Self-collected saliva for SARS-CoV-2 detection: A prospective study in the emergency room

Current diagnostic standards involve severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) detection in nasopharyngeal swabs (NPS), but saliva is an attractive and noninvasive option for diagnosis. The objectives were to determine the performance of saliva in comparison with NPS for detecting SARS-CoV-2 and to compare the optimized home brew reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) with a commercial RT-PCR. Paired NPS and saliva specimens were prospectively collected and tested by RT-PCR from patients presenting at an emergency room with signs and symptoms compatible with coronavirus disease-2019. A total of 348 samples from 174 patients were tested by RT-PCR assays. Among 174 patients with symptoms, 63 (36%) were SARS-CoV-2 positive in NPS using the optimized home-brew PCR. Of these 63 patients, 61 (98%) were also positive in saliva. An additional positive SARS-CoV-2 saliva was detected in a patient with pneumonia. Kappa Cohen´s coefficient agreement between NPS and saliva was 0.96 (95% confidence interval [CI], 0.90?0.99). Median Ct values in NPS versus saliva were 18.88 (interquartile range [IQR], 15.60?23.58; range, 11.97?38.10) versus 26.10 (IQR, 22.75?30.06; range, 13.78?39.22), respectively (p <.0001). The optimized home-brew RT-PCR demonstrated higher analytical and clinical sensitivity compared with the commercial RT-PCR assay. A high sensitivity (98%) and agreement (kappa 0.96) in saliva samples compared to NPS was demonstrated when using an optimized home-brew PCR even when the viral load in saliva was lower than in NPS. This noninvasive sample is easy to collect, requires less consumable and avoids discomfort to patients. Importantly, self-collection of saliva can diminish exposure to healthcare personnel.Fil: Echavarría, Marcela Silvia. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Reyes, Noelia Soledad. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Rodriguez, Pamela Elizabeth. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Ypas, Martin. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Ricarte, Joaquina Carmen. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rodriguez, María P.. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Pérez, Matías Gastón. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Seoane, Alejandro. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Martinez, Alfredo. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Videla, Cristina Mónica. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Stryjewski, Martin E.. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Carballal, Guadalupe. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Saliva screening of health care workers for SARS-CoV-2 detection

El personal de salud (PS) tiene un alto riesgo de contraer SARS-CoV-2. La transmisión presintomática/asintomática representa alrededor de la mitad de los casos y el análisis a partir de muestras de saliva puede ser una opción para detectar la infección. Para determinar el rendimiento de estas muestras, 100 voluntarios del PS se sometieron a la detección de SARS-CoV-2 por RT-PCR en muestras de saliva en el período septiembre-octubre de 2020. De aquellos con resultado positivo en saliva, se tomaron hisopados nasofaríngeos para detectar ARN viral y muestras de suero para evaluar anticuerpos específicos. Se detectó ARN viral en la saliva de seis individuos (6%). De ellos, 5/6 fueron SARS-CoV-2 positivos en hisopado nasofaríngeo y 4/6 desarrollaron signos y síntomas compatibles con COVID-19. Entre estos últimos, tres seroconvirtieron, en tanto que los voluntarios asintomáticos permanecieron seronegativos. La muestra de saliva fue útil para identificar la infección por SARS-CoV-2 en esta cohorte del personal de salud y así proceder al rápido aislamiento de los individuos infectados, lo que evitó una mayor transmisión del virus en el ámbito hospitalario.Health care workers (HCWs) are at high risk for SARS-CoV-2. In addition, pre-symptomatic or asymptomatic transmission accounts for around half of the cases. Saliva testing is an option to detect SARS-CoV-2 infection. To determine the performance of saliva samples for screening, HCWs were tested for SARS-CoV-2 by RT-PCR. Those with a positive result in saliva were tested by nasopharyngeal swabbing for viral RNA detection and blood collection to search for the presence of specific antibodies. In September–October 2020, 100 HCWs were enrolled and followed up. Six subjects (6%) tested positive in saliva. Of them, 5/6 were positive in a subsequent nasopharyngeal swab and 4/6 developed signs and symptoms compatible with COVID-19. Among the latter, 3 seroconverted while asymptomatic HCWs remained seronegative. Saliva screening was helpful for identifying SARS-CoV-2 infection in HCWs. This screening permitted rapid personnel isolation avoiding further transmission of the virus in the hospital setting.Fil: Echavarría, Marcela Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; ArgentinaFil: Reyes, Noelia Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; ArgentinaFil: Rodriguez, Pamela Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; ArgentinaFil: Ricarte, Joaquina Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; ArgentinaFil: Ypas, Martin. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Seoane, Alejandro. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Querci, Marcia. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Brizio, Marianela. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Stryjewski, Martin. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Carballal, Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentin