An effective rotational mating scheme for inbreeding reduction in captive populations illustrated by the rare sheep breed

Within breeds and other captive populations, the risk of high inbreeding rates and loss of diversity can be high within (small) herds or subpopulations. When exchange of animals between different subpopulations is organised according to a rotational mating scheme, inbreeding rates can be restricted. Two such schemes, a breeding circle and a maximum avoidance of inbreeding scheme, are compared. In a breeding circle, flocks are organised in a circle where each flock serves as a donor flock for another flock, and the same donor–recipient combination is used in each breeding season. In the maximum inbreeding avoidance scheme, donor¿recipient combinations change each year so that the use of the same combination is postponed as long as possible. Data from the Kempisch Heideschaap were used with computer simulations to determine the long-term effects of different breeding schemes. Without exchanging rams between flocks, high inbreeding rates (>1.5% per year) occurred. Both rotational mating schemes reduced inbreeding rates to on average 0.16% per year and variation across flocks in inbreeding rates, caused by differences in flock size, almost disappeared. Inbreeding rates with maximum inbreeding avoidance were more variable than with a breeding circle. Moreover, a breeding circle is easier to implement and operate. Breeding circles are thus efficient and flexible and can also be efficient for other captive populations, such as zoo populations of endangered wild specie

Perspectives of genomics for genetic conservation of livestock

Genomics provides new opportunities for conservation genetics. Conservation genetics in livestock is based on estimating diversity by pedigree relatedness and managing diversity by choosing those animals that maximize genetic diversity. Animals can be chosen as parents for the next generation, as donors of material to a gene bank, or as breeds for targeting conservation efforts. Genomics provides opportunities to estimate diversity for specific parts of the genome, such as neutral and adaptive diversity and genetic diversity underlying specific traits. This enables us to choose candidates for conservation based on specific genetic diversity (e.g. diversity of traits or adaptive diversity) or to monitor the loss of diversity without conservation. In wild animals direct genetic management, by choosing candidates for conservation as in livestock, is generally not practiced. With dense marker maps opportunities exist for monitoring relatedness and genetic diversity in wild populations, thus enabling a more active management of diversity

Hoornloze koeien in aantocht

Hoornloosheid komt bij enkele koeienrassen voor. Om het in de huidige melkkoe in te fokken, zou een fokprogramma hulp kunnen bieden. De veehouderij vindt gebruik van zo'n programma prima, de gemiddelde burger is daar wat terughoudender in en ook meer verdeeld

Selection for scrapie resistance decreased inbreeding rates in two rare sheep breeds in the Netherlands

An attempt to balance selection intensity and conservation of genetic diversity was made in the national program for breeding for scrapie resistance in the Netherlands. The ARR allele is associated with resistance to scrapie. In the Netherlands a breeding program was started on a voluntary basis in 2001 and starting 2004 the use of ARR/ARR rams was obligatory. In some rare breeds there were so few ARR/ARR rams that the risk of high inbreeding and associated loss of genetic diversity would be unacceptably high. Based on computer simulations predicting the inbreeding rates for several breeds exemptions on the obligatory breeding program were allowed. In this paper the ARR frequencies and associated inbreeding rates are analyzed as an indication of loss in genetic diversity during the years of scrapie selection in two breeds: the “Zwartbles schaap” (Black-blazed sheep) and the “Melkschaap” (Friesian-Zealand Milksheep)

Selectie tegen gevoeligheid voor scrapie met behoud van genetische variatie = Selection against scrapie susceptibility while maintaining within breed genetic variation

National legislation to breed for scrapie resistence was changed in 2007. The obligatory use of ARR/ARR rams was suspended in that year. Breeding for scrapie resistance is, however, still stimulated and not suspended. In this report a general advice on how to continue breeding for scrapie resistance is presented. A one day meeting on breeding in small breeds of sheep and goats provided further information and attracted much interest. A specific analysis was carried out for 2 small Dutch sheep breeds, the Black blazed sheep (Zwartbles) and the Dutch Milksheep (Melkschaap

Wenselijkheid en mogelijkheden voor het fokken van hoornloze koeien : fase 2 = Desirability and opportunities for breeding polled cattle : phase 2

Alternatives for dehorning are being sought in a set up of a breeding program taking into account demands of farmers, breeding organizations and society. This entailed balancing the speed of fixation of polledness, genetic gain in other traits and inbreeding rates. Risks have been investigated and several scenario's will be presented

Huidige staartlengte bij Clun Forest, Hampshire Down en Suffolk: startpunt voor fokken van kortere staarten

Since 2008 there is in the Netherlands a ban on tail docking in sheep. Three breeds from English origin are exempted temporarily. Mean tail length of lambs and estimated heritability are determine

Het fokken van rashonden : omgaan met verwantschap en inteelt

Het boek beschrijft de kennis van dit moment over de fokkerij van dieren en in het bijzonder die over het fokken met rashonden. Het boek gaat vooral in op de effecten van verwantschap en inteelt en het verminderen van de kans op erfelijke aandoeningen. Het boek is vooral geschreven voor bestuursleden van rasverenigingen en voor leden van foktechnische commissies. Hiermee kunnen zij binnen hun vereniging samen met de fokkers maatregelen treffen die nodig zijn om tot gezonde rashondenpups te komen

Roodbont Fries vee : adviezen voor opzetten fokprogramma

Het doel van dit onderzoek richt zich op het in kaart brengen van de demografische en genetische situatie van het Roodbont Fries Vee en het aandragen van bouwstenen voor een goed genetisch beheer. Aansluitende analyses zijn uitgevoerd om de haalbaarheid van een fundamentfokkerij in kaart te brengen. De demografische analyse gaf aan dat het aantal raszuivere Fries Roodbonten sterk is afgenomen sinds 1986. Momenteel worden er jaarlijks slechts 60 raszuivere Fries Roodbonte kalveren geboren. Dit heeft dan direct een impact op de genetische verwantschappen in de populatie. Om die goed in kaart te brengen, is het noodzakelijk dat de stamboom toch zeker minimaal 3 generaties teruggaat. Het absolute inteeltniveau van de populatie is te hoog. Door dit hoge niveau kunnen erfelijke gebreken de kop opsteken. Om het inteeltniveau in de populatie te beheersen is het belangrijk om een breed palet aan stieren in te zetten. Uit de analyses ten aanzien van de fundamentfokkerij blijkt dat er wel bedrijven aan te wijzen zijn die nauwelijks aan elkaar verwant zijn. Helaas weten wij niet welke bedrijven dat zijn, aangezien er geanonimiseerde data is geanalyseerd. Voor fundamenten is het vooral belangrijk dat de veehouders binnen dit fundament overeenstemming hebben over het eigen fokdoel. Verder moeten de onverwante dieren in verschillende fundamenten zitten om zo de diversiteit tussen de fundamenten zo veel mogelijk te behouden