betti et al, Homeopathy, 2003; Trebbi et al, Bioelectromagnetics, 2007)

L'abusivismo commerciale da parte dei cittadini immigrati a Rimini

Si tratta di una ricerca con rilevazione diretta (condotta dalla scrivente con Latella), che da un lato si confronta con i precedenti di ricerca (Catanzaro-Nelken) del 1996-1997 e, dall'altro, con i mutamenti della situazione in atto. Tra i principale risultati di carattere anche teorico il passaggio dall'attenzione privilegiata alle "economie etniche" all'attenzione posta piuttosto sui "processi migratori", che coinvolgono in percorsi simili i provenienti da diversi paesi e aree geografiche. In questa chiave, la scrivente ha approfondito la realt\ue0 e le politiche pubbliche relative agli street vendors in diversi paesi di partenza. I documenti di ricerca sono resi disponibili dal Comune di Rimini all'indirizzo: http://www.comune.rimini.it/eventi/pagina6045.html#inizio_contenut