E-BioFlow: Different Perspectives on Scientific Workflows

We introduce a new type of workflow design system called\ud e-BioFlow and illustrate it by means of a simple sequence alignment workflow. E-BioFlow, intended to model advanced scientific workflows, enables the user to model a workflow from three different but strongly coupled perspectives: the control flow perspective, the data flow perspective, and the resource perspective. All three perspectives are of\ud equal importance, but workflow designers from different domains prefer different perspectives as entry points for their design, and a single workflow designer may prefer different perspectives in different stages of workflow design. Each perspective provides its own type of information, visualisation and support for validation. Combining these three perspectives in a single application provides a new and flexible way of modelling workflows

Professionele ruimte en gespreid leiderschap

Professionele ruimte voor leraren staat hoog op de politieke agenda. Op dit moment is er een wetsvoorstel over dit thema in behandeling bij de Tweede Kamer. Professionele ruimte zou moeten leiden tot een grotere inhoudelijke ontwikkelingstaak van leraren, en tot meer reflectie en ideeënuitwisseling. Professionele ruimte is daarmee direct gekoppeld aan vraagstukken rond de professionele ontwikkeling van leraren. Hoe professionele ruimte vorm moet krijgen, is echter de vraag. Uit diverse onderzoeken blijkt dat de rol van de leidinggevende cruciaal is, maar hoe die rol er precies uitziet is onduidelijk. Er is behoefte aan een nieuw type onderzoek naar de wijze waarop leraren professionele ruimte krijgen en nemen.\ud Deze reviewstudie heeft als doel om het perspectief van gespreid leiderschap nader te duiden en in verband te brengen met de professionele ruimte die leraren ervaren in scholen. De literatuur rondom gespreid leiderschap en professionele ruimte wordt verkend en er wordt een conceptueel model voorgesteld om deze begrippen met elkaar in verband te brengen. Op basis hiervan wordt toegewerkt naar een ontwerp van een praktijknabij onderzoeksinstrument om dit verband inzichtelijk te maken

Redox properties and electron paramagnetic resonance spectroscopy of the transition state complex of Azotobacter vinelandii nitrogenase

AbstractNitrogenase is a two-component metalloenzyme that catalyzes a MgATP hydrolysis driven reduction of substrates. Aluminum fluoride plus MgADP inhibits nitrogenase by stabilizing an intermediate of the on-enzyme MgATP hydrolysis reaction. We report here the redox properties and electron paramagnetic resonance (EPR) signals of the aluminum fluoride-MgADP stabilized nitrogenase complex of Azotobacter vinelandii. Complex formation lowers the midpoint potential of the [4Fe-4S] cluster in the Fe protein. Also, the two-electron reaction of the unique [8Fe-7S] cluster in the MoFe protein is split in two one-electron reactions both with lower midpoint potentials. Furthermore, a change in spin-state of the two-electron oxidized [8Fe-7S] cluster is observed. The implications of these findings for the mechanism of MgATP hydrolysis driven electron transport within the nitrogenase protein complex are discussed

Progress of the National Air Quality Cooperation Programme (NSL)

Om de luchtkwaliteit in Nederland te verbeteren is het Nationaal Samenwerkingsprogramma Luchtkwaliteit (NSL) opgezet. In dit programma werken de Rijksoverheid en decentrale overheden samen om te zorgen dat Nederland overal tijdig aan de grenswaarden voor fijnstof (2011) en stikstofdioxide (2015) zal voldoen. Om de voortgang te volgen is bij het NSL een monitoringsprogramma opgezet. Centraal onderdeel daarvan is een rekeninstrument waarvoor de overheden de brongegevens aanleveren. De daaruitvolgende rekenresultaten zijn vervolgens door het Bureau Monitoring (samenwerkingsverband RIVM en InfoMil) samengevoegd in voorliggende voortgangsrapportage. De prognoses voor 2011 en 2015 laten zien dat voor een groot deel van Nederland de resultaten onder de Europese grenswaarden voor PM10 (fijnstof) en NO2 liggen. Op een aantal plekken zijn er wel nieuwe of grotere overschrijdingen van de PM10- en NO2-grenswaarden zichtbaar. Bij de fijnstof (PM10) overschrijdingen gaat het hoofdzakelijk om locaties bij veehouderijen en een aantal industriele gebieden. Vooral nabij veehouderijen is op een aantal plekken nog sprake van grote overschrijdingen die lastig voor medio 2011 op te lossen zijn. De huidige prognose voor de concentraties stikstofdioxide in 2015 laat een minder gunstige ontwikkeling zien ten opzichte van wat is berekend in de vaststelling van het NSL. Dit komt voor een belangrijk deel door tegenvallende verkeersemissies wat heeft geleid tot een aantal nieuwe overschrijdingen. De nu in de prognoses berekende concentraties liggen op veel locaties net onder de grenswaarde. Met veel concentraties net onder de grenswaarde neemt het aantal overschrijdingen snel toe bij een tegenvaller in een van de gemaakte aannamen. In combinatie met een grote en deels onbekende onzekerheid in de rekenresultaten vormt dit een risico voor het behalen van de doelstelling van het NSL.The NSL has been put in place to improve air quality in the Netherlands and to ensure that the Netherlands meets the date of compliance with the EU limit values for particulate matter and nitrogen dioxide. Local, regional and national authorities work together within the framework of this programme to ensure that these goals are met. A monitoring programme, centred around a specially designed assessment tool, has been set up to monitor the progress. This tool uses data that the participating authorities are required to provide as part of the annual monitoring cycle. The results of the tool have been bundled by the Bureau Monitoring into this progress report. The prognosis for 2011 and 2015, based on the results obtained using the assessment tool, are that the concentrations of PM10 and NO2 fall below the EU limit values in most parts of the Netherlands. However, exceedances of the limit values do occur at specific locations. For PM10, these exceedances mostly occur close to a number of industrial sites and stock farms. Particularly high exceedances in the vicinity of these stock farms will make it difficult to meet the limit values by mid 2011 at these locations. The prognostications for NO2 show a less favourable decline in NO2 concentrations than was modelled at the establishment of the NSL. This is mostly due to the decline in traffic emissions falling short of expectations, resulting in new exceedances. At many locations, the calculated concentrations in the prognostications fall just under the limit value and, consequently, there will be a large increase in the number of exceedances when one or more of the premises become less favourable. This possibility, together with the large and partially unknown uncertainty in the calculation results, add up to a risk for not meeting the limit values by the date of compliance.VRO

Diagnosis of hepatocellular adenoma in men before onset of diabetes in HNF1A-MODY:Watch out for winkers

Hepatocyte nuclear factor 1A (HNF1A) maturity-onset diabetes of the young (MODY) is a monogenetic, autosomal dominantly inherited form of diabetes. HNF1A-MODY is associated with HNF1A-inactivated hepatocellular adenoma (H-HCA) formation. Hepatocellular adenoma (HCA) are benign liver tumours and related complications are rare but serious: hepatic haemorrhage and malignant transformation. Guidelines recommend resection of all HCA in men and do not take any co-occurring metabolic disorders into account. We report a family with HCA preceding diabetes mellitus. Male index patient presented with numerous, irresectable HCA. After initial diagnostic and aetiologic uncertainty HNF1A germline mutation c.815G>A (p.Arg272His) was confirmed 8 years later. No HCA-related complications occurred. His diabetic mother was diagnosed with HCA after severe hepatic haemorrhage years before. HNF1A-MODY should be considered in (non-)diabetic (male) patients with H-HCA. We advocate liver biopsy and, if necessary, genetic analysis to precede any intervention for HCA in males and screening for HCA in HNF1A-MODY patients